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- 张凝一臧天仪赵飞
- 对动物组织进行微环境细胞异质性分析的方法和系统
- 本申请提供了对动物组织进行微环境细胞异质性分析的方法和系统。该方法包括:获取动物组织的切片;对切片进行多重荧光免疫组化染色,通过定量图像分析获得细胞轮廓;基于细胞轮廓,使用自动激光显微切割技术,获取第一细胞样本,其中包括...
- 田瑞军许燕芬王曦毛亦衡李元
- 基于单细胞转录组测序的脐带间充质干细胞异质性分析方法
- 本发明公开了一种基于单细胞转录组测序的脐带间充质干细胞异质性分析方法,包括以下步骤:(一)进行单细胞文库制备,进行单细胞转录组测序;(二)利用生物信息学工具对获得的转录组数据进行分析;(三)根据聚类分析结果,识别UC‑M...
- 杨海燕王小龙杨志宽白志远石珂
- 单细胞测序揭示骨质疏松症患者B细胞异质性及与成骨细胞的相互作用
- 2025年
- 背景:免疫与骨质疏松症的发病机制有着密切关系,全面、深入地研究两者之间的关系对于理解和治疗骨质疏松症具有重要意义。目的:利用单细胞测序技术探究免疫细胞在骨质疏松症中的作用。方法:从GEO数据库下载骨质疏松症和非骨质疏松症患者股骨头组织单细胞测序分析数据,利用R 4.3.0软件及Seurat v.4.3、monocle(2.28.0)、CellChat等软件包对测序数据进行细胞聚类分析、功能富集分析、拟时序分析、细胞互作等分析。获取行人工髋关节置换手术的股骨颈骨折患者股骨头组织,包括骨质疏松症患者2例、非骨质疏松症患者2例,采用免疫组化染色检测CCL13、CCL18蛋白表达,qPCR检测免疫球蛋白重常数γ-4、免疫球蛋白λ常数3、人Ⅱ类主要组织相容性复合体DRβ1、CD83 mRNA表达,Western Blot检测受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C、CD22、CD99蛋白表达。结果与结论:①转录组数据分析共识别了10个不同的细胞类型,包括破骨细胞、髓样细胞、T细胞、成骨细胞、巨噬细胞、单核细胞、红细胞、B细胞、骨髓间充质干细胞、肥大细胞,骨质疏松症组股骨头组织中破骨细胞与T细胞比例增加,成骨细胞与B细胞比例减少。在B细胞亚群中,骨质疏松症组股骨头组织中第1,3类群B细胞(BC1、BC3)比例高于非骨质疏松症组,第2类群B细胞(BC2)比例少于非骨质疏松症组。BC1富集显著的标签有适应性免疫反应调节、免疫受体的体细胞重组、调节淋巴细胞介导的免疫等,BC3富集显著的标签有免疫球蛋白产生的调节、对Ⅱ型干扰素的应答、半胱氨酸内肽酶参与的凋亡过程、细胞毒性等。骨质疏松症组股骨头组织中B细胞亚型BC1与成骨细胞间的通讯强度高于非骨质疏松症组,同时BC3与BC1之间的通讯强度也有所提高;BC3与BC1之间的通讯在CD22-受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C通路富集显著,BC1与成骨细胞之间的通讯主要富集在
- 唐志邵阳李绍烁戚树斌陆恒杨吴毛杨俊锋王建伟
- 关键词:骨质疏松症B细胞成骨细胞
- 动脉粥样硬化中内皮细胞异质性智能分析方法及系统
- 本发明公开了一种动脉粥样硬化中内皮细胞异质性智能分析方法及系统,所述方法包括:获取患者的动脉粥样硬化中内皮细胞的样本数据;对所述内皮细胞的样本数据进行特征提取,得到内皮细胞的基因表达特征;依据所述内皮细胞的基因表达特征并...
- 王玉张城林王畅郑泽广郑明余蒲玉洁赵慧娟
- 一种利用CRISPR筛选Th17细胞异质性的调节因子的高通量方法
- 本发明公开了一种利用CRISPR筛选Th17细胞异质性的调节因子的高通量方法,涉及CRISPR筛选技术领域,该方法包括如下步骤:CRISPR文库构建;Il17a<SUP>Cre</SUP>Rosa26<SUP>YFP/C...
- 宋健张福萍韩小娟
- 慢性皮肤溃疡的细胞异质性的单细胞转录组测序及临床意义分析
- 2025年
- 背景与目的:目前,慢性皮肤溃疡仍是影响患者日常生活及心理负担的重要疾病,其组织内细胞及细胞外基质的异常可能破坏微环境内的平衡,从而阻碍正常的皮肤修复进程,导致溃疡迁延不愈。其发生发展机制及诊断标志物尚无相关研究。单细胞测序是近年来新发展的高通量测序方法,通过对单细胞分辨率下的基因测序,精准地揭示疾病的机制,在多种疾病中均有研究。本研究利用单细胞转录组测序(scRNA-Seq)技术检测慢性皮肤溃疡组织细胞异质性,以期阐明慢性溃疡难以愈合的潜在分子机制,并为临床治疗提供新思路。方法:通过scRNA-Seq技术,比较慢性溃疡组织和正常皮肤组织在细胞亚群及基因表达层面的差异。使用微流控平台对单细胞进行分选,并构建c DNA文库,随后进行差异基因分析和功能富集分析。