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青海草原毛虫雌蛾性腺气味受体基因的鉴定及组织表达分析: 2025年; 为明确青海草原毛虫Gynaephora qinghaiensis雌蛾性腺气味受体(odorant receptors,ORs)基因的分子特性及组织表达水平,进而为后续基因功能的研究奠定基础,本研究利用生物信息学方法及RT-qPCR技术,对性腺ORs基因进行鉴定及表达谱分析。从性腺转录组数据库共筛选鉴定出13个气味受体基因(包括12个GqinORs,1个GqinOR_(co)),其中只有GqinOR1具有1个信号肽;除GqinOR3、GqinOR7和GqinOR9以外,其余GqinORs具有1~3个跨膜结构域,GqinOR_(co)具有8个跨膜结构;GqinORs二级结构以α螺旋为主。系统进化分析表明,GqinORs可能与桃蛀螟Conogethes punctiferalis和小线角木蠹蛾Streltzoviella insularis的ORs具有共同祖先。基因表达谱分析发现,性腺ORs基因在雌雄不同组织表现出不同的表达水平(P<0.05),13个气味受体基因在性腺中都有表达,且GqinOR8、GqinOR10在触角和性腺中高表达。本研究为进一步研究青海草原毛虫气味受体嗅觉功能提供重要依据。; 刘占玲高书晶韩海斌唐德靖孔一森潘学能周渊涛; 关键词：气味受体性腺生物信息学分析表达谱分析

从江香猪DDX6基因克隆、组织表达分析及真核表达蛋白鉴定: 2025年; 本研究克隆了从江香猪DDX6(DEAD-Box Polypeptide 6,DDX6)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析和组织表达分析,并构建真核表达载体,鉴定其表达与细胞定位,为研究DDX6在抗病毒免疫应答中的作用奠定基础。结果表明:成功克隆了从江香猪DDX6基因CDS区,从江香猪DDX6基因CDS区序列全长1452 bp,编码483个氨基酸。DDX6蛋白为可溶性蛋白,不存在跨膜结构,拥有多个糖基化修饰位点。DDX6在从江香猪的心脏、肝脏和脾脏等组织中均有表达。DDX6在淋巴结的表达量显著高于其余组织,在骨骼肌的表达量则相对最低。DDX6在猪肺泡巨噬细胞传代细胞系(PAM-CD163)中主要定位于细胞质,重组蛋白Myc-DDX6具有良好的反应原性。以上试验结果为进一步探究DDX6基因的生物学功能奠定基础。; 赵静邓乔木胡璇王怡然杨洪兴温贵兰李波; 关键词：从江香猪生物信息学真核表达载体

鸡Sox10基因克隆、生物信息学及组织表达分析: 2025年; 为了探究Sox10(SRY-related HMG-box 10)氨基酸序列特征以及Sox10在淅川乌骨鸡不同组织的表达量变化,试验对淅川乌骨鸡Sox10基因CDS区进行PCR克隆并使用在线软件分析氨基酸序列,同时,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分别检测Sox10在心、肝、胸肌、腿肌和背肤的表达水平。结果表明:Sox10基因CDS区测序长度为1386bp,编码了461个氨基酸。同源性比对和系统进化树显示,淅川乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与鱼类最远。Sox10蛋白分子质量为49.86 ku,等电点为6.20,具有不稳定性、酸性和亲水性,且不存在跨膜区和信号肽,存在HMG结构域及55个磷酸化位点,5'端2000 bp不含甲基化位点。Sox10主要包括无规则卷曲,大部分位于细胞核,与DCT、EDNRB、Pax3、Pax7等蛋白存在互作关系,参与细胞发育过程中的DNA、蛋白质结合以及转录调节功能。qRT-PCR结果表明,Sox10在背肤的表达量显著高于心、肝、胸肌和腿肌,在肝脏和胸肌的表达量显著低于心、腿肌和背肤。以上结果为进一步探究Sox10基因对黑色素沉积的调控机制提供了理论依据。; 徐硕辉张朋威朱慧媛宋素芳李文婷孙桂荣田亚东田亚东李东华; 关键词：组织表达分析

