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一种鉴定植物组织中活性顺式作用元件组的方法及其应用
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种鉴定植物组织中活性顺式作用元件组的方法及其应用。所述方法包括如下步骤:(1)制备随机DNA文库;(2)去除植物组织材料中的胞质蛋白;(3)抽提获得植物组织材料中的核蛋白;(4)凝胶迁移...
朱方捷张笑天温陈金袁振林俊城
小麦TaDEP1基因转录增强顺式作用元件的鉴定及其分子标记和应用
本发明公开了一种小麦TaDEP1基因转录增强顺式作用元件的鉴定及其分子标记和应用,本发明提供了如SEQ ID No.2所示的小麦TaDEP1基因转录增强顺式作用元件,以及用于鉴定TaDEP1基因转录水平的分子标记,用于特...
刘磊赵祥祥赵红桃张国芳裔新刘福霞
促进天然无内含子mRNA出核的顺式作用元件鉴定
背景:mRNA的转运出核是真核生物基因表达的重要步骤之一,它与pre-mRNA的各个加工过程都密切相关。Pre-mRNA在细胞核内经历5’端加帽,剪接和3’端加尾等一系列步骤加工为成熟的mRNA,并招募TREX(tran...
陈沁凡
关键词:顺式作用元件基因表达
SlPSY1顺式作用元件变异改变番茄红素含量的分子机制
番茄不仅是重要的经济作物,同时也是研究果实发育及植物-病原菌互作机制的经典模式作物。远缘野生番茄具有更优异的抗逆能力,是天然的抗逆基因资源库。野生番茄经过人工驯化后,果实产量不断提高,但在这个过程中遗传多样性降低,导致驯...
李秀红
关键词:番茄番茄红素八氢番茄红素合成酶顺式作用元件自然变异
一种响应非生物胁迫的顺式作用元件及其鉴定方法和应用
本发明属于植物基因工程技术领域,公开了一种响应非生物胁迫的顺式作用元件及其鉴定方法和应用,顺式作用元件的核苷酸序列为“AGCCT”,并提供了含有权利要求1所述的顺式作用元件的植物报告载体。本发明所述顺式作用元件的启动子片...
胡萍杨传平张凯敏
基因顺式作用元件CRE编辑对根际细菌LG3145良性互作能力的影响
植物根际微生物在促进作物生长、抵御病害等方面发挥着重要作用。由于在农耕过程中长期施用合成农药或者化学肥料,使得这些微生物与植物的互作能力逐渐退化。本课题组采用非特异性UgRNA/Cas9基因编辑技术,对一株短小芽孢杆菌基...
毕美营
关键词:短小芽孢杆菌
辣椒miR169家族在非生物胁迫下的表达及启动子顺式作用元件分析被引量:1
2023年
miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信息学手段分析辣椒与其他植物miR169成熟体和前体保守性和进化关系。采用real-time PCR技术对干旱、低温、高盐、高温胁迫下辣椒miR169基因家族前体进行应答检测。克隆辣椒Can-miR169基因家族12个成员启动子,进行顺式作用元件预测及元件功能验证。结果显示:(1)miR169成熟体在植物中保守性强。(2)4种非生物胁迫下,辣椒miR169家族成员前体表达量相对于对照组差异显著。(3)成功克隆了Can-miR169基因家族12个启动子,顺式作用元件预测其家族启动子中含有大量与非生物胁迫相关的元件,如MYB、MYC、MBS、ABRE、LTR、DRE等。(4)经验证明,这些元件为干旱、低温、高盐等胁迫应答元件。本研究结果为进一步挖掘非生物胁迫下调控Can-miR169的转录因子,明确其上游调控机制提供新信息,为辣椒分子育种及品种改良提供新视野。
黄渺宋泽洋蔡骏一南红肇瑾
关键词:辣椒启动子非生物胁迫顺式作用元件
猪繁殖与呼吸综合征病毒转录调控序列顺式作用元件的鉴定及其在基因转录表达中的机制解析被引量:1
