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细胞外基质蛋白质预测工具和参考数据库的研发与应用
细胞外基质(extracellular matrix,ECM)蛋白质微环境的重要组成部分,它不仅可以通过与其他蛋白质的相互作用为提供机械结构支持,还可以通过信号传导对功能进行调节。ECM蛋白质的结构和功能失...
刘炳辉
关键词:细胞外基质蛋白质组数据库
细胞外基质蛋白质预测工具研究进展被引量:2
2019年
细胞外基质蛋白质的一系列生物过程中发挥着重要作用,它的异常调节会导致很多重大疾病。理论细胞外基质蛋白质参考数据是实现细胞外基质蛋白质高效鉴定的基础,研究者们已经基于机器学习的方法开发出一系列的细胞外基质蛋白质预测工具。文中首先阐述了基于机器学习模型构建细胞外基质蛋白质预测工具的基本流程,之后以工具为单位总结了已有细胞外基质蛋白质预测工具的研究成果,最后提出了细胞外基质蛋白质预测工具目前面临的问题和可能的优化方法。
刘炳辉马洁马洁
视网膜光感受器细胞外基质蛋白质SPACR的分离纯化
2011年
目的建立视网膜光感受器细胞外基质(Interphotoreceptor matrix,IPM)蛋白质sialoprotein associated with cones and rods(SPACR)分离和纯化方法。方法分离视网膜IPM,提取蛋白质组份,通过离子交换、凝胶过滤层析等技术分离纯化SPACR,并通过双向电泳及western blot技术验证。结果通过双向电泳技术及western blot结果显示分离纯化后仅有等电点在5-5.5,分子量约在150 kDa的单一条带和SPACR抗体反应,表明得到高纯度的SPACR。结论通过本文所述方法可以得到纯度较高的SPACR,为将来进一步对SPACR活性及结构研究奠定了基础。
赵劲松黄岚峰王淑荣
关键词:视网膜双向电泳
老年人皮肤局部应用17β-雌二醇可通过体内途径刺激TGF-β信号增加细胞外基质蛋白质合成被引量:3
2005年
To investigate the effects of topically applied 17β-estradiol on the expression of extracellular matrix proteins in aged human skin, 17β-estradiol (0.01%) and its vehicle (70%propylene glycol, 30%ethanol) were applied to aged (68-82 y, eight females and five males) human buttock skin under occlusion for 2 wk (three times per week). Topical 17β-estradiol was found to increase the expression of type 1 procollagen mRNA and protein significantly in human aged skin in vivo. In addition, MMP-1 protein levels were reduced by topical 17β-estradiol. The expressions of TGF-β1,TGF-βtype II receptor, and Sma and Mad related (Smad)3 were increased by topical 17β-estradiol in aged human skin, and TGF-β1 neutralizing antibody inhibited 17β-estradiol-induced procollagen synthesis in cultured fibroblasts. We also found that the expressions of tropoelastin and fibrillin-1 mRNA and protein, and elastic fibers in aged skin were also increased by topical 17β-estradiol. Topical 17β-estradiol also increased keratinocyte proliferation and the epidermal thickness in aged human skin. We also observed the same effects of topical 17β-estradiol in young skin. In conclusion, our results suggest that topical 17β-estradiol treatment may improve the cutaneous function of aged human skin by improving the connective tissue and increasing epidermal thickness.
