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使用受控的链置换的DNA序列测定
本申请公开了制备用于测序的DNA链的方法,以及使用根据这些方法制备的DNA链的遗传构建体、文库和阵列。本申请还公开了使用产生的DNA链、遗传构建体、文库和阵列进行测序的方法。在某些方面,被测序的DNA包括靶序列和至少一个...
柯荣勤斯尼泽纳·德尔马纳茨拉多吉·德尔马纳茨蔡光阳马修·卡洛
采用带修饰的核苷酸通过纳米通道进行DNA序列测定
本发明提供一种方法,用于采用纳米通道和带修饰的核苷酸对单股DNA进行序列测定
居景悦
D型产气荚膜梭菌贵州分离株ε毒素的DNA序列测定与分析
2014年
为研究产气荚膜梭菌ε毒素的结构与功能,以及对该病的防治提供基础依据,利用D型产气荚膜梭菌贵州分离株(CP02株),根据GenBank中登记的产气荚膜梭菌ε毒素基因设计特异性引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后测定核苷酸序列并与NCBI登录的参考毒株进行相似性比较。结果表明:D型产气荚膜梭菌CP02株基因片段大小为456bp,与CWD_CN_409、NCTC_8533、NCTN_6121、ETX21512、KurCpD1、CtrCpD2、IVRI_Vac1和IVRI_49菌株的核苷酸序列相似性在98.5%~100%,推导的氨基酸序列相似性在98.4%~100%。碱基突变以A-G、C-T间的转换为主,也发生低频率的A-C、G-T间颠换,但突变均为点突变。
王璇张晓可余波史开志李干洲徐景峨
关键词:D型产气荚膜梭菌
PCR-DNA序列测定法检测脊柱结核分枝杆菌耐药基因的研究
目的研究聚合酶链反应、DNA序列测定在脊柱结核分枝杆菌耐药性临床应用价值。方法 (1)25例脊柱结核病例脓液、干酪样坏死组织采用PCR法扩增上述样本的耐药基因rpoB、rpsL、katG片段;(2)PCR-DNA序列测定...
司建炜王自立
关键词:结核分枝杆菌耐药基因DNA序列测定
PCR-DNA序列测定法检测脊柱结核分枝杆菌耐药基因的研究
目的 研究聚合酶链反应、DNA序列测定在脊柱结核分枝杆菌耐药性临床应用价值。方法 (1)25例脊柱结核病例脓液、干酪样坏死组织采用PCR法扩增上述样本的耐药基因rpoB、rpsL、katG片段;(2)PCR-DNA序列测...
司建炜
关键词:结核分枝杆菌耐药基因DNA序列测定
PCR-DNA序列测定法检测脊柱结核分枝杆菌耐药基因的研究
2010年
目的研究聚合酶链反应、DNA序列测定在脊柱结核分枝杆菌耐药性临床应用的价值。方法对25例脊柱结核病例脓液、干酪样坏死组织,采用PCR法扩增样本的耐药基因rpoB、rpsL、katG片段;以PCR-DNA序列测定法检测扩增产物,利用DNATools(5.1)软件、NCBI/BLAST公共数据库对耐药基因比较分析。结果 73份耐药基因片段,检测出15份基因突变,其中rpsL基因突变4份,rpoB基因突变5份,katG基因突变6份,平均报告时间6d。结论脊柱结核分枝杆菌耐药基因序列检测具有快速、灵敏和特异性高等特点,与细菌学等方法相结合,能为脊柱结核临床治疗提供有利的帮助。
司建炜王自立
关键词:结核分枝杆菌耐药基因DNA序列测定
采用带修饰的核苷酸通过纳米通道进行DNA序列测定
本发明提供一种方法,用于采用纳米通道和带修饰的核苷酸对单股DNA进行序列测定
居景悦
PCR-DNA序列测定法检测脊柱结核分枝杆菌耐药基因的研究
目的: 研究聚合酶链反应、DNA序列测定在脊柱结核分枝杆菌耐药性临床应用价值。 方法: (1)25例脊柱结核病例术中取脓液、干酪样坏死组织病椎骨组织,采用PCR法扩增上述样本的耐药基因rpoB、rps...
司建炜王自立
关键词:脊柱结核分枝杆菌耐药基因DNA序列测定
DNA序列测定法与实时荧光PCR法检测YMDD突变结果的比较被引量:5
2008年
目的比较DNA序列测定法与实时荧光法检测YMDD突变的结果,并对除YMDD突变之外的耐药相关基因突变及其意义进行讨论。方法收集89例慢性乙肝患者的92份血清样本,均用实时荧光PCR法做YMDD突变检测。采用巢式PCR法扩增HBV反转录酶(RT)基因,对PCR产物进行DNA双向测序,采用NTI软件比对结果,并对RT基因上其他11个已知耐药相关突变位点进行分析。结果在37份YMDD突变阴性的样本中,DNA测序法检测结果为33份M204M(未突变)、1份M204I、3份M204V;4份YMDD突变阳性样本均为突变/未突变序列共存;另检出7份样本存在ADV耐药相关突变,占18.9%(7/37)。在55份YMDD突变阳性样本中,DNA测序法检测到52份,阳性结果符合率为94.5%(52/55);另检出5例存在ADV或ETV耐药相关突变,占9.1%(5/55)。结论DNA序列测定法检测HBVRT基因耐药相关突变敏感性高,重复性好,与实时荧光PCR方法的检测结果有较高的符合率,可同时检出YMDD突变以外的各种耐药相关突变,有助于临床全面了解患者对核苷(酸)类似物的耐药情况,合理地制订抗HBV治疗方案。
许彪徐东平成军李晓东毛远丽王海滨马洪滨胡瑾华王业东
关键词:YMDD突变
基于DNA切割过程的双链DNA序列测定的方法
一种基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法。本发明中双链DNA序列作为输入分子,由限制性内切酶对DNA进行切割,露出粘性末端,与状态转移分子通过碱基配对相结合并发生连接。由于状态转移分子仍然含有限制性内切酶的识别...
张治洲胡钧贺林

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李锋
作品数:426被引量:1,185H指数:15
供职机构:首都医科大学附属北京朝阳医院
研究主题:食管癌 哈萨克族 食管鳞癌 乳腺癌 横纹肌肉瘤
胡文浩
作品数:66被引量:184H指数:7
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研究主题:免疫组织化学 肾肿瘤 甲状腺肿瘤 乳腺癌 石蜡包埋
司建炜
作品数:40被引量:119H指数:6
供职机构:宁夏医科大学总医院
研究主题:脊柱结核 胸腰段骨折 结核分枝杆菌 DNA序列测定 分枝杆菌
王振华
作品数:32被引量:168H指数:6
供职机构:新疆医科大学
研究主题:乳腺癌 维吾尔族 DNA序列测定 BRCA1基因 BRCA1
蒋金芳
作品数:134被引量:392H指数:9
供职机构:石河子大学医学院新疆地方与民族高发病省部共建教育部重点实验室
研究主题:乳腺癌 免疫组织化学 免疫组化 表达及意义 新疆哈萨克族