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多重耐药弗劳地枸橼酸杆菌的基因组及耐药机制分析被引量：1: 2024年; 目的对多重耐药弗劳地枸橼酸杆菌进行全基因组分析,为研究其耐药机制提供依据。方法采用含美罗培南的MH培养基对粪便标本进行初筛,经BD Phoenix100全自动微生物鉴定仪进行菌种鉴定及药敏试验,提取耐药菌总DNA进行二代测序和细菌多位点序列分型(MLST),经质粒全基因组序列分析检测质粒的组分和功能,并与参考质粒进行比较,通过质粒接合转移实验分析耐药质粒传递情况。结果413份粪便标本中分离出1株多重耐药弗劳地枸橼酸杆菌,该菌株对头孢菌素类、碳青霉烯类抗菌药物、复方磺胺甲噁唑的耐药率均为100%,对氨曲南、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素等抗菌药物呈现不同程度耐药;MLST分型的耐药弗劳地枸橼酸杆菌为ST22型,该菌株共含有5412个基因,含耐药基因367个,包括碳青霉烯酶类耐药基因、AmpC酶基因、大环内酯类耐药基因、氨基糖苷类耐药基、喹诺酮类耐药基因等。质粒的全基因组分析结果显示,该质粒含碳青霉烯类耐药基因blaNDM-1、blaSHV12,该质粒与泄殖腔肠杆菌菌株ECN49质粒和肺炎克雷伯菌菌株质粒pA575-NDM有极高的同源性;质粒接合实验显示,blaNDM-1和blaSHV-12可以通过质粒转移。结论弗劳地枸橼酸杆菌耐药的主要原因之一是含有blaNDM-1、blaSHV-12等耐药基因,并且该耐药性能通过质粒进行水平转移。; 黄蓉段小女芮勇宇; 关键词：弗劳地枸橼酸杆菌全基因组分析耐药基因质粒

154株枸橼酸杆菌的临床分布及耐药性分析: 2024年; 目的了解枸橼酸杆菌在医院感染中的临床分布及耐药性。方法采用VITEK 2全自动微生物分析仪和配套的GNI、GNS-13,对2013年1月—2022年12月分离的枸橼酸杆菌进行鉴定和药敏试验,药敏结果使用Whonet 5.6软件进行分析。结果共分离到154株枸橼酸杆菌,主要来自尿液标本(53.25%),其次是脓液/切口(16.88%)。其中,弗氏枸橼酸杆菌最多,占49.35%;其次是克氏枸橼酸杆菌,占33.12%。枸橼酸杆菌对头孢唑啉耐药率在97.8%~100.0%,对碳青霉烯类的耐药率均为0.0%,对三代或四代头孢菌素、头孢替坦、氨曲南、庆大霉素、妥布霉素和哇诺酮类的耐药率均小于15.8%,对哌拉西林/他唑巴坦和呋喃妥因耐药率均小于1.7%,对复方新诺明的耐药率在11.8%~40.8%。结论枸橼酸杆菌耐药机制复杂,临床应以药敏结果为指导,哌拉西林/他唑巴坦和呋喃妥因可作为首选药物。; 屠友权陈群英韩清; 关键词：医院感染枸橼酸杆菌耐药性

