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搜索到51054篇“ 蛋白质编码基因“的相关文章

调控金针菇蛋白质编码基因表达的物质的应用: 本发明公开了调控金针菇蛋白质编码基因表达的物质的应用。本发明所要解决的技术问题是如何调控金针菇的农艺性状(如改善子实体产量、菌柄长度、菌丝分支距离和/或生长速率)。本发明提供了调控金针菇蛋白质编码基因表达的物质在调控金针...; 刘媛媛宋爽严俊杰谢宝贵江玉姬王守现刘宇高琪

巨桉二肽转运蛋白质编码基因EgNPF8.1的应用: 本发明公开一种巨桉二肽转运蛋白质编码基因EgNPF8.1的应用，属于植物基因工程和生物技术领域。本发明提供的EgNPF8.1基因功能参与了丛枝菌根真菌的侵染和菌根共生体发育过程，基因转录水平分析表明EgNPF8.1受AM...; 谢贤安谢鸿运范晓宁王岳敏唐明陈辉

抑制LsSgp24蛋白质编码基因表达的物质在抗飞虱和条纹病毒中的应用: 本发明公开了抑制LsSgp24蛋白质编码基因表达的物质在抗飞虱和条纹病毒中的应用。本发明所要解决的技术问题是如何抗飞虱和/或条纹病毒。本发明提供了抑制或降低或下调LsSgp24蛋白质含量或LsSgp24蛋白质编码基因表达...; 张莉莉霍岩孟祥旖

基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定被引量：1: 2024年; 目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。; 武乐闵开元柳江枫梁万丰杨晔宏胡刚杨俊涛; 关键词：浸润性乳腺癌生物标志物蛋白质编码基因

蝎蝽次目线粒体蛋白质编码基因的比较研究: 2020年; [目的]本研究旨在对蝎蝽次目11科线粒体基因组中13个蛋白质编码基因(PCG)的密码子使用情况、A+T含量、氨基酸序列和核苷酸序列信息位点以及核苷酸进化速率进行比较研究,同时基于13个PCG序列构建蝎蝽次目系统发育树。[方法]通过GenBank获得蝎蝽次目所有14个代表种的PCG序列,统计蝎蝽次目起始密码子和终止密码子的使用频率。在BioEdit 7.1中计算核苷酸串联序列第一位、第二位、第三位和一二三位密码子A+T含量。在MEGA 6.0中计算核苷酸串联序列和氨基酸串联序列的保守位点、信息简约位点和自裔位点。用软件DnaSP 6.0计算蛋白质编码基因每个位点的非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks),由此分析每个基因的核苷酸进化速率Ka/Ks。在RAxML 8.2.8和MrBayes 3.2.5中分别基于最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树。[结果]蝎蝽次目昆虫起始密码子使用中,ATN的使用频率明显高于GTG和TTG。蝎蝽次目使用的4种终止密码子中,TAA和T的使用频率最高。蝎蝽次目每一位密码子的碱基组成含量表明第三位密码子的AT含量最高,远远高于第一位与第二位密码子。在氨基酸和核苷酸序列中,COI的保守位点数最多,ATP8和ND4L的保守位点数最少;ND5的简约信息位点数最多,其次为ND2和ND4。核苷酸进化速率的分析中,ATP8基因的进化速率最快,COI基因进化速率最慢。ML和BI的系统发育结果基本一致,分支关系如下:(划蝽总科+((蟾蝽总科+蝎蝽总科)+(潜蝽总科+(仰泳蝽总科+固蝽总科))))。[结论]本研究补充了蛋白质编码基因在蝎蝽次目比较线粒体基因组学研究中的不足,揭示了蛋白质编码基因在比较线粒体基因组学研究中的重要性。; 张丹丽李敏张苗苗田菁李悦锐张虎芳; 关键词：线粒体基因组蛋白质编码基因系统发育

普通野生稻线粒体蛋白质编码基因密码子使用偏好性的分析被引量：8: 2019年; 以普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)线粒体基因组为对象,分析其蛋白质编码基因的密码子使用特征及与亚洲栽培稻(O. sativa L.)的差异,探讨其密码子偏性形成的影响因素和进化过程。结果显示:普通野生稻线粒体基因组编码序列第1、第2和第3位碱基的GC含量依次为49.18%、42.67%和40.86%;有效密码子数(Nc)分布于45.32～61.00之间,其密码子偏性较弱; Nc值仅与GC_3呈显著相关,密码子第3位的碱基组成对密码子偏性影响较大;第1向量轴上显示9.91%的差异,其与GC_(3s)、Nc、密码子偏好指数(CBI)和最优密码子使用频率(Fop)的相关性均达到显著水平;而GC_3和GC_(12)的相关性未达到显著水平。因此,普通野生稻线粒体基因组密码子的使用偏性主要受自然选择压力影响而形成。本研究确定了21个普通野生稻线粒体基因组的最优密码子,大多以A或T结尾,与叶绿体密码子具有趋同进化,但是与核基因组具有不同的偏好性。同义密码子相对使用度(RSCU)、PR2偏倚分析和中性绘图分析显示,普通野生稻线粒体基因功能和其密码子使用密切相关,且线粒体密码子使用在普通野生稻、粳稻(O. sativa L. subsp. japonica Kato)和籼稻(O. sativa L. subsp.indica Kato)内具有同质性。; 金刚王丽萍龙凌云吴凤唐玉娟覃剑峰危丹妮黄秋伟苏文潘; 关键词：普通野生稻线粒体基因组密码子偏好性

病毒蛋白质编码基因预测算法的研究: 对病毒基因组的深入研究在许多方面都有很大帮助，特别是在治疗由病毒感染引起的人类疾病方面。随着病毒数据的快速积累，需要更加有效的基因识别方法来处理和挖掘这些数据。在本文中，我们提出了一个新的病毒基因预测和注释系统——Vga...; 高依舟; 关键词：病毒检测基因识别功能注释

细菌蛋白质编码基因识别系统的研究: 基因识别是对DNA序列进行分析，获取其中重要信息的第一步。目前测序技术的发展使得测序数据呈爆发式增涨，然而实验方法无法快速有效的从海量信息中获取知识，基于此运用计算机技术来识别基因的方法应运而生。在2015年，我们课题组...; 袁亚洲; 关键词：基因识别 DNA序列

柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法被引量：35: 2017年; 为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。; 傅建敏索玉静刘慧敏谭晓风; 关键词：柿属植物叶绿体密码子偏好性

Shewanella loihica PV-4基因组蛋白质编码基因重注释: 对原核生物基因组蛋白编码基因的预测工作已经持续了近30年。由于缺少内含子，人们一直以为原核生物基因预测相对简单，然而，越来越多的研究表明不同的基因预测算法得到的基因预测结果差别较大，造成预测结果假阳性和假阴性的不断积累，...; 刘青斌

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