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结核分枝杆菌耐药表型预测方法、装置、计算机设备
本申请涉及一种结核分枝杆菌耐药表型预测方法、装置、计算机设备。所述方法包括:根据待处理结核分枝杆菌的基因测序数据,从待处理结核分枝杆菌的目标基因片段的至少一个突变位点中,确定未存在于突变表型注释数据库中的待预测突变位点;...
杨丽石淞元郭俊成邓小龙吴康戴立忠
一种快速鉴定致病菌耐药表型方法
本发明涉及医学技术领域,具体提供了一种快速鉴定致病菌耐药表型方法,包括:通过质谱甄别单元获取致病菌培养前后的蛋白指纹三维图谱;使用人工神经网络对致病菌培养前后的蛋白指纹三维图谱进行分类识别,得到致病菌耐药表型的鉴定结果。...
李进韩宝如吴柯刘雨陇赵峻英何建春谢铌奇杨雷
一种分析病原微生物耐药表型的方法
本发明涉及病原基因检测技术领域,公开了一种分析病原微生物耐药表型的方法,包括以下模块:耐药特征筛选模块,使用曼‑惠特尼U检验方法和多因素方差分析法筛选影响微生物耐药表型的潜在耐药基因特征,使用多重线性分析法构建耐药风险得...
高乾坤剡江梅
机器学习方法在预测细菌耐药表型中的应用
2024年
随着我国经济迅速发展和医疗需求不断增长,人医临床、宠物临床和畜牧养殖行业中抗菌物的使用愈发频繁,导致病原菌耐药问题日趋严峻,造成公共卫生安全隐患。快速、准确的细菌耐药表型检测能够有效指导临床医生对感染性疾病的诊断和治疗,降低由经验用和不合理用引发的耐药风险。然而,现有检测技术耗时较长且操作繁琐,难以在临床中推广,种类单一的快速检测试剂等产品又无法满足临床的多元化需求。因而,亟需开发新的技术方法以提供快速鉴定细菌耐药表型的有效解决方案。细菌的组学信息中蕴含大量与细菌耐药表型相关的特征,从中快速、准确地挖掘相关信息能够为快速诊断和治疗提供帮助。机器学习模型在处理复杂结构数据方面有显著优势,在挖掘组学信息工作中展示巨大应用潜力。随着该领域的快速发展,机器学习方法有望为临床快速、准确地预测耐药表型提供技术支持,助力医生诊疗准确性的提升。本综述系统总结了机器学习模型在细菌耐药表型预测领域的研究现状和发展趋势,并比较了不同机器学习方法的特点和性能,同时归纳总结细菌耐药表型预测建模工作所需的关键要素,为后续相关研究提供参考。
邹之宇张凯英马士珍杨璐陈丝雨吕艳丽吴聪明沈建忠夏兆飞王璐汪洋
关键词:细菌耐药性
耐药表型快速检测敏平板及耐药表型快速检测方法
一种耐药表型快速检测敏平板及耐药表型快速检测方法,用于耐药表型快速检测,在敏平皿内的M‑H琼脂厚度均匀地铺设为3mm构成tMHA。在tMHA上涂布2.0~3.0麦氏单位菌液后贴敏纸片,仅需4~6小时的培养,即可根据...
曾吉景小鹏
一种脱氧核酶探针在大肠杆菌耐药表型高通量传感中的应用
本发明公开了一种脱氧核酶探针在大肠杆菌耐药表型高通量传感中的应用,属于分析检测领域。所述脱氧核酶探针包括如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的脱氧核苷酸链,以SEQ ID NO.2为底物链,SEQ ID ...
