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一种基于菌结构进行样品溯源的方法
本发明提供了一种基于菌结构进行样品溯源的方法,属于微生物分析技术领域。本发明通过16S序列扩增、宏基因组以及大数据获取大量样本的菌结构,通过判断待测样品的香农指数以及菌结构的相似性,从而确定某一确定来源的菌图谱,...
吴森王绪敏方向东单广乐
有限的几乎SΦ-嵌入子结构
2025年
本文利用有限G中某些给定子的几乎SΦ-嵌入性质刻画了有限的p-幂零性,得到有限的新的结构特征.此外,还得到两个新的判断一个有限是否属于给定包含超可解类的可解饱和系的判别准则.
霍丽君朱清江
关键词:有限群SYLOW子群P-幂零超可解群
黄连干预下雌激素水平对小鼠粪便菌结构影响的研究
2025年
目的探讨黄连干预下雌激素水平对小鼠粪便菌结构的影响,为黄连的药理作用及临床应用提供新的理论依据。方法选用SPF级雌性小鼠,随机分为假手术组(SHAM)、卵巢摘除手术组(OVX)、卵巢摘除手术+雌激素组(E_(2))。给予相同剂量的黄连灌胃后,采用高通量测序技术对小鼠粪便样本进行16S rRNA基因测序,观察各组小鼠粪便菌结构的变化。结果卵巢摘除改变小鼠雌激素水平,导致OVX组小鼠的粪便菌结构与SHAM组相比发生了显著变化(P<0.05),通过雌激素治疗,E2组与SHAM组菌相近。结论黄连干预下雌激素水平对小鼠粪便菌结构的影响显著,该研究为理解雌激素与肠道菌之间的相互作用以及根据不同性别使用黄连药物提供新的线索和思路。
朱晨段学清田维毅
关键词:雌激素水平黄连粪便菌群
新生儿痰标本中微生物菌结构特征与呼吸道感染的关系
2025年
目的 分析新生儿痰标本中微生物菌结构特征与呼吸道感染的关系。方法 选取2023年8月~2024年8月我院收治的50例呼吸道感染新生儿作为研究对象(纳入观察组),另选取同期于我院分娩的50例健康新生儿作为对照组。采集新生儿痰标本,提取全基因组DNA并进行16S rDNA高通量测序,绘制稀释性曲线和物种累积曲线;比较两组新生儿痰标本中微生物α多样性、β多样性、物种组成结构、物种及功能丰度。结果 稀释性曲线和物种累积曲线显示本研究测序深度合理,样本量足够全面;α多样性分析结果显示,观察组Shannon指数、Simpson指数较对照组均明显较低(t=2.804、2.512,P=0.006、0.014);两组间Bray-Curtis距离较组内(100例新生儿)明显增加(R=0.581,P=0.024);PCoA分析结果显示,两组痰标本菌呈现显著分离(F=2.985,P=0.017);在属水平上,观察组新生儿痰标本中拟杆菌属、粪杆菌属、毛螺菌属丰度明显低于对照组,双歧杆菌属、韦荣氏球菌属、志贺菌和大肠埃希菌属、链球菌属丰度明显高于对照组(P<0.05);在种水平上,观察组痰标本中的肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌丰度明显高于对照组,乳酸杆菌丰度明显低于对照组(P<0.05);功能预测分析结果显示,观察组其他次生代谢产物的生物合成、碳水化合物代谢通路途径丰度明显低于对照组(P<0.05)。结论 呼吸道感染新生儿痰标本中微生物菌多样性降低,健康新生儿痰标本中微生物其他次生代谢产物的生物合成和碳水化合物代谢通路途径更为活跃。
夏端祥李娜
关键词:新生儿呼吸道感染痰标本菌群结构丰度
结直肠息肉患者的肠道菌结构和丰度与结直肠组织PHLPP、IGFBP5相对表达水平的相关性研究
2025年
目的探讨结直肠息肉患者的肠道菌结构和丰度与结直肠组织PH结构域和富含亮氨酸的重复蛋白磷酸酶(PHLPP)、胰岛素样生长因子结合蛋白5(IGFBP5)相对表达水平的相关性。方法回顾性分析2021年1月至2023年12月上海中医药大学附属曙光医院内镜中心诊治的82例结直肠息肉患者(息肉组)和76例肠镜检查阴性者(对照组)的临床资料。比较2组结直肠组织PHLPP、IGFBP5相对表达水平、肠道菌结构(包括Chao指数、Ace指数、Simpson指数)和肠道菌(拟杆菌门、厚壁菌门、梭杆菌门、放线菌门、变形菌门和厌氧芽孢杆菌属、双歧杆菌属、埃希菌属、不动杆菌属、拟杆菌属)丰度。采用Pearson相关分析肠道菌结构和丰度与结直肠组织PHLPP、IGFBP5相对表达水平的相关性。