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- 一种蛋白质-蛋白质相互作用位点预测方法及装置
- 本发明涉及蛋白质技术领域，公开了一种蛋白质‑蛋白质相互作用位点预测方法及装置，包括：将待预测蛋白质序列的生物特征矩阵经过多种不同的深度学习模型的输出特征矩阵横向拼接，得到集成特征矩阵；基于待预测蛋白质序列的语义特征矩阵获...
- 杨洋陈梦淇薛亮
- 基于细菌细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的深度突变扫描方法及结合亲和力预测方法
- 本发明公开了一种基于细菌细胞内蛋白质‑蛋白质相互作用的深度突变扫描方法及结合亲和力预测方法。本发明将分裂dCas9蛋白（SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2）分别与待测结合亲和力的受体和配体融合表达，并结合毒性...
- 崔论王玉梁钱英
- 蛋白质--蛋白质相互作用预测算法研究
- 蛋白质是重要的生物大分子，是生命体的重要组成部分。蛋白质-蛋白质相互作用是指两个或多个蛋白质结合的过程，对于细胞内的信号传导、代谢途径、基因表达调控等生命活动有着关键作用。因此，研究蛋白质-蛋白质相互作用对于深入理解生物...
- 狄泽原
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用
- 蛋白质-蛋白质相互作用的分析方法和装置
- 本发明涉及一种通过蛋白质‑蛋白质相互作用分析来分析细胞或组织中信号传导途径的激活状态的方法，一种用于选择个性化的治疗剂和/或用于使用该分析方法监测治疗剂的效果的方法，以及用于其中的装置。
- 李泓沅罗有真
- 基于深度学习的蛋白质-蛋白质相互作用关系预测方法
- 蛋白质相互作用(Protein-protein interactions,PPI)在细胞系统中发挥着至关重要的作用,比如转录、翻译和代谢调节。因此,预测这些PPI相互作用对于理解各种生物过程以及参与疾病发病的分子机制至关...
- OBAMA ABOGO JUAN PABLO NTUTUMU
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用卷积神经网络
- 一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法
- 一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法，首先，根据输入的待测定蛋白质‑蛋白质作用的蛋白质序列信息，生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征；其次，生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基...
- 胡俊樊学强郑琳琳董世建白岩松张贵军
- 邻近标记技术在蛋白质-蛋白质相互作用中的研究进展
- 2024年
- 蛋白邻近标记(proximity labeling,PL)技术是指通过融合特定的催化酶,实现对目标蛋白相互作用蛋白的原位标记,再采用质谱或测序分析鉴定标记蛋白。该技术能够在瞬时动态条件下精确识别蛋白质相互作用,是传统分析手段的重要补充,在蛋白质相互作用研究中具有广阔应用前景。本文介绍了各类PL酶的工作原理、分类及优缺点;论述了该技术在研究蛋白质与蛋白质相互作用中的应用;讨论了PL技术的优势、目前存在的问题和发展趋势,以期为该技术的应用提供参考。
- 董娜张文峰
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用工具酶
- 基于多信息融合的人类-病毒蛋白质-蛋白质相互作用预测研究
- 人类-病毒蛋白质-蛋白质相互作用的预测对于探索病毒感染机制意义重大,因此预测人类-病毒蛋白质-蛋白质相互作用是一个必要且具有实际价值的研究课题。由于确定人类-病毒蛋白质-蛋白质相互作用的传统方法非常复杂和昂贵,因此模型的...
- 来佳丽
- 核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
- 2024年
- 蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列。由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域。核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质。之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了PPI的高通量检测。这一技术推动了PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持。本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势。
- 李林鑫秦晓红米立志
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用
- 一种基于邻近标记技术研究smad3蛋白质-蛋白质相互作用的方法
- 本发明提供了一种基于邻近标记技术研究smad3蛋白质‑蛋白质相互作用的方法，属于生物技术领域。本发明在Smad3KO细胞系的基础上建立了Smad3‑Turboid生物素酶系统，采用邻近标记技术研究与smad3蛋白质相互作...
- 王丽李健春王洪连缪捷