牛miR-155靶基因预测及其组织表达分析: 2025年; 为探究bta-miR-155在牛重要组织中的潜在功能,使用miRDB、TargetScan和miRWalk在线软件预测bta-miR-155靶基因,利用DAVID在线数据库对预测靶基因进行GO注释和KEGG通路富集分析;利用MEGA 11.0软件对牛、人、猪、狗、大鼠、家鼠、山羊和恒河猴的miR-155进行保守性分析并进行系统进化树构建;最后利用RT-qPCR技术对bta-miR-155在牛主要组织心、脾、肺、肾、睾丸、股二头肌和背最长肌中的表达进行检测。结果表明,bta-miR-155位于牛基因组1号染色体,其成熟序列在各物种间保守性较高,只有猪、家鼠和大鼠在12 nt或23 nt处不完全保守或缺失,且有24个预测靶基因;GO功能分析发现,bta-miR-155靶基因富集程度高的条目主要有RNA聚合酶Ⅱ启动子对pri-miRNA转录的正向调控、NF-kappaB转录因子活性的正调控、白细胞介素-1β产生的正调控、平滑肌细胞增殖的正向调节和成肌细胞分化的负调控等;KEGG通路显著富集于脂质和动脉粥样硬化、白细胞分化抗原36、固醇调节元件结合蛋白1、NOD样受体、白细胞介素18和脂肪细胞因子等信号通路。bta-miR-155的组织表达分析结果表明,bta-miR-155在成年牛股二头肌中的表达量最高,在心肌中的表达量最低;成年牛背最长肌中bta-miR-155的表达量显著高于犊牛(P<0.05)。综上,btamiR-155在牛肌肉组织中的高表达提示其可能在肌肉生长发育过程中发挥重要作用,为后续开展bta-miR-155在牛肌肉发育、肌纤维类型转化中的分子功能探究奠定了基础。; 何学亮徐俊杰姬小云丁燕玲曲畅周小南梁嘉豪魏大为史远刚康晓龙

槟榔江水牛SREBF1基因克隆、分子特征及组织表达分析: 2025年; 【目的】阐明水牛固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的分子特征和组织表达特异性,初步揭示其分子功能。【方法】以槟榔江水牛为研究对象,采用RT-PCR技术克隆水牛SREBF1基因完整编码序列(coding sequence,CDS);利用生物信息学方法分析SREBF1分子特征;采用qPCR技术检测SREBF1在泌乳期水牛多个组织中的表达特异性。【结果】水牛SREBF1 CDS全长3438 bp,编码1145个氨基酸残基组成的亲水蛋白;SREBF1包含1个bHLHzip_SREBP1(AA319~393)DNA结合结构域,无跨膜结构和信号肽,主要定位于细胞核和内质网,主要功能是结合并调控DNA转录、参与脂质代谢等。水牛与其他牛科物种SREBF1在一级结构、理化特征、结构域和高级结构上高度相似。在基于SREBF1氨基酸序列构建的系统发育树上,水牛与其他牛科物种聚为1类。在泌乳期水牛的8个组织中,SREBF1基因在乳腺中的表达水平最高,其次是肝脏、骨骼肌、垂体、肾脏,在脾脏、瘤胃和心脏中的表达水平较低。【结论】水牛与其他牛科物种SREBF1氨基酸序列具有高度的相似性。水牛SREBF1可调控DNA转录,在脂质代谢旺盛的组织中发挥作用。; 刀文彬欧阳依娜梁建平范新阳范新阳苗永旺; 关键词：槟榔江水牛分子特征

大豆IGT基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析: 2025年; 【目的】利用生物信息学方法对大豆‘天隆1号’Glycine max ‘Tianlong 1’ IGT基因家族进行全基因组鉴定,探究IGT基因家族在大豆中的潜在功能。【方法】通过对大豆‘天隆1号’IGT蛋白结构域进行BLASTP搜索,确定GmIGTs;以生物信息学方法分析其进化关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、共线性关系,以及在不同组织部位表达模式。【结果】共鉴定出17个GmIGT基因,并根据其系统发育关系将其分为4个分支:TAC、IGT-like、DRO和LAZY。蛋白质保守基序分析发现:‘天隆1号’IGT蛋白均含有Motif2。染色体定位和共线性分析显示:GmIGT不均匀地定位在11条染色体上,并且片段复制可能在GmIGT基因的扩张中发挥了重要作用。顺式作用元件分析表明:GmIGT的表达可能与光响应、生理响应、植物激素响应和胁迫等相关。此外,实时荧光定量聚合酶链式反应分析表明:GmIGT基因具有明显的组织特异表达特点,GmIGT4在所有组织中表达量都相对较高,GmIGT4、GmIGT10与GmIGT17在茎与叶柄中高度表达。【结论】GmIGT基因可能在塑造大豆‘天隆1号’株型中发挥某些潜在作用,GmIGT4、GmIGT10与GmIGT17可能为该过程中的核心基因。; 陈梦瑶胡怡然郑志富潘天; 关键词：株型

