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搜索到101篇“ 贵州分离株“的相关文章

牛支原体贵州分离株P33基因的克隆及遗传进化分析被引量：1: 2023年; 为了解牛支原体贵州分离株的遗传进化情况,对其P33基因进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD19-T载体,筛选阳性克隆质粒进行基因序列和同源性分析,构建遗传进化树。结果:牛支原体贵州株P33基因PCR产物长度约690 bp(命名为GZ-Mb),与湖北株HB0801、Hubei-1同源性为99.6%,且在同一进化分支。结论:牛支原体贵州株P33基因与湖北株同源性最高,亲缘关系最近。; 韩帅博成虹松王婕万芝灵罗怡泓盛伊果牟真权程振涛; 关键词：牛支原体贵州分离株克隆遗传进化

伪狂犬病病毒贵州分离株与疫苗株遗传进化和抗原表位分析被引量：1: 2023年; 【目的】了解贵州省猪群伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株与疫苗株的分子特征,探究贵州省PRV变异株的遗传演化情况并对比其与疫苗株抗原差异性。【方法】通过分子克隆和生物信息学技术对本实验室在2015-2021年间贵州省分离到的5株PRV毒株的gB、gC、gD基因和商品化疫苗株(C株和HB2000株)进行克隆测序,利用本实验室序列库中的2株PRV贵州株及GenBank上登录的疫苗毒株序列,进行系统遗传进化和B细胞线性抗原表位差异性分析。【结果】结果显示,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的核苷酸序列相似性分别为98.1%~100%、94.7%~100%和98.8%~100%,7株贵州株与疫苗株gB、gC、gD全基因组的氨基酸序列相似性分别为96.4%~100%、90.9%~100%和97.0%~100%;氨基酸替换分析结果显示,7株PRV贵州株和疫苗毒株间gB、gC、gD基因存在56、68和23处氨基酸位点差异,其中gC基因氨基酸位点差异最大;GZQX2017株缺失gE基因,在遗传进化树中GZQX2017株与Bartha-K61、Becker和NIA3等国外株位于同一大进化分支,属于PRVⅠ型;其余6株贵州株gE基因在第48和496位各插入1个天冬氨酸(D),符合流行变异株的基因特征,与国内流行PRV变异株位于另一大进化分支,属于PRVⅡ型;以GZQX2017株gB、gC、gD全基因作为目标基因,以Bartha-K61株作为主要亲本、Fa株作为次要亲本,gB、gC全基因均能检测到重组信号,gD全基因重组信号不明显;相比Bartha-K61株,gB、gC、gD蛋白抗原表位数量和位点存在差异。【结论】7株PRV贵州株中,GZQX2017株与疫苗Bartha-K61株、C株属于PRVⅠ型,GZQX2017株可能是由Bartha-K61株为主要亲本进行重组产生的gE基因自然缺失株,后续有望将其作为候选疫苗株进行进一步研究;其余6株贵州株与Fa株、HB2000株等属于PRVⅡ型,具有流行变异毒株的流行特征。本研究结果对了解中国贵州省流行PRV毒株分子特征具有十分重要的意义。; 张婧旭徐玉梁海英曾智勇汤德元王彬徐松平万娟祝羊; 关键词：遗传进化

