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甘蓝型油菜花蕾发育的比较蛋白质学研究
2024年
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国目前的主栽油菜类型,其花蕾发育包含一系列复杂的代谢和调控过程,尤其是小孢子成熟前的早期发育过程对油菜育性影响较大。本研究首先通过织形态学观察,确定甘蓝型油菜花蕾大小在1~3 mm时期,对应于雄蕊发育的5~9期。利用高通量的HPLC-MS/MS质谱测序技术,对该发育时段的花蕾进行蛋白质学分析,共鉴定到13444个蛋白,比较各时期鉴定到的蛋白筛选出613个差异表达蛋白。对差异蛋白的功能进行分析,发现细胞壁建成、脂质代谢、细胞转运相关蛋白大量上调,这将有利于花蕾发育过程中的细胞建成和花粉发育;核酸相关蛋白表达与含量变化迅速,这与该时段细胞的急剧分裂与生长的代谢过程一致;而ABCDE发育模型相关蛋白的表达未发生显著变化,可能具有除诱导花蕾分化外的其他功能。研究结果说明油菜花蕾发育早期细胞代谢旺盛,大量代谢相关蛋白发生了显著变化,这将为进一步分析花蕾发育过程中的代谢及调控过程提供基础。
吕恬岳伟莹蔡萌萌常江何冬丽
关键词:甘蓝型油菜花蕾比较蛋白质组学发育
单增李斯特菌感染人绒毛膜滋养层细胞比较蛋白质学研究
2024年
目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质学技术对HTR-8/Svneo感染和非感染蛋白质进行定量分析,运用GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达蛋白进行分子功能、生物过程及代谢途径富集分析。结果共鉴定肽段76285个,可定量蛋白6979个。HTR-8/Svneo感染过程中356个蛋白发生了显著性差异表达。153个表达量上调,203个表达量下调。差异表达量倍数最高的蛋白为微管马达蛋白(B4DYE2),最低为翻译起始因子1(Q6IAV3)。GO功能富集和KEGG代谢途径富集结果表明,上调蛋白参与的生物过程和代谢途径集中在微管、微丝运动,细胞自噬等方面,下调蛋白集中在碳代谢、氮代谢、氨基酸生物合成、核酸代谢等初级代谢途径和泛素介导的蛋白质水解等方面。结论单增李斯特菌侵袭HTR-8/Svneo过程中,宿主细胞的基础代谢可能发生了显著降低,并处于较高的自噬水平。细胞迁移诱导透明质酸酶CEMIP(Q8WUJ3)的显著上调说明该蛋白可能在调节滋养层细胞迁移、侵袭能力进而造成不良妊娠方面具有重要作用,为单增李斯特菌感染胎盘分子机制研究提供新的思路。
张云怡张政张俊彦陈鸿鹄占利陈建才
关键词:单增李斯特菌蛋白质组
比较蛋白质学揭示茉莉酸甲酯诱导的雷公藤甲素生物合成
2024年
目的:探索雷公藤甲素生物合成途径,以提高其产量或用于合成生物学异源生产。方法:使用无标记(lable-free)比较蛋白质学对茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的雷公藤悬浮细胞进行测序,通过京都基因与基因百科全书(KEGG)、基因本体(GO)分析等方法,结合基因转录表达分析和基因体内功能研究,逐步筛选参与雷公藤甲素生物合成的功能基因。结果:MeJA诱导不同时间的样品鉴定得到376个差异蛋白质,包括8个细胞色素P450酶(CYP450)、3个转录因子(TF)和2-氧戊二酸依赖的双加氧酶(2ODD)。其中CYP71BE89、CYP82AQ2和Tw2ODD基因在MeJA诱导及植物不同织部位中,均与已知参与雷公藤甲素母核环化的二萜合酶TwTPS7(v2)和TwTPS27(v2)基因具有相似的表达模式,表明其可能与雷公藤甲素生物合成相关。进一步利用植物细胞体内功能研究,验证了CYP71BE89、CYP82AQ2和Tw2ODD基因干扰使雷公藤甲素积累分别降低了24.1%、41.4%和71.4%,表明了3个基因与雷公藤甲素生物合成直接相关。结论:利用比较蛋白质学技术揭示了几种与雷公藤甲素生物合成相关的蛋白,进一步表征了雷公藤甲素生物合成与外源激素刺激之间的关系,并为发掘中药活性成分生物合成途径提供了一种有效方法。
张逸风赵瑜君苏平吴晓毅夏梦高伟黄璐琦
关键词:雷公藤比较蛋白质组学雷公藤甲素细胞色素P450酶
白纹伊蚊昌平种群高效氯氰菊酯抗性的比较蛋白质学研究
2023年
