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新模型预测结直肠癌肝转移：结合脂质标志物与癌胚抗原分析: 王禹尧

用于新抗原分析的方法和系统: 本申请提供了通过检测手段，诸如质谱来表征靶标肽的方法，包括：引入至少一种保护性分子来与所述靶标肽混合；以及应用所述检测手段来表征所述靶标肽。每种保护性分子配置为具有与所述靶标肽相似的特征，但仍然能够通过所述检测手段来区分...; 王磬

疏水性半抗原分析物的精确测定测量: 公开了用于测定怀疑含有疏水性半抗原分析物的未知样品中的疏水性半抗原分析物的实际浓度的方法，其中所述未知样品怀疑含有干扰物质。对未知样品进行第一测定方法以获得未知样品中的疏水性半抗原分析物的测量浓度。对未知样品进行第二测定...; I.巴哈魏铁全

犬感染细粒棘球绦虫粪样中靶抗原分析: 包虫病又可称为棘球蚴病，此病是一类严重的人兽共患寄生虫病，它严重危害了人类与家畜的健康，并对畜牧业造成了危害与阻碍。作为终末宿主的犬科动物，其粪样中会含有细粒棘球绦虫生长发育过程中的代谢物、节片、虫卵、分泌物等虫体组织，...; 徐晶; 关键词：细粒棘球绦虫棘球蚴双向电泳

江苏某牛场奶牛乳房炎病原菌的分离鉴定、耐药性及保守抗原分析被引量：18: 2019年; 2018年6月对江苏某奶牛场30头隐性乳房炎奶牛的50个发病乳区采集生牛乳进行检测,分离鉴定主要病原菌,其中大肠埃希菌19株(38%)、肺炎克雷伯菌13株(26%)、金黄色葡萄球菌5株(10%)、凝固酶阴性葡萄球菌11株(22%)、无乳链球菌4株(8%)、停乳链球菌1株(2%)。采用PCR和血清学方法对金黄色葡萄球菌分离株进行分型,结果显示5株金黄色葡萄球菌中4株为CP8型(80%),1株为非CP5、CP8或336PS型。耐药性分析结果显示该牛场松鼠葡萄球菌菌株对磺胺类药物复方新诺明和广谱抗菌药甲氧胺嘧啶表现双重耐药,耐药率达100%;肺炎克雷伯菌对利福平和万古霉素表现双重耐药,耐药率达100%。此外,部分葡萄球菌、链球菌、肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌对四环素、红霉素、克林霉素和克拉霉素表现出中度敏感。但所有菌株对头孢哌酮、链霉素、庆大霉素、妥布霉素、氯霉素和呋喃妥因表现高度敏感,敏感率100%。通过PCR方法检测发现,在分离菌株中金黄色葡萄球菌TraP和FnbpA,无乳链球菌GapC和Sip,大肠埃希菌Lpf1A等保守抗原检出率高达89%~100%,证明其作为亚单位疫苗候选抗原的普适性。这一研究为该牛场乳房炎的临床用药和综合防控提供了参考依据。; 周明旭周明旭徐悦徐悦鲍熹张金秋杨章平朱国强; 关键词：奶牛乳房炎耐药性

诱导特异性CD8^+T细胞产生的肝细胞癌相关新抗原分析被引量：3: 2019年; 目的寻找肝细胞癌(HCC)突变相关肿瘤新抗原,确定其诱导产生的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)可特异性作用于肿瘤细胞,为进行HCC的疫苗免疫治疗提供理论依据.方法分析HCC患者肿瘤组织及其配对的正常组织全基因组和外显子测序数据,寻找肿瘤相关体细胞突变,结合患者人类白细胞抗原(HLA)表型,利用NetMHC软件预测具有较高结合力的突变表位,由此合成相应的多肽.在GEO数据库中选取GSE25097,利用GPL10687平台统计突变基因在肝癌组织和正常组织中的表达差异.采用实时荧光定量PCR法和免疫组化染色,检测10例HCC患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织中相关基因及其蛋白的表达差异.采用预测的带有突变位点的肿瘤新抗原合成多肽,诱导特异性CTL,检测其对负载有相应抗原的肿瘤细胞的杀伤效果.结果在全基因组和外显子测序的HCC组织中,TP53的突变率约为40%,LAMA3的突变率约为8%.在GSE25097数据库中,TP53和LAMA3 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量分别为1.57±0.02和1.37±0.10,均高于正常组织(分别为0.54±0.01和0.36±0.01,均P<0.05).实时荧光定量PCR法检测结果显示,TP53 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量为0.24±0.03,明显高于癌旁组织(0.11±0.01,P<0.05);LAMA3 mRNA在肿瘤组织中的相对表达量为0.13± 0.06,明显高于癌旁组织( 0.01± 0.01,P<0.05).免疫组化染色检测 TP53 和LAMA3蛋白的表达情况,与实时荧光定量PCR检测结果一致.对中国人群Ⅰ型主要组织相容性抗原(MHC-Ⅰ)基因亚型的统计结果显示,HLA-A2、HLA-A11或HLA-A24三者所占比列高达70%.预测的带有TP53和LAMA3突变位点的肿瘤新抗原多肽所诱导的CTL对负载有相应抗原的靶细胞具有显著杀伤作用,但不具有杀伤负载同一肽段带有正常非突变抗原的靶细胞,对机体正常细胞无杀伤作用.结论 TP53和LAMA3在HCC组织中存在高突变,并且其表达高于正常组织.带有突变位点的肿瘤新抗原多肽; 王艳梅赵博慧陈坤李正江曲春枫; 关键词：肝细胞癌 TP53

