搜索到106篇“ 蚕豆萎蔫病毒“的相关文章
蚕豆萎蔫病毒2根芹分离物全基因组测序与分析
2025年
[目的]获取蚕豆萎蔫病毒2(broad bean wilt virus 2,BBWV 2)内蒙古根芹(Apium graveolens var.rapaceum)分离物全基因组序列,并将该基因组序列与其它BBWV 2分离物基因组序列进行一致性、系统发育及重组等分析。[方法]以疑似感染病毒的根芹叶片样品为试验材料,利用NGS技术确定样品中感染病毒的种类,通过RT-PCR技术结合cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)验证病毒种类,使用VectorNTI、MEGA11、SDTV1.2以及RDP4等软件对克隆到的BBWV 2内蒙古根芹分离物20IM-ApGr进行全基因组序列分析。[结果]成功克隆了BBWV 2内蒙古根芹分离物20IM-ApGr两条RNA的完整序列;序列一致性分析结果显示,20IM-ApGr与其它分离物在Pro-RdRp区域和CPs区域的氨基酸序列一致率分别为85.2%~99.5%和82.8%~92.7%;基于BBWV 2基因组的Pro-RdRp区域和CPs区域所构建的系统发育树均可以将目前已知的BBWV 2分离物分为2个分支,其中本研究所获得的分离物均处于第II分支,并分别与中国辣椒分离物Hunan、XJ14-3亲缘关系最近。[结论]明确了造成根芹叶脉黄化以及叶片皱缩的病毒性病原为BBWV2,首次获得BBWV 2内蒙古根芹分离物的全基因组序列,并阐述了其与已知的BBWV 2分离物之间的进化关系,可为BBWV 2株系划分、遗传进化研究奠定理论基础。
郭孟泽尹任孙平平张磊李文彪郑莎李正男
关键词:根芹系统发育分析
蚕豆萎蔫病毒2号北京玫瑰分离物的鉴定被引量:1
2024年
为明确引起北京怀柔玫瑰黄化、矮缩的病原,采用小RNA测序和反转录PCR对玫瑰病叶进行鉴定和分析。小RNA测序表明该病害与蚕豆萎蔫病毒2号(broad bean wilt virus 2,BBWV2)的侵染有关。根据深度测序结果,设计特异性引物对其全基因组进行克隆,序列分析表明该分离物基因组RNA1和RNA2分别为5903和3535 nt。基于RNA1和RNA2 CP基因序列的系统进化树分析表明,BBWV2-Rose RNA1与中国沈阳藜分离物BBWV2-CN:SY:Chenopodium album(MN786954)聚为一支,BBWV2-Rose RNA2与中国沈阳藜分离物BBWV2-CN:SY Chenopodium album(MN786955)聚为一支,亲缘关系最近。根据蚕豆病毒属(Fabavirus)的分类标准,该病毒是BBWV2的一个分离物。
梁宇卿孙春辉邓丛良史喜菊种焱李永强
关键词:玫瑰
蚕豆萎蔫病毒2的RT-LAMP检测方法的建立
2024年
蚕豆萎蔫病毒2(broad bean wilt virus 2,BBWV 2)属于蚕豆病毒属(Fabavirus),是地黄和山药上的重要病毒之一,严重影响这些中药材的产量和品质。本研究建立了BBWV 2的环介导恒温扩增(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP)检测方法。根据BBWV 2基因组RNA2上的小外壳蛋白(small coat protein, SCP)基因序列的保守区设计引物,对RT-LAMP的反应温度和时间进行了优化,最佳反应条件为60~65℃反应60 min对其灵敏度、特异性和准确性进行了检测,RT-LAMP方法的灵敏度是常规PCR的10倍,为6.47×10^(3)拷贝·μL^(-1),可特异地检测出BBWV 2,对田间地黄、白术和白芷检测的准确性高于常规PCR,对山药检测的准确性度与常规PCR一致。本研究建立的RT-LAMP是一种特异、灵敏、快速、方便的BBWV 2检测方法,适用于基层科研单位对该病毒的准确检测和诊断。
秦艳红王凤丽张重义刘红彦刘玉霞高素霞文艺李绍建刘永康张德胜鲁书豪赵正伟王飞鲁传涛
河南温县蚕豆萎蔫病毒2的鉴定与多样性分析被引量:1
2024年
蚕豆萎蔫病毒2(broad bean wilt virus 2,BBWV2)属豇豆花叶病毒蚕豆病毒属。2019年7月从河南温县采集20株具有褪绿和皱缩等典型病毒病症状的地黄,采用PCR技术从cDNA中扩增目的片段,有13株样品扩增出与预期大小相符的目的条带,检出率为65%;并通过克隆测序获得BBWV2 CP序列,将其与GenBank中其他48个BBWV2分离物进行序列分析,结果显示有75.4%~82.95%的一致率。系统发育分析表明,BBWV2可分为3个组,其中河南温县BBWV2地黄分离物(No.2279841-China-R.glutinosa-11)位于第Ⅲ组。
邓小龙秦朗王铁霖王智磊蒋润州贺振
关键词:地黄
太子参蚕豆萎蔫病毒检测引物及检测方法
本发明涉及一种太子参蚕豆萎蔫病毒检测引物及检测方法,包括以下序列的引物:内引物FIP:CGAAACATAAACGCTGGGGCGCAATTTT TTTACTACGAACCTGC内引物BIP:CTCTGGCTTTC AAG...