西门塔尔牛NDUFS2基因CDS区克隆、序列特征及组织表达分析: 2025年; NDUFS2基因已被报道参与了线粒体相关功能的生物学调控,而线粒体是肌肉发育过程中重要的细胞器,因此NDUFS2基因在肌肉发育过程中可能发挥潜在作用。为深入探究NDUFS2基因在调节牛肌肉发育及线粒体功能方面的分子作用,本研究以西门塔尔牛背最长肌组织cDNA为模板,PCR扩增获得NDUFS2基因CDS区全长,采用生物信息学方法,分析NDUFS2基因全长编码区的序列特征,最后采用qRT-PCR检测NDUFS2基因在重要组织及不同时期肌肉组织中的表达特征。结果表明:西门塔尔牛NDUFS2基因编码区全长为1392 bp,编码463个氨基酸。NDUFS2基因在不同物种间具有较高的保守性,且与绵羊的同源性最高。该基因编码蛋白为亲水性稳定蛋白,主要由α-螺旋及不规则卷曲构成,且主要分布在线粒体内膜上。蛋白互作分析发现,NDUFS2蛋白与NDUFA3、NDUFA9、NDUFB6等与线粒体功能相关的蛋白存在相互作用。qRT-PCR结果表明,NDUFS2基因在各个组织均有广泛表达,在背最长肌和股二头肌中高表达,且在成年牛中的表达量极显著高于犊牛,提示其可能在线粒体功能和肌肉发育方面发挥潜在调控作用。本研究结果为后续牛NDUFS2基因的分子调控机制研究奠定了基础。; 曲畅周小南徐俊杰史远刚康晓龙; 关键词：编码区肌肉组织线粒体

合作猪TRIF基因CDS区克隆鉴定及组织表达分析: 2025年; 【目的】β-干扰素TIR结构域衔接蛋白(TIR domain-containing adaptor protein inducing interferon β,TRIF)基因在机体抗病免疫中具有重要作用,本研究旨在探究合作猪TRIF基因CDS区序列特征及组织表达特点。【方法】以甘肃合作猪为研究对象,克隆TRIF基因CDS区全长序列,并对其进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR技术检测合作猪TRIF基因在肺脏、肾脏、脾脏、背最长肌、盲肠、回肠、直肠、结肠共8种组织中的表达量。【结果】合作猪TRIF基因CDS区全长2 142 bp,编码713个氨基酸,与NCBI数据库中收录的野猪TRIF基因序列(登录号:NM_001315738.2)相似性为99.81%。系统进化树结果显示,合作猪与野猪亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。合作猪TRIF蛋白具有亲水性,无跨膜区域,不存在信号肽,且不存在N-糖基化修饰位点,其主要定位于细胞核内。TRIF蛋白的二级结构主要以无规则卷曲为主,三级结构与二级结构预测结果基本一致,该蛋白存在6个低复杂度结构域和1个卷绕线圈区域。实时荧光定量PCR检测结果表明,合作猪TRIF基因在肺脏、肾脏、脾脏、背最长肌、盲肠、回肠、直肠、结肠中均有表达,其中在背最长肌中表达量最高。【结论】本试验成功克隆出合作猪TRIF基因CDS区序列,其在背最长肌中的表达量最高,该研究结果可为后续研究合作猪TRIF基因提供参考依据。; 胡慧慧付盼盼李杰闫尊强高小莉杨姣姣黄晓宇; 关键词：合作猪