2015—2021年CHINET临床分离枸橼酸杆菌属细菌耐药性变迁: 2024年; 目的了解2015—2021年CHINET中国细菌耐药监测网成员单位临床分离枸橼酸杆菌属的分布特点及其耐药性变迁情况。方法按照CHINET统一技术方案,采用纸片扩散法或自动化仪器法进行药敏试验,按CLSI 2021年版标准判读药敏结果,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果2015—2021年共分离出枸橼酸杆菌属细菌12855株,其中弗劳地枸橼酸杆菌7925株,占61.65%,克氏枸橼酸杆菌2589株,占20.14%。7年间枸橼酸杆菌属细菌在全部细菌和肠杆菌目细菌中的检出占比呈上升趋势,2015年分别占0.76%和1.76%,2021年分别占0.94%和2.09%。科室来源主要为外科病房(32.33%±5.42%),其次为内科病房(26.92%±3.70%)。标本来源主要分离自尿液(34.15%±1.01%)及呼吸道(22.23%±2.09%)。2015—2021年枸橼酸杆菌属对氨苄西林耐药率有所升高,对其他抗菌药物耐药率均呈下降趋势;对亚胺培南和美罗培南耐药率分别从9.5%和8.3%下降到5.5%和5.8%,对环丙沙星、替加环素以及多黏菌素耐药率波动幅度较小;在所有枸橼酸杆菌属细菌中,弗劳地枸橼酸杆菌对各类抗菌药物耐药率最高。结论枸橼酸杆菌对多数临床常用抗菌药物耐药率呈下降趋势,应继续加强抗菌药物合理应用管理及细菌耐药监测,以遏制细菌耐药率回升。; 李可可魏莲花杨洋胡付品朱德妹徐英春张小江张朝霞季萍谢轶康梅王传清王爱敏徐元宏黄颖孙自镛陈中举倪语星孙景勇褚云卓田素飞胡志东李金俞云松林洁单斌杜艳郭素芳张泓王春胡云建艾效曼卓超苏丹虹郭大文赵金英喻华黄湘宁刘文恩李艳明金炎邵春红徐雪松鄢超王山梅楚亚菲张利侠马娟周树平周艳朱镭孟晋华董方吕志勇胡芳芳沈瀚周万青贾伟李刚; 关键词：细菌耐药性监测抗菌药物

一种多重PCR试剂盒及用其检测弗劳地枸橼酸杆菌的方法: 本发明属于微生物鉴定领域，具体涉及一种多重PCR试剂盒及用其快速检测弗劳地枸橼酸杆菌的方法。本发明利用弗劳地枸橼酸杆菌的三个特异性强的靶基因，设计获得三对引物对，进行电泳检测；并据此提供了一种可快速检测出弗劳地枸橼酸杆菌...; 王利张楠驰

弗氏枸橼酸杆菌中发现介导bla_(KPC-2)传播的新型质粒及比较基因组学分析: 2023年; 目的探讨来自弗氏枸橼酸杆菌的产碳青霉烯酶的新型不相容群组质粒pNY2385-KPC的耐药机制及基因结构特征。方法从宁波市医疗中心李惠利医院急诊病房的发热患者尿液样本中获得1株多药耐药菌。采用16S rRNA基因扩增和平均核苷酸一致性(ANI)进行菌种鉴定;采用全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌MIC值;通过“三代”测序方法获得基因组序列,然后通过BLASTP/BLASTN、RefSeq、ConservedDomains、ResFinder、Isfinder等对基因功能进行详细注释及比较基因组学分析。结果弗氏枸橼酸杆菌NY2385携带的质粒pNY2385-KPC为一种新型不相容群组质粒,包含bla_(KPC-2),具有接合转移(Ⅳ型分泌系统)基因,可发生接合转移。NCBI中共检索到同型质粒15个,来源于弗氏枸橼酸杆菌、黏质沙雷菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、肺炎克雷伯菌和植生拉乌尔菌等细菌,为泛宿主质粒。通过对来自弗氏枸橼酸杆菌中6个该新型质粒进行序列比较分析,发现该新型质粒结构具有一定的保守性,具有携带bla_(KPC-2)的Tn6296变体结构,而且质粒pCF1807-3同时具有repApNY2385-KPC和repAIncX8。结论弗氏枸橼酸杆菌中的pNY2385-KPC型质粒均携带bla_(KPC-2)耐药基因,分为repApNY2385-KPC单复制子和repApNY2385-KPC/repAIncX8双复制子两种亚型,属于泛宿主质粒,作为可移动遗传元件促进了bla_(KPC-2)的传播。; 郭会钱李昕悦陈素明张旺鲍春梅殷喆李伯安; 关键词：多药耐药肠杆菌科