2023年
猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的转录调控序列(TRS)在sg mRNA的合成中起着至关重要的作用。为了深入了解TRS在病毒亚基因组转录和翻译过程中的作用,本研究通过对高致病性PRRSV细胞传代致弱株HuN4-F112的转录调控序列进行鉴定,并构建了一系列针对TRS6突变以及将TRS6替换为其他Body TRS的全长感染性克隆。结果表明,同时突变TRS6核心寡核苷酸3'端两个碱基或同时缺失5'端和3'端侧翼序列的全长突变体克隆均不能拯救出病毒,而单独缺失TRS65'端或3'端侧翼序列的全长突变体克隆可以拯救出病毒,但侧翼序列缺失后拯救出的病毒相较于原始亲本病毒的滴度有所下降;将HuN4-F112-EGFP的TRS6替换为TRS2、3、7均可以拯救出病毒,并有相似的生长特性,但含有TRS2的重组病毒滴度相对较低,而将TRS6替换为TRS4或TRS5后,无法拯救出病毒。本研究鉴定了HuN4-F112的一系列Body TRS在基因组中的相对位置,同时也证明了ORF1b和ORF2a基因区中4种不同的Body TRS都可以引导基因稳定高效的表达,该研究为今后以PRRSV疫苗株为活病毒载体进行多价重组疫苗的研发奠定了基础。
张宽陈金霞张玉娇杜楠楠郑浩姜一峰姜一峰虞凌雪李丽薇童武虞凌雪高飞
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒
番茄SlNAC1基因的功能验证与顺式作用元件分析
番茄转录因子SlNAC1(Solanum lycopersicum NAC1)参与调控多种生物和非生物胁迫应答,但其分子调控机制仍不清楚。本研究构建p BI121-Ca MV35S::SlNAC1-GFP载体并转化烟草,...
李德鑫
关键词:启动子非生物胁迫
GbTCP5与GbGL3启动子中TCP顺式作用元件的结合特性分析
2022年
TCP转录因子是参与植物生长发育的特异性家族蛋白,但是棉花TCP转录因子家族中的大多数成员功能尚不清楚。为了定位GbTCP5转录因子调控的靶基因,本研究通过Plant CARE在线网站分析棉花纤维发育基因GbGL3上游3 000 bp启动子中的顺式作用元件,构建含有TCP顺式作用元件的载体PHISII-GbGL3和酵母表达载体p GADT7-GbTCP5,通过酵母单杂交分析GbTCP5与GbGL3启动子中TCP顺式作用元件的结合特性。结果表明:GbGL3上游3 000 bp启动子中包含TCP顺式用作元件和功能各异的顺式作用元件,酵母单杂交实验结果表明GbTCP5能够与GbGL3启动子中含有的TCP顺式用作元件结合。本研究为进一步了解GbTCP5转录因子的功能提供依据。
王怡于月华万会娜蔡永生倪志勇
关键词:酵母单杂交

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唐克轩
作品数:483被引量:1,735H指数:21
供职机构:上海交通大学
研究主题:青蒿 青蒿素 基因工程育种 青蒿素含量 腺毛
吴燕民
作品数:100被引量:663H指数:15
供职机构:兰州大学草地农业科技学院
研究主题:百脉根 编码基因 逆境胁迫 转录因子 MYB转录因子
石璞
作品数:47被引量:4H指数:1
供职机构:上海交通大学
研究主题:基因工程育种 腺毛 启动子 青蒿 特异表达
李秋莉
作品数:47被引量:353H指数:12
供职机构:辽宁师范大学生命科学学院
研究主题:辽宁碱蓬 转录因子 启动子 甜菜碱醛脱氢酶 非生物胁迫
梁宗锁
作品数:768被引量:9,648H指数:49
供职机构:浙江理工大学
研究主题:丹参 黄土高原 干旱胁迫 土壤干旱 黄精