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靶向假外显子的等位基因特异性剪接转换寡核苷酸
本发明涉及一种鉴定剪接转换寡核苷酸(SSO)的方法,所述剪接转换寡核苷酸能够在与假外显子的5’剪接位点下游的+9至+39区域中的pre‑mRNA结合时通过促进所述假外显子掺入成熟mRNA中来调节细胞中靶蛋白的表达。本发明...
布拉吉·斯托尔斯泰因·安德烈森 托马斯·科艾德·多克托 利兹·洛莱·霍尔姆 乌尔丽卡·西蒙妮·斯潘斯伯格·彼得森 吉特·霍夫曼·布鲁恩
香菇单核体交配型及杂交后代的等位基因特异性PCR鉴定被引量:1
2024年
【背景】食用菌交配型和单单杂交杂合子的鉴定通常采用显微镜检测观察是否具有锁状联合的方式进行,存在耗时长、工作量大且易出现误检等问题。【目的】建立一种鉴定香菇单核体交配型和单单杂交后代的分子辅助育种技术,为提高育种效率提供技术支撑。【方法】利用交配型因子保守序列单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)位点设计分型引物,建立等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术,鉴定香菇L808和YX7的单孢分离株交配型及其杂交后代。【结果】AS-PCR鉴定结果表明,L808的38个单孢分离株中,交配型为A1B1、A2B2、A1B2和A2B1的单核体分别有6、13、8和11个;YX7的45个单孢分离株中,交配型为A3B3、A4B4、A3B4和A4B3的单核体分别有15、8、8和12个,交配型为A3A4B3B4的异核体2个;12个单单杂交菌株中,10个为真正的杂合子,2个为非杂合子。传统方法与AS-PCR分子鉴定结果完全一致,但前者容易将异核体误判为单核体。【结论】基于SNP位点的AS-PCR技术能有效鉴别香菇单核体交配型和单单杂交后代,区分单核体与异核体,具有精准、高效的特点,是一种香菇分子辅助育种的理想工具。
张芳芳陈雪凤张雯龙刘增亮赵承刚吴圣进
关键词:香菇交配型杂交后代
用于对ELANE基因进行等位基因特异性编辑的化合物和方法
本发明涉及一种用于对ELANE基因进行等位基因特异性编辑的核酸分子、一种包含所述核酸分子的载体、一种包含所述核酸分子或载体的组合物、一种在包含编码所述ELENE基因的遗传物质的生物材料中等位基因特异性编辑ELENE基因的...
茱莉亚·斯科科娃马苏德·纳斯里佩里安·米尔
基于新型高保真Taq酶的多重等位基因特异性PCR方法的建立与应用
2024年
在8号染色体存在部分替换片段的小鼠上挑选3个SNP位点进行初步方案检验,包括高保真Taq酶的特异性测试以及引物浓度对分型结果的影响,并评价该方法的灵敏度;之后应用该技术检测野生1号染色体替换系小鼠上的9个SNP的不同样本。对Taq酶的特异性研究表明:引物在未引入突变的前提下检测结果与测序结果保持一致;引物稀释实验说明浓度最低为0.003~0.006μmol/L,灵敏度的检测结果表示最低浓度检测限可达0.07 ng/μL以下。最后检测得到5种标准样本的基因型,其代表9个SNP的组合。成功验证并建立该新型高特异性Taq酶应用于多重等位基因特异性PCR实验的总体流程。提供一套具备高特异性、能够针对多个SNP位点进行检测的低成本方案,对多重等位基因特异性PCR技术的开发同样具有参考价值。
沈泽嘉徐逸梦时景景周宇荀李凯肖君华
关键词:多重PCR基因分型
基于等位基因特异性PCR技术检测Sw-5b基因
2023年
番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)是世界范围内危害最大的病毒病之一。为了加快番茄抗TSWV育种进程,利用等位基因特异性PCR(Allele-Specific PCR,AS-PCR)技术建立了与TSWV抗性基因Sw-5b连锁的标记。结果表明:在63℃退火温度下,引入A-C错配的特异性引物rg3-F可以检测出抗性基因型。没有引入错配的特异性引物sg1-F,在60℃退火温度下可以检测出感病基因型。在验证试验中,利用引物Sw5b-f1/r1进行PCR扩增并测序,结果表明利用rg3-F和sg1-F进行AS-PCR,能够有效区分番茄的不同基因型。本研究建立的AS-PCR方法为育种工作者在番茄抗TSWV育种中筛选Sw-5b抗性基因提供了有力的工具。
刘文明华明艳宋兰芳崔少杰孙海波金凤媚
关键词:SNP番茄TSWV
等位基因特异性表达影响苹果斑点落叶病抗性的分子机理
由链格孢属苹果专化型致病菌(Alternariaalternataapplepathotype,AAAP)引起的苹果斑点落叶病是苹果(Malusdomestica)面临的主要真菌病害之一。目前苹果斑点落叶病的防治措施主要...
