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用于制备用于蛋白质 组 分析 的液体蛋白质 样品的方法、装置和计算机软件 蛋白质 组 分析 的液体蛋白质 样品的方法提供了一种制备用于蛋白质 组 分析 的液体蛋白质 样品的方法。该方法包括：将液体蛋白质 样品泵入加热管，其中该液体蛋白质 样品包含多个部分；在该加热管中孵育该液体蛋白质 样品，其中该样品的第一...阿萨希毛孢子菌响应氟康唑胁迫的蛋白质 组 分析 2025年 蛋白质 组 学的影响,从蛋白 层面揭示T.asahii对氟康唑胁迫的响应过程及唑类耐药机制。方法以T.asahii AS 2.2174作为研究菌株,基于微量液基稀释法测定氟康唑的最低抑菌浓度(MIC)。应用串联质谱标签(TMT)技术结合液相色谱与串联质谱(LC-MS/MS)技术检测氟康唑(1×MIC)处理前后T.asahii蛋白 丰度的变化。以差异倍数≥1.20或≤0.83,且P<0.05作为筛选标准,鉴定差异表达蛋白 (DEPs)。对DEPs进行Gene Ontlogy(GO)和京都基因与基因组 百科全书(KEGG)富集分析 ,以了解DEPs的生物学属性以及DEPs参与的主要生物学通路。最后,使用多反应监测(MRM)技术对目标差异蛋白 进行靶向验证。结果氟康唑对T.asahii AS 2.2174的MIC值为8μg/ml。共鉴定到DEPs 196个,其中上调DEPs 93个,下调DEPs 103个。功能富集分析 提示DEPs主要参与甾醇合成与代谢、药物代谢、应激反应、能量代谢及翻译等生物学过程。目标差异蛋白 在MRM靶向验证和TMT-LC-MS/MS检测中具有一致的表达趋势。结论在氟康唑胁迫下,T.asahii蛋白 丰度发生显著改变。生物信息学分析 揭示了T.asahii响应氟康唑胁迫的复杂分子机制,这些机制对于了解T.asahii唑类耐药性及挖掘新的药物靶点提供了重要见解。关键词：阿萨希毛孢子菌 蛋白质组学 多反应监测 一种基于AIE光催化剂的高尔基体蛋白质 组 分析 方法 蛋白质 组 及其介导分泌蛋白质 组 鉴定的新型化学标记方法——基于聚集诱导发光(AIE)分子的光催化邻近标记。该方法利用具有AIE特性且可高效靶向高尔基体的光敏剂，在可见光激发下催化产生单线态氧或发生单...一种基于硫酸软骨素的光催化剂的高尔基体蛋白质 组 分析 方法 蛋白质 组 分析 方法，公开了一种基于硫酸软骨素(CS)的光催化剂的制备方法，并同时将该材料用于的高尔基体蛋白质 组 原位分析 。在可见光激发下，该材料催化产生单线态氧或发生单电子转移反...非细胞毒性浓度AFB_(1)暴露下H1N1型猪流感病毒感染3D4/21细胞的蛋白质 组 分析 2025年 蛋白 转印和TCID50法分别检测猪流感病毒(swine influenza virus, SIV)的NP蛋白 相对表达量和滴度,确定非毒性浓度AFB_(1)暴露对SIV复制的影响。接下来,应用蛋白质 组 学平台下的TMT技术检测SIV感染组 和SIV+AFB_(1)共同处理组 细胞之间的差异表达蛋白 和富集通路,探索AFB_(1)促进SIV复制的可能机制。结果显示,0.01μg·mL^(-1)AFB_(1)对3D4/21细胞无细胞毒性,且能够显著促进SIV复制;TMT检测显示,与SIV感染组 相比SIV+AFB_(1)共同处理组 细胞中242个蛋白 表达上调,327个蛋白 表达下调;进一步通路富集分析 筛选出影响AFB_(1)促进SIV复制的差异通路137条,前5名分别为蛋白 酶体通路、坏死性凋亡通路、多物种细胞凋亡通路、军团杆菌病通路和药物代谢-其他酶通路。其中细胞凋亡相关通路可能是调控AFB_(1)促进SIV复制的关键性通路,随后的DAPI染色试验也证实了这一点。本研究将为早期预防和控制因AFB_(1)污染而加剧的SIV感染奠定基础,并为探讨其他感染性疾病增加的原因提供参考。关键词：H1N1 猪流感病毒 差异表达蛋白 基于转录组 和蛋白质 组 分析 筛选五龙鹅产蛋相关候选基因 2025年 组 和蛋白 组 联合分析 来挖掘五龙鹅产蛋量相关候选基因,为其产蛋性能遗传机制研究提供理论基础。本研究选取200只体重相近的36周龄健康五龙鹅种鹅,记录其36~54周龄产蛋情况。在产蛋后期(54周龄)时,根据产蛋水平,将产蛋量最高的30只鹅定为高产组 ,产蛋量最低的30只鹅定为低产组 ,从高产组 (H)和低产组 (L)鹅中各采集3个卵巢组 织,提取RNA和蛋白质 ,通过转录组 测序(RNA-Seq)和4D-DIA蛋白 组 定量分析 筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和差异表达蛋白 (differentially expressed proteins, DEPs)。