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群体遗传学
(日)向井辉美著
关键词:群体遗传学
新疆3个地区儿童头癣患者犬小孢子菌的群体遗传学研究
2025年
目的研究新疆3个(和田、阿克苏及乌鲁木齐)地区儿童头癣患者犬小孢子菌菌株的遗传多样性水平以及菌种的种群结构。方法收集2000年1月-2020年12月新疆3个地区的52株儿童头癣患者的犬小孢子菌菌株,基于微卫星方法,用Popgen软件分析观察等位基因数、有效等位基因数、香农信息指数、Nei氏基因多样性指数。采用GenAlEx软件进行分子方差变异分析和主坐标分析;采用NTSYS软件构建聚类图;采用STUCTURE软件分析犬小孢子菌的种群结构。结果和田地区犬小孢子菌的观察等位基因数为2.091,有效等位基因数为1.878,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.307和0.596,阿克苏地区犬小孢子菌的观察等位基因数为2.182,有效等位基因数为1.503,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数为0.307和0.457,乌鲁木齐地区犬小孢子菌的观察等位基因数最高达到3.000,有效等位基因数为1.447,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.307和0.492。种群间遗传变异占4%,种群内遗传变异占96%。阿克苏地区犬小孢子菌和乌鲁木齐地区犬小孢子菌遗传距离最小,遗传相似度最大,亲缘关系较近,和田地区犬小孢子菌与阿克苏地区犬小孢子菌遗传距离最大,遗传相似度最小,新疆3个地区犬小孢子菌可被分为3个谱系。结论新疆和田、阿克苏及乌鲁木齐3个地区的儿童头癣患者的犬小孢子菌具有遗传多样性。
刘蕾王晓东凯迪丽亚·艾米拉江帕丽达·阿布利孜
关键词:犬小孢子菌微卫星种群结构
2022年浙江省嘉兴市湖北钉螺的群体遗传学分析被引量:2
2024年
【目的】基于微卫星遗传标记法对浙江省嘉兴市不同有螺环境的湖北钉螺进行基因分型,开展群体遗传学分析,探讨钉螺存在或扩散的原因及其影响因素,为有效监测和控制钉螺提供依据。【方法】选取嘉兴市2022年重点有螺环境的平湖市姚浜(YB)村和三兴(SX)村,以及秀洲区的运河(YH)农场3个种群共90只钉螺样本,采用9个微卫星位点对钉螺进行基因分型和群体遗传学分析。【结果】共观察到84个等位基因,YB、SX和YH种群平均等位基因数分别为7.889、5.667、3.778;有效等位基因数分别为4.807、3.329和2.294;近交系数分别为0.400、0.377、0.493。在无限等位基因模型下,SX和YH近期可能出现瓶颈效应。NeEstimator和LDNe软件计算的有效种群均>31.9。分子方差分析显示3个种群钉螺的变异主要存在于个体间,占总变异的41.44%,群体遗传分化指数为0.286,表示遗传分化程度很大。主坐标分析与系统发生树结果一致,3个种群分为2个谱系,YB和SX为1个谱系,YH分属另一个独立谱系。种群历史及动态分析显示3个种群基因流不充分。溯源分析表示可能为YH首先从SX分化,YB由SX和YH接触融合形成。【结论】嘉兴市钉螺种群遗传多样性总体较低,钉螺种群较不稳定,遗传分化程度很大,各种群之间基因流不充分。
顾伟玲彭晗琪张韩香向泽林陈中文富小飞亓云鹏谢亮胡洁吕大兵
关键词:湖北钉螺微卫星标记群体遗传学
南海澄黄滨珊瑚及其共生虫黄藻C15的群体遗传学特征与相互联系
在全球气候变化和人类活动的影响下,珊瑚礁正面临着迅速退化的风险。珊瑚作为一种共生功能体,宿主本身和其体内的共生虫黄藻对维持整个共生体系的长期生存能力均有重要的贡献。众多研究表明,南海澄黄滨珊瑚(Porites lutea...
