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四株细菌纤维素生产菌株16SrDNA序列分析及生产性能比较研究被引量:3
2018年
对实验室筛选保藏的DHU-HL-Z1、DHU-HL-Z2和DHU-HL-Z3三株细菌纤维素(bacterial nanocellulose,BNC)生产菌株和对照菌Komagataeibacter xylinus ATCC 23770进行16SrDNA序列分析以及BNC生产性能比较。序列分析结果显示三株菌均属于木葡糖醋杆菌K. xylinus,与已报道的多株BNC生产菌株亲缘性较近。该三株菌的产量(12.8~14.8 g/L)均明显高于8.7 g/L(p>0.05)。DHU-HL-Z1和DHU-HL-Z2所产BNC的结晶度(87.64%和86.65%)明显高于对照菌ATCC 23770(62.34%)。凝胶膜力学性能方面,DHU-HL-Z2、DHU-HL-Z3和DHU-HL-Z1的杨氏模量分别为130 KPa、96 KPa和39 KPa,均高于ATCC 23770的23 KPa。结果表明三株保藏菌优良性能,在BNC研究和生产领域具有很好的利用价值。
邹小周曹张军陈琳洪枫
关键词:细菌纤维素
宠物犬布鲁氏菌的分离与16SrDNA序列鉴定
从某疑似感染布鲁氏菌宠物犬全血中分离到一株细菌,对其进行纯化培养、染色镜检,PCR扩增其16SrDNA基因片段,将扩增的产物纯化后测序,用NCBI软件对测序结果进行同源性检索,结果显示其与布鲁氏菌同源性达到100‰应用D...
黄萃刘林峰张祥华邓贤才邬向东
关键词:宠物犬布鲁氏菌
文献传递
16SrDNA序列在细菌鉴定和检测分析中的应用价值被引量:5
2017年
传统的微生物鉴定及分类方法是对细菌进行分离培养, 根据其形态特征和生化反应进行鉴定. 当该菌种不具有特征的形态及生化反应时, 传统鉴定方法便难以奏效, 并且传统方法耗时长、 操作繁琐,无法满足临床快速检测的需要, 无法对临床用药及治疗提供可靠依据. 随着分子生物学技术不断发展,诸多新技术手段逐渐应用于微生物的鉴定及分类,其中16SrDNA (编码核糖体16SrRNA基因) 序列测序分析法已经广泛应用于菌种鉴定和系统发生学研究. 本文就16SrDNA序列在细菌鉴定和检测分析中的应用研究进行如下综述.
刘新武于艳妮滕海风殷积芳
关键词:16SRDNA序列细菌鉴定
黄蒿丛枝病植原体的鉴定及其16SrDNA序列分析被引量:2
2017年
黄蒿为菊科蒿属一、二年生草本植物,在医学和植物病害生物防治方面具有重要价值。植原体是一类重要的病原物,常引起丛枝、小叶、黄化、簇生等症状。从山东泰山山涧采集到表现丛枝症状的感病黄蒿植株,以叶片总DNA为模板,利用植原体通用引物对R16F2n/R2进行PCR扩增,获得了大小为1 244 bp的片段,与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)一致性分别为99.4%和99.8%。系统进化树显示,黄蒿丛枝病植原体(登录号:KT899994)与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)处于同一分支。植原体分类鉴定在线工具i Phy Classifier分析结果显示,所获得的片段与16Sr XII-A亚组代表性植原体(AF248959)相似系数为1.0,表明黄蒿丛枝病植原体归属于16Sr XII-A亚组。利用葡萄黄化(Stolbur)植原体特异性引物对STOL4f/r进行PCR扩增,获得大小为1 754 bp的片段,与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)一致性为99.5%,i Phy Classifier分析结果显示,该片段(登录号:KU759570)与AF248959相似系数为1.0,验证了植原体通用引物对R16F2n/R16R2分析结果的可靠性。综上,将黄蒿丛枝病植原体的分类地位确定为16Sr XII-A亚组。
余贤美王洁付丽翟浩孙清荣
关键词:分子鉴定RDNA序列分析
16SrDNA序列在艾伯特埃希菌鉴定中的应用被引量:8
2016年
目的通过16S rRNA基因序列分析快速鉴定艾伯特埃希菌。方法以30株疑似艾伯特埃希菌为材料,使用通用引物扩增其16S rRNA基因并进行测序。获得的序列与艾伯特埃希菌型菌株LMG 20976,基因组测序菌株KF1、NBRC107761、TW07627以及其他密切相关的细菌种(大肠埃希菌、赫曼埃希菌、费格森埃希菌、志贺菌和Shimwellia blattae)的16S rRNA基因序列进行比较,并使用N-J法构建进化树来分析其相关性。结果 30株疑似艾伯特埃希菌的16S rRNA基因序列与艾伯特埃希菌参考菌株的序列相似性最高,并与其聚类为一簇,为艾伯特埃希菌。结论 16S rRNA基因测序分析可用于艾伯特埃希菌的快速鉴定。
王斌王红熊衍文许彦梅刘祥肖波孙松松周阳白锐张玲
