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基于锈斑蟳简化基因组数据的微卫星DNA标记开发: 2024年; 锈斑蟳(Charybdis feriata)是我国重要的海洋水产种质资源保护对象,具有较高的经济价值和遗传育种价值,开发微卫星DNA(Microsatellite DNA)标记有助于锈斑蟳种群生态、种质资源等方面研究。本研究基于简化基因组测序技术获得锈斑蟳简化基因组序列信息,开展微卫星相关信息分析,并开发微卫星DNA标记。共检测到2419242个微卫星位点,其中二核苷酸和单核苷酸重复基序数量最多,各占总位点的43.95%和28.71%。六核苷酸重复基序的类型最多,达287种;其次是五核苷酸的重复基序的类型,为275种。不同类型SSR位点基序的重复次数也不同。使用Primer3 v2.3.6软件共设计出21330对锈斑蟳微卫星引物,选取多态性高的192对引物在12个锈斑蟳样本中进行验证,有14对引物具有单一条带且多态性较好,每个引物的等位基因数为4-14,期望杂合度(H_(e))和观测杂合度(H_(o))分别为0.503-0.892和0.167-1.000,多态信息含量(PIC)为0.456-0.882。研究表明,本方法在筛选锈斑蟳SSR标记中是可行的,所得引物可以应用于锈斑蟳遗传多样性、种群遗传分析等研究。; 唐棣杨明秋邹雄刘洪涛; 关键词：微卫星引物开发

一种金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检...; 吴莹莹鲍大鹏李燕王莹陈洪雨汪滢

一种金针菇SCY12菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇SCY12菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检...; 鲍大鹏吴莹莹李燕茅文俊王莹郭婷

一种金针菇X995菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇X995菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检测...; 李燕吴莹莹鲍大鹏万佳宁邹根王莹

一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的...; 吴莹莹李燕鲍大鹏茅文俊杨瑞恒陈洪雨

一种金针菇FL159菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇FL159菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检...; 吴莹莹高利慧鲍大鹏李燕王莹汪滢

一种金针菇金1754菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇金1754菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检...; 李燕吴莹莹鲍大鹏王莹杨瑞恒周陈力

一种金针菇FV1923菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇FV1923菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的...; 鲍大鹏吴莹莹高利慧李燕李焱汪滢

一种金针菇J1011菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇J1011菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检...; 鲍大鹏吴莹莹高利慧李燕龚明尚俊军

一种金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用: 本发明公开了一种金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用，包括该指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成。构建方法包括：(1)菌丝培养；(2)基因组DNA的提取；(3)微卫星DNA分子标记的检测...; 吴莹莹李燕鲍大鹏王莹尚俊军邹根

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