新生抗原分析: 癌症免疫学为癌症治疗提供了有希望的新途径，但是验证待针对为靶标的潜在的新生抗原是成本高的且昂贵的。分析MHC结合亲和力、抗原加工、与已知抗原的相似性、预测的表达水平(作为mRNA或蛋白质)、自相似性和突变体等位基因频率，...; V·瓦库雷斯库T·张J·R·怀特L·迪亚斯

猪流产胎儿中猪繁殖与呼吸综合征病毒的检测及GP5抗原分析被引量：3: 2018年; 河南某规模化猪场,按照每年4次高致病性猪繁殖与呼吸综合征弱毒疫苗免疫接种,2016年11月,妊娠后期母猪陆续产死胎。为确诊病因,采集死产胎儿肺脏组织,采用RT-PCR方法,扩增PRRSV NSP2基因部分片段(根据产物片段大小,能区分高致病性与经典毒株)和ORF5全长基因,结果显示,NSP2片段扩增大小约为418bp,表明检测毒株是高致病性PRRSV毒株;ORF5全长基因扩增结果,与预期大小片段一致。为分析猪繁殖与呼吸综合征疫苗免疫失败的原因,利用DNA Star软件,将检测毒株ORF5基因序列与其他17种PRRSV毒株ORF5基因序列构建遗传进化树,并对检测毒株与其他9种高致病性PRRSV毒株ORF5基因推导的氨基酸序列进行分析、比较及GP5抗原性分析。结果显示,ORF5序列分析表明,检测毒株与2015年福建分离毒株FJYR、河南分离毒株TJbd14-2同源性最高,分别为97.2%和97.0%,与美洲型经典毒株VR-2332同源性为87.7%,与欧洲型毒株Lelystad virus、NMEU09-1亲缘关系最远,分别为62.8%和62.6%;根据ORF5DNA序列推导氨基酸序列分析表明,与其他9种高致病性PRRSV毒株相比,从病料中检测毒株的GP5共有13个位置发生变异;GP5抗原指数分析表明,第30-40、51-63位抗原性,相比其他9种高致病性PRRSV毒株显著降低,据此推测这是导致免疫失败的根本原因,导致该猪场母猪流产的病原为一种变异的美洲型高致病性猪繁殖与呼吸综合征毒株。; 蒋增海赵攀登邓同炜陈益徐耀辉; 关键词：流产胎儿反转录-聚合酶链反应

疏水性半抗原分析物的精确测定测量: 公开了用于测定怀疑含有疏水性半抗原分析物的未知样品中的疏水性半抗原分析物的实际浓度的方法，其中所述未知样品怀疑含有干扰物质。对未知样品进行第一测定方法以获得未知样品中的疏水性半抗原分析物的测量浓度。对未知样品进行第二测定...; I.巴哈魏铁全

肺癌细胞株A549的常见肿瘤干细胞抗原分析和细胞分选比较被引量：3: 2017年; 背景:多项研究表明癌症有可能是起源于肿瘤组织内一个细胞亚群即肿瘤干细胞,近期的研究发现肺癌内也存在肿瘤干细胞,但肺癌内存在的肿瘤干细胞的表型目前仍未取得一致。目的:对人类非小细胞肺癌细胞株A549通过目前最常见的肿瘤干细胞表面抗原进行全面系统分析。方法:A549肺癌细胞株在常规高糖培养环境下,培养1周后进行表面抗原的检测。使用流式细胞术分析A549细胞CD133,CD44,CD24以及ABC运转蛋白家族G2的表达情况,并且通过流式分选的方法分离出CD44^+/CD24+和CD44^+/CD24^-两类亚群细胞,在低黏附、无血清并添加生长因子的环境下观察肿瘤干细胞肿瘤球形成的能力。结果与结论:(1)细胞表型变化:A549细胞中度表达肿瘤干细胞常见的抗原CD44(64.23%)和CD24(58.62%),而CD133和ABC运转蛋白家族G2的表达率很低,均约为0.9%,其中CD133/CD44双阳性的细胞数比例极低。表型为CD44^+/CD24+和CD44^+/CD24^-的细胞群比例分别为54.64%和23.38%。两类亚群细胞在碱性成纤维细胞生长因子及表皮生长因子存在的条件下,无血清培养均可形成肿瘤干细胞肿瘤球;(2)肿瘤球形成效率:CD44^+/CD24+和CD44^+/CD24^-的细胞群其肿瘤干细胞肿瘤球形成效率与A549细胞相比差异无显著性意义;(3)结果说明:CD44和CD24也许并非肺癌肿瘤干细胞的特异性标志,对于肺癌内肿瘤干细胞的表型鉴别还需要更多的研究。; 彭卓党晓燕张秋红张瑞杨拴盈; 关键词：干细胞肺癌细胞株A549 CD24

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