结果息肉组PHLPP相对表达水平低于对照组(P<0.05),IGFBP5相对表达水平高于对照组(P<0.05)。息肉组Chao指数、Ace指数均高于对照组(P<0.05),但息肉组和对照组Simpson指数比较,差异无统计学意义(P>0.05)。息肉组拟杆菌门、梭杆菌门丰度均低于对照组(P<0.05),而厚壁菌门、放线菌门、变形菌门丰度均高于对照组(P<0.05)。息肉组埃希菌属、拟杆菌属丰度均低于对照组(P<0.05),而厌氧芽孢杆菌属、双歧杆菌属、不动杆菌属丰度均高于对照组(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示:息肉组患者Chao指数、Ace指数及厚壁菌门、放线菌门、变形菌门、厌氧芽孢杆菌属、双歧杆菌属、不动杆菌属丰度均与结直肠组织PHLPP相对表达水平呈负相关(P<0.05),与结直肠组织IGFBP5相对表达水平呈正相关(P<0.05);息肉组患者拟杆菌门、梭杆菌门、埃希菌属、拟杆菌属丰度均与结直肠组织PHLPP相对表达水平呈正相关(P<0.05),与结直肠组织IGFBP5相对表达水平呈负相关(P<0.05)。结论结直肠息肉患者肠道菌结构和肠道菌丰度均发生异常变化,且肠道菌结构和丰�
杨姗莹庄羽骁郭丽坤岑戎
关键词:结直肠息肉肠道菌群
6周力竭运动对大鼠肠道菌结构的影响
2025年
目的:中低强度的运动会对宿主肠道菌产生有益影响,但高强度或力竭性运动对肠道菌影响的相关研究较少。本研究观察力竭运动对大鼠肠道菌结构的影响,进一步理解力竭运动对肠道菌的影响机制。方法:12只7周龄SD大鼠分为力竭组和对照组,力竭组采用递增运动强度的力竭运动为干预方式对大鼠进行为期6周的干预,对照组允许笼中自由活动。6周运动干预结束后24h内收集大鼠新鲜粪便样品,提取粪便细菌DNA,16srDNA高通量测序对大鼠肠道菌进行分析。结果:Alpha多样性分析显示:对照组和力竭组肠道菌的丰富度存在显著差异(P<0.05)。两组样本的肠道菌多样性差异不具有统计学意义(P>0.05)。两组样本的菌在门和纲水平上差异不显著,在目、科、属水平上存在显著差异的菌种,力竭组健康菌种如嗅杆菌科(Odoribacteraceae)、杆菌属(Odoribacter)、理研菌科(Rikenellaceae)、双歧杆菌(Bifidobacterium)等相对含量显著低于普通组,而一些有害菌如葡萄球菌科(Staphylococcaceae)等相对含量显著高于普通组(P<0.05)。结论:力竭性运动会改变大鼠肠道菌的丰度,也会使部分健康菌种含量降低;部分有害菌种含量增加。
王龙飞江大雷
关键词:肠道菌群力竭运动微生物多样性
青海不同地区传统牦牛酸奶品质差异及菌结构分析
2025年
为了解青海省不同地区牦牛酸奶品质的差异和菌微生物资源,本研究对青海省果洛(G)、玉树(Y)、海北(B)和海南(N)4个地区的24份酸奶样品进行理化特性测定。结果表明,不同地区间牦牛酸奶品质存在差异,果洛(G)和海南(N)地区牦牛酸奶样品的pH和酸度普遍较好,玉树(Y)地区样品的黏度和持水性较高,果洛(G)地区6份样品持水性均达40%以上,海北(B)地区只有B5、B6样品的pH和酸度较好;通过16sRNA测序技术,4个地区牦牛酸奶鉴定出22个门和272个属,其中厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,乳杆菌属(Lactobacillus)和链球菌属(Streptococcus)为G地区的优势菌属,而Y、N和B地区优势菌属均为乳杆菌属。本研究旨在为进一步实现传统发酵乳制品菌种的工业化生产奠定理论基础,为更好地调控牦牛乳发酵产品的品质提供理论科学依据,有效提高青海牦牛乳资源的利用率。
任海佳吴海玥胡蓉闫忠心胡博郭娅慧
关键词:理化特性菌群结构高通量测序
林下菊苣草地放养对北京油鸡盲肠菌结构和代谢物的影响
2025年