目的对白纹伊蚊昌平种群高效氯氰菊酯抗性个体与敏感个体之间的差异表达蛋白进行生物信息学分析,研究白纹伊蚊高效氯氰菊酯代谢抗性机制,为白纹伊蚊抗药性以及杀虫剂的合理使用提供理论依据。方法通过生物学测定筛选出白纹伊蚊昌平种群高效氯氰菊酯抗性个体与敏感个体,提取总蛋白进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析,通过生物信息学分析找到差异表达蛋白,并在mRNA水平上进行验证。结果生物信息学分析共鉴定到1861个蛋白,其中差异表达蛋白有383个,在抗性个体体内上调表达的有213个,下调表达的170个。选择京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析中显著性P<0.05的功能通路中与药物代谢相关的8个差异表达蛋白进行验证,鉴定到丙氨酸氨基转移酶、尿苷酸-胞苷酸(UMP-CMP)激酶、谷胱甘肽S-转移酶(GST)在抗性个体体内上调表达。结论白纹伊蚊抗性个体与敏感个体之间存在差异表达蛋白,其中丙氨酸氨基转移酶、UMP-CMP激酶、GST在抗性群体中上调表达,可能与高效氯氰菊酯代谢抗性相关。
华栋栋王磊肖迪李文玉周欣欣伦辛畅母群征刘起勇马伟孟凤霞
关键词:白纹伊蚊比较蛋白质组学
猬迭宫绦虫不同发育时期比较蛋白质学研究
猬迭宫绦虫是一种人畜共患寄生虫,其生活史复杂,包括五个不同发育阶段(虫卵、钩球蚴、原尾蚴、裂头蚴和成虫),涉及至少三个宿主和多个转续宿主。为了与其寄生生活相适应,猬迭宫绦虫在不同发育时期表达的蛋白质是不同的,研究不同阶段...
龚腾芳
关键词:线粒体基因不同发育时期蛋白质组学PRM
白纹伊蚊对高效氯氰菊酯抗性的比较蛋白质学研究
研究背景  白纹伊蚊(Aedesalbopictus)是一种重要的病媒生物,其分布范围遍及热带、亚热带与温带地区,在我国分布地域从东南沿海到东北辽宁、西至西藏自治区。白纹伊蚊可传播登革热、基孔肯雅热、黄热病以及寨卡病毒病...
华栋栋
关键词:白纹伊蚊高效氯氰菊酯抗药性蛋白质组学
周围神经感觉束和运动束在神经损伤修复过程中蛋白变化的比较蛋白质学研究
2023年
目的:探寻周围神经感觉和运动束损伤后不同时间点的蛋白变化,为周围神经再生研究提供标志蛋白。方法:制备SD大鼠股神经运动束和隐神经(感觉束)在正常状态、Sunderland V损伤8 h和8 d时间点模型;神经断端远侧5 mm样本取材,6种样本共18;分离、提取、纯化及定量蛋白后,应用差异凝胶电泳技术荧光标记蛋白质,凝胶图像扫描,选择差异表达>1.5倍的蛋白点定义为高差异表达蛋白;用图像分析软件BVA分析显示9块凝胶平均分离1586个蛋白点,胶上切割、酶切、点靶,质谱仪进行肽质量指纹谱(PMF)分析鉴定,识别各间的高差异表达蛋白质图谱。应用逆转录PCR(RT-PCR)技术分析验证蛋白质学研究的结果。结果:共有12个高差异表达蛋白点被确切鉴定:TPM1、Serpina10、NF-L、DRP-2、CaBP1、Serpina3n、Peroxiredoxin-2、Gng7、HSP70、LDHB、Enolase2、PDIA3。其中,Serpina10、TPM1、NF-L、DRP-2、CaBP1是隐神经正常状态、损伤8 h和8 d时间点时比较蛋白质学高差异蛋白;Serpina10、Serpina3n、Peroxiredoxin-2、Gng7、HSP70、LDHB、Enolase2、CaBP1、PDIA3是股神经运动束正常状态、损伤8 h和8 d时间点时比较蛋白质学的高差异蛋白。Serpina10和CaBP1是隐神经和股神经运动束损伤后多时间点比较蛋白质学均出现的高差异表达的蛋白蛋白质学的结果与RT-PCR检测的mRNA转录水平相一致。结论:周围神经感觉束、运动束损伤后不同时间的比较蛋白质学表达存在明显差异,Serpina10和CaBP1作为高差异表达蛋白,可能为周围神经再生研究提供新的方法。
孟宪宇李秋红刘岩张旭王磊姜巍李凤久路来金陈焕新
关键词:周围神经蛋白质组学
白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质学研究被引量:1
2023年
