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蛋白质结构预测方法和装置
本申请公开了一种蛋白质结构预测方法和装置,该方法包括:获取第一氨基酸序列;基于第一氨基酸序列中多个氨基酸在第一氨基酸序列中的上下文关系,生成第一多序列比对MSA数据;基于第一MSA数据分别进行N次预测,得到蛋白质的N个3...
张骏刘思睿王紫东倪宁曦于璠王敏陈梦云余家良楚浩田高毅勤
蛋白质结构域识别方法、系统、存储介质和设备
本发明提供了一种蛋白质结构域识别方法、系统、存储介质和设备。所述方法包括:通过基于密度塔和原子塔的双塔网络,获取密度图嵌入及原子结构嵌入,并进行跨模态对齐;基于跨模态对齐后的密度图嵌入及原子结构嵌入,构建知晓密度图的结构...
张强锋代沐芷徐魁
蛋白质结构预测方法、电子设备、存储介质及程序产品
本申请实施例提供了一种蛋白质预测方法、电子设备、存储介质及程序产品,应用于电子设备,该方法包括:获取待测氨基酸序列;将待测氨基酸序列输入预测模型中,预测模型用于提取待测氨基酸序列的特征信息(例如进化信息、氨基酸的物理性质...
马剑鹏徐罡
用于蛋白质结构预测的方法、设备和计算机程序产品
提出了一种用于蛋白质结构预测的方法。在该方法中,针对扩散过程,基于与目标蛋白质的氨基酸有关的组成信息,获取目标蛋白质的初始结构。基于组成信息和针对目标蛋白质的力场预测,对初始结构执行扩散过程。基于扩散过程的结果,确定目标...
汪励颢王晏沈宇宁王逸群顾全全
蛋白质结构中的结合位点的识别
一方面,提供了一种用于识别蛋白质分子的特定构象中能够在化合物与所述蛋白质分子之间形成稳定结合的残基的方法。所述方法可以包括从所述蛋白质分子的所述构象中识别一个或多个残基以包括在扰动集中,所述一个或多个残基表现出满足一个或...
B·T·沃尔特斯
浅谈2024年诺贝尔化学奖——通过计算模拟和人工智能破译蛋白质结构的奥秘
2025年
蛋白质是生命活动的主要承担者和执行者,蛋白质的三维结构与其生物学功能息息相关。2024年诺贝尔化学奖的一半奖项授予了DeepMind公司的DemisHassabis博士和JohnJumper博士,以表彰他们在蛋白质结构预测领域的突破性贡献;另一半奖项则授予了华盛顿大学的David Baker教授,以表彰他在蛋白质计算设计领域的系统性研究。本文简要回顾了蛋白质结构预测与设计这两个互逆问题研究历程的重点事件,并对它们的前沿应用进行了展望。
王冯璋刘源王初
关键词:诺贝尔化学奖蛋白质折叠蛋白质结构预测ROSETTA
一种抗菌肽的蛋白质结构特性及其研究方法
本发明涉及生物技术领域,公开了一种抗菌肽的蛋白质结构特性及其研究方法,通过收集生物样品,将生物样品进行预处理,采用离子交换层析技术根据抗菌肽的电荷性质进行分离,对离子交换层析得到的洗脱液进行凝胶过滤层析,对凝胶过滤层析得...
何伶杰
复合体蛋白质结构确定方法、装置、电子设备和存储介质
本公开涉及一种复合体蛋白质结构确定方法、装置、电子设备和存储介质,确定复合体蛋白质的电子密度图和组成复合体蛋白质的多个氨基酸序列,提取电子密度图中位于主链的支撑点,按照预设的预测顺序依次匹配每个氨基酸序列对应的支撑点,并...
郭良越李盼刘海宾郭春龙
一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质
本发明提供一种优化蛋白质结构预测的方法、系统、设备和存储介质,方法包括:修改完善openfold代码以实现对第二代深度学习神经网络结构alphafold2的初步跑通;将openfold中的数据进行切分以进行初步显存优化;...
刘鑫
预测结合亲和力的基于靶向蛋白质结构的候选物质发掘系统及其操作方法
一种预测结合亲和力的基于靶向蛋白质结构的候选物质发掘系统的操作方法,可以包括如下步骤:显示接收对靶向蛋白质实施对接的多个配体的第一画面;根据用户通过第一画面输入的设定,对所述多个配体依次实施分子对接并运算预估的结合能;在...
崔载文朴英斌成哲黎文香陈忠瑞尹裕敬朴辰熙乔纳森·威廉图努祖普·沙迪耶夫

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研究主题:蛋白质结构 蛋白质结构预测 构象 残基 能量函数
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作品数:152被引量:49H指数:5
供职机构:浙江工业大学信息工程学院
研究主题:蛋白质结构预测 蛋白质结构 构象 能量函数 残基
郝小虎
作品数:178被引量:29H指数:3
供职机构:浙江工业大学
研究主题:蛋白质结构 蛋白质结构预测 构象 蛋白质构象 种群
刘俊
作品数:146被引量:29H指数:3
供职机构:浙江工业大学
研究主题:蛋白质结构预测 蛋白质结构 能量函数 构象 残基
胡俊
作品数:157被引量:13H指数:2
供职机构:浙江工业大学
研究主题:残基 蛋白质结构 蛋白质结构预测 能量函数 蛋白质