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检测塑料与抗生素对沉积物生物群落结构及生态功能影响的方法
本发明提供了一种检测塑料与抗生素对沉积物生物群落结构及生态功能影响的方法,包括:在采样点获取沉积物样本;将塑料颗粒和抗生素溶液加入沉积物样本中,进行孵育;提取生物DNA进行16S rRNA测序;基于测序结果,进行...
熊炜平彭树典罗远玲杨朝晖李玮翔何思颖叶宇航张洪林何乐乐
一种检测死亡藻类对沉积物生物群落结构和功能影响的方法
本发明提供一种检测死亡藻类对沉积物生物群落结构和功能影响的方法,包括采集样品;对沉积物、上覆水进行理化性能的测定;提取沉积物的总DNA,然后进行高通量测序,对序列进行OUT聚类,获取生物群落组成分布;基于OUT聚类进...
李大鹏陈艳琦刘松琪徐垚
一种烟草发酵生物群落结构的分析系统
本申请公开了一种烟草发酵生物群落结构的分析系统,属于数据处理技术领域,所述系统包括:采样单元用于获取烟叶表面生物样本,以通过高通量测序平台获取原始测序数据,并进行数据预处理以得到序列文件;聚类单元用于对预处理后的序列...
许忠顺甘龙站姚敏邹晓董醇波陈进
酱香型白酒一轮次糟醅生物群落结构及溯源分析
2025年
为探究酱香型白酒一轮次堆积和窖池发酵过程糟醅生物群落结构组成与理化指标的相关性及生物来源,基于传统可培养方法与Illumina MiSeq测序平台对糟醅、酿造环境生物群落结构组成及演替规律开展研究,并分析其与理化因子的关联作用,进一步采用Source Tracker软件解析糟醅优势生物的来源和比例。结果表明:一轮次堆积发酵6 d糟醅中细菌和酵母菌的菌落总数达到最大值,分别为(3.45±0.15)×10^(6) CFU/g和(40.5±2.50)×10^(4) CFU/g;堆积发酵6 d后未被分类的乳杆菌科细菌(unclassified_Lactobacillaceae,91.23%~91.77%)和毕赤酵母属(Pichia,32.84%~91.00%)为绝对的优势细菌和真菌属,其中unclassified_Lactobacillaceae与糟醅水分含量和酸度呈显著正相关,Pichia与糟醅水分含量和还原糖含量呈显著正相关。生物溯源分析表明,堆积发酵0 d和堆积发酵3 d糟醅中优势生物主要来源于堆积地面(32.44%~57.37%)和生产器具(26.89%~50.74%),堆积发酵6 d至窖池发酵43 d糟醅中优势生物主要来源于窗台墙壁等物体表面(86.41%~87.31%)。其中unclassified_Lactobacillaceae主要来源于堆积地面(85.79%),堆积发酵6 d后由主要来源于窗台墙壁等物体表面(91.96%~94.91%)。Pichia(1.32%~87.06%)在酿造环境中来源较多,堆积发酵6 d前,在堆积发酵过程中其主要来源于厂房内空气、生产器具和窗台墙壁等物体表面,窖池发酵过程主要来源于窖池内壁,占比为18.21%~30.79%。本研究进一步揭示了酱香型白酒一轮次堆积和窖池发酵过程糟醅生物群落组成与理化指标的关联作用以及优势生物菌群来源,为阐明酱香型白酒酿造机理提供了理论基础。
朱安然汪地强胡建锋吴成谢丹黄河鸥杨军林胡峰路虎李傲
关键词:酱香型白酒微生物群落结构
不同部位云产雪茄烟叶品质及生物群落结构的研究
2025年
