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一种用于B细胞抗原表位预测的数据集构建方法
一种用于B细胞抗原表位预测的数据集构建方法,所述发明是利用河北省自然科学基金做出的一项发明,基金的项目名称为“基于自学习机制的B细胞抗原表位预测研究。本发明包括以下步骤:a.建立表位样本集合、非表位样本集合和候选序列集合...
羊红光白双艳成彬
人乳头瘤病毒39型遗传变异分析及T细胞B细胞抗原表位预测
2025年
目的分析人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)39基因组遗传变异特征,并对病毒早期蛋白(E1、E2、E6、E7)和晚期蛋白(L1、L2)的T、B细胞优势抗原表位进行预测和筛选。方法从临床样本和NCBI数据库中共获取70条HPV39全长序列构建进化树、分析基因多态性,并对病毒蛋白理化性质进行预测;采用IEDB和ABCpred预测T、B细胞抗原表位,并结合表位所在区域的二级结构,以及肽段的柔韧性、亲水性、表面可及性、抗原性评分等参数进一步筛选潜在优势抗原表位;最后对潜在优势抗原表位与12种高危型HPV进行同源性分析。结果HPV39突变株可分为两个进化分支,分布于不同进化分支的毒株具有其特定的突变模式。在不同病毒基因中,E7突变率最高,而E1突变率最低,但这些碱基/氨基酸突变未对病毒的理化性质产生明显影响。经预测和筛选后,L1、L2各获得5、6条B细胞潜在优势抗原表位;E1、E2、E6、E7分别获得18、10、4及1条HLA-I类T细胞潜在优势抗原表位;E1、E2、E6获得7、3及2条HLA-II类T细胞潜在优势抗原表位。同源性分析发现E1、E2、E6区域的T细胞抗原表位,以及L2中的B细胞抗原表位与HPV68、HPV33、HPV45和HPV59具有较高的同源性(93%~100%)。结论HPV39突变株可分为A、B两个主要进化分支,各进化分支具有其特定突变模式。病毒蛋白中含有可供进一步研究的T、B细胞潜在优势抗原表位,为HPV39相关多肽形式的疫苗和药物开发提供了更多理论依据。
张誉小杨一娟王丽蓝锶菡俞晶何洁张红平冯敏
关键词:遗传变异分析T细胞B细胞抗原表位预测
靶向SARS-CoV-2棘突蛋白中独特B细胞抗原表位的鲨鱼单域抗体的研制
2025年
目的制备特异性识别SARS-CoV-2棘突蛋白中独特B细胞抗原表位的鲨鱼单域抗体,并探究其在靶向SARS-CoV-2棘突蛋白S的免疫学检测中的作用。方法根据SARS-CoV-2棘突蛋白独特B细胞抗原表位序列人工合成多肽S9,与载体蛋白KLH偶联后对条纹斑竹鲨进行背部皮下免疫。尾静脉采血并分离外周血淋巴细胞,从中提取总RNA后逆转录为cDNA,以cDNA为模板扩增条纹斑竹鲨vNAR片段,与载体pComb3XSS连接构建噬菌体文库。从噬菌体文库中淘选识别该抗原表位的阳性克隆。将抗体基因克隆至pET-28a构建表达载体,诱导大肠杆菌原核表达并纯化获得鲨鱼单域抗体,分别应用于WB、ELISA和IFA等方法检测SARS-CoV-2棘突蛋白。结果共获得1个鲨鱼单域抗体克隆T01。重组表达并纯化的鲨鱼单域抗体T01与多肽S9结合的亲和力良好,EC50为(2.050±0.064)nmol/L且可特异性结合棘突蛋白的NTD片段。WB检测显示鲨鱼单域抗体T01能特异性地识别重组SARS-CoV-2棘突蛋白S1片段,而与其他6种感染人的冠状病毒的重组棘突蛋白S1片段没有交叉反应;IFA检测提示鲨鱼单域抗体T01可特异性地结合瞬间表达于HEK293细胞内的SARS-CoV-2棘突蛋白。结论成功制备一株靶向SARS-CoV-2棘突蛋白中独特B细胞抗原表位的鲨鱼单域抗体,为新型冠状病毒抗原检测提供了有效工具。
王越沈立军方权张锋罗永能
关键词:新型冠状病毒B细胞抗原表位条纹斑竹鲨单域抗体
PEDV S蛋白RBD的优势B细胞抗原表位、其嵌合基因、重组菌株及其制备方法和应用
本发明公开了PEDV刺突(S)蛋白受体结合结构域(RBD)的优势B细胞抗原表位、其嵌合基因、重组菌株及其制备方法和针对其在ETEC和PEDV多联多价疫苗中的应用。本发明制备的F4‑F18‑PEDV‑S重组疫苗株能同时表达...
