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调节性T细胞转录因子T-bet、GATA-3失衡表达与重症肺炎患儿病情程度及预后的关系: 2025年; 目的探究调节性T细胞转录因子T细胞表达的T盒(T-bet)、GATA结合蛋白3(GATA-3)失衡表达与重症肺炎患儿病情程度及预后的关系。方法选取2020年9月—2023年9月我院104例重症肺炎患儿为重症组,另以1∶1∶1比例选取104例普通肺炎患儿为轻症组,104例健康体检儿童为对照组,检测调节性T细胞转录因子T-bet、GATA-3表达水平,采用急性生理与慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)、肺炎严重指数(PSI)评价病情,评估治疗后7 d疗效预后。比较三组T-bet、GATA-3表达水平及PSI、APACHEⅡ评分,比较三组血清Th1/Th2细胞因子含量[白介素-2(IL-2)、IL-4、IL-10、γ干扰素(IFN-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)],分析重症组T-bet、GATA-3与APACHEⅡ、PSI评分及血清Th1/Th2细胞因子的相关性,分析T-bet、GATA-3对重症肺炎患儿预后不良中的交互作用,比较重症组不同预后患儿T-bet、GATA-3,分析T-bet、GATA-3对患儿预后的预测价值。结果重症组T-bet mRNA、T-bet/GATA-3低于轻症组、对照组,GATA-3 mRNA、APACHEⅡ评分、PSI评分高于轻症组(P<0.05);重症组IL-2、IL-4、IL-10、IFN-γ、TNF-α均高于轻症组、对照组(P<0.05);APACHEⅡ、PSI评分与T-bet呈负相关,与GATA-3呈正相关(P<0.05),IL-2、IL-4、IL-10、IFN-γ、TNF-α与T-bet呈负相关,与GATA-3呈正相关(P<0.05);低T-bet mRNA与高GATA-3 mRNA二者同时存在时,交互作用OR为19.259,提示低T-bet mRNA与高GATA-3 mRNA在重症肺炎患儿预后不良中呈正向交互作用;19.259<4.078×11.556,提示低T-bet mRNA与高GATA-3 mRNA为次相乘模型。入院时、治疗3 d预后不良组患儿T-bet mRNA表达及T-bet/GATA-3均低于预后良好组,GATA-3 mRNA均高于预后良好组(P<0.05);入院时、治疗3 d T-bet/GATA-3预测的AUC分别为0.835(95%CI:0.750~0.901)、0.856(95%CI:0.774~0.917),大于T-bet mRNA、GATA-3 mRNA预测的AUC(P<0.05)。结论重症肺炎患儿调节性T细胞转录因子T-bet、GATA-3失衡表达与病情加重及预后有关,T-bet、GATA-3�; 李佳杨保昌郑双双; 关键词：T-BET GATA-3 TH1/TH2

基于单细胞ATAC测序数据的乳腺癌上皮细胞转录因子研究被引量：1: 2024年; 研究表明,乳腺肿瘤细胞染色质开放区域上的转录因子显著影响乳腺癌患者的临床表型和预后。然而,在单细胞层面,这些调控元件如何调控乳腺癌发生发展尚不明确。为此,本研究从GEO数据库中下载了45216个正常和肿瘤乳腺组织的单细胞染色质可及性测序(single-cell ATAC sequencing,scATAC-seq)数据,并对其进行了分析。根据标记基因在细胞群的基因活性得分进行细胞类型注释后得到7种乳腺细胞类型。皮尔逊相关性分析表明,肿瘤和正常乳腺样本的上皮细胞存在明显的染色质可及性差异,且乳腺上皮细胞存在高度样本间异质性(PCC=-0.07),暗示其是乳腺肿瘤的主要恶性细胞类型。为了探究正常和恶性乳腺上皮细胞的差异可及性区域中转录因子结合基序的富集情况,在提取上皮细胞群后对4个上皮细胞亚型的特征开放区域进行了转录因子结合基序富集分析。结果表明,恶性乳腺上皮细胞有194个转录因子显著富集(P<0.001),它们可能涉及乳腺肿瘤发展和转移等调控过程。对上皮细胞亚型中富集程度较高的转录因子进行活性分数计算及转录组数据验证,结果进一步显示这些差异调控元件可能与乳腺细胞恶性发展相关。此外,对转录因子结合基序在不同乳腺癌亚型中的可及性差异进行了分析,发现SNAI2在三阴性乳腺癌样本中具有显著高的可及性,提示SNAI2在三阴性乳腺癌中具有潜在的特异性调控作用。; 张雅娜牟苑菁李苇祥赵俊焱郭志云; 关键词：乳腺癌单细胞