半番鸭NMB基因克隆、生物信息学和组织表达分析: 2025年; 【目的】本研究旨在克隆半番鸭神经介素B(NMB)基因并对其进行序列分析,检测NMB基因在半番鸭不同组织中的表达情况。【方法】根据NCBI数据库中鸭NMB基因的预测序列(登录号:XM_027466185.2)设计引物,通过PCR扩增获得半番鸭NMB基因片段,克隆后测序获得NMB基因序列;利用生物信息学分析软件对半番鸭NMB核苷酸和氨基酸序列进行分析,并构建遗传进化树;通过实时荧光定量PCR检测NMB基因mRNA在半番鸭体内多个组织中的表达情况。【结果】本试验克隆获得了半番鸭NMB基因,其CDS序列长度为387 bp,编码128个氨基酸,包括14个氨基酸(GNLWATGHFMGKKS)的蛙皮素保守结构域,与鸡、小鼠、猪、牛和人的NMB的保守结构域完全相同。相似性比对发现,半番鸭与鸡NMB基因核苷酸和氨基酸序列的相似性较高,分别为87.9%和89.8%,与其他动物的相似性较低;半番鸭NMB在进化上与鸡亲缘关系较接近,与牛、马、猪、犬等家畜较远。生物信息学分析结果表明,半番鸭NMB蛋白属于亲水性蛋白,其N-端22个氨基酸为信号肽,二级结构和三级结构中α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占53.91%、14.06%、7.03%和25.00%,半番鸭NMB蛋白主要与NMBR和GRPR蛋白结合发挥作用。实时荧光定量PCR结果显示,NMB基因mRNA在半番鸭中枢和外周多个组织器官中均有表达;以空肠为对照,NMB基因在中枢的小脑、大脑和视叶表达量相对较高(P<0.01),在外周的气管、肺脏、松果体、甲状腺、肾脏和尾脂腺表达量相对较高(P<0.01)。另外,NMB基因mRNA在不同性别半番鸭体内的表达趋势基本一致,但在在小脑和胰腺等组织中母鸭比公鸭NMB基因mRNA的表达量相对较高(P<0.01),但在松果体和肾脏等组织中则相反(P<0.01;P<0.05)。【结论】半番鸭NMB蛋白具有蛙皮素的保守结构域,与鸡的亲缘关系最近、蛋白相似性高,属于亲水性蛋白,有信号肽。NMB基因在半番鸭多�; 张莹陈广振刘梅李红霞俞燕贾雪波李雯倩范建华马志禹; 关键词：半番鸭克隆生物信息学

九疑山兔FGF 10基因克隆、生物信息学及组织表达分析: 2025年; 【目的】探讨九疑山兔成纤维细胞生长因子10(fibroblast growth factor 10,FGF10)基因的分子结构特征及其在九疑山兔不同日龄、不同组织中的表达模式。【方法】试验以九疑山兔背最长肌为材料,对九疑山兔FGF 10基因编码区序列(CDS)进行克隆,利用MegAlign软件分析FGF10氨基酸序列相似性,并使用Mega 11.0软件构建系统进化树。利用ProtParam、SOPMA等在线网站对FGF10蛋白的理化性质、二级结构和三级结构等进行预测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测FGF 10基因在1、35、84、180日龄九疑山兔的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌中的表达量。【结果】九疑山兔FGF 10基因CDS区长度为663 bp,共编码220个氨基酸,其编码的氨基酸序列与家兔、欧洲兔、鸡、蟾蜍、绵羊、家牛、马、人、小鼠的相似性分别为100.0%、99.5%、87.3%、73.1%、97.2%、97.2%、99.1%、99.0%、93.8%,系统进化树结果显示九疑山兔与马的亲缘关系较近。九疑山兔FGF10蛋白属于亲水性不稳定蛋白,存在1个跨膜区域和1个信号肽,其结构域包括跨膜区、低复杂度区域和FGF家族同源结构域等结构,并含有2个糖基化位点和40个磷酸化位点。其二级结构以无规则卷曲为主(49.55%),其次为延伸链(25.91%),三级结构与二级结构的预测结果一致。蛋白互作预测发现FGF10蛋白还与KL、FGFR2、FGFR4等蛋白存在互作。实时荧光定量PCR结果表明,FGF 10基因在4个日龄九疑山兔的肺脏中表达量均为最高,肾脏其次,而在肝脏中表达量最低。此外,FGF10基因在九疑山兔背最长肌组织中的表达水平随着时间的延长呈现下降趋势,在84日龄时达到最低点。【结论】九疑山兔FGF10蛋白与家兔和欧洲兔的相似性最高,为不稳定的亲水蛋白,存在跨膜区、信号肽、糖基化位点和磷酸化位点。FGF 10基因在九疑山兔不同日龄、不同组织中差异表达。试验结果为深入研究FGF 10; 黄念旎黄子珂李聪聪刘晗马诗语宋果蒋亮彭为波杨联熙黄生强; 关键词：九疑山兔分子特性

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