为研究不同部位云产雪茄烟叶的品质及生物群落结构,以雪茄品种云雪39号的不同部位(上部二级叶C1、中部二级叶C2和下部二级叶C3)为研究对象,考察其感官质量,通过气相色谱质谱法(GC-MS)测定中性致香成分含量,通过α-多样性、β-多样性等分析生物群落结构变化。结果表明,感官质量方面,云雪39号不同部位感官质量评分由高到低依次为中部烟叶C2>上部烟叶C1>下部烟叶C3,中部烟叶香气量足、香韵丰富、杂气少、刺激弱、余味和舒适性较好;中性致香成分方面,3种部位雪茄烟叶检测出主要中性致香成分29种,中性致香成分总含量及各香气类型含量均为中部烟叶C2最高;生物群落结构方面,不同部位雪茄烟叶的表面生物群落结构组成和相对丰度存在差异,下部烟叶C3样品OTU总数和特有OTU数均最多,细菌群落多样性较丰富,假单胞菌属、泛菌属和未命名菌属是造成烟叶生物群落结构差异的关键菌属,不同部位雪茄烟叶代谢通路集中在信号转导和细胞过程、氨基酸代谢、脂肪酸代谢和遗传信息处理,不同部位的雪茄烟叶同种代谢通路存在差异。本文为雪茄烟叶产品配方的进一步开发及发酵功能生物筛选提供参考。
周潇何福英禹紫云徐峥嵘董军忠王冰冰李田刘妍陆欣
关键词:感官质量微生物群落结构代谢途径
稻田混养异育银鲫对稻蟹综合种养系统生物群落结构的影响
2025年
【目的】研究稻田中套养不同密度异育银鲫“中科3号”(Carassius auratus gibelio var.CASⅢ,以下简称异育银鲫)对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肠道和养殖环境中生物群落结构的影响。【方法】采用高通量测序技术对中华绒螯蟹肠道和养殖环境的生物群落结构进行分析。【结果】1)套养异育银鲫对中华绒螯蟹的成活率无显著的影响(P>0.05)。2)在异育银鲫套养密度为100尾/666.7 m~2时,中华绒螯蟹的终末体质量、增重率和特定生长率均显著高于其他组(P<0.05)。3)套养异育银鲫可以增加中华绒螯蟹肠道(P<0.05)和养殖环境中的生物多样性(P>0.05)。4)套养不同密度的异育银鲫不会改变中华绒螯蟹肠道和养殖环境中优势菌门的种类,但会对其相对丰度产生一定的影响。水体中的优势菌门为变形菌门、蓝菌门和放线菌门;底泥中的优势菌门为变形菌门、放线菌门和绿弯菌门;中华绒螯蟹肠道中的优势菌门为厚壁菌门和变形菌门。5)磷酸盐(PO_(4)^(3-)-P)和亚硝态氮(NO_(2)^(-)-N)对水体中生物群落结构影响较大。水体中的优势菌norank_f_norank_o_Chloroplast和LD29与pH、NO_(2)^(-)-N、氨氮(NH_(4)^(+)-N)、溶解氧(DO)、总氮(TN)呈正相关,Cyanobium_PCC-6307与PO_(4)^(3-)-P、NH_(4)^(+)-N、DO、TN呈正相关,hgc I_clade与PO_(4)^(3-)-P呈正相关,Limnohabitans与高锰酸钾指数(COD_(Mn))呈正相关。6)PO_(4)^(3-)-P和pH对中华绒螯蟹肠道生物群落结构具有显著的影响。中华绒螯蟹肠道的优势菌Candidatus_Bacilloplasma和嗜冷杆菌属(Psychrobacter)与pH、NH_(4)^(+)-N呈正相关,乳球菌属(Lactococcus)与PO_(4)^(3-)-P、TN、DO、COD_(Mn)和NO_(2)^(-)-N呈正相关,不动杆菌属(Acinetobacter)与PO_(4)^(3-)-P、TN、COD_(Mn)、NH_(4)^(+)-N呈正相关,柠檬酸杆菌属(Citrobacter)与pH和DO呈正相关。【结论】在本研究条件下,异育银鲫[(48.53±2.11)g/尾]的最优初始套养密度为100~200尾/666.7 m^(2)�
李赫胡宗云肖祖国封岩吴丽娜李敬伟闫有利
关键词:中华绒螯蟹养殖密度微生物群落结构高通量测序
海(咸)水入侵对莱州湾南岸含水层生物群落结构的影响
2025年
为了探究海(咸)水入侵对含水层生物群落结构影响及生物丰度与环境因素关系,在莱州湾南岸白浪河下游沿岸3眼监测井内,采集各含水层中地下水和沉积物样品;根据高通量测序结果,研究海(咸)水入侵对含水层生物群落结构影响。结果表明:地下水中生物丰富度和多样性均高于沉积物中的;随着海(咸)水入侵的加剧,地下水中生物的丰富度和多样性降低,沉积物中生物的丰富度和多样性则呈现波动变化并有升高的趋势;地下水中生物以变形菌门、拟杆菌门为主,而沉积物中以变形菌门、放线菌门为主,在门以下生物群落结构差异性较大,涅斯特连科氏菌属可作为识别海(咸)水入侵的标志生物;地下水的Cl-、HCO-3含量和酸碱度对生物群落结构影响显著,溶解性总固体、化学需氧量、全盐量对沉积物中生物群落结构影响显著。
陈宏帆支传顺胡晓农黄宪瑞陈耿
关键词:地下水微生物群落结构
三叶青不同种植模式对土壤生物群落结构的影响
2025年
【目的】旨在探索三叶青不同种植模式对土壤生物群落结构的影响,为优化林下三叶青生态种植生产提供理论支撑。【方法】通过设置林下袋栽和地栽2种种植模式,一年的生长期后,测定三叶青根际土壤理化性质,结合Illumina MiSeq测序技术分析不同模式下根际土壤生物物种组成、多样性和群落构建的差异。【结果】三叶青袋栽和地栽2种种植模式根际土壤的理化性质和群落结构具有明显差异。土壤总磷、总钾和有效磷差异极显著。对于细菌和真菌样品中的OTU数目,均是袋栽模式高于地栽模式。在门水平上,地栽模式下,土壤优势细菌群落是变形菌门(Proteobacteria,29%)、酸杆菌门(Acidobacteriota,26%);袋栽模式下,土壤优势细菌群落是酸杆菌门(Acidobacteriota,24%)、变形菌门(Proteobacteria,22%)和绿弯菌门(Chloroflex,15%);地栽模式下,土壤优势真菌群落是担子菌门(Basidiomycota,49%)、子囊菌门(Ascomycota,16%);袋栽模式下是子囊菌门(Ascomycota,46%)、担子菌门(Basidiomycota,26%)。【结论】三叶青不同种植模式会对根际土壤理化性质和土壤生物群落造成不同影响,土壤pH等指标形成的环境空间的差异可能是造成2种模式土壤群落组成差异的主要因素。
任晓旭周建金应武程大军严建立徐卫军阮松林许寿增
关键词:生态种植土壤微生物
国家级大连刺参原种场核心区生态环境质量和生物群落结构周年变化及其相关性分析
2025年
水产原种是良种培育的种质基础和保护生物多样性的核心,为全面掌握我国首家国家级刺参(Apostichopus japonicus)原种场核心保种区状况,本研究于2022年7月至2023年5月对该核心保种区的水环境、沉积物环境进行了周年检测,同时利用高通量测序方法分析了海水和沉积物生物群落结构周年变化,进一步完成生态环境因子与生物群落结构相关性分析。结果显示,海水水质良好,除春季活性磷酸盐,夏、秋、冬季铅元素和秋季镍元素含量符合Ⅱ类水质标准外,其他水质指标均符合Ⅰ类水质标准,保种区水体属于贫营养级;沉积物中除了秋季铬元素含量未达到Ⅰ类沉积物标准外,其他全部指标均符合Ⅰ类沉积物标准,表明保种区生态环境保护良好。对海水和沉积物四季生物群落结构分析结果显示,核心区水体共获得3796个OTUs,4个季节水体中的Shannon指数在5.90±0.04~6.84±0.01之间,秋季最高,夏季最低;沉积物中共获得4151个OTUs,四个季节沉积物的Shannon指数在6.06±1.44~7.88±0.22之间,夏季最高,春季最低。