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结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统: 本发明提供一种结合参考序列和从头拼接的病毒基因组拼接方法和系统，该方法包括：对病毒基因组序列的测序数据进行质量控制后，基于k‑mers策略去除测序数据中的宿主基因组序列；对测序数据从头拼接，生成病毒基因组初步组装序列；基...; 郑振华张乃楼徐闻魏锦博陈丹苗元玖

一种机器学习模型高通量分析乙型肝炎病毒基因组RT/S区序列特征预测肝癌风险的方法: 本发明涉及一种机器学习模型高通量分析乙型肝炎病毒基因组RT/S区序列特征预测肝癌风险的方法，属于基因组序列计算技术领域。本发明选用相应的特征计算方法完成HBV基因组RT/S区序列特征矩阵的构建；再采用机器学习模型对数据集...; 高春芳王颖陈世鹏朱山风张子寒

用于检测CAEBV和IM的EB病毒基因组差异甲基化基因的物质、试剂盒及其应用: 本发明公开了一种检测待测样品基因组中EBNA‑LP 30069bp、EBNA‑3A 53968bp、A73 157064bp、BALF5 15437bp和BNRF1 2422bp位点甲基化水平的物质在制备鉴定或辅助鉴定慢...; 谢正德王然张林琳艾军红张萌

一种用于单病毒基因组测序的微流控芯片及测序方法: 本发明涉及一种用于单病毒基因组测序的微流控芯片及测序方法，微流控芯片包括第一功能区、延时管道、融合管道、第二功能区以及融合电极；第一功能区用于生成油包病毒及裂解液的第一液滴；延时管道两端分别与第一功能区和融合管道连接；第...; 赵浏阳赵蕊蕊

一种基于T7核酸内切酶I纠错的病毒基因组高效组装方法: 2025年; 基因合成技术是支撑合成生物学发展的使能技术。现有的基因从头合成技术存在操作步骤多、效率低、错误率高且长度有限等问题,难以支撑合成生物学日益拓展的庞大需求。其中DNA片段的组装和纠错是基因合成的关键环节。本研究首先通过平衡序列设计软件能力、PCR扩增能力以及组装酶组装能力等参数,将约10 kb病毒基因组序列进行合理拆分后设计寡核苷酸序列;然后使用高保真聚合酶进行两步PCR反应,完成3.0 kb DNA片段的从头合成,并使用T7核酸内切酶I分别对不同阶段的PCR产物进行纠错反应;最后将从头合成并经过纠错的3.0 kb DNA片段进行约10 kb片段的组装并测序验证。结果表明,本方法可成功获得约10 kb DNA片段,有效降低组装过程中的大片段突变概率,组装错误率最低可至0.36 errors/kb。综上,本研究开发了一种高效从头合成约10 kb病毒基因组方法,辅以T7核酸内切酶I纠错,可1 d内获得约10 kb病毒基因组片段,5 d内获得病毒基因组的正确质粒。该方法优化了基因从头合成流程,降低了错误率,简化了合成与组装步骤,并进一步降低了病毒基因组组装成本。; 张绪伟文斌王飞王学军刘丽艳王淑美王升启; 关键词：纠错

一种用于扩增血清型登革II型病毒基因组的引物组、试剂盒及应用: 本发明公开了一种用于扩增血清型登革II型病毒基因组的引物组。所述引物组包括引物对1～引物对16，所述16对引物对的核苷酸序列依序如SEQ ID NO：1‑32所示。还公开了含有上述引物组的用于快速扩增血清型登革II型病毒...; 郭祥刘晓华葛柳陈海洋张晓晴李紫瑶王宇基曾淑周晓红

一种用于扩增血清型登革I型病毒基因组的引物组与试剂盒及应用: 本发明公开了一种用于扩增血清型I型登革病毒(DENV‑1)基因组的引物组。所述引物组包括引物对1～引物对16，每对引物均由正向引物与反向引物组成，所述引物对1～引物对16的核苷酸序列依序如SEQ ID NO：1‑32所示...; 郭祥张晓晴刘晓华钟嘉瑶周晓红

RAA法靶向测序分析人偏肺病毒基因组的引物组、试剂盒及用途: 本发明属于生物检测技术领域，具体而言，涉及RAA法靶向测序分析人偏肺病毒基因组的引物组、试剂盒及用途。所述引物组包括如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:84所示核苷酸序列的42对引物。本发明提供的引物组针对不同...; 周冬根岑晨霞童淑梅翟敏李红曹雪春

病毒基因组鉴定和拼接的方法及应用: 本发明提供了一种病毒基因组鉴定和拼接的方法及应用。该方法包括：对于原始数据进行前处理。将高质量reads拼接为初始重叠群。以初始重叠群作为查询序列，对待鉴定病毒的蛋白序列做同源性搜索，得到潜在病毒重叠群。以潜在病毒重叠群...; 彭友松傅萍

一种用于Salivirus病毒基因组测序的捕获引物组、试剂盒、建库方法及其应用: 本发明属于病毒检测及基因组测序技术领域，具体涉及一种用于Salivirus病毒基因组测序的捕获引物组、试剂盒、建库方法及其应用。本发明所述捕获基因组是基于多个Salivirus病毒基因组的保守区域设计得到，所述捕获引物组...; 张子龙刘霞田相廷张静田桢干刘丹蕾戴悦李深伟王强胡春立程春明

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