关键词:RDNA
基于线粒体16SrDNA序列的深圳水库区双脐螺分子鉴定
2016年
目的基于线粒体16SrDNA序列对深圳水库区双脐螺进行分子鉴定。方法以双脐螺基因组DNA为模板,聚合酶链反应扩增16SrDNA目的基因片段,并以pMDl8.T载体克隆后进行序列测定,采用BLAST和MEGA4软件分析序列特征。结果双脐螺线粒体16SrDNA扩增片段大小约为466bp:测定序列与GenBank中1株巴西藁杆双脐螺(Biomphalaria straminea,B.straminea)同源性为99%;与3株库恩双脐螺(B.kuhniana)同源性均为98%;与1株中介双脐螺(B.intermedia)和1株双脐螺(B.edisoni)的同源性分别为95%和94%。深圳水库区2株双脐螺与巴西藁杆双脐螺(序列号AY030213.1)的遗传距离为O:基于16SrDNA序列,采用MEGA4软件作系统发生分析,以邻位连接法(NJ)和非加权组平均法(UPGMA)构建的系统发生树,水库区双脐螺与该藁杆双脐螺属于同一个分支。结论根据16SrDNA序列特征,深圳水库区双脐螺可归类为藁杆双脐螺。
高世同李晓恒耿艺介谢旭梅树江黄达娜
关键词:线粒体DNA分子系统发生
基于16SrDNA序列分析和BIOLOG快速鉴定方法鉴定杭州地区原料乳中嗜冷菌被引量:6
2015年
以杭州地区四个牧场的原料乳为对象,采用传统平板法分离培养嗜冷菌,得到嗜冷菌的生长曲线。通过形态学观察及镜检分离纯化出15株形态各异的菌种。基于16S r DNA序列分析和BIOLOG微生物快速鉴定方法,最终鉴定为假单胞菌属、类黄假单胞菌、荧光假单胞菌、乳酸菌等种属。其中假单胞菌属有13株,为杭州地区原料乳中嗜冷菌的优势菌。
叶慧谢海华黄俊刘士旺毛建卫楼坚
关键词:原料乳嗜冷菌RDNA序列
基于16srDNA序列分析冬樱花花期蜜囊细菌多样性被引量:1
2014年
对昆明冬樱花花期东、西方蜜蜂蜜囊细菌进行分离、纯培养;并对分离菌株的16srDNA基因片段进行扩增和测序,序列比对后进行系统发育分析。结果表明:东方蜜蜂蜜囊细菌包括3个纲中的10个种,西方蜜蜂蜜囊细菌包括3个纲中的13个种,花蜜细菌包括4个纲中的6个种,所采集样品除Bacillus subtili相似以外,其余菌种差异较大。
王淼赵文正徐鸿尹革芬和绍禹
关键词:冬樱花系统发育分析
利用16SrDNA序列探讨优颖蜡蝉属和卡颖蜡蝉属的分类地位(半翅目:蜡蝉总科:颖蜡蝉科)被引量:2
2014年
采用DNA测序技术测定了颖蜡蝉科中比较相似的优颖蜡蝉属与卡颖蜡蝉属的线粒体16S rDNA基因,分析其亲缘关系。结果表明:佛坪卡颖蜡蝉、紫阳卡颖蜡蝉与刺突优颖蜡蝉的遗传距离为0.038和0.155,系统发育分析两个属的种不能各自独立聚为一支,结合形态特征建议将优颖蜡蝉属与卡颖蜡蝉属合并为一个属。
徐世燕龙见坤杨琳陈祥盛
关键词:颖蜡蝉科RDNA
内蒙古11种主要草原蝗虫16SrDNA序列分析被引量:1
2014年
测定了内蒙古11种主要草原蝗虫的线粒体基因组16S rDNA序列,并构建了其分子系统树。在获得的505 pb序列中,G+C占30.2%,A+T占69.8%,表现出A/T偏向性。在505 bp个碱基中检测到156个多态性位点,占碱基总数的30.9%。156个多态性位点中包括50个单变异多态性位点(占总位点数的32.1%)和106个简约信息位点(占总位点数的67.9%)。分别采用NJ、ME、MP和UPGMA聚类方法构建系统发生树。结果表明,4科的17种蝗虫共聚为6支,其中槌角蝗科、斑腿蝗科与网翅蝗科3个科的蝗虫先聚在一起,再与斑翅蝗科相聚。4种聚类方法中UPGMA聚类法更为符合传统的以形态学为基础的分类体系。
张敏哲周晓榕庞保平韩海斌
关键词:蝗虫RDNA分子系统发育

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陈文新
作品数:218被引量:1,904H指数:24
供职机构:中国农业大学生物学院
研究主题:根瘤菌 豆科植物 褐煤 系统发育 掺杂
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作品数:55被引量:1,086H指数:21
供职机构:浙江大学生命科学学院生物科学系
研究主题:水稻田 甲烷氧化菌 甲烷 土壤 废水处理
赵伟全
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研究主题:马铃薯疮痂病 马铃薯疮痂病菌 马铃薯 链霉菌 毒素
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作品数:2被引量:29H指数:2
供职机构:四川理工学院生物工程学院酿酒生物技术及应用四川省重点实验室
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研究主题:根瘤菌 慢生根瘤菌 紫花苜蓿 促生菌 多样性