之后对筛选的差异基因和蛋白 进行RT-qPCR验证、功能富集分析 和蛋白 互作(PPI)网络的构建与分析 ,筛选鹅产蛋性能相关的候选基因。结果:共鉴定到450个DEGs和333个DEPs,其中,AFAP1、INHA、FNDC1、INHBB在基因和蛋白 水平上表达出相同的差异趋势。富集分析 显示,DEGs和DEPs显著富集到364个GO条目和75个KEGG通路,涉及生殖结构发育(gland development)、性别分化(sex differentiation)、性激素活性(hormone activity)、TGF-β通路(TGF-β signaling pathway)、卵母细胞减数分裂(oocyte meiosis)、GnRH信号通路(GnRH signaling pathway)、孕激素介导的卵母细胞成熟(progesterone-mediated oocyte maturation)等多个与产蛋相关的通路和关键生物过程。选取9个潜在候选基因,对高产组 和低产组 (包含转录组 测序样品)各8个卵巢组 织进行RT-qPCR验证,表达趋势与测序结果一致。基于上述研究结果,本研究最终筛选到6个与五龙鹅产蛋性能密切相关的候选基因(PTTG1、LRP2、TNFSF10、INHA、INHBB、FST),丰富了五龙鹅产蛋性能的相关分子机制。关键词：五龙鹅 转录组 蛋白组 产蛋量 候选基因 以肽的C末端酰胺衍生物为内标的靶向蛋白质 组 分析 方法 蛋白质 组 分析 方法，步骤为：将等量的内标肽段和目标肽段混合，溶解于甲酸水溶液；倍比稀释为一系列浓度梯度的混合溶液，液相色谱质谱联用仪对各个浓度的混合溶液...蛋白质 半胱氨酸及其氧化修饰探针在化学蛋白质 组 分析 中的应用蛋白质 编码氨基酸中是独一无二的。蛋白质 半胱氨酸的硫原子可以呈现多种不同的氧化还原状态,从而表现出广泛的化学反应活性。它们可以很容易地受到诸多的氧化还原机制影响,从而形成各种氧化翻译后修饰...关键词：氧化修饰 NaCl胁迫盐芥的转录组 与氧化还原蛋白质 组 分析 及相关基因功能解析 关键词：盐芥 盐胁迫 转录组 茶树应答茶小绿叶蝉为害的蛋白质 组 分析 2024年 蛋白质 。【方法】以被茶小绿叶蝉侵染0、12、24、36、48 h的都匀毛尖本地种茶树叶片为材料,利用串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术对茶小绿叶蝉侵染茶树叶片后的蛋白质 进行定性定量分析 。【结果】共鉴定出2893个蛋白质 ,0 h与12 h、24 h、36 h、48 h之间分别有0、1、848、849个差异蛋白质 ,共有2622个蛋白质 被注释,其中2360个蛋白 注释到GO数据库,1232个注释到KEGG数据库。GO和KEGG分析 表明茶小绿叶蝉侵染茶树时可能通过差异蛋白质 4-二磷酸胞基-2-c-甲基-d-赤藓糖醇激酶、法尼基二磷酸合成酶、香叶基二磷酸合成酶、香叶基香叶基二磷酸合成酶、过氧化物酶、果胶酯酶、丙二烯氧化环化酶、倍半萜类、三萜类、单萜类、二萜类化合物以及倍半萜和三萜生物合成途径、萜类骨架生物合成途径和单萜生物合成途径来抵御害虫的侵染。【结论】筛选出4个差异蛋白质 (4-二磷酸胞基-2-c-甲基-d-赤藓糖醇激酶、法尼基二磷酸合成酶、香叶基二磷酸合成酶和香叶基香叶基二磷酸合成酶)和萜类化合物可能在应答防御小绿叶蝉侵害时具有重要的作用。研究结果可为揭示茶树应答茶小绿叶蝉为害的分子机制提供理论依据。关键词：茶树 茶小绿叶蝉 蛋白质组 TMT 差异蛋白
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张丽华 作品数：717 被引量：819 H指数：13 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所 研究主题：蛋白质 蛋白质组 肽段 整体柱 蛋白质组学 张玉奎 作品数：1,071 被引量：2,253 H指数：22 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所 研究主题：蛋白质 蛋白质组 肽段 高效液相色谱 整体柱 李建科 作品数：177 被引量：166 H指数：7 供职机构：中国农业科学院蜜蜂研究所 研究主题：蜜蜂 蜂王浆 蛋白质组 蜂箱 双向电泳 叶明亮 作品数：289 被引量：129 H指数：7 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所 研究主题：肽段 蛋白质组学 糖肽 磷酸化 糖基化 刘斯奇 作品数：60 被引量：100 H指数：6 供职机构：中国科学院北京基因组研究所 研究主题：水稻 蛋白质组分析 蛋白质组学 腾冲嗜热厌氧菌 蛋白质组