段强德庞胜美葛猛刘梅王龙龙朱国强戴鹏丁国伟徐萍
识别艰难梭菌谷氨酸脱氢酶中构象B细胞抗原表位的驼源单域抗体GH12及应用
本发明公开了一种识别艰难梭菌谷氨酸脱氢酶中构象B细胞抗原表位的驼源单域抗体GH12及应用。所述驼源单域抗体GH12的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明的驼源单域抗体GH...
翟华倩胡珲罗永能沈立军张凯李哲舟金大智蔡梦婷
识别艰难梭菌谷氨酸脱氢酶中线性B细胞抗原表位的驼源单域抗体GA4及应用
本发明公开了一种识别艰难梭菌谷氨酸脱氢酶中线性B细胞抗原表位的驼源单域抗体GA4及应用。所述驼源单域抗体GA4的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明的驼源单域抗体GA4具...
胡珲罗永能翟华倩沈立军张凯李哲舟金大智蔡梦婷
B细胞抗原表位鉴定方法的研究进展
2024年
抗原表位抗原决定其抗原性的基础,是诱导机体产生免疫应答的最小功能单位。B细胞抗原表位研究对于新型疫苗和治疗性药物的研发以及诊断试剂的开发具有重要意义。本文总结了近几年应用B细胞抗原表位研究的技术,并分析了各种技术的优缺点。
伍春平尹苗陈希文
关键词:B细胞抗原表位免疫
CD36蛋白B细胞抗原表位的生信预测及其多抗原肽的制备
2024年
目的分析CD36蛋白的结构,寻找可能的B细胞抗原表位,制备含有B细胞表位的多抗原肽(multiple antigenic peptide,MAP),为基于B细胞表位的MAP用于CD36抗体的制备提供前期实验基础。方法通过生物信息学方法分析CD36蛋白的理化性质、二级结构、潜在磷酸化及糖基化位点等,预测可能的B细胞表位。以多聚赖氨酸为核心基质,采用Fmoc方法合成含有CD36 B细胞表位的八分枝MAP,并利用反向高效液相色谱(RP-HPLC)分析MAP的纯度、质谱分析法测定MAP的分子量,对合成的CD36-MAP进行鉴定。结果CD36是1种稳定的、亲水性的碱性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,具有多个磷酸化、糖基化位点,抗原性较强。综合分析获得可能的优势B细胞表位4个,制备了4个含有优势B细胞表位的MAP,RP-HPLC分析表明合成的MAP的纯度均在85%以上,其中3个MAP的分子量与理论预期值相符。结论CD36具有较强的抗原性,利用预测得到的4个可能的B细胞表位合成MAP,为CD36抗体的制备和相关研究提供实验基础。
刘静刘静丁浩强徐秀章王嘉励丁浩强夏文杰邓晶
关键词:血小板CD36B细胞表位
PEDV S蛋白RBD的优势B细胞抗原表位、其嵌合基因、重组菌株及其制备方法和应用
本发明公开了PEDV刺突(S)蛋白受体结合结构域(RBD)的优势B细胞抗原表位、其嵌合基因、重组菌株及其制备方法和针对其在ETEC和PEDV多联多价疫苗中的应用。本发明制备的F4‑F18‑PEDV‑S重组疫苗株能同时表达...
段强德 庞胜美 葛猛 刘梅 王龙龙 朱国强 戴鹏 丁国伟 徐萍
非洲猪瘟病毒pA104R蛋白免疫优势性B细胞抗原表位及其单克隆抗体与应用
本发明公开了一种非洲猪瘟病毒pA104R蛋白免疫优势性B细胞抗原表位及其单克隆抗体与应用,属于分子免疫学技术领域。本发明的非洲猪瘟病毒pA104R蛋白的单克隆抗体由保藏编号为CCTCC NO:C2022334的杂交瘤细胞...
王湘如陈启超余怡丰刘李鑫杰李亮国师榜刘占悝陈焕春

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作品数:915被引量:2,144H指数:19
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研究主题:单克隆抗体 原核表达 猪瘟病毒 PD-1 盐酸克伦特罗
王三虎
作品数:143被引量:531H指数:12
供职机构:河南科技学院动物科学学院
研究主题:克隆 病毒 B细胞抗原表位 抗菌肽 感染动物
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作品数:208被引量:277H指数:8
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研究主题:试纸条 单克隆抗体 胶体金标记 吸附纤维 蛋白溶液
李学伍
作品数:167被引量:429H指数:10
供职机构:河南省农业科学院
研究主题:试纸条 金标 快速检测试纸条 印迹 胶体金标记