搜索到1301篇“ 甲基化分析“的相关文章
- 一种单细胞或少量细胞的DNA和RNA甲基化分析法
- 本发明公开了一种单细胞或少量细胞的DNA和RNA甲基化分析法,包括:A、直接使用单个细胞或少量的哺乳动物细胞;B、直接使用高温或蛋白酶处理达到破碎细胞的目的;C、使用甲基化敏感的内切酶处理非甲基化DNA;E、直接在上述样...
- 邓亚光
- 杂交三倍体泥鳅减数分裂相关基因Dmc1启动子甲基化分析
- 2025年
- 为探究减数分裂特异重组酶1(Dmc1)在杂交三倍体泥鳅不育机制的重要作用,本试验克隆了杂交三倍体泥鳅(4n♀×2n♂)Dmc1基因,分析了Dmc1基因的理化性质和系统发育地位。用亚硫酸氢盐测序技术和逆转录PCR技术分析了泥鳅杂交三倍体子代及其亲本性腺组织中Dmc1基因启动子区甲基化发生率和表达量。结果显示,Dmc1基因全长3895bp,开放阅读框为1029bp,编码342个氨基酸,Dmc1蛋白的预测分子质量为37.85ku,理论等电点为6.95。氨基酸多序列比对表明,泥鳅Dmc1氨基酸序列与其他鲤形目鱼类Dmc1氨基酸序列相似性较高,与节肢动物的相似性较低。系统发育进化树结果显示,泥鳅与其他硬骨鱼类Dmc1聚于同一进化支。亚硫酸氢盐测序结果显示,四倍体母本、二倍体父本及三倍体子代Dmc1基因的启动子区域甲基化发生率分别为100%、80.0%及82.2%。三倍体雄性子代Dmc1启动子区甲基化发生率高于二倍体父本,Dmc1基因表达量显著低于二倍体父本;三倍体雌性子代Dmc1启动子区甲基化发生率低于四倍体母本,Dmc1基因表达量显著高于四倍体母本。根据Pearson相关系数分析可知,Dmc1基因启动子区的甲基化发生率与其表达水平呈负相关(r=-0.986,P=0.014)。综上所述,在不同倍性泥鳅中Dmc1基因的表达量受启动子区域甲基化的负调控作用,因此推测Dmc1基因的DNA甲基化发生率与三倍体泥鳅的减数分裂异常及低育性具有一定的相关性。试验结果可为解析杂交三倍体泥鳅不育的分子机制提供理论依据。
- 马可馨李逸帆杨悦瑶李川郭文轩庄子昕王伟周贺
- 关键词:泥鳅启动子甲基化
- 蛋白质甲基化分析新技术研究进展
- 2025年
- 蛋白质甲基化修饰在细胞生理过程中发挥着重要的调控作用.为实现蛋白质甲基化的深入研究,发展高效的分析技术十分关键.随着蛋白组学技术的不断完善发展,蛋白质甲基化的高通量研究已取得了巨大的突破.蛋白质甲基化分析技术的研究大致包括:甲基化修饰位点的鉴定分析、甲基转移酶的催化机制研究和蛋白质甲基化相关的相互作用分析.近年来,在这些研究领域,相关的分析技术都取得了显著的进展,本评述从上述方面展开,介绍了蛋白质甲基化研究的最新进展情况.
- 王科云李海涛李海涛
- 关键词:蛋白组学翻译后修饰甲基转移酶
- 免亚硫酸氢盐的全基因组甲基化分析
- 本公开提供了用于对包括全基因组DNA在内的DNA中的5‑甲基胞嘧啶、5‑羟基甲基胞嘧啶、5‑羧基胞嘧啶和5‑甲酰基胞嘧啶中一种或多种的位置进行的成本有效的免亚硫酸氢盐鉴定的方法。本文所述的方法基于:例如通过TET辅助的吡...
- 宋春啸程京飞波琳娜·西耶卡-杰琳斯卡刘艺斌
- 基于小于胎龄儿构建目的印记基因的全基因组甲基化分析方法的巢式病例对照研究
- 2025年
