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‘黑果枸杞’杂交F1代群体遗传结构及其农艺性状关联分析
2025年
【目的】挖掘‘黑果枸杞’重要农艺性状关联的分子标记,为其新品种选育与种质创新提供参考依据。【方法】以‘黑果枸杞’杂交F1代227份群体样本为实验材料,在17个重要农艺性状多样性、相关性及主成分分析的基础上,结合19对SSR引物进行的遗传多样性和遗传结构分析结果,采用Tassel 3.0软件中MLM模型,进行农艺性状与SSR标记的关联分析,筛选标记用于新品种选育。【结果】227份‘黑果枸杞’杂交F1代群体17个表型性状变异系数在20%以上,Shannon指数H'均大于6.5;相关性分析表明叶面积与叶片宽度、叶片长度呈极显著正相关(P<0.01),未成熟果实数与果柄长呈极显著正相关(P<0.01);PCA分析筛选出累计贡献率为88.78%的6个主成分,其中叶片宽度(-0.79)、叶片长度(-0.76)、果实纵径(0.75)、果实横径(0.73)、单株结果主枝条数(0.72)、枝条基部粗度(0.63)、平均单果质量(0.61)、枝条长度(0.57)和花色苷含量(0.41)9个性状为关键性状;多态性信息含量(PIC)平均值为0.758,群体总遗传分化指数(F_(st))为0.010(P<0.05)产生的遗传分化均来自于杂交群体内;遗传结构与聚类分析明确将参试样本分成6个亚群;关联分析(MLM模型)得出5个与叶片宽度、叶片长度、叶片面积等生长性状高度关联的SSR标记,表型变异解释率均在10.00%以上,且存在同一标记与多个性状、同一性状与多个标记高度关联的现象。【结论】‘黑果枸杞’枝条、叶片及果实性状上存在广泛的遗传多样性,5个标记存在“一因多效”现象。
戴国礼米佳张波尹跃秦垦何昕孺
关键词:黑果枸杞农艺性状SSR
高粱BZR基因的鉴定及与籽粒性状关联分析
2025年
油菜素内酯(BRs,brassinosteroids)是植物体内存在的一种重要激素,在调控植物生长发育及抵抗多种环境胁迫过程中发挥作用。BZRs转录因子是BRs信号途径中的关键调节因子,通过调控靶基因的表达传递BRs信号。为了深入研究高粱BZRs基因的生物学特性及功能,本研究从高粱基因组中鉴定获得10个BZR基因。组织特异性表达分析显示,SbBZR3、SbBZR4和SbBZR10在多个组织中高表达,且均在籽粒发育过程中的表达量较高。同时,基于340份高粱种质资源的重测序结果及籽粒性状表型数据,鉴定SbBZRs的优异等位变异,结果表明,SbBZR3的优异等位变异SbBZR3-SNP404(T)与粒长显著相关,SbBZR10的优异等位变异SbBZR10-SNP660(A)与粒长、粒宽和千粒重显著相关,且在进化过程中SbBZR3-SNP404(T)和SbBZR10-SNP660(A)均受到了人工选择。本研究不仅为揭示高粱BZRs基因的作用机制奠定了基础,也将为利用优异等位基因改良籽粒大小、促进高产高粱新种质的创制提供参考。
赵娟莹李金彪李皓翔王绘艳张晓娟范昕琦梁笃郭琦柳青山张一中
关键词:高粱籽粒性状等位变异
大山羊AMH基因多态性筛选及其与产羔性状关联分析方法
本发明公开了大足黑山羊基因多态性及与产羔性状关联分析方法,涉及基因领域;包括以下步骤:样品采集和数据采集,采集大足黑山羊以及其血液样本、卵巢样本,并分别采集黑山羊的产羔数、初生重,然后计算第一胎平均初生重、前三胎平均产羔...
李亚茹赵中权杨明志李嘉悦张义语王磊宋帅飞
一种高通量转录组测序数据与性状关联分析系统及方法
本发明提供了一种高通量转录组测序数据与性状关联分析方法,包括如下步骤:获取对象的高通量转录组测序数据;根据高通量转录组测序数据获取对象的每个基因的归一化表达量;通过线性回归模型拟合对象的性状表型值与每个基因的归一化表达量...
康慧敏李华
一种分子标记在仔猪均匀度性状关联分析中的应用
本发明公开了与仔猪均匀度性状相关的SNP分子标记及其应用,登录号为rs328479442的SNP位点与仔猪均匀度性状显著关联,其位于猪3号染色体26987339位碱基(猪基因组11.1版本),参阅Ensembl数据库,得...
余梅梁浩徐鹏飞李小平付亮亮李新云刘小磊赵书红项韬马云龙付玉华
一种分子标记在长白猪总产仔数性状关联分析中的应用
本发明公开了与长白猪总产仔数性状相关的SNP分子标记及其应用,登录号为rs322407989的SNP位点与总产仔数性状显著关联,其位于7号染色体92518039位碱基(猪基因组11.1版本),参阅Ensembl数据库,得...