目的本文通过开展白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质学研究,发现和鉴定白癜风患者病变表皮与正常表皮之间的差异表达蛋白,以探讨白癜风患者表皮发生病变的分子机制。方法首先,建立和优化了表皮样品中蛋白质的最佳酶切条件。其次,采用基于串联质谱标签(TMT)标记的定量蛋白质学技术策略开展了稳定期白癜风患者病变表皮与正常表皮的比较蛋白质学研究,并筛选了差异表达蛋白。最后通过生物信息学分析工具及数据库(GO、KEGG、STRING、GSEA)对差异蛋白进行功能富集分析。结果优化所得到的最佳酶解条件是由Lys-C(酶∶底物,1∶100)和胰酶(酶∶底物,1∶50)合而成的顺序酶切。比较蛋白质学研究共鉴定4496个蛋白质,其中181个蛋白质为白癜风患者病变表皮中的差异表达蛋白。生物信息学分析表明差异表达蛋白主要与代谢、免疫、氧化还原和细胞黏附相关。其中119个上调蛋白主要参与角质化、转录、氧化应激及蛋白酶解等过程。62个下调蛋白主要参与细胞内物质运输、谷胱甘肽代谢和肌动蛋白细丝封端等过程。结论比较蛋白质学研究揭示了白癜风患者病变表皮与正常表皮之间主要存在角质化、免疫、脂质代谢和氧化还原等方面的功能差异,发现了PRDX1、PRDX2、EEF2、ITGB1、SPTBN2、ANXA1及PFKL等蛋白质为潜在的白癜风患者病变表皮功能失调的关键蛋白质
艾力克木·吐尔逊陈秀兰陈秀兰艾尼瓦尔·塔力甫王继峰李娜郭晓静丁翔蔡潭溪牛丽丽郭晓静丁翔谢振声牛丽丽
关键词:白癜风角质化
恩诺沙星胁迫下嗜水气单胞菌的比较蛋白质学研究
2023年
为深入了解喹诺酮类抗生素胁迫下细菌产生的耐药机制,本研究以水生病原菌嗜水气单胞菌为研究对象,利用定量蛋白质学方法比较嗜水气单胞菌在有无恩诺沙星处理下的蛋白表达差异。质谱结果发现446个差异蛋白,其中233个蛋白表达上调,213个蛋白表达下调。生物信息学分析显示,嗜水气单胞菌可能通过DNA修复和硫代谢相关蛋白的上调表达,促进细菌存活。进一步通过生长曲线测定发现,参与硫代谢的半胱氨酸与恩诺沙星联用能更好地抑制细菌的生长。同时,利用qPCR技术验证硫代谢相关基因在mRNA水平的表达量,发现大部分相关基因在转录水平上的差异表达与蛋白水平一致。以上研究结果表明硫代谢对嗜水气单胞菌在ENR胁迫下起着重要作用。
姚近东汤华妹杨文霄张丽珊林向民
关键词:嗜水气单胞菌恩诺沙星LC-MS/MSDNA修复
比较蛋白质学在周围神经感觉束和运动束鉴别中作用的实验研究被引量:1
2022年
目的寻找周围神经感觉和运动束之间的特异蛋白,为周围神经功能束的鉴别提供标志蛋白。方法分别对Wistar大鼠股神经运动支和隐神经正常状态、在Sunderland V损伤后8 h和8 d时间点取材,断端远侧各切取5 mm样本,6种样本共18分离提取蛋白,纯化及定量后应用差异凝胶电泳技术(DIGE)荧光标记蛋白质,凝胶图像扫描,用图像分析软件(DeCyder)比较分析并识别各间的差异表达蛋白质图谱,选择表达差异大于1.5倍的蛋白点,制备胶上切割、酶切、点靶,MALDI-TOF-Pro质谱仪进行PMF图谱分析鉴定,应用Rt-PCR技术分析验证蛋白质学研究的结果。结果Annexin V、NF-L、Tec、Serpina3n、PRDX-2、TPM1等6个蛋白点被确切地鉴定。Annexin V在股神经运动支/隐神经的比值是-1.94倍,匹配良好,蛋白稳定出现在所有胶中,P(0.00068)<0.05,具有统计学意义;在Sunderland V损伤后8 h的股神经运动支/隐神经的比值是-2.07倍,匹配良好,蛋白稳定出现在所有胶中,P(0.0053)<0.05,具有统计学意义;在Sunderland V损伤后8 h的股神经运动支/隐神经的比值是-2.20倍,匹配良好,蛋白稳定出现在所有胶中,P(0.0069)<0.05,具有统计学意义。结论周围神经感觉束和运动束之间的比较蛋白质学表达存在明显差异,Annexin V可作为鉴别周围神经感觉和运动束的高差异标记蛋白
孟宪宇路来金陈焕新
关键词:周围神经蛋白质组学

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王洪海
作品数:262被引量:727H指数:15
供职机构:复旦大学
研究主题:结核分枝杆菌 结核杆菌 结核病 结核病疫苗 分枝杆菌
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作品数:180被引量:576H指数:12
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陈主初
作品数:254被引量:1,022H指数:16
供职机构:中南大学湘雅医院
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供职机构:绵阳市第三人民医院
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乐军
作品数:133被引量:685H指数:15
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研究主题:结核分枝杆菌 结核病 异烟肼 结核 异烟肼耐药