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搜索到2516篇“ 生物信息技术“的相关文章

高中生物课堂教学中生物信息技术的整合与创新研究: 2024年; 随着信息技术的快速发展,生物信息技术在高中生物教学中的整合与创新日益受到重视。研究采用调查分析、案例研究等研究方法,对当前高中生物课堂教学中生物信息技术的应用情况进行了全面分析。研究发现,良好的生物信息技术应用可以有效提升教学质量和学生的学习兴趣,培养学生的信息处理和问题解决能力,但同时也存在课程资源的配备不足、教师专业素质短板等问题。因此,研究提出了对生物课堂教学的创新策略,包括引入更多的实践操作、开发富有创新性的教学资源与教学方法、加强教师专业培训等,从而实现生物信息技术与高中生物课堂教学的深度整合。研究结果可为高中生物教师做出科学的教学决策,推动生物教学的现代化,提供有益的参考。; 张新美; 关键词：生物信息技术高中生物教学教学创新教师专业培训教学决策

基于生物信息技术探究桂枝加芍药汤治疗炎症性肠病的作用机制: 2024年; 桂枝加芍药汤为《伤寒论》中的经典中医方剂,在治疗胃肠道疾病方面具有悠久的历史,但其药效作用机制却鲜有报道.本研究通过生物信息学手段来探究桂枝加芍药汤治疗炎症性肠病的潜在机制.在TCMSP和GeneCards平台分别筛选桂枝加芍药汤中的化合物和炎症性肠病的靶点,通过Cytoscape软件构建关于桂枝加芍药汤的“药材—化合物—靶点”拓扑网络,并确定核心化合物;分别采用STRING和DAVID在线工具分析桂枝加芍药汤治疗炎症性肠病靶点之间的蛋白相互作用,确定核心靶点,并分析GO和KEGG通路;用Autodock软件将核心化合物与靶点一一进行分子对接.结果显示,收集到的桂枝加芍药汤的活性化合物有94个,对应靶点有263个,炎症性肠病靶点有7 851个.核心化合物包括槲皮素、β-谷甾醇和山奈酚,核心靶点包括IL6、AKT1、TP53、IL1B和TNF等.具有显著性差异的KEGG信号通路一共有173条,包括TNF、PI3K-AKT和IL-17通路等. 3个核心化合物与其中的4个核心靶点具有较高的结合能.桂枝加芍药汤可通过干预多个靶点和多种信号通路来发挥其治疗炎症性肠病的作用.; 黄泽彬林烁佳金富军鲍雅丹卢宇靖; 关键词：桂枝加芍药汤生物信息技术炎症性肠病

构建高精度中国人基因组变异图谱,为"健康中国"建设奠定关键科学基础——哈尔滨工业大学生物信息技术研究院、生物大数据教育部重点实验室: 2024年; 2018年,由哈尔滨工业大学(以下简称:哈工大)生物信息技术研究院、生物大数据教育部重点实验室牵头并联合国内30余家单位启动了我国首个大规模基因组计划——"中国十万人基因组计划"("十三五"国家重点研发计划"精准医学"重点专项项目,如图1所示).该项目旨在构建中国参比人群并开展大规模全基因组测序与数据分析,绘制高精度的中国人基因组变异图谱,全面揭示中国人基因组变异分布规律,并探索中国人基因变异与环境暴露和表型之间的复杂关系,为"健康中国"建设奠定重要科学基础.; 姜涛刘博王亚东; 关键词：生物信息技术基因组计划基因组变异环境暴露全基因组测序

一种基于生物信息技术的SSR分子标记开发方法: 本发明涉及分子标记技术领域，尤其涉及一种基于生物信息技术的SSR分子标记开发方法。本发明所提供的SSR分子标记开发方法包括：对目标物种的基因组DNA进行测序，组装得单倍型基因组；基于单倍型基因组序列的SSR序列设计得到引...; 冀晓昊王海波冯学杰时梦王孝娣王宝亮邓会栋钟义旺孙阳阳

基于生物信息技术筛选肝硬化铁死亡相关差异基因与中药预测研究: 2024年; 目的:采用生物信息技术筛选与肝硬化铁死亡相关的差异表达基因,并预测具有潜在治疗作用的中药及活性成分。方法:利用美国国立生物技术信息中心平台下的基因表达综合数据库(GEO)收集肝硬化患者基因表达数据集,应用R软件对数据集进行差异化分析,获得肝硬化的差异表达基因集(DEGs);通过FerrDb数据库获得铁死亡相关基因(FRGs),采用蛋白质互作(PPI)网络分析筛选核心基因,并进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Coremine Medical数据库查找核心基因对应的中药,通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集中药有效活性成分和筛选核心活性成分;使用分子对接验证核心基因与核心活性成分的结合能力。结果:共筛选到与肝硬化铁死亡相关差异表达基因67个,参与了单体代谢过程、细胞对压力的反应、含磷化合物代谢过程等,涉及p53信号通路、谷胱甘肽代谢、FoxO信号通路等,其中沉默信息调节因子1(SIRT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素6(IL-6)、过氧化物酶体增殖活化受体α (PPARα)和核因子红细胞2相关因子2 (NFE2L2) 5个核心基因均在铁死亡通路中高度富集。TCMSP预测得到丹参、枸杞子、黄芩和赤芍等17种中药及β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素、山柰酚4种关键活性成分;分子对接显示,核心基因与关键活性成分结合良好。结论:丹参、枸杞子、黄芩和赤芍等中药含有的β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素、山柰酚成分可以通过调控SIRT1、EGFR、IL-6、PPARα、NFE2L2等靶点来调控铁死亡治疗肝硬化。; 王雅欣刘汶吴颖宋思琦刘颖初宋瑾张会存; 关键词：肝硬化生物信息差异基因中药

