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搜索到498篇“ 系统发育学“的相关文章

中国主产区冬虫夏草菌ITS基因及其寄主蝙蝠蛾COI基因的系统发育学分析: 2024年; [目的]对冬虫夏草菌ITS基因序列及其寄主蝙蝠蛾COI基因序列进行系统发育学分析,研究其遗传分化和变异程度。[方法]采用系统发育分析法,分析ITS基因、COI基因序列并构建系统发育树,计算序列单倍型多样性(Hd)、核苷酸多态性(Pi)。[结果]冬虫夏草菌ITS基因序列可分为17个单倍型,Hd=0.875,Pi=0.00119;寄主蝙蝠蛾COI基因序列可分为18个单倍型,Hd=1.000,Pi=0.00034。利用基因替代速率推测冬虫夏草菌至少起源于58.3百万年前,寄主蝙蝠蛾约起源于17.5百万年前。[结论]冬虫夏草菌及其寄主蝙蝠蛾的遗传差异均与所处纬度无关,且遗传距离与地理距离无相关性;中国主产区冬虫夏草菌及其寄主蝙蝠蛾群体具有丰富的遗传和分化多样性,可能是冬虫夏草菌及其寄主蝙蝠蛾的起源之一;冬虫夏草菌的分化时间明显早于寄主蝙蝠蛾,推测冬虫夏草菌在寄生蝙蝠蛾之前可能以土生方式存在或者有另外的寄主,在寄生蝙蝠蛾后二者产生了协同进化关系,并促使寄主蝙蝠蛾的多样性分化。; 杜玉杰李劲涛陈玉龙; 关键词：冬虫夏草菌蝙蝠蛾 ITS基因 COI基因系统发育

庞泉沟结丝藻的形态学与系统发育学分析: 2024年; 结丝藻是具有独特形态特征且分布十分广泛的丝状蓝藻,但我国对结丝藻的物种多样性和分布研究较少.从山西庞泉沟国家级自然保护区分离出两株丝状蓝藻,编号为SXACC0059和SXACC0060,运用包括形态学、系统发育学以及生态学等多相方法对藻株进行分类鉴定.结果表明,藻株的形态特征与结丝藻属物种相似,16S rRNA基因相似度高达98%以上,系统发育分析表明藻株SXACC0059和SXACC0060分布在结丝藻属进化枝中,自展支持值分别为1/100/100和0.85/79/82.此外,藻株SXACC0059与Nodosilinea chupicuarensis的二级结构相似,藻株SXACC0060与Nodosilinea epilithica的二级结构相同.因此,藻株SXACC0059属于Nodosilinea chupicuarensis,藻株SXACC0060属于Nodosilinea epilithica.藻株的准确鉴定丰富了我国蓝藻的物种多样性,进一步探究蓝藻的分类地位,为实现单系化蓝藻奠定基础.; 张婷王捷郭香宏杨晓帆郭姗姗魏爱丽; 关键词：形态学系统发育学

成都市植物园子囊菌分类及系统发育学研究: 成都市位于中国西南部,地处亚热带湿润季风气候区,气候温暖,四季分明,降水充沛,地理特征独特。优越的气候和地理条件不仅提高了园林植物的多样性,还孕育了丰富的真菌资源。园林植物与真菌密切相关,真菌不仅在其生长过程中扮演着重要...; 梁瑞茹; 关键词：形态学系统发育学多样性

四川省花椒上腐生和叶部病原真菌的分类及系统发育学研究: 花椒作为具有高经济价值和药用价值的重要植物,其在我国拥有悠久的栽培历史。人工种植的花椒主要是花椒(Zanthoxylum bungeanum)和竹叶花椒(Z.armatum)这两种植物,两者果实统称为“花椒”。尽管对影响...; 吴凯; 关键词：病原真菌腐生真菌花椒真菌分类

砗磲分子系统发育学研究综述: 2023年; 砗磲是目前现存体型最大的海洋双壳纲软体动物,具有重要的观赏价值和经济价值,研究其系统发育关系对于砗磲种质保存、利用和遗传育种具有重要意义。该文从不同分类单元的系统关系总结了砗磲分子系统发育学研究进展。结果表明,现有分子发育学研究结果大多支持砗磲为亚科,亚科下有砗磲属、砗蚝属,砗磲属下分为3个亚属,种群亚属之前的系统发育关系仍然模棱两可,需要更多的实验和数据进行分析明确。此外,还对近年来新发现的种类重新分析、梳理,为砗磲的进一步研究提供了参考。; 胡美玲王沛张明哲周卫川陈宇; 关键词：砗磲分子系统发育基因组

安徽省皮下盘菌属的分类及分子系统发育学研究: 本研究包括两大部分，第一部分是采用现代菌物分类法，即形态学结合分子生物学技术。从形态解剖学、系统发育学、地理分布以及生态等多个方面入手，对安徽省的皮下盘菌属（Hypoderma）成员进行较系统全面的研究。第二部分采用分子...; 杨富霞; 关键词：斑痣盘菌科系统发育学分子验证