- 背景小于胎龄儿(SGA)是围产期不良结局、生长发育迟缓、神经认知发育障碍的高危人群。在其遗传病因中,除了10%左右的单基因及染色体异常,印记区域/基因缺陷也是重要遗传病因之一。目的采用全基因组甲基化芯片检测,基于目的印记基因panel,建立一套可应用于临床的数据分析流程,并应用于常规高通量测序检测阴性的SGA患儿,分析其印记基因/区域缺陷。设计巢式病例对照研究。方法基于中国新生儿基因组计划(CNGP)队列,纳入2020年7~12月临床外显子检测结果阴性的SGA患儿作为病例组,以1∶1的比例行性别及胎龄匹配适于胎龄儿(AGA)作为对照组,采用Methylation 850K阵列进行全基因组甲基化检测。重点分析由269个印记基因组成的目的印记基因panel。利用AGA样本建立稳健的甲基化水平基线,逐个检测SGA个体的目的印记区域/基因甲基化水平,建立甲基化异常值检测分析流程,并使用甲基化特异性多重连接依赖探针扩增(MS-MLPA)和焦磷酸测序对发现的差异甲基化区域(DMR)进行验证。主要结局指标SGA印记基因/区域中的DNA甲基化水平。结果SGA 50例,AGA 48例。患儿目的印记基因甲基化水平与AGA基线逐个比较后,在5例SGA中发现了3个既往已报道与SGA相关的DMR,其中3例检测到15q11.2-DMR(SNORD116、SNORD115、SNRPN、PWRN1、NDN基因),其中1例DMR区域在MS-MLPA的检测范围内,诊断为Prader Willi综合征。2例检测到20q13.12-DMR(L3MBTL1基因),其中1例同时检测到了7q34-DMR(SVOPL基因)。15q11.2-DMR使用MS-MLPA进行验证,20q13.12-DMR及7q34-DMR位点甲基化改变进行焦磷酸验证。结论构建的基于目的印记基因的全基因组DNA甲基化分析流程,在SGA患儿中检测到3个与SGA相关的DMR,其中1例明确诊断。针对15q11-13区域的甲基化位点的分析,拓宽了该区域与SGA相关性的认识。
- 俞可欣王潇肖慧刘仁超吴冰冰程国强王来栓胡黎园董欣然杨琳
- 关键词:小于胎龄儿印记基因
- 棉花愈伤组织诱导过程中的DNA甲基化分析
- 2025年
- 为了解棉花(Gossypium spp.)体细胞胚胎发生过程中早期非胚性愈伤组织诱导的表观遗传学变化,利用全基因组甲基化测序(whole-genome bisulfite sequencing,WGBS)技术,对陆地棉(Gossypium hirsutum)品系‘YZ1’的下胚轴和非胚性愈伤组织进行DNA测序,并对其甲基化变化进行对比分析。结果表明,在棉花非胚性愈伤组织诱导过程中发生了整体甲基化水平的降低;棉花下胚轴和非胚性愈伤组织的平均甲基化水平分别为29.11%和23.54%;CG位点和CHG位点的甲基化水平上升幅度分别为4.19%和4.64%,但CHH位点的甲基化水平从44.66%下降到35.81%,下降了8.85%,CG和CHG序列背景平均甲基化变化幅度较小,而CHH序列背景甲基化下降幅度较大,这可能暗示在棉花非胚性愈伤组织诱导过程中基因组CHH序列背景发生了去甲基化,在愈伤组织诱导过程起着重要作用。在棉花下胚轴诱导形成非胚性愈伤组织的过程中,不同基因组功能区基因的甲基化水平均有所下降,其中启动子区域的变动最大,由26.18%下降至17.51%,而外显子、内含子区域的下降幅度最小,仅为2.00%~3.00%。GO和KEGG分析表明,差异甲基化基因主要富集在减数分裂、类固醇生物合成及基底转录因子等通路。本研究结果为探明棉花愈伤组织诱导的调控网络提供了新的途径。
- 胡蝶李雪林梁华
- 关键词:棉花愈伤组织DNA甲基化
- 舌黏膜癌变基因组甲基化分析
- 2024年
