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金沙鲈鲤全长转录组测序分析与抗菌肽基因的鉴定
2025年
为进一步丰富金沙鲈鲤(Percocypris pingi)基因信息数据库,采用PacBio测序平台对金沙鲈鲤进行全长转录组测序。共获得499 007个全长非嵌合序列(Full-length non-chimeric read,FLNC),通过聚类和去冗余获得70 321个isoforms,isoforms的平均长度和N50分别为1 882 bp、2 243 bp。将isoforms与NR、GO、KEGG、KOG和Swiss-Prot 5个公共数据库进行比对,成功注释了57 521个isoforms,并鉴定到2 310个TF、16 225个LncRNA和35 314条CDS。鉴定到5个抗菌肽基因,包括2个hepcidin基因和3个hemoglobin基因。金沙鲈鲤的hepcidin-1、hepcidin-2与多鳞白甲鱼(Onychostoma macrolepis)的hepcidin亲缘关系较近;金沙鲈鲤的hemoglobin-1α与斑马鱼(Danio rerio)的hemoglobin α亲缘关系较近;金沙鲈鲤的hemoglobin-1β与斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)的hemoglobin 1β、hemoglobin 2β亲缘关系较近;hemoglobin-2β与多鳞白甲鱼的hemoglobin 2β亲缘关系较近。通过对金沙鲈鲤全长转录组的注释分析,阐明了金沙鲈鲤基因参与的生物过程、所在的代谢途径或信号通路等,可以更有效地探究抗菌肽在鱼类免疫中的作用。
朱思艺邓龙君李天才张扬郭勇垚罗伟杜宗君
关键词:测序抗菌肽基因
一种表达小鼠抗菌肽基因的植物乳杆菌对新生儿坏死性小肠结肠炎的作用
本发明公开了一种表达小鼠抗菌肽基因的植物乳杆菌对新生儿坏死性小肠结肠炎的作用,属于生物技术领域。本发明利用重组植物乳杆菌L.plantarumFCQHC24/pMG36e‑Usp45‑Linker‑CRAMP有效提高了N...
潘礼龙孙嘉董晓亮孙煜东李彬彬杨军
Bt对棉铃虫天蚕素抗菌肽基因(HacD)转录的影响
2024年
抗菌肽是昆虫体液免疫的重要组成部分,对抵御外源致病微生物的侵染具有重要作用。明确苏云金芽胞杆菌Bacillus thuringiensis(Bt)诱导下棉铃虫天蚕素抗菌肽基因(HacD)转录的空间特征和时序特征,有利于进一步了解昆虫体液免疫与棉铃虫抗Bt发展的关联性。本研究测定了HacD cDNA序列,对序列进行了蛋白质翻译,并通过RT-qPCR技术研究了棉铃虫HacD基因在Bt诱导下的转录规律。结果表明,棉铃虫HacD cDNA全长189 bp,其中GC含量为48.15%,链由63个氨基酸组成。Bt诱导后棉铃虫幼虫HacD相对转录水平整体呈显著上调趋势,其中脂肪体中HacD的相对转录水平上调最高,其次为血淋巴。Bt对棉铃虫幼虫进行短期诱导后,脂肪体和血淋巴中的HacD基因的相对转录水平均呈持续上调趋势,分别在诱导24 h和18 h时达到最高,随后均持续下调。对幼虫进行持续诱导后,F 0代初孵幼虫、5龄幼虫、蛹和成虫的HacD基因均可以保持上调的转录特性;传代培养获得的F 1代初孵幼虫、5龄幼虫、蛹和成虫的HacD基因转录较F 0代下调,但均高于对照组。综上所述,Bt能够诱导棉铃虫HacD基因转录水平上调。
袁伟宁魏玉红郭建国郭建国张美娇刘月英
关键词:棉铃虫苏云金芽胞杆菌抗菌肽脂肪体
草鱼TAB2与TAK1蛋白互作鉴定及其对两种抗菌肽基因表达的影响
2024年
