搜索到36659篇“ 蛋白质数据库“的相关文章
- 参考蛋白质数据库的构建方法、存储介质、电子设备
- 本发明属于生物技术领域,特别涉及一种参考蛋白质数据库的构建方法,包括如步骤:S2、获取公共数据库中的SNP位点信息,对SNP位点进行筛选,得到导致编码氨基酸改变的SNP位点列表;S3、在SNP位点列表中根据样品的蛋白丰度...
- 戚良
- 一种基于近红外快速检测组织蛋白中蛋白质数据库的建立方法与应用方法
- 本发明公开了一种基于近红外快速检测组织蛋白中蛋白质数据库的建立方法与应用方法,包括:建模集和验证集,收集一定数量的建模样品,分别测定组织蛋白样品的近红外光谱和化学分析值,将近红外光谱数据信息与化学测定值一一对应建立对应关...
- 江猛全志远刘春燕蒋翠翠常刚李欢欢王俊坤王晓杨林波吴亮华
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- 戚良
- UniProt蛋白质数据库简介被引量:44
- 2019年
- UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot和TrEMBL两个子库。Swiss-Prot子库中50多万条序列均由人工审阅和注释,而TrEMBL子库中1.4亿多条序列是由核酸序列数据库EMBL中的蛋白质编码序列翻译所得,并由计算机根据一定规则进行注释。UniParc归档库将存放于不同数据库中的同一个蛋白质归并到一个记录中以避免冗余,并赋予序列唯一性特定标识符。UniRef参考序列集按相似性程度将UniProtKB和UniParc中的序列分为UniRef100、UniRef90和UniRef50三个数据集。UniProt网站为用户提供了高效实用的高级检索系统和大量帮助文档。UniProt数据库每4周发布新版的同时也发布统计报表,用户可通过统计报表了解该数据库的数据量及更新情况、数据类别和物种分布等基本信息,查看常规注释信息、序列特征注释信息和数据库交叉链接等统计数据。UniProt是目前国际上序列数据最完整、注释信息最丰富的非冗余蛋白质序列数据库,自本世纪初创建以来,为生命科学领域提供了宝贵资源。
- 罗静初
- 关键词:数据库蛋白质序列蛋白质功能
- 肾虚睾丸表达的差异蛋白质数据库及其构建方法
- 本发明涉及一种肾虚睾丸表达的差异蛋白质数据库及其构建方法,选取氢化可的松诱导的肾阴虚模型和肾阳虚模型,采用iTRAQ技术、蛋白互作网络和聚类分析手段比较正常模型、肾阴虚模型和肾阳虚模型睾丸表达的差异蛋白,从而获得肾虚睾丸...
- 马静贾瑊陈昌波
- 核糖体相互作用蛋白质数据库的构建
- 核糖体是细胞中合成蛋白质的必要细胞器,也是许多抗生素的作用靶点,现有的靶向核糖体的抗生素一般作用于蛋白质的翻译过程。近年来,对核糖体组装的调控已被证实对核糖体的功能有重要影响,因而可用于新药物靶点的发现。而新靶点的发现对...
- 黄巾帼
- 关键词:核糖体蛋白质-蛋白质相互作用数据库耐药性药物靶点
- 蛋白质数据库(PDB)在基础生物化学课程教学中的应用被引量:8
- 2018年
- 蛋白质的结构与功能是基础生物化学课程教学中的重点和难点,对生物化学课程知识体系的构建起至关重要的作用。蛋白质分子结构抽象,功能复杂,文章将蛋白质结构数据库中丰富的立体结构资源引入课程教学,对于提升学生的学习兴趣和教学效果起积极作用。
- 张斌黄伟伟
- 关键词:生物化学蛋白质PDB
- 一种位点注释的蛋白质数据库用于磷酸化肽段的鉴定被引量:2
- 2015年
- 磷酸化修饰的分析一直是蛋白质组学研究的热点之一。在鸟枪法的蛋白质组学研究中,通过在数据库检索中设定磷酸化为可变修饰可以直接鉴定磷酸化修饰的位点。但是翻译后修饰的引入会增加数据检索空间,造成鉴定灵敏度的降低。为了解决这一问题,我们构建了一种位点注释的数据库,这种数据库包含蛋白质的磷酸化位点信息,并开发了一种新的数据库检索策略用于磷酸化肽段的可靠鉴定。用不同类型的数据作为分析对象,通过Mascot检索软件对这种新的数据库检索策略进行了考察,证明了这种方法在保证鉴定结果可靠性的前提下提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。
- 程凯王方军边阳阳叶明亮邹汉法
- 关键词:蛋白质组学磷酸化
- 真核模式生物蛋白质数据库统计规律研究被引量:1
- 2014年
- 目的:根据NCBI Refseq基因集的蛋白质序列数据,构建包含11种真核模式生物在内的基因、蛋白质信息数据库(EPD),探讨各种模式生物的蛋白质序列长度频率分布,并以此来探讨在生物进化过程中,蛋白质序列长度的变化趋势。方法:通过计算机编程软件提取不同种类生物基因总数、有实验数据支撑的蛋白质序列(标记为NP_的序列)数、理论预测的蛋白质序列(标记为XP_的序列)数等相关信息进行统计。结果:对该数据库数据统计规律的研究表明:数据库共有347042个基因,469887个蛋白质,平均每个基因可翻译有1.35个蛋白质;蛋白质序列长度为300-350个氨基酸的最多;长度小于100个氨基酸和大于2500个氨基酸的蛋白质序列很少。结论:模式生物蛋白质序列长度频率分布具有一定规律性;人和爪蛙的蛋白质长度频率分布曲线形状最相似;从蛋白质长度频率分布曲线的靠近程度上看,人与小鼠更接近;生物偏好使用中等长度的蛋白质序列。
- 冯立芹李宏
- 关键词:真核生物数据库
- 凋亡蛋白质数据库的建立及亚细胞定位预测
- 二十世纪末,随着大量的蛋白质序列和核酸序列涌入公共数据库,人类进入了后基因时代。生物信息学作为后基因时代的核心技术,目的是分析和解读蛋白质和核酸序列中所表达的关于结构和功能的信息,而蛋白质的功能与其亚细胞定位是密切相关的...
- 宋孟丽
- 关键词:真核细胞亚细胞定位组合分类器
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- 张贵军

- 作品数:605被引量:480H指数:13
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- 俞旭锋

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- 迟浩

- 作品数:73被引量:48H指数:4
- 供职机构:中国科学院计算技术研究所
- 研究主题:蛋白质鉴定 肽段 质谱 肽谱 蛋白质序列
- 徐东伟

- 作品数:241被引量:36H指数:3
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- 研究主题:道路交通流 网络 道路交通 构象 交通状态