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HSV-1即刻早期基因编码序列作为5'UTR对mRNA翻译的影响
mRNA疫苗因其特有优势在新型冠状病毒肺炎疫情爆发期间备受关注。它利用人体细胞来产生病毒抗原蛋白,从而激发免疫应答。与传统疫苗相比,mRNA疫苗诸多优势,但其不稳定性也会大大降低翻译效率。5'UTR是决定mRNA疫苗表达...
徐朗希
关键词:单纯疱疹病毒1型非编码序列蛋白表达水平
TNFAIP3编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用
本发明提供了TNFAIP3编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。是基于本发明发明人首次发现TCL患者外周血中TNFAIP3编码序列突变情况与TCL患者的预后相关。当发生TNFAIP3编码序列...
李扬秋 陈存特陈政黄玲周玲玲朱丽花刘思初 曾成武李文瑜
基于cpDNA编码序列的北沙柳遗传多样性分析被引量:1
2020年
为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体编码序列(trnL-trnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良、遗传育种及品种选育提供理论依据。结果表明:(1)经trnL-trnF和trnD-trnT片段联合比对获得了1811 bp序列,共有12个核苷酸变异位点(8个简约信息位点,4个变异位点),得到16个单倍型。(2)单倍型多样性指数(Hd)为0.737,核苷酸多样性指数(π)为0.00107;且单倍型H3的分布在所有居群中位于单倍型网络图中心,其余单倍型随机分布于各个居群。(3)AMOVA分析表明,北沙柳cpDNA的变异主要来源于居群内(91.16%),居群间遗传分化程度中等(FST=0.08837),各居群间的基因交流常频繁(Nm=2.58);遗传分化系数NST(0.085)显著大于GST(0.056,0.01
李娅翔路东晔郝蕾张国盛宁静乌兰娜日阿拉腾苏和
关键词:CPDNA单倍型
编码序列对细胞因子的转录后调控功能探究
蛋白质是细胞生物功能最重要的行使者,但在人类基因组中编码蛋白质的序列大约只占3%,绝大部分是编码序列。从DNA到蛋白质需经历转录、RNA的加工和转运、蛋白翻译、降解等一系列的过程,对基因表达的调控存在于每一个层次。基因...
殷玮婕
关键词:免疫微环境白细胞介素4非编码序列转录后调控
基于叶绿体DNA编码序列的蒙古扁桃谱系地理学研究被引量:2
2018年
该研究选取中国西北干旱区第三纪孑遗植物蒙古扁桃(Amygdalus mongolica),基于叶绿体DNA编码trnH-psbA序列对蒙古扁桃17个居群324个个体进行了谱系地理学研究。结果表明:(1)蒙古扁桃trnH-psbA序列长度350bp,变异位点63个,共有9种单倍型,居群间总遗传多样性为(Ht)为0.758,居群内平均遗传多样性为(Hs)为0.203,贺兰山东麓及阴山南麓边缘的居群具有较高的单倍型多样性及核苷酸多样性并固定较多特有单倍型,推测这2个地区是蒙古扁桃在第四纪冰期时的重要避难所。(2)AMOVA分析表明,居群间的遗传变异为83.84%,居群内的遗传变异为16.16%,居群间遗传分化系数Nst>Gst(Nst=0.733,Gst=0.655,P>0.05),表明蒙古扁桃不存在明显的谱系地理结构;根据单倍型地理分布及网络关系图,把蒙古扁桃自然地理居群分为东、西两大地理组群,而且东、西地理组群没有共享单倍型;居群遗传结构分析表明,两大地理组群遗传分化较大。(3)蒙古扁桃居群在间冰期或冰期后经历了近期的居群扩张,由于奠基者效应使得多数居群只固定了单一的单倍型。
段义忠白春梅段春燕申烨华
关键词:蒙古扁桃谱系地理学遗传分化叶绿体DNA
基于叶绿体DNA编码序列的滇牡丹分子系统地理学研究
滇牡丹(Paeonia delavayi)为芍药科(Paeoniace)芍药属(Peoria)牡丹组(sect.Mouton DC)植物,分布于我国西南地区,为芍药属分布最南的牡丹组植物,在芍药属的起源、演化和地理分布等...