安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析被引量：1: 2022年; Fiber2蛋白是禽腺病毒血清4型(FAdV-4,又称安卡拉病毒)重要的免疫原蛋白,为深入了解FAdV-4贵州株Fiber2基因的遗传变异情况,本研究利用PCR技术扩增FAdV-4贵州晴隆株(GZ-QL)Fiber2基因,胶回收后将其连接至pMD19-T载体,转化入DH5α筛选阳性克隆质粒,经质粒PCR及双酶切鉴定后进行DNA测序,然后对测序结果进行生物信息学分析。结果显示,GZ-QL株Fiber2基因全长为1 440 bp,与四川分离的SCnj1601强毒株、北京分离的NIVD2强毒株Fiber2基因核苷酸同源性均为100.0%,与FAdV-4经典ON1株Fiber2基因核苷酸同源性为95.9%,两者位于相同进化分支。GZ-QL Fiber2蛋白共有33个氨基酸突变位点,其中,在第11~15位之间有5个氨基酸插入;蛋白质亲水性平均值为-0.031,其二级结构以无规则卷曲为主(占51.8%),无跨膜结构域或信号肽,抗原表位分布均匀,预测有8个优势抗原表位区域,且集中于N端。以上结果表明,FAdV-4贵州株GZ-QL Fiber2蛋白在禽腺病毒血清4型内相对保守且抗原性良好,具备成为优势抗原的潜力。; 方天何玲尹德晶岳筠朱二鹏文明程振涛; 关键词：生物信息学分析

鸭疫里默氏菌贵州分离株OmpA基因的克隆及生物信息学分析被引量：1: 2022年; 为了解鸭疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer,RA)贵州分离株OmpA基因遗传特性和用作基因工程亚单位疫苗开发的可能性,以13株RA贵州分离株(RA-SS-1~12株和RA-AS-1株)为研究对象,用RA OmpA基因特异性引物对13株RA贵州分离株进行PCR扩增,将扩增得到的OmpA基因片段与pMD19-T载体连接,转化大肠埃希氏菌DH5α感受态细胞,经PCR和双酶切鉴定为阳性克隆后进行测序;用生物信息学软件将13株RA贵州分离株与国内外15株参考株OmpA基因序列进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析,并对RA OmpA蛋白进行理化性质分析、跨膜结构和信号肽预测、B细胞抗原表位预测、二级和三级结构预测。结果表明,13株RA贵州分离株OmpA基因全长均为1164 bp,可编码387个氨基酸,株间核苷酸同源性为100%,与参考株GZ-RA8、GZ-RA9、GZ060302、SD-RA2018和Yb2株的同源性达100%”;RA OmpA蛋白属亲水性蛋白,无跨膜和信号肽区域,含有较多的优势抗原表位结构,且OmpA基因高度保守并具有良好的抗原特性,其可作为制备RA基因工程亚单位疫苗的候选蛋白。; 马光强刘丽娟陈国权吴良涛杨均刘军泽李潇蒙潘成文周碧君; 关键词：鸭疫里默氏菌生物信息学分析

PRRSV贵州分离株GZZJ11、GZBJ12对解旋酶DDX6、Mov10的影响: 猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome，PRRS)，又叫“猪蓝耳病”，是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and ...; 张升波; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒; 文献传递

2株PEDV贵州分离株M基因的克隆及相似性分析: 2018年; 为了解贵州省猪流行性腹泻病毒（PEDV）分离株M基因的变异及分子进化情况,试验采用RT-PCR扩增、目的基因克隆与测序及生物信息学软件对贵州省分离的PEDV-GZAS株和PEDVGZHZ株M基因进行序列分析。结果表明：经RT-PCR扩增,得到的片段大小为695 bp;测序结果证实,贵州分离株M基因核苷酸序列大小为695 bp;贵州分离株PEDV-GZAS株与PEDV-GZHZ株之间同源性为84.2%;PEDV-GZHZ株与瑞士疫苗株（AF353511）之间的同源性为97.7%,与中国贵州（KF150217）、泰国（FJ158546）和美国（KF272920）分离株同源性最高为99.4%;贵州分离株PEDVGZAS株与瑞士疫苗株（AF353511）之间的同源性为97.5%,与中国贵州（KF150217）、泰国（FJ158546）和美国（KF272920）分离株同源性最高为99.3%;此次分离的2株分离株都与中国河南（EU287429）分离株同源性最低为83.1%。PEDV贵州分离株PEDV-GZAS株M基因与泰国（FJ158546）分离株遗传进化关系最近,与中国河北（JF508465）分离株亲缘关系较近;PEDV-GZHZ株与PEDV-GZAS株及参考毒株之间遗传进化关系较远。; 杨伟汤德元曾智勇王彬黄涛龙冬梅石远菊胡玲玲叶丽; 关键词：M基因克隆

