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海棠感染苹果茎痘病毒发生与检测: 2024年; 【目的】研究海棠(Malus spp.)上病毒病的种类及田间侵染情况。【方法】利用宏病毒组测序技术结合RT-PCR方法,对采自新疆7个海棠种植区的158份样品进行病毒检测。【结果】宏病毒组测序结果只对比到苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus, ASPV)一种植物病毒。158份海棠样品中巴音郭楞蒙古自治州(简称巴州)、阿克苏地区、喀什地区、昌吉回族自治州(简称昌吉州)、石河子市、伊犁哈萨克自治州(简称伊犁州)、奎屯市ASPV检出率分别为0.00%、12.00%、0.00%、31.71%、29.41%、17.65%和0.00%。在检测的7个种植区中,昌吉州检出率最高,为31.71%;石河子市检出率次之,为29.41%;巴州、喀什地区和奎屯市未检测到ASPV。【结论】海棠上的ASPV在北疆检出率较高,在南疆检出率较低。在观赏海棠样品中检测到ASPV,其病毒检出样本均为田间发病症状叶片,与田间观察到的发病情况相符合,海棠为ASPV的自然寄主之一。; 张李娅刘保军单佳祁王澍顾爱星白剑宇; 关键词：海棠苹果茎痘病毒 RT-PCR 病毒检测

苹果茎痘病毒CP和TGB蛋白在该病毒运动和致病中的功能解析: 苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)是 β-线状病毒科(Betaflexiviridae)凹陷病毒属(Foveavirus)的代表种，主要侵染苹果和梨。一些敏感的苹果和梨植株感染AS...; 李柳; 关键词：苹果茎痘病毒外壳蛋白侵染机制

利用Y2H筛选西方烟中与苹果茎痘病毒CP互作的蛋白: 2023年; 苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)是苹果和梨树上普遍发生的潜隐病毒之一,西方烟(Nicotiana occidentalis)是其重要的草本寄主之一。在本研究中,构建了酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-CP(CP-BD),并从西方烟cDNA文库中筛选与ASPV CP互作的蛋白。经通过酵母双杂交回转验证和NCBI BLAST比对,获得30种可能与ASPV CP互作的西方烟蛋白质,为研究ASPV侵染致病的分子机制及CP在侵染过程中的功能打下基础。; 丁磊孙平平张磊张磊; 关键词：酵母双杂交外壳蛋白苹果茎痘病毒

苹果茎痘病毒RdRp基因分子变异分析被引量：2: 2022年; 苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)是凹陷病毒属β线性病毒科(Foveavirus,Betaflexiviridae)的典型代表。ASPV基因组是正单链RNA(+ssRNA),全长约9300个核苷酸,包含5个开放式阅读框(Open reading frames,ORFs),5′端非翻译区(Untranslated region,UTR)和3′UTR。ORF 1编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)。; 马小方马小方洪霓蒋迎春吴黎明何利刚何利刚于婷婷王志静王志静; 关键词：苹果茎痘病毒

山西苹果茎痘病毒遗传多样性分析被引量：1: 2022年; 苹果茎痘病毒是苹果安全生产的巨大威胁,严重影响苹果产量和质量。探讨苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus, ASPV)在山西省的分布、变异和多样性,可为制定可持续的病毒管理策略提供理论依据。从山西省11个地区采集苹果叶片样品进行RT-PCR检测。结合在线数据库,利用相关软件对文中研究获得的序列进行系统发育、遗传多样性、重组以及种群遗传分化等分析。RT-PCR检测结果显示从山西省11个地区采集的409份苹果叶片样品中,ASPV的检出率为36.33%(临漪)至55.37%(平遥)。选择15个ASPV检测为阳性的样品,分别克隆其CP基因并与22个不同的ASPV分离物进行核苷酸和氨基酸一致性分析,发现37个ASPV分离物的核酸一致率为70.27~96.31%,氨基酸一致率为37.04~96.64%,其中,Shanxi-2与JX673826.1的核酸一致率最高,为90.86%, Shanxi-2与MN617853.1的核酸一致率最低,为70.40%。基于CP的进化树分析结果显示37个ASPV分离物被划分为2个进化群体。遗传多样性分析结果表明ASPV种群发生了收缩,且在两个群体之间呈现较大的遗传差异。ASPV-CP基因受负选择压力影响。该研究结果将为评估山西省ASPV的流行病学特征提供重要线索。; 丁磊崔正秀陈伟吴云锋; 关键词：苹果茎痘病毒外壳蛋白