- 目的研究舌黏膜癌变过程中基因组甲基化特征,探讨舌癌中DNA甲基化的规律。方法用50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水诱导C57BL/6J小鼠舌黏膜癌变,分别取第0、12、28周的舌黏膜(分别代表正常、癌前病变和癌变)进行基因芯片检测和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq),在人舌黏膜组织和人舌癌细胞系中,用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和飞行质谱检测验证转化生长因子贝塔信号蛋白1(SMAD1)的表达和启动子的甲基化。结果28周较12周和0周舌黏膜的胞嘧啶鸟嘌呤岛(CGI)甲基化水平均升高,12周时启动子甲基化水平高于0周。在0、12和28周期间,208个差异表达基因与启动子中的差异甲基化呈负相关。与正常黏膜相比,细胞系中SMAD1的mRNA上调,同时启动子甲基化水平降低。结论舌黏膜癌变中伴随DNA甲基化修饰异常,舌癌中SMAD1高表达伴启动子低甲基化。
- 刘华岳万远邵帅孙家平杨莹代晓明
- 关键词:舌癌甲基化差异表达基因
- 杉虎杂交斑5S rRNA基因甲基化分析被引量:1
- 2024年
- 核糖体RNA是构成核糖体的重要组成部分,在蛋白质合成过程中起着重要作用。利用雌性棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)与雄性清水石斑鱼(Epinephelus polyphekadion)杂交,获得在生长、肉质等方面具有一定优势的子代——杉虎杂交斑。对杉虎杂交斑及其亲本5S rRNA基因编码区前1 000 bp、编码区以及非转录区的DNA甲基化水平进行测定和比较分析。结果表明,杉虎杂交斑5S rRNA基因整体甲基化水平(0.418)高于棕点石斑鱼(0.379)和清水石斑鱼(0.037),但与母本棕点石斑鱼不具有显著性差异,与父本清水石斑鱼存在显著性差异。对5S rRNA基因编码区和非转录区的甲基化位点进行分析发现,在棕点石斑鱼与杉虎杂交斑中所有甲基化位点是一致的,但在清水石斑鱼中均未发现这些位点,表明杉虎杂交斑的5S rRNA基因甲基化模式与母本棕点石斑鱼一致。结果阐明了杉虎杂交斑5S rRNA基因的DNA甲基化水平和模式,为石斑鱼杂交育种提供理论基础。
- 曹柳黄潇庆陈菁苗卢艳黄海
- 关键词:石斑鱼杂交DNA甲基化
- 一种DNA条码甲基化分析装置
- 本发明涉及生物检测技术领域,尤其涉及一种DNA条码甲基化分析装置。其技术方案包括放置台、调节结构、夹料结构和固定结构,所述放置台上端设置有样品盒;所述调节结构包括固定板、位于固定板下方的移动板;所述夹料结构包括顶板、位于...
- 王思振
- 高灵敏度DNA甲基化分析方法
- 提供了用于扩增一定量的基因组甲基化DNA的方法、组合物和试剂盒,该基因组甲基化DNA可进行随后分析和/或测序。其特别适用于少量DNA,包括但不限于无细胞DNA样品。在一些实施方案中,控制聚合酶和甲基转移酶的比例以提供最大...
- 何川普拉德尼亚·纳尔赫德赵伯譞刘畅崔晓龙
相关作者
- 蔡彦宁

- 作品数:96被引量:140H指数:6
- 供职机构:首都医科大学宣武医院
- 研究主题:时钟基因 昼夜节律 帕金森病 特异性改变 甲基化修饰
- 潘泽民

- 作品数:147被引量:329H指数:9
- 供职机构:石河子大学医学院新疆地方与民族高发病省部共建教育部重点实验室
- 研究主题:子宫颈鳞癌 维吾尔族妇女 子宫颈癌 迁移 宫颈癌
- 杨晓红

- 作品数:172被引量:717H指数:13
- 供职机构:新疆维吾尔自治区人民医院
- 研究主题:饲鸽者肺 肺血栓栓塞症 慢性阻塞性肺疾病 维吾尔族 哮喘
- 杨昕

- 作品数:20被引量:19H指数:3
- 供职机构:新疆医科大学
- 研究主题:子宫颈鳞癌 新疆维吾尔族 宫颈癌组织 甲基化分析 MGMT基因
- 黄朝晖

- 作品数:106被引量:320H指数:9
- 供职机构:江南大学附属医院
- 研究主题:结直肠癌 胃肿瘤 人乳头瘤病毒11型 限制性内切酶 DNA甲基化