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- 蛋白质二级结构预测
- 该文的研究分两个部分:一是将遗传神经网络用于蛋白质二级结构预测;二是考虑位于同一二级结构的残基间的相互作用,进一步提高预测正确率.全文共分四章.第一章介绍了此问题的历史起源和已有的一些重要结果.第二章介绍了遗传算法、神经...
- 王龙会
- 关键词：蛋白质二级结构神经网络遗传算法
- 文献传递
- 蛋白质二级结构预测
- 牛卫东
- 一种蛋白质二级结构预测方法、装置及计算机装置
- 本发明涉及蛋白质二级结构预测领域，具体涉及一种蛋白质二级结构预测方法、装置及计算机装置，提高了蛋白质二级结构预测的精确性。方案包括：通过预训练蛋白质语言模型获得给定蛋白质的序列嵌入特征；通过位置特定评分矩阵的计算方式得到...
- 许龙倩刘勇国李巧勤朱嘉静张云
- 一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统
- 本发明公开了一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统，涉及计算机辅助药物研发技术领域。包括获取待预测的目标蛋白质序列，将待预测的目标蛋白质序列输入预构建的基于Transformer的多类不平衡蛋白质二级结构预测模型，获...
- 何朝政 赵君研 肖秦琨 付玲
- 一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统
- 本发明公开了一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统，涉及计算机辅助药物研发技术领域。包括获取待预测的目标蛋白质序列，将待预测的目标蛋白质序列输入预构建的基于Transformer的多类不平衡蛋白质二级结构预测模型，获...
- 何朝政 赵君研 肖秦琨 付玲
- 基于多任务深度学习的蛋白质二级结构预测方法
- 本发明提供一种基于多任务深度学习的蛋白质二级结构预测方法，包括如下步骤：1)数据预处理与特征编码2)构建用于蛋白质二级结构预测的多任务深度学习模型3)模型训练、验证与独立测试。本发明属于生物信息学领域，本发明提供的基于多...
- 王珣冯润秋
- 一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法
- 一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法，首先根据输入的待进行二级结构预测的蛋白质序列，使用独热编码方式对蛋白质序列进行编码，获取一个L×20的特征矩阵M<Sub>1</Sub>，使用PSI‑BLAST程序生成蛋白质...
- 胡俊殷文杰贾宁欣曾文武董明张贵军
- 一种基于单氨基酸序列特征的蛋白质二级结构预测方法
- 一种基于单氨基酸序列特征的蛋白质二级结构预测方法，它属于生物信息学领域。本发明解决了由于进化信息特征获取存在局限性且模型忽略了氨基酸序列中二级结构标签之间的相互依赖关系，导致利用现有方法获得的模型预测效果不佳的问题。本发...
- 董本志 苏慧
- 基于深度学习的蛋白质二级结构预测研究
- 蛋白质二级结构作为生命科学领域的重要组成部分，揭示了蛋白质的局部构象，指导和确认了蛋白质的功能，为改造现有蛋白质和进一步设计新型药物分子提供了可靠依据。在深度学习算法的不断发展和输入进化信息的丰富下，利用计算的方法构建氨...
- 赵君研
- 关键词：蛋白质二级结构预测
- 基于多核LSSVM的谷物蛋白质二级结构预测与优化
- 2024年
- 蛋白质的二级结构对其空间结构和功能有着极其重要的影响,利用机器学习方法进行谷物蛋白质二级结构预测是生物和食品领域的重要研究内容。作者在现有蛋白质数据库中选取玉米、小麦、大豆的谷物蛋白质,使用多特征融合方式对蛋白质序列进行特征提取,提出将多核学习与最小二乘支持向量机(LSSVM)相结合,以多个核函数的线性加权组合代替传统单一核函数,利用核权重调整融合效果,构建多核LSSVM模型预测谷物蛋白质二级结构。使用粒子群优化算法(PSO)对模型超参数进行优化,寻找最佳超参数组合提升模型预测性能。研究结果表明,多核LSSVM模型能够改善单一核函数高维映射的局限性,融合各核函数优势,通过PSO算法获取最佳超参数组合。该模型结合多特征提取方式显著提高了谷物蛋白质二级结构预测的Q_(3)准确率。
- 梁俊刘静管骁陈滢滢
- 关键词：谷物蛋白质二级结构多核最小二乘支持向量机粒子群算法