苹果茎痘病毒在山楂中的首次鉴定与序列分析被引量：6: 2021年; 山楂是我国重要的果树,但山楂病毒的相关研究较少。本研究通过高通量测序及生物信息学分析首次在山楂样品中发现苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)。利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术对ASPV山楂分离物全长序列进行扩增,结果表明,ASPV山楂分离物基因组全长由9290个核苷酸组成,包含5个开放阅读框(open reading frames,ORFs)。ORF1编码与病毒复制相关的蛋白-RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp),其在氨基酸水平上与ASPV苹果和梨分离物的RdRp序列相似性分别为72.8%~80.9%和81.7%~92.8%;ORFs 2~4表达与病毒移动相关的三基因块(triple gene block 1~3,TGB 1~3),其与印度苹果N分离物(LM999967)的氨基酸序列相似性最高,为92.9%~98.2%;ORF5编码外壳蛋白(coat protein,CP),与苹果和梨分离物CP的序列相似性较低,分别为64.8%~88.4%和69.8%~92.2%,高于目前凹陷病毒属病毒新种的划分界限。将ASPV山楂分离物的全长核苷酸序列与其他ASPV分离物的全长序列进行比对,构建系统发育树,结果表明,ASPV山楂分离物与巴西苹果分离物BR-Brae2的亲缘关系最近,但两者核苷酸序列相似性较低(81.5%),说明与其他分离物相比该分离物具有较大的变异性。综上,本研究初步验证了山楂是ASPV的重要自然寄主,并首次获得了ASPV山楂分离物的全长基因组序列,为山楂病毒病诊断和防控策略的制定提供参考。; 高德航何成勇邢飞侯婉莹李世访战斌慧王红清; 关键词：山楂高通量测序苹果茎痘病毒

苹果茎痘病毒内蒙古分离物基因组序列和生物学特征研究被引量：9: 2019年; 利用RT-PCR结合RACE技术获得了苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)内蒙古‘金红’苹果分离物(ASPV-NM)全长基因组序列(登录号:MK239268)。该分离物基因组除去Poly A尾共有9286个核苷酸,与17个已经报道的ASPV分离物全长基因组序列核酸一致性为70.6%~79.2%;基于全长基因组、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因和外壳蛋白(Coat protein,CP)基因分别将分离物ASPV-NM划分到组Ⅲ、组Ⅲ和组Ⅰ;在ASPV-NM基因组中检测到1个显著的重组事件;将ASPV-NM摩擦接种到西方烟37B上,可引起显著的褪绿黄化症状,利用透射电子显微镜可以观察到典型的病毒粒子。; 孙平平鞠明岫马强李正男; 关键词：苹果茎痘病毒 RACE

RNAi抗苹果茎痘病毒表达载体及其在苹果抗病育种中的应用: 本发明属于生物育种领域，具体涉及一种RNAi抗苹果茎痘病毒表达载体及其在苹果抗病育种中的应用，该表达载体由以下步骤制成：（1）RT‑PCR扩增获得目的基因片段；（2）表达载体的构建。该表达载体在苹果抗病育种中的应用方法包...; 田莉莉牛良; 文献传递

苹果茎痘病毒双重RT-PCR检测体系的建立及应用被引量：3: 2019年; 病毒病是危害苹果(Malus domestica)的一类重要病害。已报道的苹果病毒种类很多,在我国发生普遍的主要有苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)、苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)、苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)、苹果花叶病毒(Apple mosaic virus,ApM V)以及苹果锈果类病毒(Apple scar skid viroid,ASSVd)[1~3]。; 胡国君董雅凤张尊平范旭东任芳张梦妍; 关键词：APPLE APPLE PITTING VIRUS RT-PCR VIRUS

苹果茎痘病毒新疆阿克苏分离物基因组全序列测定及分析被引量：3: 2018年; 苹果病毒病在世界各苹果种植地广泛发生,严重影响苹果生产。苹果茎痘病毒（Apple stem pitting virus,ASPV）是一种危害苹果的重要潜隐病毒,是凹陷病毒属Foveavirus的代表种（Adams et al.,2004）,基因组为正单链RNA,长约9 306 nt,编码5个开放阅读框（open reading frame,ORF）。自然寄主有苹果、梨、樱桃和海棠等,被ASPV侵染后一般症状不明显,但生长不良,树势衰退,果实产量和品质下降（郝璐等，2015）。; 龚卓群郝璐谢吉鹏国立耘周涛; 关键词：苹果茎痘病毒全序列测定分离物 VIRUS 开放阅读框

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