李小平徐鹏飞梁浩余梅付亮亮李新云刘小磊赵书红项韬马云龙付玉华
槐山羊PFOXic基因多态性与间性性状关联分析
2024年
间性是一种多发于山羊群体的先天性繁殖障碍疾病。为了解槐山羊间性性状发生机制,叉头转录因子2(FOXL2)启动子反向互补(PFOXic)基因的遗传多态性及其与间性性状的关系,本试验进行了间性槐山羊Y染色体易位分析、无角间性综合征(PIS)区缺失检测、PFOXic基因单核苷酸多态性(SNP)分析和PFOXic基因型与间性性状关联分析。结果显示,间性槐山羊染色体构成不含Y染色体,且PIS区均纯合缺失;在PFOXic基因中共检测到4个SNP:g.129749119 T>C、g.129749087 C>T、g.129748782 T>C和g.129747880 T>C,其中g.129749087 C>T为错义突变。SNP突变位点分析结果显示,g.129749119 T>C、g.129748782 T>C和g.129747880 T>C突变为中度多态,g.129749087 C>T突变为低度多态,4个SNP均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。SNP和基因型与间性性状关联分析结果显示,g.129749119 T>C突变位点与槐山羊间性性状之间存在显著相关性(P=0.023),CC基因型与CT和TT基因型间均差异显著(P<0.05);单倍型与间性性状关联分析结果显示,CCCC单倍型与CTTT单倍型间差异显著(P<0.05),CCCC单倍型与TCCT和TCCC单倍型间均差异极显著(P<0.01)。结果表明,间性槐山羊PIS区缺失,且PFOXic基因g.129749119 T>C突变与间性性状相关,本试验结果为进一步研究山羊间性性状发生机制和PFOXic基因功能提供参考依据。
哈斯通拉嘎宋小雨姚志云蒯子茹李君魏红芳王拥庆尹慧茹权凯韩浩园
关键词:槐山羊间性遗传多态性
基于Zm00001d025794基因的玉米子粒脱水性状关联分析
2024年
随着全程机械化技术的发展,玉米成熟后期子粒脱水速率成为影响玉米生产的重要因素。有必要开展子粒脱水速率的遗传解析,挖掘可用于分子标记辅助选择育种的有利等位基因。候选基因的关联分析是目前有利等位基因挖掘的有效方法之一。使用91份玉米自交系对前期全基因组关联分析筛选获得的子粒脱水相关基因Zm00001d025794进行候选基因关联分析,找到该基因16个与子粒脱水速率显著相关的多态性位点。进一步结合不同脱水速率材料中的子粒发育不同时期的转录组数据,发现该基因在子粒发育后期表达量逐渐下降,且在脱水快的材料中表达量下降更快。最后选取3个与42DAP-63DAP的子粒脱水速率(KDR6342)显著关联的位点(P<0.05)进行单倍型分析,获得了最优单倍型。
李佳雨张子然李冉冉渠建洲马丽薛吉全徐淑兔
关键词:玉米基因表达
坝上长尾鸡UCP基因SNP标记与脂肪酸性状关联分析
2024年
为明确UCP基因SNP与坝上长尾鸡脂肪酸性状间的关联性,为坝上长尾鸡脂肪酸性状分子标记辅助育种奠定基础,本试验采用直接测序技术对已测肌肉脂肪酸的54只坝上长尾鸡进行UCP基因SNP检测,运用SPSS 26.0软件中一般线性模型对SNP与坝上长尾鸡脂肪酸性状进行关联分析。通过直接测序,在坝上长尾鸡UCP基因片段上共检测出10个SNP位点,包含3个中度多态位点和7个低度多态位点,且10个位点均符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。3个位点含有3种基因型,7个位点含有2种基因型。关联分析结果显示,g.224A>T、g.284C>T、g.329G>A、g.409T>C和g.450G>A各基因型与脂肪酸含量无显著相关(P>0.05);g.195A>G各基因型与棕榈油酸、γ亚麻酸和肉豆蔻油酸呈显著相关(P<0.05);g.398C>T各基因型与肉豆蔻油酸、珠光脂酸和二高γ亚麻酸呈显著相关(P<0.05);g.399A>G各基因型与珠光脂酸呈显著相关(P<0.05);g.431C>T各基因型与肉豆蔻油酸、珠光脂酸和二高γ亚麻酸呈显著相关(P<0.05);g.434C>T各基因型与反油酸呈显著相关(P<0.05)。综上所述,g.195A>G、g.398C>T、g.399A>G、g.431C>T和g.434C>T,5个位点与不同类型脂肪酸含量呈显著相关(P<0.05),可作为坝上长尾鸡分子标记辅助育种的候选标记。
胡紫意李可强李祥龙
关键词:SPSSSNP
东北秋子梨种质资源多样性评价及主要性状关联分析
秋子梨(Pyrus ussuriensis Maxim.)是我国4大梨属植物之一,主要分布在东北地区。野生资源遗传多样性丰富,具有抗寒性、抗病性等特点,是栽培品种的主要砧木。栽培品种枝、花、叶、果呈现不同形态,其中梨花可...
刘畅
关键词:秋子梨综合评价核心种质全基因组关联分析

相关作者

赵书红
作品数:542被引量:622H指数:13
供职机构:华中农业大学
研究主题:分子标记 标记辅助选择 性状相关 碱基 猪免疫
李新云
作品数:303被引量:147H指数:7
供职机构:华中农业大学动物科学技术学院
研究主题:分子标记 标记辅助选择 性状相关 猪免疫 碱基
余梅
作品数:255被引量:254H指数:10
供职机构:华中农业大学
研究主题:分子标记 性状相关 标记辅助选择 碱基 多态性检测
梅书棋
作品数:475被引量:826H指数:13
供职机构:湖北省农业科学院
研究主题:分子标记 引物 湖北白猪 肌内脂肪 基因
吴俊静
作品数:211被引量:131H指数:6
供职机构:湖北省农业科学院
研究主题:分子标记 引物 肌内脂肪 肉质性状 基因