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B细胞表位预测被引量：20: 2004年; 从原理、方法及应用等多方面对B细胞表位预测研究的既往成果、当前现状及存在问题进行了回顾与分析。; 黄健郭建巍蔡美英; 关键词：B细胞表位

B细胞表位预测方法及装置: 本发明提供了一种B细胞表位预测方法及装置。涉及机器学习技术领域。本发明提供的一种B细胞表位预测方法及装置，通过对蛋白质序列进行滑窗分割转换为多肽序列并对多肽序列进行编码处理，使蛋白质序列能够转换为适合机器学习模型的输入格...; 张靖樊瑜波邰呈正

线性B细胞表位预测的生物信息学资源和工具的研究进展: 2024年; 随着生物技术的迅猛发展,生物信息学在免疫研究领域发挥着日益重要的作用。线性B细胞表位的预测对于疫苗设计、疾病诊断和免疫治疗等方面具有关键意义。本文介绍了目前用于线性B细胞表位预测的各类生物信息学资源和工具,包括基于氨基酸序列特征、结构特征以及机器学习算法等多种预测方法,分析了其优势与局限性,并对未来的发展趋势进行了展望,旨在为相关领域的研究人员提供参考,以推动线性B细胞表位预测技术的进一步发展。; 刘一心; 关键词：B细胞抗体特异性表位预测

呼和浩特哮喘儿童常见气传花粉变应原T、B细胞表位预测及免疫分析: 武艳

不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析: 2024年; D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性。基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/CA2019谱系。不同于甲型、乙型流感病毒,IDV的潜在N-糖基化位点主要集中分布在HEF基因上。为系统了解不同谱系毒株HEF蛋白的N-糖基化位点和B细胞表位,从Gen Bank数据库获得151条全长HEF基因序列,通过使用MEGA-X生物信息学软件构建遗传进化树,并用在线工具进行各毒株N-糖基化位点和线性B细胞表位预测分析。结果表明IDV的HEF蛋白具有6~8个潜在的N-糖基化位点,其中有2个N-糖基化位点(N146和N613)在不同谱系间相同,有6个N-糖基化位点(N28、N54、N249、N346、N390和N513)在不同谱系间存在差异。B细胞表位在不同谱系间有3个保守的表位和8~9个各谱系独特的表位。线性B细胞表位的预测将有助于设计激活体液反应的多表位疫苗,预测结果还需要体外和体内实验证实来证明该应用的可行性。; 蒋智勇周霞李春玲楚品品勾红潮李艳卞志标刘建营翟少伦; 关键词：谱系 B细胞表位

基于人工智能的线性B细胞表位预测: 线性B细胞表位(Bcellepitope,BCE)是一种生物活性肽，在疫苗设计、免疫诊断试验、抗体制备、疾病防治等方面应用广泛，因此准确识别线性BCE具有重要意义。基于实验方法的线性BCE检测既昂贵又费时，已不能满足现代...; 刘宇峰; 关键词：自然语言处理神经肽

基于抗原序列和集成学习的线性B细胞表位预测方法研究: 生物信息学是一个综合了多种传统科学领域的新兴的科学领域。在遗传学、分子生物学和生物技术发展的推动下，包括生物学、计算机和信息技术在内的许多学科聚集在一起，组织和存储大量的生物信息。免疫学在这一领域也发挥着重要作用。B 细...; 刘岩; 关键词：表位预测特征抽取

基于Point Transformer的B细胞表位预测研究: 免疫信息学是21世纪初建立的以信息学与现代免疫学为基础的一门交叉学科。它利用免疫学的规律,并根据相关实验结果,实现包含抗原性的预测、分析和计算机辅助疫苗设计。表位是由抗原蛋白中可以被TCR和BCR特异性识别的亲水性残基组...; 秦文远; 关键词：B细胞表位点云

基于点云架构的B细胞表位预测研究: 免疫信息学是在现代信息学和免疫学的基础上建立的新兴学科,它是一种使用信息学的相关方法理论来处理免疫和疫苗学相关问题的学科,同时也是研究生物免疫应答过程中信号传输规律以及免疫系统调节的学科。作为免疫信息学研究的主要问题之一...; 于洋; 关键词：B细胞表位表位预测蛋白质三维结构点云

人体疟原虫乳酸脱氢酶基因多态性及B细胞表位预测: 2022年; 目的分析4种人体疟原虫乳酸脱氢酶(Plasmodium lactate dehydrogenase,pLDH)基因多态性并预测pLDH肽链B细胞抗原表位。方法收集传染病报告信息管理系统中登记的云南省疟疾病例血样和流行病学等信息。采用巢式PCR技术扩增4种人体疟原虫pLDH基因并测序,应用MEGA 7.0.26和DnaSP 5.10软件分析4种人体疟原虫p LDH基因DNA序列多态性,并采用免疫表位数据库(IEDB)预测pLDH肽链B细胞抗原表位。结果分别从153份间日疟、29份恶性疟、17份卵形疟和11份三日疟患者血样中获得间日疟原虫LDH(PvLDH)、恶性疟原虫LDH(PfLDH)、卵形疟原虫LDH(PoLDH)、三日疟原虫LDH(PmLDH)基因测序序列,分别定义15、2、4、2种单倍型,核苷酸多样性指数(π)为0.104。Po LDH基因种内分化程度较高,π为0.012;PvLDH、PfLDH和PmLDH基因π值均<0.001。4种人体疟原虫pLDH肽链可预测到4~5个/链的B细胞抗原活性区,活性得分约0.430;其中活性区短肽"86-PGKSDKEWNRD-96"为4种人体疟原虫共有的B细胞抗原表位,"266-GQYGHS(T)-271"仅出现在PvLDH和PoLDH肽链,PvLDH、PfLDH肽链特有的B细胞抗原表位分别是"212-EEVEGIFDR-220"和"208-LISDAE-213"。结论PoLDH基因多态性可能来自微弱的负向纯化选择,PvLDH、PfLDH、PmLDH基因则可能维持了相对保守状态。p LDH肽链近C端可能存在可区分间日疟、恶性疟原虫感染的B细胞抗原表位"212-EEVEGIFDR-220"和"208-LISDAE-213"。; 黄和荣董莹邓艳徐艳春陈梦妮刘言张苍林; 关键词：乳酸脱氢酶基因多态性 B细胞表位表位预测

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