结果:scRNA-Seq分析揭示了慢性溃疡组织的显著免疫-代谢重塑特征:溃疡组织中B细胞、单核细胞及巨噬细胞数量较对照正常组织增加2.1~3.5倍,同时伴随胶原合成基因(COL1A1/COL3A1)的广泛激活与免疫调节因子(如颗粒酶家族GZMA/GZMB/H)的协同抑制。跨细胞亚群的功能网络分析显示,HIF-1信号介导的缺氧应答与PI3K/Akt通路异常形成正反馈环路,加剧炎症因子(CXCL3/8,TGFBI)的分泌失衡及线粒体氧化磷酸化代偿性上调。结论:慢性皮肤溃疡在细胞异质性和基因表达方面有显著差异,提示慢性溃疡不仅是单纯的组织缺损,更是由长期炎症和免疫失调主导的复杂病理过程。慢性溃疡微环境中多细胞亚群的协同失调,其持续性炎症反应与代谢异常通过HIF-1/TNF/MAPK通路网络相互关联。颗粒酶基因家族下调及组蛋白修饰异常可能共同导致免疫清除缺陷,为开发靶向表观调控或线粒体功能的新型疗法提供理论依据。
- 王楚望周建大向艳莲李珮婷王少华陈佳陈舒悦熊武刘钰符晓
- 关键词:皮肤溃疡基因表达谱
- 红细胞异质性与调控机制研究
- 研究目的:红细胞作为人体血液中含量最丰富的一类细胞,对于机体维持生命活动具有十分重要的生物学意义。传统的观点认为,红细胞的主要功能是运输氧气到身体各个组织和器官,并将二氧化碳排出体外。但近年有研究表明,在机体处于肿瘤或者...
- 张英楠
- 关键词:红细胞生成RNA结合蛋白红细胞生成细胞周期
- 人产前免疫细胞图谱构建与巨噬细胞异质性分析
- 免疫系统是人体内部的重要防御系统,负责识别并对抗外来病原体,以维持身体的健康平衡。然而,免疫系统的形成和发展是一个复杂的过程,在人体早期发育阶段尤其显著。当前的免疫学研究主要集中在成年阶段,对早期发育阶段的免疫特性了解十...
- 王泽帅
- 小鼠原位移植肝癌模型脏器内中性粒细胞异质性分析
- 2024年
- 目的:建立小鼠原位移植肝癌模型,深入分析肝癌负荷下小鼠骨髓、脾脏和肝脏内中性粒细胞的异质性。方法:选取16只健康雌性BALB/c小鼠,6~8周龄,随机分为肝癌模型组和对照组。模型组通过肝脏注射H22细胞系建立肿瘤,对照组注射PBS。接种后18~20天,收集两组小鼠的骨髓、脾脏及肝脏组织,分离免疫细胞,流式细胞术检测中性粒细胞的比例,并探讨肝癌负荷下中性粒细胞的异质性。根据CXCR2和CD101分子的表达,我们分析了荷瘤小鼠脏器内四个不同成熟状态的中性粒细胞亚群。结果:与对照组相比,肝癌组小鼠的骨髓、外周血、脾脏和肝脏内中性粒细胞比例均显著升高;进一步分析发现荷瘤小鼠脏器内存在四个不同成熟阶段的中性粒细胞亚群,包括CXCR2^(-)CD101^(+)、CXCR2^(+)CD101^(+)、CXCR2^(+)CD101^(-)和CXCR2^(-)CD101^(-)亚群,这一发现支持了中性粒细胞的异质性。具体来说,在肝癌小鼠骨髓中CXCR2^(-)CD101^(+)亚群和CXCR2-CD101^(-)未成熟亚群比例显著增加,而CXCR2^(+)CD101^(+)成熟亚群和CXCR2^(+)CD101^(-)低成熟亚群比例则显著减少。脾脏和肝脏内的粒细胞亚群整体变化趋势类似,即CXCR2^(-)CD101^(+)亚群、CXCR2^(+)CD101^(-)低成熟亚群和CXCR2^(-)CD101^(-)未成熟亚群的比例均增加,而CXCR2^(+)CD101^(+)成熟亚群的比例显著减少,提示外周脏器内未成熟或低成熟中性粒细胞增加,而成熟中性粒细胞减少。结论:本研究揭示了肝癌进展中,小鼠骨髓、脾脏和肝脏内中性粒细胞数量的显著增加及其亚群比例的显著变化,为理解肝癌进展中中性粒细胞的表型异质性提供重要依据,并为进一步阐明中性粒细胞参与肝癌进展的机制提供了新的视角。
- 贺改霞冯俊周颖李文娟梁映雪尚琪张栩锐李宗芳
- 关键词:中性粒细胞肝细胞癌
相关作者
- 陆瑶

- 作品数:40被引量:0H指数:0
- 供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
- 研究主题:微流控芯片 单细胞分析 高通量 分泌蛋白 单细胞
- 臧天仪

- 作品数:41被引量:52H指数:3
- 供职机构:哈尔滨工业大学
- 研究主题:操作系统 类蛋白 蛋白质 内分泌疾病 细胞异质性
- 赵飞

- 作品数:21被引量:5H指数:1
- 供职机构:哈尔滨工业大学
- 研究主题:内分泌疾病 细胞异质性 心血管疾病 基因 邻域信息
- 张韵

- 作品数:10被引量:10H指数:2
- 供职机构:山东大学齐鲁医院
- 研究主题:TIM-3 妊娠早期 单核 细胞异质性 蜕膜
- 冯颖

- 作品数:200被引量:719H指数:13
- 供职机构:沈阳农业大学食品学院
- 研究主题:牛磺酸 弓形虫 多糖 黄酮 花色苷