基于生物信息技术探讨湿润烧伤膏治疗糖尿病足的作用机制被引量：1: 2024年; 目的通过网络药理学浅究湿润烧伤膏(MEBO)治疗糖尿病足(DF)的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取MEBO的活性化学成分及有效成分靶点信息,将获得靶点通过UniProt数据库统一基因名称;通过人类基因综合数据库(GeneCards)查询DF的相关靶标基因,利用Venny2.1将MEBO药物活性成分靶点与DF靶点相映射,获得潜在作用靶点。将交集靶点导入STRING网站进行分析,并使用Cytoscape3.10.0构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,选出关键靶点基因。将交集靶点导入Metascape进行GO和KEGG通路富集分析,并通过Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点”网络图。结果MEBO治疗DF的主要化学成分是小檗碱、汉黄芩素、黄麻苷A、黄连碱、黄柏酮等;关键作用靶点为表皮生长因子受体(EGFR)、一氧化氮合酶3(NOS3)、蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素-1B(IL-1B)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等;关键作用通路为AGE-RAGE、HIF-1、VEGF、NF-κB等信号通路。结论本研究初步揭示了MEBO的有效成分可以从多靶点、多通路治疗DF,发挥着改善微环境、抑制创面感染及促进组织修复再生等作用。; 李开燕何於成周丁鹏曾昭洋; 关键词：湿润烧伤膏糖尿病足网络药理学

基于生物信息技术分析GINS1基因在肺癌中的表达及意义: 2024年; 背景与目的肺癌是全球最常见的恶性肿瘤,大多数患者初次诊断时已发生转移,因此寻找肺癌新的诊断标志物并探索其在肺癌发生中的作用具有重要价值。基于生物信息数据探讨分析肺癌中GINS1基因与肺癌预后的相关性具有重要意义。方法检索Oncomine、EGPIA、TCGA、Human protein atlas等基因数据库,分析GINS1基因在肺癌中的表达差异。应用蛋白质免疫印记法检测肺癌及癌旁组织中GINS1蛋白的表达水平,应用Kaplan-Meier进行患者生存分析,并利用String-DB数据库分析GINS1蛋白相互作用网络。结果对Oncomine、GEPIA和The Human Protein Atlas数据库中肺癌与癌旁组织蛋白表达数据进行差异性分析,发现GINS1蛋白在肺癌组织中显著高表达,特别以肺腺癌、肺鳞癌中表达明显增加;通过生存分析发现高表达GINS1肺腺癌患者生存期明显低于低表达者,高表达患者预后更差;利用String-DB数据库发现与GINS1蛋白关联最为密切的为GINS蛋白家族(GINS2、GINS3、GINS4),其次为CDC45、MCM蛋白家族(MCM2、MCM3、MCM4、MCM5、MCM6、MCM7),富集分析发现互作蛋白主要参与DNA复制和细胞周期。结论GINS1基因在肺癌组织中显著高表达,与患者预后相关,其有可能成为肺癌诊断及药物治疗的新靶点。; 余国雄伍丹丹王有娜黄毅; 关键词：肺癌

基于生物信息技术人呼吸道合胞病毒感染基因分析及关键基因功能研究: 目的:呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)是世界范围内引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infe ctions,AL...; 薛苗苗; 关键词：人呼吸道合胞病毒关键基因 ISG15

融合生物信息技术的微生物学实验教学改革探索——以华中科技大学为例被引量：2: 2023年; 微生物学实验是大多数高校生命科学相关专业本科生的一门必修基础实验课,是生命科学教学研究的基础之一。随着高通量测序技术的快速发展,生命科学领域进入以海量多元组学数据为特征的大数据时代,这势必要求高校教学内容根据学科特点结合时代特色进行适度改革。本实验教学改革的探索,针对大数据背景下微生物组学所蕴含的丰富知识,构思了将传统微生物学实验和微生物组分析相结合的实验教学框架,设计了校园土壤微生物组探究实验,通过实验操作和数据分析,证实了其在本科生实验教学中的可行性。该实验不但有助于学生了解数据驱动进行知识发现的研究方式,尤其是针对微生物群落的研究方式,还可拓展学生基于全局整体思考的科研思维。; 白虹程铭悦王莎莎白云刘亚丰宁康; 关键词：微生物学实验生物信息技术微生物多样性数据驱动

大数据时代下生物信息技术在生物医药领域的应用及发展: 2023年; 实际上,将大数据与生物医药研究相融合,既是相关研究适应时代发展的一个必然趋势,也是生物医药领域获得新发展机遇的机会。一方面,大数据时代的到来,很好的完善了传统研究工作中的不足,让相关工作有效性得到不断提升。另一方面,大数据为相关研究活动开展,提供了更加丰富的生物研究资源,对整个行业发展都有促进作用。但是,对于大数据时代下生物信息技术在生物医药领域运用的发展前景,还需要进一步研究。; 赵芮; 关键词：大数据生物信息技术生物医药

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