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RNA甲基化与肿瘤染色质重塑
2025年
表观遗传重编程在癌症发展中扮演着关键角色,其中RNA的N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)甲基化修饰与染色质重塑之间的相互作用对肿瘤演进具有重要影响。该文综述了RNA m^(6)A甲基化与染色质重塑之间的相互作用,包括m^(6)A写入对染色质重塑的影响、RNA m^(6)A如何通过影响DNA甲基化和组蛋白修饰调控染色质状态以及RNA m^(6)A对染色质三维结构的调控作用。同时,该文探讨了染色质重塑如何调控RNA m^(6)A修饰,包括对RNA m^(6)A相关因子表达及功能的影响。这些相互作用在肿瘤的发生、发展以及治疗反应中发挥着关键的调控作用。
叶灿彬张嘉良林东昕郑健
关键词:染色质重塑组蛋白修饰DNA甲基化
一种检测tat基因影响染色质重塑相关基因表达量的方法
本发明公开了一种检测tat基因影响染色质重塑相关基因表达量的方法,涉及实时荧光PCR应用技术领域,包括以下步骤:将包含tat基因的粒转染入细胞,提取细胞RNA,将RNA逆转录为cDNA模板,采用引物对cDNA模板进行q...
姜维嘉黄诚
构建基于染色质重塑相关基因的皮肤黑色素瘤预后预测模型
2025年
目的 本研究旨在探究染色质重塑相关基因(chromatin remodeling-related genes, CRRGs)与皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma, SKCM)患者总生存期(overall survival, OS)之间的关联,并构建风险评分预后预测模型。方法 基于TCGA和GTEx数据库,获得皮肤黑色素瘤中差异表达的CRRGs,进一步通过蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析和单因素Cox回归分析以及LASSO回归分析筛选皮肤黑色素瘤预后相关基因,并构建风险评分预后模型。根据风险评分的中位数,将皮肤黑色素瘤患者分为高风险组和低风险组。通过单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA)算法评估高、低风险组间皮肤黑色素瘤患者的免疫细胞浸润情况。结果 PPI网络分析筛选到15个hub基因,单因素Cox回归和LASSO回归分析筛选到5个与皮肤黑色素瘤患者OS相关的CRRGs,分别为MMP2、MMP9、SPP1、TNFSF11和TIMP1。基于5个预后基因构建风险评分,多因素Cox回归分析表明风险评分是皮肤黑色素瘤患者的独立预后因素(P<0.05)。生存分析结果显示高风险组皮肤黑色素瘤患者的OS短于低风险组(P<0.05)。免疫细胞浸润分析结果表明高低风险组患者间有16种免疫细胞的浸润比例存在显著差异,其中活化B细胞、未成熟B细胞、效应和记忆性CD8+T细胞以及活化的CD8+T细胞等在高风险组中的占比显著降低(P<0.05)。而CD56bright自然杀伤细胞、CD56dim自然杀伤细胞、γδT细胞和未成熟的树突状细胞等在高风险组中的占比显著升高(P<0.05),药物敏感性分析表明高风险和低风险皮肤黑色素瘤患者对克唑替尼、厄洛替尼、吉非替尼和维诺瑞滨的敏感性存在显著差异(P<0.01)。结论 本研究构建了由5个CRRGs组成的皮肤黑色素瘤预后模型,进一步揭示了皮肤黑色素瘤不同风险组患者的免疫微环境和药物敏感性差异,为皮肤黑色素瘤患者的个性
李勇刘冰梅
关键词:皮肤黑色素瘤染色质重塑
SWI/SNF染色质重塑复合物在肿瘤耐药中的作用
2025年
肿瘤耐药是化疗和靶向药物治疗面临的重要问题,它是一个涉及染色质重塑的复杂过程。SWI/SNF是肿瘤发生中研究最多的ATP依赖性染色质重塑复合物之一,在染色质结构稳定性、基因表达和翻译后修饰的协调过程中起着重要作用,但其调控肿瘤耐药的机制尚未被系统梳理。SWI/SNF按其亚基组成可分为BAF、PBAF和ncBAF 3种,这3种亚型均包含ATP酶催化亚基、核心亚基和调节亚基,可以通过调控染色质结构来控制基因表达。SWI/SNF复合物亚基的改变是调控肿瘤耐药和进展的重要因素之一,充分了解该复合物在肿瘤耐药中的分子机制可以改善癌症的治疗。本文总结了SWI/SNF复合物的组成、引起肿瘤耐药的突变或异常表达亚基类型、主要的耐药机制以及肿瘤耐药的克服方法等,为临床上SWI/SNF亚基突变或异常表达引起的肿瘤预后不良的诊断和治疗提供了思路。
朱桂珍叶巧罗渊彭洁王璐杨昭婷段峰森郭丙乾梅竹松王广云
关键词:肿瘤耐药
染色质重塑的功能和机理研究进展被引量:1
2024年
染色质重塑蛋白利用ATP的能量改变染色质中核小体的位置和组成,促进组蛋白变体交换、核小体滑动、解聚、或弹出,进而影响基因组DNA可及性.染色质重塑对DNA复制、基因转录和DNA损伤修复等生命过程至关重要.染色质重塑蛋白与一些调控蛋白共同组装形成复杂的分子机器,应答不同的细胞信号,广泛参与细胞分化、组织发育及免疫应答等过程.染色质重塑复合物的功能失调与肿瘤、发育缺陷、神经退行性疾病等众多重大疾病的发生发展密切相关.近年来,有关染色质重塑的机理和作用研究突飞猛进.文章综述了SWI/SNF、ISWI、INO80和CHD四个染色质重塑家族蛋白复合物的组成和功能特点,阐释了“DNA波”模型这一普适的染色质重塑机制,并总结了染色质重塑活性的多重调控的研究进展,进一步讨论了染色质重塑蛋白对启动子区核小体的调控机理.这些研究对于理解基因表达调控,以及相关疾病的发生发展具有重要意义.
