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蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品
本申请公开了一种蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品,应用于人工智能领域。该方法包括:获取蛋白质框架,以及提取蛋白质框架的蛋白质特征;获取靶点蛋白序列,以及提取靶点蛋白序列的靶点蛋白特征;融合蛋白质特征与靶点蛋白特...
吴凡迪赵宇肖阳
杂交蛋白质设计
本申请提供了一种方法,其可包括:应用蛋白质序列计算模型以基于输入蛋白质序列来生成多个提出的蛋白质序列。可基于所述多个提出的蛋白质序列来识别针对输出蛋白质序列的至少一部分中的每个位置的一组可能的氨基酸残基。可通过以下来生成...
S·P·凯洛D·J·贝伦贝格S·内尔利A·P·莱弗-费J·B·马奎尔M·F·中远A·M·沃特金斯J·H·李S·R·拉H·V·德威尔M·M·李K·赵R·A·邦诺V·格利戈里耶维奇
蛋白质设计方法、装置、设备和介质
本公开提供了一种蛋白质设计方法、装置、设备和介质,涉及人工智能领域,具体为深度学习、生物计算和大语言模型等技术领域。生成方法包括:构造多个候选蛋白质,其中每个包括原始蛋白质的第一链和基于原始蛋白质的第二链构造的非天然序列...
薛洋崔超方晓敏张肖男
开物成务:2024年诺贝尔化学奖“计算蛋白质设计与结构预测”
2024年
2024年的诺贝尔化学奖颁发给美国华盛顿大学的科学家David Baker,表彰他在“计算蛋白质设计”领域的杰出贡献;以及英国DeepMind公司的两位科学家Demis Hassabis和John M. Jumper,表彰他们在“蛋白质结构预测”领域的突破性成果。
刘源王初
关键词:诺贝尔化学奖蛋白质折叠蛋白质结构预测ROSETTA
蛋白质设计中的口袋预测与计算优化新方法
蛋白质设计蛋白质工程的核心,其主要任务之一是改造天然蛋白质的性质以满足工业生产上的需求,即实现蛋白质的改造与优化。为达此目标,蛋白质配体结合口袋的确定和蛋白质氨基酸的点突变在其中起着重要的作用。由于湿实验对蛋白质配体结...
蔡称
关键词:蛋白质工程
基于氨基酸微环境与EMO神经网络的蛋白质设计方法
本发明属于智能细胞生物识别领域,具体涉及一种基于氨基酸微环境与EMO神经网络的蛋白质设计方法。该方法包括:初始蛋白质原子特征构建,氨基酸微环境特征构建,深度特征构建,MLP分类器分类,共4个阶段。本方法通过蛋白质的结构信...
邓赵红蔡称王士同吴敬未志胜王蕾
大语言模型在蛋白质设计中的应用综述
2024年
蛋白质设计领域,人工智能技术的应用已经催生了一些大模型。蛋白质的计算设计是指利用计算机技术辅助确定蛋白质的氨基酸序列,实现预设的结构和功能的过程。基于计算的蛋白质设计可进行改造设计或从头设计。特定功能的蛋白质快速生成,对生物医学研究、药物开发和生物工程等领域的发展具有重要意义。本文首先从传统计算方法、机器学习方法和深度学习方法对蛋白质的计算设计进行了梳理概述,然后介绍大语言模型的核心架构Transformer,重点分类介绍了蛋白质大语言模型的研究应用,最后对未来的研究重点进行了展望。
张锦雄孟雪莉陈燕韦松键吕丽兰胡小春
关键词:蛋白质序列蛋白质结构
具有区段保留的蛋白质设计
本文提供了一种用于区段保留蛋白质设计的方法,所述方法包括在具有第一残基序列的蛋白质结构内确定一个或多个固定区段和可调整区段。所述蛋白质结构可以被标识为具有期望的特性。蛋白质设计计算模型可以用于生成第二残基序列,所述第二残...
V·格利戈里耶维奇 S·P·基洛 J·H·李 朴芝院 S·R·拉 A·M·沃特金斯 D·贝伦伯格 R·A·博诺 K·楚
2024年诺贝尔化学奖:计算蛋白质设计蛋白质结构预测的新时代
2024年
2024年诺贝尔化学奖授予了三位科学家:David Baker,Demis Hassabis和John Jumper,表彰他们在计算蛋白质设计蛋白质结构预测方面的开创性工作.这一成就不仅突破了人类对蛋白质这一生命基本分子的理解,还在生物技术、药物开发、材料科学等领域引发了革命性变革.
郭福虎
关键词:诺贝尔化学奖蛋白质结构预测
一种蛋白质设计方法、装置、电子设备及存储介质
本申请提供了一种蛋白质设计方法、装置、电子设备及存储介质,该方法包括:将生成的可设计序列加入可设计序列族群中;从可设计序列族群中选取第二设定数量的候选可设计序列;通过对至少部分候选可设计序列进行突变操作和/或重组操作,生...
丁文泽 杨冰 李辉 宋乐

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刘海燕
作品数:47被引量:109H指数:6
供职机构:中国科学技术大学
研究主题:蛋白质 蛋白质设计 氨基酸序列 触觉 合成生物学
来鲁华
作品数:194被引量:376H指数:9
供职机构:北京大学
研究主题:蛋白质 抑制剂 药物设计 分子设计 多肽
陈慰祖
作品数:114被引量:155H指数:7
供职机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院
研究主题:HIV-1 HIV-1整合酶 分子对接 整合酶 蛋白质
王存新
作品数:187被引量:257H指数:9
供职机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院
研究主题:HIV-1整合酶 整合酶 HIV-1 蛋白质 分子对接
王宝翰
作品数:20被引量:31H指数:4
供职机构:中国科学院生物物理研究所
研究主题:神经网络 蛋白质 相对熵 设计方法 蛋白质设计