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- 本发明公开了基于机器学习的细菌基因组数据预测细菌表型特征的方法，包括以下步骤：(1)对细菌基因组数据进行蛋白质结构域解析；(2)将解析得到的细菌蛋白质结构域进行重构组合，统计频率并转化成矩阵，得到细菌重构的蛋白质结构域特...
- 韩国民刘海达万思琪
- 细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质
- 本申请公开了一种细菌基因组的基因簇识别方法、装置、设备及存储介质，方法包括：利用预处理单元、ESM蛋白质语言单元、余弦近似度计算单元、归一化逐点互信息单元、术语频率‑逆文档频率单元、图卷积单元、BERT单元及softma...
- 杜智华钟宁宇
- 单链DNA退火蛋白介导细菌基因组同源重组的机制及应用研究进展
- 2025年
- 基因组编辑技术是研究细菌等微生物在基因功能、耐药机制及致病机制等方面的重要工具,而同源重组是细菌基因组编辑的重要方式之一,传统的细菌内源性重组途径存在效率低下的问题,而一种来自噬菌体的单链DNA退火蛋白(SSAP)表现出了远超内源性重组途径的基因组编辑效率,该蛋白具有单链DNA结合活性、介导基因组定向重组的特点,使其成为目前极具潜力的基因组编辑工具。本文主要对同源重组基本原理、噬菌体源SSAP介导的同源重组途径的基本元件、重组机制模型以及应用策略展开概述,旨在为进一步解析单链DNA退火蛋白介导的同源重组过程提供帮助,为研究更多细菌基因功能、致病机制以及开发工程菌株提供技术支撑,也为缺乏基因编辑方法的细菌提供技术参考。
- 尹号尤留超韩瑞高鹏程付磊储岳峰
- 关键词：细菌同源重组
- 细菌基因组DNA提取试剂盒及其使用方法
- 本发明属于生物技术领域，公开了一种细菌基因组DNA提取试剂盒和细菌基因组DNA提取方法，所述试剂盒包括悬浮液、结合液、去蛋白液、漂洗液和洗脱液。本发明的试剂盒采用独特的缓冲液系统配合特异性吸附DNA的离心柱，能够快速1h...
- 肖晓文王文朋李妍东昱汝
- 细菌基因组绝缘位点的鉴定方法及应用
- 本发明公开了一种细菌基因组绝缘位点的鉴定方法及应用，该方法利用生物学方法测定待测位点的两端均具有转录强终止子且两个所述转录强终止子的末端相对，即鉴定为绝缘位点。本发明实现了将外源基因插入到细菌绝缘表达位点，使外源基因表达...
- 胡杨波何丽娜陈士云
- 细菌基因组高通量测序数据的变异检测可视化工具研究
- 基因组变异检测是一项重要基础技术,在细菌进化研究、临床菌种及耐药位点鉴定、传染病疫情监测等领域中发挥着重要作用。近年来,随着测序技术不断发展,基于高通量测序数据的细菌基因组变异检测成为上述领域研究人员面临的难题。目前研究...
- 熊子瑶
- 关键词：高通量测序细菌比较基因组学可视化
- 一种来源于野生亚洲象肠道丁酸球菌科细菌基因组的单宁酶及其基因
- 本发明涉及酶的基因工程技术领域，具体为一种来源于野生亚洲象肠道丁酸球菌科细菌基因组的单宁酶及其基因，利用宏基因组分箱技术组装获得一株丁酸球菌科(Butyricicoccaceae)细菌的基因组，经InterPro和Pfa...
- 黄遵锡张呈波吴倩
- 一种快速细菌基因组DNA提取试剂盒、使用方法及应用
- 本发明公开了一种快速细菌基因组DNA的提取试剂盒及使用方法。所述试剂盒的试剂包括：裂解液、加强液、清洗液和洗脱液。所述使用方法包括在样品中加入裂解液和加强液裂解、清洗液清洗、核酸洗脱液洗脱后的得到细菌核酸。本发明的快速细...
- 王伟洪钱福初尹维宏牟颖胡凯金伟童照威钟剑峰
- 一种在细菌基因组中定点插入DNA的基因编辑系统及其应用
- 本发明公开了一种在细菌基因组中定点插入DNA的基因编辑系统及其应用，系统包括：第I调节元件，其包括转座模块和靶向效应模块，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，编码7个氨基酸序列；第II调节元件，其包括“II‑1核苷...
- 邓杰王新磊
- 一种细菌基因组DNA提取试剂盒
- 本实用新型公开了一种细菌基因组DNA提取试剂盒，包括底壳，所述底壳的内部设置有动力空间，所述动力空间内设置有电机，所述电机的上侧输出端动力连接有转轴，所述底壳的上侧固设有盒体，所述盒体内可转动的设置有内盒，所述转轴的上端...
- 李鹏尹锐王志豪陈惠杰刘喜东董长颖
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