为了探究草鱼TAB2(Ci TAB2)与Ci TAK1能否互作及其对2种草鱼抗菌肽基因(Cihepcidin与Ciβ-defensin1)表达的影响,实验首先采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法分析拟态弧菌感染后Citab2和Citak1在草鱼免疫相关组织中的时空表达模式。然后利用荧光共定位、免疫共沉淀及Western blot技术鉴定Ci TAB2与Ci TAK1在细胞内共定位及相互作用情况。最后将过表达质粒pEGFP-N1-Citak1与pEGFP-N1-Citab2共同转染草鱼肾细胞(CIK细胞),检测Cihepcidin与Ciβ-defensin1的相对mRNA表达水平。结果显示,拟态弧菌感染能够显著改变Citab2和Citak1的相对表达水平,前者于感染后不同时间在各检测组织中表现出不同的时空表达模式,而后者均呈现先上调后下调的表达模式;荧光显微镜下观察到Ci TAB2与Ci TAK1共定位于转染后的HEK293T和CIK细胞的胞质中,且在HEK293T细胞内能够形成Ci TAB2-Ci TAK1蛋白复合物;共同过表达Ci TAB2与Ci TAK1后,CIK细胞内Cihepcidin与Ciβ-defensin1的相对mRNA表达水平在各检测时间点均显著上调。结果表明,Ci TAB2与Ci TAK1存在互作关系且二者互作能够促进上述两种抗菌肽的转录表达。本研究从蛋白互作调控抗菌肽表达的角度为防治鱼类弧菌病提供了新策略。
杨文飞郭佳静赵文平李槿年
关键词:草鱼
烟草甲抗菌肽基因Defensin的鉴定及响应细菌的表达模式分析
2024年
本研究旨在阐明烟草甲Lasioderma serricorne Defensin(LsDef1和LsDef2)基因在响应细菌侵染过程中的功能。利用生物信息学分析了LsDef1和LsDef2编码蛋白的结构、特征和系统进化关系。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测LsDef1和LsDef2在烟草甲不同发育阶段(卵、1龄幼虫、2龄幼虫、3龄幼虫、4龄幼虫、蛹、成虫)、4龄幼虫不同组织(脂肪体、表皮、中肠、血细胞和马氏管)、病原微生物诱导情况、细菌及细菌细胞壁成分胁迫后的表达模式。序列比对发现烟草甲LsDef1和LsDef2具有典型的6个半胱氨酸,形成3对二硫键,属于β防御素。RT-qPCR显示LsDef1和LsDef2基因在烟草甲不同发育阶段均有表达,在幼虫4龄处于高水平表达;主要表达组织为脂肪体(Fat body)和血细胞(Hemocyte),其次为表皮和中肠,而在马氏管的表达水平最低。外来病原物诱导后,LsDef1和LsDef2基因表达量显著增加,对金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus诱导最为敏感,进一步得细菌和细菌细胞壁成分诱导表达模式显示金黄色葡萄球菌诱导高峰期出现在诱导后6 h;PGN-SA诱导表达高峰期为3 h。烟草甲LsDef1和LsDef2是一类可被革兰氏阳性菌诱导的抗菌肽,研究结果为进一步研究昆虫防御素类抗菌肽的功能奠定了基础。
彭琛李昂许小霞张舒昊张学伟古政坤梁耀星金丰良
关键词:烟草甲防御素组织特异表达免疫反应
藏猪与杜长大三元猪免疫器官和组织中Toll样受体与抗菌肽基因的表达差异分析
2024年