Son E.D.Lee J.Y.Lee S.J.H. Chung刘安
关键词:Β-雌二醇蛋白质合成细胞外基质胶原合成前胶原
急性白血病患者OLFML2A的表达及其诊断和预后评估价值
2025年
目的探讨嗅介蛋白蛋白2A(OLFML2A)在急性白血病(AL)患者周血中转录水平的表达及其诊断和预后评估价值。方法回顾性队列研究。选取2019年1月至2023年3月连云港市第二人民医院收治的34例AL患者(AL组),其中急性髓系白血病(AML)(非急性早幼粒白血病)26例,急性淋巴白血病(ALL)8例;另选取同期体检健康者15名作为健康对照组。26例AML患者中,男性18例,女性8例;中位年龄[M(IQR)]59(9)岁;5例为复发患者。8例ALL患者中,男性4例,女性4例;中位年龄48(12)岁;1例为复发患者。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)法检测各组周血OLFML2A mRNA相对表达量。比较临床病理因素分层患者间OLFML2A mRNA相对表达量。以骨髓涂片学或骨髓活组织检查病理学诊断为金标准,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析OLFML2A mRNA相对表达量对AML及ALL的诊断效能。根据AL患者OLFML2A mRNA中位相对表达量将患者分为OLFML2A mRNA高表达(≥中位值)组和低表达(<中位值)组,采用Kaplan⁃Meier曲线分析两组患者无进展生存(PFS)和总生存(OS)情况,组间比较采用log⁃rank检验。结果AL组OLFML2A mRNA中位相对表达量高于健康对照组[3.53(8.19)比0.27(0.23)],差异有统计学意义(Z=4.38,P<0.001);AML组OLFML2A mRNA中位相对表达量高于ALL组[4.92(9.80)比1.60(4.35)],且两组均高于健康对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。不同预后危险分层、是否融合基因阳性、有无染色体异常、日平均住院费是否<2500元的AML患者间OLFML2A mRNA相对表达量差异均有统计学意义(均P<0.05);不同预后危险分层、是否伴融合基因、有无染色体异常的ALL患者间OLFML2A mRNA相对表达量差异均有统计学意义(均P<0.05)。ROC曲线分析显示,依据OLFML2A mRNA相对表达量诊断AML的曲线下面积为0.936(95%CI:0.862~1.000),最佳临界值为0.780;诊断ALL的曲线下面积为0.767(95%CI:0.535~0.998),最佳临界值为0.558
何耀李金莲卢璇庄万传柴星星
关键词:细胞外基质蛋白质类预后
基质金属蛋白酶在儿童哮喘发生机制中作用的研究现状
2024年
儿童哮喘(childhood asthma)是一种常见儿童慢性气道炎症性疾病,临床表现为反复出现的喘息、呼吸急促和咳嗽。儿童哮喘的病理机制包括气管炎症、气道高反应性(AHR)和气道重塑(AR),可导致患儿气流受限和呼吸困难。儿童哮喘的病因复杂,涉及多种遗传和环境因素,可导致患儿气管对多种刺激因子表现出异常敏感性。近年研究表明,基质金属蛋白酶(MMP)在儿童哮喘病程中起着重要作用。MMP可通过调控细胞外基质(ECM)降解,促进炎症迁移和气管结构改变,从而影响哮喘病情发展。目前,以MMP为靶点的儿童哮喘治疗方法,已在临床和临床前研究中显示出积极的治疗疗效。未来通过深入研究MMP在儿童哮喘中的复杂调控机制,有望精准开发更为有效的治疗药物,从而提高哮喘患儿生活质量,并为其他慢性气管疾病的治疗提供借鉴。笔者拟就MMP对儿童哮喘发生的作用机制及MMP对哮喘患儿分子靶向治疗应用的最新研究现状进行阐述。
刘琴刘瀚旻谢亮
关键词:哮喘基质金属蛋白酶类支气管高反应性气道重塑细胞外基质蛋白质类分子靶向治疗儿童
骨涎蛋白促进破骨分化和骨吸收的分子网络分析
背景:随着人口老龄化和人寿命的延长,骨质疏松症正日益成为全球性的流行病,目前有2亿多人患有骨质疏松症;全球10%以上的成年人可能受到严重牙周病的影响,两者可导致生活质量下降,造成巨大的财政负担。两大疾病都是因过度骨吸收...