弗劳地枸橼酸杆菌的临床分布及其耐药性分析被引量：1: 2022年; 目的了解临床中C.freundii的分布和耐药情况,从而为现阶段少见菌种抗菌药物的使用提供针对性的方案。方法收集97株2016—2021年非重复C.freundii,运用聚合酶链反应(PCR)筛查第1、2、3类整合酶基因(intI1、intI2、intI3),对intI+的C.freundii采用长片段PCR扩增整合子可变区,通过测序确定可变区基因盒种类。结果 97株C.freundii中,21株第1类整合酶阳性,2株第2类整合酶阳性。扩出的可变区中,有8株是dfrA12-aadA2,其中aac(6’)-II-ereA2-aac3-arr-ereA2和aac(6’)-II-ereA2-tnpA-aac3-arr-ereA2携带的基因盒种类最多。结论 C.freundii菌株整合子携带率低于其他肠杆菌科细菌,其可变区耐药基因盒种类多样,该菌目前临床耐药之所以如此严峻,是与其携带的可变区启动子(Pc)密切相关。碳青霉烯类抗生素(CRE)仍然是对多重耐药菌株具有活性的抗生素,但应限制其使用以避免出现耐药性,而第三代头孢类抗生素依然可作为治疗由C.freundii所引起的感染首选药物。; 朱玉张龙魏取好; 关键词：弗劳地枸橼酸杆菌耐药性整合子启动子

低氧对鼠枸橼酸杆菌感染小鼠肠道固有免疫功能的影响: 2022年; 目的探讨低氧对细菌感染小鼠肠道固有免疫功能的影响。方法将C57BL/6野生型小鼠随机分为常氧对照组(NC)、常氧感染组(NB)、低氧对照组(HC)和低氧感染组(HB)。以感染肠道鼠枸橼酸杆菌的小鼠为模型,分别在海拔2 260 m(大气压582mmHg, PO;121.6mmHg)和海拔5 000 m(大气压405mmHg, PO;84.7mmHg)处建立细菌感染模型,观察小鼠体重和结肠形态学变化;同时检测小鼠结肠、脾脏和血清中的中性粒细胞和巨噬细胞的相关细胞因子水平。结果 (1)HB组体重明显低于NB组(P<0.05);(2)HB组结肠组织有明显的黏膜破损和严重的炎细胞浸润,且HB组病理组织评分明显高于NB组(P<0.05);(3)HB组血清和结肠、脾脏中的中性粒细胞、巨噬细胞的炎性细胞因子及趋化因子明显低于NB组(P<0.05);(4)各感染组血清和结肠、脾脏中的中性粒细胞与巨噬细胞相关细胞因子及趋化因子水平均与相应对照组存在差异,差异有统计学意义(P<0.05)。结论低氧会降低小鼠肠道中性粒细胞和巨噬细胞的趋化性,造成小鼠肠道固有免疫功能的降低;低氧可加重鼠枸橼酸杆菌感染导致的小鼠肠道病理变化。; 高翔高翔张昱杜忠蕾韩莹贾茹涵马倩倩周义玲申香群张伟; 关键词：低氧

耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌致医院获得性感染的临床特征与耐药性分析被引量：1: 2022年; 目的探讨耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌(CRCF)致医院获得性感染的临床特征与耐药性。方法回顾性分析2016年1月—2020年12月某院住院患者临床标本分离CRCF菌株药敏数据及相关临床资料。结果在2016—2020年间检出的27 486株肠杆菌科细菌中共检出CRCF 39株,检出率为0.14%。不同性别、年龄段、年度、季节、标本类型、临床科室间CRCF的检出率差异有统计学意义(P<0.05)。药敏结果表明,CRCF菌株对临床常用抗菌药物呈高度耐药,对临床广泛使用的含酶抑制剂、三代和四代头孢类、单酰胺环类、碳青霉烯类等抗菌药物100%耐药,对氨基糖苷类药物的耐药率均高于40.00%,对喹诺酮类药物的耐药率均高于55.00%,对多黏菌素B、替加环素全敏感。改良Hodge试验阳性率为79.49%,IMP-EDTA协同试验阳性率为87.18%。结论该地区CRCF检出率较低,存在严重的多重耐药现象,应对其耐药性进行监测,指导临床合理用药。; 陈建飞方寅飞徐浩; 关键词：医院感染耐药性