小鼠脑缺血再灌注后血管新生及内皮细胞转录因子网络研究: 刘宁远

点按法对颈肌慢性损伤模型大鼠肌细胞凋亡及肌卫星细胞转录因子表达的影响: 目的观察点按法对颈肌慢性损伤模型大鼠肌肉损伤的修复及肌肉组织中MyoD、Pax7、IGF-1、Bax、Bcl-2蛋白表达的影响,探讨点按法治疗颈肌慢性损伤的机制,为临床治疗提供理论依据。方法28只Wistar大鼠购回后适...; 屈伸华; 关键词：点按法肌卫星细胞细胞凋亡

GATA2对血管内皮细胞转录因子ERG表达的调控作用及机制研究: 研究背景　　成红细胞转化特异性(E26transformationspecific,ETS)相关基因(ETS-relatedgene,ERG)是ETS家族中的一种转录因子，表达仅限于血管内皮细胞(Endothelialc...; 许善虎; 关键词：血管功能障碍

基于变分自编码器的单细胞转录因子调控网络构建方法: 本发明公开了基于变分自编码器的单细胞转录因子调控网络构建方法，涉及基因转录调控领域，该方法包括：根据scATAC‑seq数据和scRNA‑seq数据，确定输入矩阵和真实标签矩阵；构建转录因子调控网络模型，并根据输入矩阵和...; 张永清牛颢龙树全邹权龚美琴王茂丞何宇辰丁春利杨显华

基于深度学习和注意力机制的单细胞转录因子预测方法: 本发明公开了一种基于深度学习和注意力机制的单细胞转录因子预测方法，其包括获取单细胞染色质可及性分析测序数据，并对其进行预处理，之后进行数据增强操作，得到增强测序数据；提取增强测序数据中的回归峰作为特征向量S，拼接正向和反...; 张永清邹权何宇辰牛颢丁春利吴锡王紫轩刘宇航王茂丞

基于深度学习的单细胞转录因子结合预测及调控网络构建的研究: 何宇辰

靶向小胶质细胞转录因子ATF3在脑损伤疾病中的应用: 本发明公开了脑内小胶质细胞中转录因子ATF3在脑损伤后脑内神经炎症反应和神经功能和认知功能中的作用。提供了特异性靶向脑内小胶质细胞中转录因子ATF3的抑制剂在用于制备治疗脑损伤疾病的药物中的用途。本发明提出，特异性敲除脑...; 李佩盈李妍俞卫锋陈晨范秋月庞睿

巨噬细胞转录因子阴阳1基因通过调节脂肪细胞因子影响胰岛素敏感性: 2022年; 目的探讨巨噬细胞转录因子阴阳1(YY1)基因对葡萄糖耐量、胰岛素敏感性的影响。方法通过Cre-Loxp系统,成功获得巨噬细胞YY 1基因特异性敲除(YY 1^(f/f);lyz2-cre)小鼠。高脂喂养小鼠12~13周,检测小鼠葡萄糖耐量(血糖水平)和胰岛素耐量(相对血糖值)。将高脂喂养的YY 1基因敲除小鼠(实验组,YY 1^(f/f);lyz2-cre)与对照组(YY 1^(f/f))小鼠分别注射0.9%氯化钠溶液和胰岛素(剂量均为0.75 U/kg),取其附睾脂肪、肌肉、肝脏组织,采用免疫印迹法检测蛋白激酶B(Akt)-糖原合成酶激酶3β(Gsk3β)通路关键蛋白(Akt、Gsk3β)的磷酸化水平。采用ELISA法检测高脂饮食后实验组小鼠与对照组小鼠血清胰岛素、脂联素和瘦素水平。应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测正常饮食的两组小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM)中炎症因子mRNA相对表达量。结果琼脂糖凝胶电泳见700 bp处显示条带,表明lyz2-cre基因成功表达。实验组小鼠BMDM中,YY 1基因mRNA相对表达量显著低于对照组,表明巨噬细胞YY 1基因特异性敲除小鼠模型构建成功。高脂喂养下,实验组小鼠注射葡萄糖后60、90 min时的血糖水平均显著低于对照组同时间点(P值均<0.05),实验组小鼠注射胰岛素后30、60、90 min时的相对血糖值均显著低于对照组同时间点(P值分别<0.05、0.001、0.01)。正常饮食喂养下,两组各时间点间血糖水平和相对血糖值的差异均无统计学意义(P值均>0.05)。实验组小鼠附睾脂肪中胰岛素信号通路关键蛋白Akt及Gsk3β磷酸化水平较对照组均明显上调,肌肉和肝脏组织中无明显变化。实验组小鼠血清瘦素、脂联素水平均显著高于对照组(P值均<0.05);实验组小鼠血清胰岛素水平较对照组有下降趋势,但差异无统计学意义(P>0.05)。实验组小鼠BMDM中IL-6 mRNA、TNF-αmRNA、IL-1βmRNA相对表达量均显著低于对照组(P值均<0.001)。结论巨噬细胞转录因子YY1基因敲除,可以通过�; 于汐刘醒赵洁洁焦阳陆炎杨琰英李小英汤其群; 关键词：巨噬细胞胰岛素敏感性脂联素

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