曾俊铭
关键词:骨涎蛋白破骨细胞
Periostin在妇科恶性肿瘤中的研究现状
2022年
骨膜蛋白(periostin)是近年被发现的一种多功能高分子糖蛋白,主要由成骨及其前体分泌,也可由肿瘤及癌旁分泌。该蛋白是一种高度保守的功能蛋白质,参与细胞外基质(ECM)的组成,并与肿瘤黏附、转移和生长密切相关,属于分泌型可溶性ECM蛋白。periostin促进肿瘤生存的分子机制及其与肿瘤发生、发展的关系具有重要理论意义,而且可为肿瘤的临床检测和治疗提供新靶点。笔者拟就periostin的结构与功能,periostin高表达在妇科恶性肿瘤发生、发展中的作用机制,在卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌的初步研究,以及periostin为肿瘤治疗提供新靶点等的最新研究进展进行阐述。
初磊郭翼童晓文
关键词:细胞外基质PERIOSTIN细胞外基质蛋白质类子宫内膜肿瘤间质细胞
ST段抬高型心肌梗死患者术后发生主要不良心血管事件风险标志物探索被引量:14
2022年
目的探讨择期PCI术后的血清可溶性髓样触发受体样转录因子1(sTLT-1)、骨膜素水平对ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者发生主要不良心血管事件(MACE)的预测价值。方法选取华中科技大学协和深圳医院收治的220例首次确诊为STEMI患者,均行择期PCI,根据术后是否发生MACE将患者分为MACE组67例和无MACE组153例,比较2组患者血清sTLT-1、骨膜素水平,探讨其变化与MACE发生的关系。结果 2组Killip分级、血清sTLT-1、骨膜素水平比较有显著差异(P<0.05,P<0.01)。血清sTLT-1预测STEMI患者PCI术后发生MACE的ROC曲线下面积为0.82(95%CI:1.124~4.237),敏感性和特异性分别为75.46%和78.52%,骨膜素预测STEMI患者PCI术后发生MACE的ROC曲线下面积为0.79(95%CI:1.135~3.216),敏感性和特异性分别为72.69%和74.38%,联合检测的ROC曲线下面积为0.83(95%CI:1.146~2.235),敏感性和特异性分别为80.34%和83.45%。多因素logistic回归分析显示,Killip分级Ⅳ级、血清sTLT-1水平>0.63μg/L、骨膜素水平>40.35μg/L是STEMI患者PCI术后发生MACE的独立危险因素(P<0.05)。结论血清sTLT-1、骨膜素水平与MACE发生概率呈正比,其水平检测对于预测PCI术后MACE发生具有较高临床应用价值。
朱靖陈少源王玉肖坚刘远昌
关键词:ST段抬高型心肌梗死细胞外基质蛋白质类血小板黏附
周血游离CD147及其诱导产物基质金属蛋白酶-9对颅脑创伤患者短期预后的评估意义被引量:1
2022年
目的观察颅脑创伤患者周血游离CD147及其诱导产物基质金属蛋白酶-9(MMP-9)动态变化,并探讨其表达变化与短期预后的关系。方法纳入2014年5月至2016年12月天津医科大学第二医院收治的39例颅脑创伤患者,酶联免疫吸附试验测定周血游离CD147和MMP-9表达变化,明胶酶谱法测定MMP-9活性,出院时采用Glasgow预后分级(GOS)评价预后。结果男性与女性患者出院时GOS评分差异无统计学意义(2.63±1.28对2.57±1.14;t=0.161,P=0.873);不同年龄段出院时GOS评分差异具有统计学意义(t=2.191,P=0.038),>60岁患者GOS评分低于<40岁(t=2.645,P=0.014)和40~60岁(t=2.320,P=0.029)患者。根据GOS评分分为预后良好组(GOS评分≥3,25例)和预后不良组(GOS评分<3,14例),预后不良组患者周血游离CD147[(5.07±1.89)ng/ml对(10.37±1.69)ng/ml;t=2.080,P=0.048]和MMP-9[(41.55±4.67)ng/ml对(75.23±5.18)ng/ml;t=2.512,P=0.019]水平高于预后良好组。偏相关分析结果显示,出院时GOS评分与周血游离CD147(r=-0.473,P=0.000)和MMP-9(r=-0.435,P=0.036)水平呈负相关。结论颅脑创伤患者周血游离CD147及其诱导产物MMP-9水平越高、预后越差,可以作为提示颅脑创伤患者预后不良的重要指标。
王德胜刘士敏魏铭李宏
关键词:细胞外基质蛋白质类基质金属蛋白酶9预后酶联免疫吸附测定

相关作者

万玲
作品数:52被引量:278H指数:10
供职机构:第四军医大学口腔医学系
研究主题:牙周膜细胞 釉基质蛋白 牙周组织再生 牙周膜细胞增殖 牙周炎
吴织芬
作品数:242被引量:1,130H指数:17
供职机构:第四军医大学
研究主题:牙周膜细胞 牙周炎 牙周病 牙周组织再生 牙周膜细胞增殖
欧会林
作品数:8被引量:0H指数:0
供职机构:浙江大学
研究主题:蛋白聚糖类 SHRNA干扰 胶原凝胶 细胞外基质蛋白质类 细胞共培养
沈燕
作品数:122被引量:238H指数:8
供职机构:贵州省人民医院
研究主题:腹膜透析 疗效观察 结缔组织生长因子 急性肾损伤 腹膜透析患者
石关桐
作品数:96被引量:838H指数:17
供职机构:上海中医药大学附属曙光医院
研究主题:中医药疗法 骨密度 骨质疏松症 股骨头坏死 软骨寡聚基质蛋白