【目的】在哺乳动物中,Toll样受体和抗菌肽基因是先天免疫系统的重要组成部分,在对抗病原体侵袭过程中起至关重要的作用。针对藏猪和杜长大三元猪的Toll样受体和抗菌肽基因在不同免疫器官或组织中的表达差异进行探索,以揭示这些基因对于抗病能力和免疫反应的潜在贡献,为筛选抗病分子标记提供理论支撑。【方法】通过qPCR对6月龄藏猪和杜长大三元猪肺脏、肠系膜淋巴结、腹股沟淋巴结、颌下淋巴结和脾脏中Toll样受体基因(TLR1~TLR9)和两种抗菌肽基因(PBD-1和PR-39)的mRNA丰度进行检测。【结果】在藏猪的免疫器官或组织中Toll样受体与抗菌肽基因的m RNA表达大多数显著高于杜长大三元猪。其中,肺脏中TLR1、TLR2的m RNA表达量均提高50%左右,PR-39提高2.6倍;肠系膜淋巴结中TLR4的表达提高40%,TLR1、PR-39的表达分别提高88%和3倍;腹股沟淋巴结中TLR1、TLR2的表达提高约2倍,TLR9、PR-39的表达提高70%,PR-39的表达更是提高了7倍多;颌下淋巴结中TLR1、TLR2、TLR4、TLR7的表达均高出2倍以上,PR-39的表达也高出近7倍,它与腹股沟淋巴结中的水平相近;脾脏中TLR1的表达上升3.5倍,与在颌下淋巴结中的表达结果相似。TLR4、TLR9的表达上升50%左右,PR-39的表达上升2.5倍。【结论】藏猪相对于杜长大三元猪,在多个免疫器官或组织中的Toll样受体和抗菌肽基因表现出更高的表达水平。暗示藏猪可能拥有更强大的先天免疫能力,能够产生更有效的局部或系统免疫反应对抗病原微生物的感染。研究结果为识别抗病分子标记提供了重要的理论支持,有望为进一步改良藏猪和其他猪种的抗病性提供科学依据。
李新明洪纯黄秋艳程蕾燕孟繁明朱向星唐冬生唐冬生
关键词:TOLL样受体抗菌肽先天免疫藏猪
三种抗菌肽基因的克隆、表达及黄龙病抗性评价
柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)是柑橘生产中的毁灭性病害,可造成韧皮部坏死、筛管堵塞、根部腐烂、果实畸形乃至植株死亡,主要病原为韧皮部杆菌属难培养菌亚洲种(Candidatus Liberi...
曹鹏
关键词:柑橘黄龙病抗菌肽发根农杆菌抗性评价
象虫金小蜂寄生调控烟草甲抗菌肽基因表达的分子信号通路研究
张越
一种岷江百合defensin抗菌肽基因LrDef1及应用
本发明公开了一种岷江百合defensin抗菌肽基因<I>LrDef1</I>,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所述,编码如SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的蛋白质,本发明通过功能基因组学相关技术研究证实<I>Lr...
刘迪秋王自娥梁婷婷邓婕苏琳琳陈虹均葛锋
转DON毒素降解酶基因抗菌肽基因小麦的创制及鉴定
赤霉病(Fusarium head blight,FHB)是一种对小麦生产造成严重破坏的世界性病害。小麦被赤霉病菌感染后,造成产量大幅下降,威胁粮食生产安全;更重要的是,赤霉病菌在侵染小麦后还会产生多种真菌毒素,影响人和...
马玲
关键词:小麦赤霉病抗菌肽基因

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朱家勇
作品数:284被引量:779H指数:13
供职机构:广东药科大学
研究主题:家蝇 抗菌肽 肝靶向 家蝇抗菌肽 融合蛋白
柯涛
作品数:84被引量:353H指数:8
供职机构:南阳师范学院
研究主题:抗菌肽 油菜 抗菌肽基因 酿酒酵母 突变
金小宝
作品数:238被引量:512H指数:11
供职机构:广东药科大学
研究主题:家蝇 抗菌肽 肝靶向 家蝇抗菌肽 融合蛋白
黄自然
作品数:205被引量:1,494H指数:24
供职机构:华南农业大学
研究主题:抗菌肽 家蚕 柞蚕 柞蚕蛹 蚕沙
黄军艳
作品数:117被引量:149H指数:7
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:甘蓝型油菜 油菜 基因 启动子 菌核病