梁兆林
关键词:苹果斑点落叶病
‘嘎啦’苹果不同组织中等位基因特异性表达及lncRNA分析
苹果(Malus×domestica Borkh.)作为一种十分重要的园艺作物,由于其基因组杂合度高、遗传背景复杂等问题一直困扰着对苹果的深入研究。等位基因特异性表达是位于同一基因位点上的来自两个不同亲本的等位基因的表达...
青游
关键词:苹果
杂交玉米等位基因特异性表达的鉴定及其与杂种优势的关系
杂种优势是一个具有重要理论研究和应用价值的重要现象。前人总结并提出了多个理论和假设来解释杂种优势的机制,如显性、超显性和上位性理论等。然而,到目前为止,我们对杂种优势背后的遗传和分子机制的了解仍然有限,很难用一个统一的遗...
RABAIL AFZAL
关键词:杂种优势玉米杂交种RNA-SEQ
使用重叠非等位基因特异性引物和等位基因特异性阻断剂寡核苷酸进行等位基因特异性扩增
本发明提供包含阻断剂和第一引物寡核苷酸的寡核苷酸组合物。所述阻断剂寡核苷酸包含具有靶中性子序列和阻断剂可变子序列的第一序列。非靶特异子序列在其3’和5’端被所述靶中性子序列侧接,并且与该靶中性子序列连续。所述第一引物寡核...
D·Y·张吴若嘉王珏皛
文献传递
血小板输注无效患者HLA等位基因特异性抗体及其表位的分析被引量:1
2022年
目的分析血小板输注无效(PTR)患者中HLA等位基因特异性抗体的特异性和表位情况。方法采用PCR-SBT方法检测患者HLA-A、B基因型,Luminex单抗原微珠包被法检测患者血清中HLA-Ⅰ类抗体。采用HLA比对软件寻找等位基因特异性抗体存在的差异氨基酸,HLA Eplet数据库分析注册表位。结果在82例PTR患者中发现12例患者存在HLA等位基因特异性抗体。经序列比对,共发现了19E>19K、166D>116E、167G>167W等18个差异氨基酸。在这些差异氨基酸中,检索到19E>19K、95I>95L、113YD>113HD等16个注册表位,另有166DG>166EW、70Q>70H、67S>67Y、94I>94T、82LR>82RG、211G>211A可能为尚未注册的新表位。A11、A24、B15、B27、B38等抗原可以进一步细分为HLA窄特异性抗原。结论发现PTR患者存在HLA等位基因特异性抗体,提示PTR的HLA配合性输注中宜对这类患者和血小板捐献者进行HLA-A、-B位点高分辨分型。
张兵黄新宇刘瑛徐罡陈舒许先国朱发明
关键词:血小板输注无效

相关作者

吴潇
作品数:168被引量:147H指数:7
供职机构:上海市农业科学院
研究主题:猪肉产品 等位基因频率 草菇 等位基因 转基因
潘玉春
作品数:170被引量:613H指数:12
供职机构:上海交通大学农业与生物学院
研究主题:候选基因 肉质性状 相关基因 标记辅助选择 核酸序列
王起山
作品数:88被引量:180H指数:7
供职机构:上海交通大学
研究主题:单体型 核酸序列 基因工程技术 等位基因特异性 标记辅助选择
谭桂芳
作品数:11被引量:3H指数:1
供职机构:上海交通大学农业与生物学院
研究主题:核酸序列 等位基因特异性 标记辅助选择 基因工程技术 相关基因
高运臻
作品数:18被引量:28H指数:3
供职机构:上海交通大学农业与生物学院
研究主题:核酸序列 等位基因特异性 标记辅助选择 基因工程技术 相关基因