猪瘟病毒贵州分离株E2基因的克隆及同源性分析: 2018年; 为了解贵州分离株E2基因的变异及分子进化情况,试验对贵州分离的CSFV-GZA株E2基因进行克隆与测序,并采用生物信息学软件对测序结果进行分析。结果表明：贵州分离的CSFV-GZA株E2基因与参考猪瘟病毒E2基因的核苷酸同源性在82.8%~83.4%之间,氨基酸同源性在88.7%~90.6%之间,经遗传进化树分析得出贵州分离株E2基因与参考毒株之间差异较大。说明猪瘟病毒贵州分离株与此前所分离毒株存在差异。; 胡玲玲汤德元曾智勇王彬黄涛韦冠东龙冬梅石远菊杨伟叶丽; 关键词：猪瘟病毒 E2基因同源性

猪伪狂犬病毒贵州分离株gE基因的克隆及遗传信息分析被引量：1: 2018年; 为了解贵州地区猪伪狂犬病毒的分子流行现状,本研究提取实验室分离并保存的PRV GZJS2017株病毒核酸作为PCR扩增模板,并对其进行TA克隆、序列测定和用生物学软件进行遗传信息分析。结果表明:本次分离得到的GZJS2017株gE基因所测长度1740 bp,GC含量为73.97%,通过系统进化树分析结果显示PRV不同地域毒株之间同源率达98.8%~99.9%,说明该毒株gE基因具有高度的保守性。本研究可为今后深入开展PRV gE基因的功能研究提供一些依据。; 敖清莹曾智勇徐国杨霞何祥艳何小莉张爱琼咸文叶百川; 关键词：猪伪狂犬病毒 GE基因克隆

大鲵虹彩病毒贵州分离株MCP基因的克隆与原核表达被引量：4: 2017年; 根据Gen Bank中大鲵虹彩病毒主衣壳蛋白MCP(major capsid protein,MCP)基因序列(序列号:KF512820),设计一对特异性引物,以大鲵虹彩病毒贵州分离株基因组DNA为模板,PCR扩增大鲵虹彩病毒MCP基因并测序,与Gen Bank中大鲵虹彩病毒MCP基因进行比对,然后将其亚克隆到原核表达载体p ET-32a(+)中,转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,经IPTG诱导后进行Western blot分析。结果显示:PCR扩增出长度为1 392 bp的片段,与Gen Bank中大鲵虹彩病毒MCP基因核苷酸序列相似性为99.7%~99.9%,SDSPAGE电泳显示该重组蛋白的相对分子质量约为67×103。免疫原性检测结果表明,该重组蛋白可与兔抗大鲵虹彩病毒阳性血清特异性反应,具有免疫原性。; 余波王芳康超李永霞周思旋; 关键词：原核表达免疫原性

大鲵虹彩病毒贵州分离株MCP基因的克隆与B细胞表位预测: 2016年; 为了研究大鲵虹彩病毒(GSIV)MCP基因以及预测其B细胞表位,试验采用PCR方法扩增大鲵虹彩病毒MCP基因,采用生物学软件对大鲵虹彩病毒MCP基因的氨基酸序列进行B细胞表位预测分析。结果表明:扩增产物大小为1 392 bp,将该序列与Gen Bank中大鲵虹彩病毒MCP基因中的中国分离株核苷酸相似性为99.8%。MCP蛋白有多个抗原表位位点,抗原性指数较高,而这些区域可能是B细胞抗原表位区域。说明预测的结构、亲水性、柔性区域和抗原指数可用于大鲵虹彩病毒亚单位疫苗和分子诊断试剂的研究。; 王芳康超余波李永霞周思旋; 关键词：B细胞表位预测氨基酸序列

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