[目的]解析林下菊苣草地放养与传统笼养对北京油鸡盲肠菌和代谢物的影响。[方法]将体重相近的10周龄北京油鸡母鸡随机分为3组,即林下菊苣草地放养组(T1组,放养密度100只/667 m~2;T2组,放养密度120只/667 m~2)和传统笼养对照组(CK),草地放养组采用草地放养与基础饲粮补饲相结合方式,传统笼养组仅饲喂基础饲粮,试验期95 d。饲养试验结束后采集盲肠内容物,在16S rRNA高通量测序的基础上分析微生物落丰富度和多样性、菌结构,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)代谢组学分析差异代谢物和KEGG富集通路。[结果]与CK组相比,T1组北京油鸡盲肠菌的Sobs指数、Chao1指数、Ace指数和Shannon指数均有所提高,Simpson指数有所降低,但均未达到显著水平(P>0.05);T2组北京油鸡盲肠菌的Sobs指数、Chao1指数和Ace指数分别提高41.3%、33.6%和34.7%(P<0.05)。与CK组相比,T1和T2组北京油鸡盲肠中扭链瘤胃球菌属、理研菌科_RC9菌属、欧陆森氏菌属、未分类毛螺菌科和瘤胃球菌科UCG-005菌属的相对丰度均有一定程度提高,但未达到显著水平(P>0.05);T1和T2组北京油鸡盲肠差异代谢物主要富集在萜类化合物和聚酮类化合物的代谢、植物次生代谢产物的生物合成、脂质代谢和氨基酸代谢途径。[结论]林下菊苣草地放养提高了北京油鸡盲肠内有益菌的相对丰度,影响了北京油鸡的脂质代谢途径和氨基酸代谢途径,可起到控制体脂、提高必需氨基酸含量和免疫性能等一系列良性作用。
张苏晗毛培春田小霞郭玉霞郑明利孟林
关键词:北京油鸡盲肠菌群
自然发酵厚皮菜菌结构及风味品质分析
2025年
为了探究传统自然发酵四川厚皮菜的微生物体系及其风味品质,采用高通量测序和生物信息学相关技术,解析发酵厚皮菜的微生物菌结构及菌间的生物学关系。通过液相色谱法测定其有机酸的种类及含量,采用顶空固相微萃取(HS-SPME)与气相色谱-飞行时间质谱联用(GC-TOFMS)技术分析其挥发性风味成分。结果表明:该发酵厚皮菜的主要优势菌为乳杆菌属、未分类蓝细菌属、盐单胞菌属及慢乳杆菌属;该发酵厚皮菜中含乙酸、柠檬酸、乳酸等6种有机酸,且其中乳酸含量最高为470.50 mg/100 mL;挥发性风味物质中酸类物质相对含量最高,主要是乙酸,其次是2-辛醇等醇类和乳酸乙酯等酯类物质。本研究阐明了发酵四川厚皮菜菌结构与其风味物质形成的相关性,为进一步改善传统发酵厚皮菜工艺及接种控制规模化生产等提供理论依据。
于世娇李帅翁佩芳吴祖芳刘亚楠
关键词:自然发酵菌群结构有机酸风味品质
防腐剂对牡蛎中耐药菌结构的影响
2025年
目的探究常用食品防腐剂对牡蛎中耐药共生菌的影响作用。方法以4℃冷藏为对照组,以分别经山梨酸钾、壳聚糖、乳酸链球菌素、ɛ-聚赖氨酸浸泡处理后进行4℃冷藏为实验组,通过耐药平板计数法分析不同食品防腐剂处理后牡蛎中耐药菌含量的变化情况,并通过16S rRNA扩增子高通量测序分析耐药菌结构的变化。结果山梨酸钾与壳聚糖能显著降低单种与多重抗菌药的耐药菌数;乳酸链球菌素能显著降低复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受2、3、4种药物的耐药菌数;ε-聚赖氨酸能显著降低环丙沙星耐药菌数、复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受3、4种药物的耐药菌数。山梨酸钾与壳聚糖对四环素与环丙沙星耐药菌的组成影响较大,乳酸链球菌素与ε-聚赖氨酸对复方新诺明耐药菌的组成影响较大。结论本研究表明通过应用合适的食品防腐剂可以控制牡蛎中耐药菌的含量,食品防腐剂可以影响牡蛎中可培养耐药菌的组成且不同防腐剂能抑制特定的抗菌药耐药菌,为建立牡蛎中耐药菌的控制措施提供了新思路。
宫钰洁吴书香王鹏姚琳曲梦李风铃王联珠江艳华
关键词:防腐剂牡蛎耐药菌菌群结构

相关作者

杜海峰
作品数:147被引量:1,759H指数:23
供职机构:西安交通大学公共政策与管理学院
研究主题:农民工 社会网络 克隆选择 复杂网络 社群结构
赵立平
作品数:203被引量:1,652H指数:26
供职机构:上海交通大学
研究主题:肠道菌群 ERIC-PCR 微生物群落 DGGE 变性梯度凝胶电泳
陈贵云
作品数:93被引量:248H指数:9
供职机构:西南大学数学与统计学院
研究主题:有限群 刻画 可解群 自同构群 幂零群
韦华全
作品数:86被引量:117H指数:8
供职机构:广西大学数学与信息科学学院
研究主题:有限群 可解群 极大子群 正规子群 P-幂零
钟祥贵
作品数:57被引量:106H指数:5
供职机构:广西师范大学
研究主题:有限群 超可解群 极大子群 幂零群 P-幂零性