刘猛迟艳琛石蒙常洋洋
大熊猫源肠外致病性大肠杆菌的分子分型、耐药表型耐药基因分析
2024年
【目的】明确四川大熊猫源肠外致病性大肠杆菌(Ex PEC)的耐药性与耐药基因流行情况,为大熊猫源Ex PEC感染的临床用提供参考。【方法】从四川省绵阳市和雅安市野外死亡大熊猫的肠外器官采集病料,进行病原菌的分离,通过16S rRNA基因序列分析与Ex PEC多重PCR鉴定,继而对分离的Ex PEC进行系统进化群分群、MLST分型和PFGE分型,并采用K-B法与Wafergen Smartchip超高通量qPCR进行耐药表型测定和耐药基因分析。【结果】分离出9株Ex PEC,系统进化群分别为B2群和A群;MLST和PFGE分型均为3种分子型,其中MLST为ST555、U10和ST127型,PFGE为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型;9株Ex PEC对多黏菌素B、亚胺培南、左氧氟沙星与萘啶酸敏感率达100%;对β-内酰胺类、氨基糖苷类、四环素类等9类抗生素耐药基因(ARGs)的检测发现,β-内酰胺类和多重耐药类ARGs检出率较高。【结论】分离鉴定的9株大熊猫源Ex PEC系统进化群主要为B2群,MLST和PFGE分型主要为ST127/PFGE基因Ⅰ型,具有明显的多重耐药性,且β-内酰胺类和多重耐药类ARGs检出率较高,主要通过抗生素失活(antibiotic deactivate)和抗生素外排泵(efflux pump)两种耐药机制介导耐药性。
王一霖郭向辉彭焜王乙好袁羽刘颂蕊耿毅
关键词:大熊猫分子分型耐药机制
2016~2022年昆明市临床分离铜绿假单胞菌耐药性变迁及交叉耐药表型分析
2024年
目的了解该院七年来铜绿假单胞菌耐药率变化及耐药表型特征,为铜绿假单胞菌感染早期经验治疗提供依据,并为后期耐药机制研究奠定一定的基础。方法使用Whonet 5.6软件按年统计昆明市第一人民医院2016~2022年从临床标本分离并报告的铜绿假单胞菌物敏感性数据,以亚胺培南、美罗培南、头孢他啶及头孢吡肟等物为主要观察对象,统计并分析上述物不同耐药性组合下其它抗生素耐药性情况。结果七年共检出铜绿假单胞菌1920株,其中多黏菌素耐药率最低为1%;阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素平均耐药率分别为6.4%,8.6%,5.1%;喹诺酮类与哌拉西林/他唑巴坦、头孢他啶、头孢吡肟耐药率相似,在10%~20%之间;亚胺培南和美罗培南未显示出更优秀的敏感性,耐药率分别为21.3%和18.4%。各主要抗生素耐药率在七年间存在波动,多数自2017年上升,至2018年达峰值后回落,2020年后趋于平稳并与国内平均水平一致;亚胺培南敏感株1393株,该部分美罗培南敏感率为96.2%;美罗培南敏感株1451株,该部分亚胺培南敏感率为89%。亚胺培南、美罗培南均耐药共369株,该部分头孢他啶敏感率为33.1%。β-内酰胺类抗生素耐药种类越多,阿米卡星、环丙沙星敏感率越低。结论该院铜绿假单胞菌物敏感性总体较好,应坚持严格的抗生素使用管理。氨基糖苷类可作为经验治疗首选物,喹诺酮类次之,碳青霉烯类和头孢他啶亦为备选。该院铜绿假单胞菌对β-内酰胺类抗生素耐药机制呈多样性,碳青霉烯耐药株可由不同机制分别或共同介导。
卢赞赵红燕李春付李代碧贺洋尹利民
关键词:铜绿假单胞菌耐药率交叉耐药耐药表型
新疆石河子宠物源大肠杆菌耐药表型和基因型分析
2024年
为了解石河子市宠物源大肠杆菌耐药现状及耐药基因携带情况,研究收集犬猫肛拭子56份进行大肠杆菌分离培养。采用微量肉汤稀释法测定分离株对16种常用抗菌物的最小抑菌浓度,并用PCR检测其耐药基因携带情况。结果显示:共分离得到50株大肠杆菌(分离率89.29%),其中,50株分离株对氨苄西林的耐药情况最严重(耐药率:52.0%);对氧氟沙星等10种物表现不同程度的耐药,耐药率为10.0%~38.0%。耐药基因检测结果显示,四环素类(tetK、tetM)、β-内酰胺类(blaCTX-M、blaFOX)和磺胺类(sul2)检出率均在30.0%以上。研究表明,石河子市宠物源大肠杆菌多重耐药现象普遍存在,因耐药基因的产生和传播机制复杂,其传播风险需进一步探索和评估。
喻静静邢森雨梁京京杜非凡许铭权王文静张妍郝海红
关键词:大肠杆菌耐药性耐药基因伴侣动物
产毒艰难梭菌耐药表型、分子流行病学及替加环素耐药机制研究
目的:艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)是许多国家医疗保健相关感染和腹泻的主要来源之一。目前,重庆地区缺乏对产毒艰难梭菌耐药性、耐药机制和流行病学的研究数据。因此,我们对重庆医科大学附属第...
党梓军
关键词:流行病学耐药性替加环素

相关作者

刘永芳
作品数:40被引量:223H指数:9
供职机构:川北医学院附属医院
研究主题:铜绿假单胞菌 碳青霉烯类 耐药表型 碳青霉烯类抗生素 亚胺培南
王红宁
作品数:531被引量:2,090H指数:24
供职机构:四川大学
研究主题:禽传染性支气管炎病毒 沙门氏菌 耐药基因 大肠杆菌 IBV
杨锦红
作品数:181被引量:1,034H指数:18
供职机构:温州医科大学
研究主题:肺炎链球菌 耐药性 儿童 耐药性分析 病原菌
吕晓菊
作品数:464被引量:3,953H指数:25
供职机构:四川大学华西医院
研究主题:耐药性 抗菌药物 鲍曼不动杆菌 大肠埃希菌 急性细菌性感染
俞汝佳
作品数:148被引量:637H指数:14
供职机构:华西医科大学
研究主题:耐药性 体外抗菌活性 鲍曼不动杆菌 抗菌药物 体外抗菌