碳青霉烯类耐药弗劳地枸橼酸杆菌耐药及毒力基因的分析被引量：3: 2021年; 目的对临床分离的碳青霉烯类耐药弗劳地枸橼酸杆菌(carbapenem resistant Citrobacter freundii,CRCF)进行耐药及毒力基因分析,为控制CRCF感染提供依据。方法收集昆明医科大学第一附属医院2016年1月至2017年12月22株CRCF,通过VITEK2 Compact系统对菌株进行细菌鉴定及药敏试验,用PCR检测菌株耐药及毒力基因的携带情况。结果药敏结果显示,菌株对青霉素类、头孢菌素类及碳青霉烯类抗生素的耐药率均为100%,对氨曲南、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素、四环素、复方新诺明及呋喃妥英等抗生素呈现出不同程度的耐药;22株菌株耐药基因检测结果显示,KPC-2、IMP、NDM-1、TEM、SHV和CTX等阳性率分别为27%、32%、82%、82%、23%和27%,携带2种或以上耐药基因的阳性率为91%;18株菌株毒力基因检测结果显示,ureA、wabG、ycf和uge等阳性率依次为41%、23%、14%和14%,未检测到IroN、allS、KfuB、iutA、ybtS、VatD及fimH等毒力基因。结论该院CRCF碳青霉烯类耐药性主要由NDM-1基因介导,而其毒力主要与脂多糖相关,多重耐药毒力强的CRCF应引起临床高度重视。; 杜娜李焕芹刘淑敏杜艳尧静; 关键词：耐药基因毒力基因

食品及销售环境中枸橼酸杆菌污染状况及耐药谱分析被引量：1: 2021年; 目的了解石家庄市食品以及销售环境中枸橼酸杆菌的污染状况和菌株耐药情况,为预防由该菌引起的食源性疾病及临床治疗用药提供科学依据。方法采集石家庄市内4区以及周边4县(区)的超市及农贸市场的生畜肉、生禽肉、动物性水产品、熟食,对4类食品以及销售环境样品进行枸橼酸杆菌分离检测,并对分离株进行耐药检测。菌株鉴定应用飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统和全自动细菌鉴定药敏分析系统(VITEK 2 Compact)进行鉴定,药敏试验采用微量肉汤稀释(MIC)法。结果 320份不同来源的样品中,有62份检出枸橼酸杆菌,共分离菌株72株,总检出率为19.4%(62/320),4类食品以及销售环境样品均有检出,其中生畜肉检出率为28.2%(33/117),生禽肉为21.3%(10/47),水产品为18.2%(8/44),熟食为15.7%(8/51),环境样品为4.9%(3/61),食品与环境样品间检出率差异有统计学意义(χ^(2)=10.08,P<0.01),4类食品样品检出率差异无统计学意义(χ^(2)=4.01,P>0.05)。菌株的耐药情况比较严重,对所检测的26种抗生素均有不同程度的耐药,对头孢唑林(93.1%,67/72)、头孢西丁(81.9%,59/72)耐药率较高,所有菌株均对美罗培南敏感;分离的枸橼酸杆菌中,产生超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)7株,占9.7%(7/72);耐药谱中66株显示多重耐药(MDR),多重耐药株占比高达91.7%(66/72)。结论枸橼酸杆菌在食品中污染较为严重,分离株呈高耐药和多重耐药趋势,并有可能成为引起食源性疾病发生的潜在因素,应引起重视。; 秦丽云蒋瑞萍高伟利吕国平吕新朝宿歆; 关键词：枸橼酸杆菌食品销售环境污染状况菌株耐药

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