孙金金
关键词:滇牡丹CPDNAPSBA-TRNH分子系统地理学
南方红豆杉叶绿体编码序列PCR体系优化及引物筛选被引量:1
2016年
PCR技术广泛用于分子标记、基因工程等领域,是植物系统发育及种群遗传结构等研究的基础。通过对影响PCR体系扩增的主要因子进行单因素试验,得出南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)叶绿体DNA(cpDNA)最优体系(30μL)为3μL 10×PCR buffer,1μLDNA模板(60 ng),4.2μL MgCl_2(3.5 m M),8.4μLdNTPs(0.7 m M),0.9μL引物(0.3μM),0.8μL Taq DNA聚合酶(2 U),10.8μL去离子水。利用该体系筛选出叶绿体DNA编码区通用引物4对,分别为atp I-atp H、psb J-pet A、trn H-psb A和trn L-trn F。
邹帆徐刚标何长青覃建庸
关键词:南方红豆杉叶绿体DNA引物筛选
观光木cpDNA编码序列PCR反应体系优化及引物筛选被引量:3
2014年
利用单因素与正交设计试验,对影响观光木cpDNA-PCR扩增的主要因子进行优化,建立了观光木cpDNA-PCR最适反应体系(20μL),为:50 ng模板DNA、1×PCR buffer、0.2μmol·L-1引物、2 mmol·L-1MgCl2、0.3 mmol·L-1dNTP以及1 U Taq DNA聚合酶;筛选出了适合观光木分子谱系地理学研究的编码序列引物,为rpl32-trnL、psbJ-petA、3′rps16-5′trnK、atpI-atpH、petL-psbE。
何长青王红霞付甜黄芳芳闫丽君徐刚标
关键词:观光木引物筛选
新城疫病毒编码序列的遗传演化趋势被引量:1
2014年
【目的】探讨新城疫病毒全基因序列编码序列的分子演化规律。【方法】结合本研究室2012年自产蛋下降鸭群中分离测序的一株鸭源新城疫病毒全序列,从GenBank下载35株不同基因型新城疫病毒全长cDNA序列,获取编码序列,分别绘制引导序列、尾随序列、F-HN及HN-L基因间隔序列(IGS)的遗传进化树,比较编码基因内5’及3’UTR序列核苷酸序列替代特点。【结果】编码序列的长度及位置高度保守,而其核苷酸基因序列在不断发生变异,且变异趋势与编码基因序列相一致。【结论】新城疫病毒在整个基因组上编码编码序列同步发生变异。
徐怀英秦卓明亓丽红张伟王友令刘金华
关键词:新城疫基因组非编码序列
筛选SHOX基因保守编码序列的增强元件
目的:分析保守编码元件(Conserved noncoding DNA elements,CNEs)的具体定位、数量及筛选对SHOX(short stature homeoboxcontaining gene)基因具有...
李莉
关键词:基因表达

相关作者

陈润生
作品数:130被引量:655H指数:12
供职机构:中国科学院生物物理研究所
研究主题:非编码RNA 基因组 生物信息学 大数据 RNA
徐刚标
作品数:121被引量:1,012H指数:18
供职机构:中南林业科技大学
研究主题:杉木 银杏 南方红豆杉 伯乐树 种子园
何亚文
作品数:71被引量:144H指数:6
供职机构:上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室
研究主题:申嗪霉素 黄单胞菌 DSF 生物合成 代谢产物
马欢
作品数:4被引量:6H指数:1
供职机构:河北医科大学
研究主题:GFP ALU 非编码序列 活化 顺式
张细权
作品数:453被引量:1,363H指数:19
供职机构:华南农业大学
研究主题:分子标记 SNP 多态性 性状相关 屠体性状