冯逸
关键词:虫黄藻群体遗传学SNP
乌鲁木齐市结核分枝杆菌群体遗传学研究
2024年
目的 对乌鲁木齐市结核分枝杆菌进行群体遗传学研究,揭示其遗传变异情况、单倍型分布和群体历史动态。方法 使用全基因组测序技术对乌鲁木齐市七区一县的结核分枝杆菌群体进行测序,通过单核苷酸多态性进行基因分型,开展群体遗传多样性、遗传结构、基因流动和历史动态分析。结果 结核分枝杆菌群体样本共457个,其中检测出22个单倍型,单倍型多样性(H_(d))为0.890 49,核苷酸多态性(π)为0.496 83,群体遗传多样性较高。AMOVA分析显示,结核分枝杆菌群体遗传变异主要发生在群体内,群体遗传分化系数(F_(st))为0.068 9,基因流(N_(m))为3.42,结核分枝杆菌群体间有较高的基因流动。中性检验和错配分析表明乌鲁木齐市结核分枝杆菌群体可能没有经历明显的快速扩张事件。结论 乌鲁木齐市结核分枝杆菌群体遗传性较高,主要发生群体遗传变异,具有明显基因流动。
王意达杨建东李虎玲米佳王凯
关键词:结核分枝杆菌群体遗传学基因流动
群体遗传学AI模型在我国弯曲杆菌感染散发病例归因中的初探与应用
2024年
目的探索群体遗传学模型在食源性疾病归因分析中的应用,定量识别导致我国弯曲杆菌感染散发病例的主要宿主来源。方法利用PubMLST公共数据库获得我国弯曲杆菌MLST数据,采用群体遗传学AI模型(AIM)对弯曲杆菌病例进行归因分析。结果弯曲杆菌感染散发病例归因于鸡的贡献比例最高,为50.49%,其次为鸭鹅、牛和猪,分别为22.56%、18.36%和4.52%,归因于环境和野生鸟类的贡献比例较低,分别为0.78%和0.66%。结论本研究采用AIM方法,实现了结合微生物分子分型数据和统计建模的归因方法在我国食源性疾病中的实践应用,定量获得了不同来源对我国弯曲杆菌感染散发病例的贡献,并为下阶段归因工作提供了方向和思路。
张力匀叶欣刘兆平王彝白纳
关键词:弯曲杆菌归因分析食源性疾病散发病例
造礁石珊瑚群体遗传学研究进展
2024年
受到气候变暖和人类活动的影响,全球不少珊瑚礁正面临着急剧退化的风险,开展珊瑚礁保护与修复的工作已成为当务之急。进行造礁石珊瑚群体遗传学的研究对于深入理解珊瑚物种的遗传结构、遗传多样性和连通性具有重要意义,同时可以揭示珊瑚应对环境压力时的适应性潜力和恢复能力,从而为保护和管理珊瑚礁提供科指导。本文综述了近年来在全球典型海域开展的珊瑚群体遗传学研究的现状与进展,并针对可能影响珊瑚群体遗传结构的因素进行了讨论。总体而言,目前造礁石珊瑚群体遗传学的研究多集中在澳大利亚大堡礁、加勒比海等区域,微卫星标记仍是当前使用最为广泛的DNA分子标记。繁殖方式、距离隔离、环境隔离以及人类活动等是影响珊瑚群体遗传多样性水平和遗传结构的重要因素。基于国内外研究进展,本文最后对目前我国南海造礁石珊瑚群体遗传学研究中存在的问题和发展趋势进行了分析和展望,以期为我国珊瑚礁保护与修复工作提供参考。
黄雯冯逸李明李明罗燕秋陈胤民王丽荣王丽荣
关键词:造礁石珊瑚分子标记影响因素
绵羊尾脂沉积相关基因的筛选及其群体遗传学效应研究
刘佳
翘嘴鲌不同地理群体的适应性特征和群体遗传学研究
杨昊
野生荔枝与无核荔枝比较基因组群体遗传学研究
荔枝(Litchi chinensis Sonn.)是无患子科(Sapindaceae Juss)荔枝属(Litchi Sonn.)的多年生乔木,是热带地区重要的经济果树,因其酸甜的口感以及丰富的营养物质深受消费者的喜爱...
江思容
关键词:荔枝比较基因组学群体遗传结构全基因组关联分析

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余跃生
作品数:295被引量:867H指数:17
供职机构:黔南民族医学高等专科学校
研究主题:布依族 瑶族 基因频率 遗传性状 群体遗传学
李生斌
作品数:194被引量:676H指数:16
供职机构:西安交通大学
研究主题:遗传多态性 短串联重复序列 STR 多态性研究 STR位点
侯一平
作品数:234被引量:806H指数:17
供职机构:四川大学华西基础医学与法医学院
研究主题:法医学 遗传多态性 复合扩增 短串联重复序列 基因座
李英碧
作品数:141被引量:428H指数:11
供职机构:四川大学
研究主题:遗传多态性 复合扩增 法医学 基因座 试剂盒
陆玉炯
作品数:52被引量:162H指数:10
供职机构:黔南民族医学高等专科学校
研究主题:遗传性状 基因频率 群体遗传学 人类群体遗传学 活体观察