袁俊杰陈柱成
关键词:染色质核小体染色质重塑转录调控
染色质重塑:在疾病机制与治疗中的新视角
2024年
染色质重塑是调节基因表达和维持基因组稳定性的关键机制。近年来,随着表观遗传学研究的深入,染色质重塑在疾病的发生、发展及其治疗中的作用受到了广泛关注。特别是在癌症、神经系统疾病和代谢疾病等疾病中,染色质重塑因子的异常活动已被证明与疾病的机制密切相关。文章对其研究进展进行综述。
陈卉(综述)王季石
关键词:染色质重塑疾病
染色质重塑复合体INO80调控基因表达的机制研究
2024年
真核生物基因组DNA与组蛋白形成核小体,但真核基因组仍可结合转录、复制和修复过程的一系列酶,该过程主要受ATP依赖的核小体重塑复合物的调节.核小体重塑复合物INO80具有独特的结构特征,可促进复制叉停滞后重启,并在复制叉与转录物碰撞后帮助转录的基因清除RNA聚合酶Ⅱ.此外,INO80复合物还参与DNA损伤修复并抑制与编码序列方向相反的不适当转录.这些不同功能的基础是可促进核小体滑动并进行组蛋白变异体交换的核心ATPase亚基.本文主要概述染色质重塑复合物INO80的组成及其介导的基因表达调控机制研究的最新进展,为进一步研究INO80的生物学功能以及其在发育和疾病中的作用提供基础.
章慧邱小波姜天霞
关键词:染色质重塑表观遗传调控转录调控DNA复制DNA损伤修复
染色质重塑复合体成员OsSEF在水稻抗稻瘟病中的功能分析
在与病原菌长期斗争的过程中,植物进化出了特有的天然免疫系统,转录重编程在其中发挥着重要作用。转录重编程主要由转录因子所调控,研究表明多种类型的转录因子在植物免疫中发挥着重要作用。实验室前期发现GRAS类转录因子Os SC...
张静
关键词:水稻稻瘟病抗性
组蛋白及变体在染色质重塑中的功能:以水生动物精子发生为例
2024年
两性生殖中,精子作为携带父本信息的载体,是物种延续的关键因素。精子发生经历精原细胞、初级和次级精母细胞、圆形精子、成熟精子阶段。在圆形精子形成成熟精子过程中,染色质进行重塑,细胞形态发生剧烈变化,其中,组蛋白修饰和组蛋白变体在这些过程中发挥了重要作用:如甲基化主要与基因表达的激活或抑制有关;乙酰化激活转录活性并参与组蛋白沉积和DNA修复;磷酸化促进转录后修饰或参与DNA双链断裂修复;泛素化调节不同细胞途径中各式各样的蛋白底物。组蛋白变体在调节染色体结构中发挥重要功能:如组蛋白H1变体在分化过程中具有抑制转录的作用;组蛋白H2A和H2B变体在精子染色质包装过程中发挥特有功能;H3.3是H3最重要的变体,在细胞周期的各时期都有表达;组蛋白H4则是进化最慢的组蛋白之一,目前还没有发现其组蛋白变体。本文围绕组蛋白翻译后修饰,梳理了甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化等方面的最新进展和组蛋白变体在染色质重塑过程中的功能研究进展,随后针对各类组蛋白变体及其功能进行了总结,最后以半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)为例简要介绍这些研究对水生动物精子发生的启示。
徐文腾孙雪雪
关键词:组蛋白翻译后修饰染色质重塑精子发生
ATP依赖的染色质重塑复合物异常与人类神经发育遗传病的研究进展
2024年
ATP依赖的染色质重塑复合物在改善局部DNA的可及性、调节基因转录以及介导DNA的复制和修复等过程中扮演重要的角色。根据所包含的功能结构域,又可将其分为SWI/SNF、ISWI、CHD和INO80四大类。四者均为调控基因表达的重要因子,在机体发育的过程中发挥关键的作用。复合物组分编码基因的变异与人类发育障碍和神经异常综合征等遗传病的发生密切相关。本文介绍了ATP依赖的染色质重塑复合物的分类、基本功能和作用机制,以及这类复合物亚基编码基因变异所导致的常见神经系统遗传病。
桂芸李璐璐王剑
关键词:神经系统遗传病

相关作者

万方浩
作品数:773被引量:6,385H指数:41
供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
研究主题:烟粉虱 紫茎泽兰 生物防治 番茄 豚草
刘万学
作品数:333被引量:2,143H指数:31
供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
研究主题:番茄 潜叶蛾 紫茎泽兰 烟粉虱 农业生物技术
吕志创
作品数:106被引量:168H指数:6
供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
研究主题:烟粉虱 MED 基因 农业生物技术 番茄
张桂芬
作品数:226被引量:924H指数:22
供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
研究主题:番茄 潜叶蛾 试剂盒 COI 引物
蔡汉阳
作品数:33被引量:17H指数:3
供职机构:福建农林大学
研究主题:辣椒 水稻 基因工程 转基因烟草 拟南芥