黄颖桢陈菁瑛赵云青刘保财张武君
蚕豆萎蔫病毒-2的RT-LAMP检测引物组及检测方法
本发明公开了蚕豆萎蔫病毒‑2的RT‑LAMP检测引物组,其引物组包括一对外引物BBWV‑2‑F3、BBWV‑2‑B3,一对内引物BBWV‑2‑FIP、BBWV‑2‑BIP和一条环引物BBWV‑2‑LB,成功建立了BBWV...
鲁传涛秦艳红高素霞刘玉霞王凤丽文艺王飞王素霞戚文平李雪梦杨瑾刘国彬
蚕豆萎蔫病毒2号青海辣椒分离物的鉴定与全基因组序列克隆被引量:2
2023年
对青海省循化县的辣椒病毒病进行调查,采集到部分叶片表现萎蔫和皱缩症状的样品,该症状与蚕豆萎蔫病毒2(BBWV2)引起的症状相似。为准确鉴定是否为与该病害相关的病毒,将采集的20个辣椒样品用特异性引物进行RT-PCR检测,其中13个样品检测结果为阳性。在20份循化县辣椒样品中,有13份样品被确认感染了蚕豆萎蔫病毒2(BBWV2)。基于核苷酸序列的系统发育分析表明,检测到的病毒与BBWV2聚类在一起,与其他地区或国家分离物的序列一致性较高,与蚕豆萎蔫病毒1(BBWV1)和野芝麻轻型花叶病毒(LMMV)分离物的序列一致性相对较低。结果表明该辣椒样品感染的病毒是BBWV2。
罗海林袁雷翁华闫佳会郭青云王文清马新明
关键词:辣椒全基因组
葡萄蚕豆萎蔫病毒中国分离物基因组全长序列分析被引量:2
2022年
葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus, GFabV)是近年报道的葡萄新病毒,与葡萄褪绿斑驳、皱缩等症状发生相关,严重影响葡萄长势。本研究采用小RNA测序结合Sanger测序方法分别对表现褪绿斑驳的‘贝达’和无症状的‘赤霞珠’葡萄中的GFabV分离物进行基因组全长序列测定,获得了GFabV分离物LN_BETA2和LN_CXZ的基因组全长序列,其RNA1基因组全长分别为5 824 bp和5 823 bp, RNA2基因组全长分别为3 132 bp和3 135 bp。LN_BETA2与LN_CXZ的RNA1编码的多聚蛋白核苷酸序列之间的同源性为81.7%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性分别为73.4%-99.5%和73.5%-82.5%;LN_BETA2和LN_CXZ的RNA2编码的多聚蛋白核苷酸同源性为83.8%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性为75.0%-83.3%和68.2%-98.6%。系统进化树分析结果显示,在RNA1基因组中,LN_BETA2划分在组3,LN_CXZ形成单独的分支。RNA2基因组中,LN_BETA2和LN_CXZ分别划分在组3和组5中。本研究首次报道了GFabV中国分离物基因组全长序列,可为今后GFabV生物学特性及致病性研究提供工作基础。
张宝东范旭东张尊平任芳胡国君李晨贾晓君董雅凤
关键词:葡萄基因组
葡萄蚕豆萎蔫病毒侵染性克隆构建及致病因子鉴定
葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)是一种近年新发现的病毒,流行发生在我国多个葡萄产区。本研究在获得了GFabV两个分离物的基础上,构建了GFabV的侵染性克隆,并筛选了其致病因子,最后...
张宝东
关键词:侵染性克隆致病因子
一种利用微茎尖与超低温脱除太子参蚕豆萎蔫病毒的方法
本发明提供一种利用微茎尖与超低温脱除太子参蚕豆萎蔫病毒的方法,包括步骤:1)取田间太子参茎段作为组培用外植体,经消毒、培养,获得组培苗,2继代培养获得大量组培苗,微茎尖培养获得微茎尖脱毒苗3)预培养、装载,4)玻璃化,5...
赵云青黄颖桢陈菁瑛刘保财朱景花
文献传递

相关作者

周雪平
作品数:492被引量:2,030H指数:26
供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
研究主题:单抗 杂交瘤细胞株 分泌 双生病毒 病毒
李德葆
作品数:290被引量:2,837H指数:31
供职机构:浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所
研究主题:序列标签 水稻胚乳 水稻 富积 转基因农产品
戚益军
作品数:16被引量:173H指数:7
供职机构:浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所
研究主题:蚕豆萎蔫病毒 蚕豆 中国分离物 烟草花叶病毒 分离物
陈正贤
作品数:63被引量:298H指数:9
供职机构:浙江大学
研究主题:单克隆抗体 氯霉素 酶联免疫吸附试验 多克隆抗体 水稻条纹病毒
吴建祥
作品数:238被引量:533H指数:13
供职机构:浙江大学
研究主题:单抗 杂交瘤细胞株 分泌 单克隆抗体 抗原免疫