基于形态及分子系统发育学的四种检疫性担子菌物种界定: 防止外来有害生物入侵是实现我国农林业可持续发展和维护国家生态安全的重要保障。《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》中列有130种真菌,由于大部分真菌形态微小、难以简单依靠形态特征进行精确的鉴定识别,其检测与防控一直...; 李琰; 关键词：分类学系统发育学

多位点序列和比较基因组学分析对盐单胞菌科菌株JSM 104105的系统发育学研究被引量：6: 2023年; 【目的】为了精准地判定产铁载体嗜盐新菌株JSM 104105在盐单胞菌科(Halomonadaceae)中的系统发育地位。【方法】采用基于16SrRNA基因、DNA促旋酶B亚基基因(DNAgyraseB subunit gene,gyrB)和核糖核酸聚合酶σ因子RpoD基因(RNA polymerase sigma factor RpoD gene,rpoD)序列的多位点序列分析方法(multilocus sequence analysis,MLSA),对菌株JSM 104105的系统发育地位进行初步分析;采用比较基因组学分析(comparative genomics analysis),分析该菌株与其系统发育关系密切的典型菌株之间的GC含量、平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)和数字DNA-DNA杂交值(digital DNA-DNA hybridization,dDDH),并进行基因组系统发育学分析(phylogenomic analysis),更准确地判定菌株JSM 104105在盐单胞菌科中的系统发育地位。【结果】MLSA分析结果表明,无论是单基因序列分析,还是多基因串联序列分析,对盐单胞菌科各分类单元以及菌株JSM104105的系统发育地位都能提供较为一致的结果。分析表明,菌株JSM104105归属于盐单胞菌科盐单胞菌属(Halomonas),与该属的Halomonas gudaonensis、Halomonas azerbaijanica和Halomonas lysinitropha的系统发育关系较密切,它们在系统进化树上形成稳定亚簇(subcluster),其中菌株JSM 104105占据稳定的独立进化分支。尽管它们之间的16S rRNA基因序列相似性较高,为97.3%-98.9%,但菌株JSM104105很难归属于其中任何已知物种。比较基因组学分析结果确认了这一判断。菌株JSM104105与系统发育关系密切的H.gudaonensis CGMCC 1.16133T、H.azerbaijanica TBZ202T和H.lysinitropha 3(2)T的ANI值(78.9%-91.6%)和dDDH值(22.1%-43.7%),均显著低于界定原核生物物种的阈值(ANI,95%-96%;dDDH≥70%)。基因组系统发育分析结果表明,菌株JSM104105明确构成盐单胞菌属独立的亚分支(subclade)。【结论】从分子系统发育学视角精准地判定产铁载体嗜盐细菌JSM104105归属于盐单胞菌科盐单胞菌属,与该属; 陈锦华刘细寒刘细寒冯玉周刘祝祥刘祝祥

41株戈登菌的系统发育学分析及其基因组功能的挖掘被引量：1: 2023年; 目的探讨41株戈登菌的系统发育学及其基因组中含碳水化合物活性酶、次级代谢产物生物合成基因簇的种类及多样性。方法以公开发表的41株戈登菌全基因组数据为研究对象,利用原核生物泛基因组学分析的自动化软件对泛基因组特征进行分析,结合直系同源蛋白分组对数据库、碳水化合物活性酶数据库和基因组次级代谢产物分析工具对基因组进行预测;提取19株戈登菌基因组DNA,采用16S小亚基核糖体RNA(16S rRNA)通用引物进行PCR扩增,并构建系统发育树。结果戈登菌基因组平均大小为4941636.42 bp,预测的基因数均数4370.46,G+C平均含量为67.25%,蛋白质编码区平均为4445.60;平均核苷酸多态性、DNA-DNA杂交值和16S rRNA基因序列分析表明戈登菌分类地位明确;戈登菌具有开放型泛基因组,核心基因组基因数目会稳定在1036个左右;所有菌株基因序列中含有丰富的糖基转移酶和糖苷水解酶;聚酮合酶、非核糖体肽合成酶和萜烯类生物合成基因簇在戈登菌属中占比较高,且土壤来源的菌株含生物合成基因簇最长。结论戈登菌基因组具有多样性,含丰富的碳水化合物活性酶,能产生多种抗菌和抗肿瘤的次级代谢产物。; 郭鑫瑶季晶焱程敏赵亮赵亮王丰李小兵廖万清李文均李文均; 关键词：基因组比较基因组次级代谢产物

海胆纲动物的系统发育学研究进展: 2023年; 海胆纲动物起源于4.6亿年前的奥陶纪晚期,主要分布于岩石、珊瑚礁及硬质海底,现生物种约850种。关于海胆纲动物的系统发育学关系的研究长期存在争议,根据形态学分类依据,海胆纲物种可分为14个目,而分子生物学支持不同的系统发育关系。本文综述了海胆纲物种的形态结构、形态学及分子生物学的分类依据,旨在为今后海胆纲物种的分类工作提供帮助。; 赵星星姜娇; 关键词：海胆棘皮动物系统发育

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