PcoA分析显示,水体和沉积物在四季的菌群结构存在差异,且水体的菌群结构受季节影响变化相对于沉积物而言更为显著。对不同季节的水体和沉积物菌群LEfSe分析结果显示,在不同季节的水体和沉积物样品中分别筛选到73和66个显著差异菌群(P<0.05),其中冬季沉积物中的代表性差异菌群包含弧菌科(Vibrionaceae)、冷单胞菌科(Psychromonadaceae),需要警惕冬季弧菌对刺参健康的潜在威胁。环境因子与菌群结构的相关性分析结果表明,温度、pH、盐度是影响水体菌群结构的主要环境因子,有机碳、硫化物、重金属(铜、铅)是影响沉积物菌群结构的主要环境因子。上述研究结果为评估保种核心区生态环境、解析其风险因子和影响因素提供支撑,为我国刺参原种的高效保种提供科学依据。
朱晓彤荣小军李彬王印庚葛建龙廖梅杰王锦锦吴岩强赵欣涛施国军
关键词:刺参生态环境质量
冀北采石场恢复区不同植被恢复类型对土壤生物群落结构的影响
2025年
土壤生物对矿区土壤环境及植被恢复效益有很强的影响作用,为探究中国冀北地区采石场土壤生物多样性对不同植被恢复类型的响应,以该区常见恢复用植被[油松(YS)、沙棘(SJ)、苜蓿(MX)、棉槐(MH)和刺槐(CH)]为研究对象,利用土壤养分测定技术、高通量测序技术等方法对植被根际土壤理化因子及生物群落结构进行分析,结论表明:(1)植被恢复类型对根际土壤环境影响显著,沙棘和油松根际土壤碱解氮含量、棉槐土壤有机质含量以及苜蓿、棉槐、刺槐中的生物碳含量均显著高于对照组(P<0.05).(2)不同植被类型中细菌和真菌的群落组成和多样性差异明显.变形菌门(Proteobacteria)和子囊菌门(Ascomycota)分别为细菌和真菌的主要优势种群;油松和沙棘中拟杆菌门的相对丰度高于其他植物,苜蓿和刺槐的ACE和Chao1指数差异显著(P<0.05),不同处理组的组间差异明显(stress<0.1).(3)不同恢复类型的生物群落与土壤因子有显著相关性,细菌和真菌群落结构与SOM、TN和MBC等均呈现出极显著相关性(P<0.01).细菌菌群中,酸杆菌门(Acidobacteriota)与生物量氮含量和碱解氮含量等成正比;真菌群落中,油壶菌门(Olpidiomycota)与TK和pH成正相关,养分因子的单独作用在细菌门水平群落中最大,养分因子和酶活性因子的协同作用在真菌门水平群落中最大.研究结论对后续矿区生态修复工作有理论指导意义.
闫丰赵鑫邵丽君王杏雨梁阅兵陈亚恒
关键词:土壤微生物土壤理化性质采石场冀北

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周荣清
作品数:199被引量:764H指数:15
供职机构:四川大学
研究主题:微生物群落 乳酸菌 大曲 挥发性组分 微生物
黄钧
作品数:136被引量:393H指数:11
供职机构:四川大学
研究主题:乳酸菌 挥发性组分 大曲 微生物群落 微生物群落结构
任南琪
作品数:761被引量:4,864H指数:38
供职机构:哈尔滨工业大学
研究主题:生物制氢 产氢 废水处理 发酵 产氢细菌
孙宝盛
作品数:131被引量:972H指数:20
供职机构:天津大学环境科学与工程学院
研究主题:膜生物反应器 胞外聚合物 溶解性微生物产物 PCR-DGGE MBR
赵立平
作品数:203被引量:1,652H指数:26
供职机构:上海交通大学
研究主题:肠道菌群 ERIC-PCR 微生物群落 DGGE 变性梯度凝胶电泳