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组合物及文库构建方法
本发明公开了一种组合物及文库构建方法。本发明通过在连接反应体系中引入增强剂,有效提升了连接效率,同时应用于核酸文库构建中,接头二聚体残留低,显著提升了测序有效数据量含量,减少了数据的浪费,一定程度上降低了测序成本。
商桂李洪洲关媛妹
一种用于检测与目标基因座相互作用的DNA片段的文库构建方法
本发明提供一种用于检测与目标基因座相互作用的DNA片段的文库构建方法。该方法包括:交联样本细胞内的DNA与蛋白质,酶切交联体中的DNA,加测序接头,重连DNA片段,解交联,加文库接头,和目标片段文库扩增的步骤。通过本发明...
宋健李小林韦所苏
一种马凡综合征相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和应用
本发明公开了一种马凡综合征相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和应用,属于基因检测技术领域。本发明中的捕获探针组序列如SEQ ID No.1~149和SEQ ID No.150~238所示,能针对性捕获目标基因FB...
王利新郭玮姜昕王蓓丽符伟国郁俐沈敏娜张丽李军胡诚凯赵瀛潘柏申
一种高通量小体系NGS文库构建方法
本发明涉及一种高通量小体系NGS文库构建方法。能够将建库体系缩减至0.1×,大大降低建库成本,整合Sciclone‑384、Dragonfly和G PURE等仪器设备,提高建库自动化水平,将一次建库通量提升至384个样本...
张雪川郑洪坤毕经德陈汝英
一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用
本发明涉及DNA测序领域,具体地,涉及一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用。其中,所述短链ssDNA的测序文库构建方法,包括步骤:添加多聚核苷酸尾步骤,以所述短链ssDNA为模板,利用末端脱氧核苷酸转移酶...
田振阳吕文丽逯晓云孙隽
基于Tn5转座酶复合体的Smart-seq2文库构建方法
本发明公开了基于Tn5转座酶复合体的Smart‑seq2文库构建方法,包括以下步骤:Tn5转座酶复合体溶液的制备;将制备得到的Tn5转座酶复合体溶液逆转录并进行预扩增后获得的cDNA进行消化;向获得的产物中加入其他Sma...
周莹葛芹玉陆祖宏
西伯利亚杏花芽酵母cDNA文库构建及质量评价
2025年
【目的】西伯利亚杏Prunussibirica是我国重要的生态兼木本粮油树种,由于其花期早,易受春季“倒春寒”影响,导致其产量不稳,严重制约其产业的发展。本研究利用西伯利亚杏花芽为材料构建酵母杂交cDNA文库,该文库可用于西伯利亚杏花芽分化及休眠的转录因子和互作蛋白的筛选,为今后西伯利亚杏花芽分化及休眠分子调控机制研究提供技术支撑。【方法】以西伯利亚杏花芽分化及休眠过程中15个时期的花芽为材料,进行总RNA提取以及mRNA的分离与纯化,并利用SMART同源重组技术构建cDNA文库。将cDNA文库转化至酵母感受态细胞中,即得到cDNA酵母文库。【结果】鉴定结果表明,cDNA文库库容为5.24×10^(7)CFU/mL,插入片段长度主要分布在750~2000 bp,且平均插入长度在1000 bp以上,重组率为95.83%,24个阳性克隆经测序比对后,成功检测到20个功能注释基因,其中有3个序列(钙结合蛋白CML31、组蛋白H3.3、转录调节因子ADA2)与植物休眠及低温胁迫相关。【结论】西伯利亚杏花芽分化及休眠过程的酵母杂交cDNA文库构建质量较高,具有完整的基因信息,且符合酵母文库的筛选标准。该文库构建能够为解析西伯利亚杏花芽分化及休眠相关的分子调控网络机制奠定基础。
陈俊兴包文泉敖敦蔺悦陈一潇伊茹徐宛玉王淋
关键词:花芽CDNA文库
一种基于Red/ET重组工程的质粒文库构建方法及其应用
本发明属于基因克隆和组装技术领域,具体涉及一种基于Red/ET重组工程的质粒文库构建方法及其应用。本发明通过构建合适的线性化表达载体,并以载体两端的50bp短序列作为同源臂。向待研究的所有DNA序列两端引入这两段同源臂使...
王雪崔洁卞小莹涂强张友明
一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用
本发明涉及DNA测序领域,具体地,涉及一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用。其中,所述短链ssDNA的测序文库构建方法,包括步骤:添加多聚核苷酸尾步骤;其中,所述加尾短链ssDNA长度不小于100nt;获...
田振阳吕文丽逯晓云孙隽
一种试剂盒及其文库构建方法与目标变异检测分析方法
本发明涉及高通量测序技术领域,公开了一种试剂盒及其文库构建方法与目标变异检测分析方法,该试剂盒包括预文库构建试剂和目标区域液相杂交捕获试剂;其中所述预文库构建试剂包括修复试剂、接头、连接试剂、扩增试剂和纯化磁珠;所述目标...
陶挺颜丙霄舒强王金湖顾伟忠肖锐陆利郑国枭边佳昕

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作品数:400被引量:803H指数:14
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作品数:268被引量:990H指数:17
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研究主题:棉花 陆地棉 黄萎病 抗黄萎病 黄萎病菌
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供职机构:河北农业大学
研究主题:棉花 陆地棉 黄萎病 纤维品质 抗黄萎病
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供职机构:河北农业大学
研究主题:棉花 黄萎病 陆地棉 纤维品质 抗黄萎病
关伟军
作品数:430被引量:1,243H指数:17
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