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应用基因芯片技术分析T淋巴细胞促进免疫性PTR的作用机制: 目的：探究T淋巴细胞在免疫性PTR的作用机制。　　方法：应用流式细胞技术测定不同试验组外周血 T/B淋巴细胞数目;利用Agilent表达谱芯片检测实验组PBMC中mRNA和LncRNA表达水平，通过GO和KEGG富集分析...; 宋晨辉; 关键词：T淋巴细胞丝裂原活化蛋白激酶

应用基因芯片技术探讨载脂蛋白E基因多态性与冠心病的严重程度与预后关系: 2022年; 目的应用基因芯片技术探讨载脂蛋白E基因多态性与冠心病的严重程度与预后关系。方法自2019年7月-2020年7月202例心内科住院确诊冠心病患者,所有研究对象测定血TC、TG、HDL-C、LDL-C、CREA水平,并观察GRACE评分、ApoE基因并分型。采用SPSS 23.0软件进行统计分析。结果各基因表型基因频率分布如下:E2/2型为0.99%,E2/3型为17.32%,E3/3型为67.33%,E2/4型为2.48%,E3/4型为10.89%,E4/4型为0.99%。故ApoE2表型37例,ApoE3表型141例,ApoE4表型24例。三组间的血TC、TG、LDL-C、HDL-C、CREA水平、BMI、性别、家族史,以及高血压病、糖尿病的患病率等无显著性差异。在LDL-C水平上比较,E4组高于E2组,存在统计学差异(P <0.01)。组间比较,E4与E2组相比,E4组分值高于E2组。随访6个月后,各组间MACE事件差异无统计学意义(P <0.05)。结论冠心病预后与ApoE基因多态性存在一定关系,对其检测在冠心病的防治中有重要临床意义。; 黄健中刘文东杨晓兰陈惠茹; 关键词：基因芯片技术载脂蛋白E 基因多态性冠心病预后

应用基因芯片技术分析甘草酸改善大鼠酒精性肝损伤的作用机制被引量：4: 2022年; 目的运用基因芯片技术检测甘草酸对大鼠酒精性肝损伤保护作用的分子机制。方法 45只大鼠随机分为3组:模型组、甘草酸组、正常对照组,连续灌服56度白酒8周,处理动物,测定血清谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)水平;抽提肝脏RNA,全基因组表达谱芯片检测,运用GO和KEGG Pathway富集分析。结果与正常对照组比较,模型组血清AST和ALT含量显著升高,差异有统计学意义(t=7.784,P<0.05;t=11.366,P<0.05),肝组织出现显著的肝损伤;与模型组相比,甘草酸组能显著改善肝组织病变,降低血清AST和ALT含量,差异有统计学意义(t=6.448,P<0.05;t=7.526,P<0.05)。芯片结果分析显示,甘草酸组与模型组共筛选出7 482条差异可变剪切RNA(Splicing Index<-3或>3,P<0.05),其中差异可变剪切编码RNA为6 512条。对差异可变剪切编码RNA进行GO和Pathway富集分析,结果显示,主要与乙醇分解代谢、肝星状细胞活化、氧化还原酶活性、氨基酸合成代谢、脂肪酸的生物合成、Notch信号通路等功能或通路有关。结论甘草酸在改善大鼠酒精性肝损伤病变过程中存在大量差异可变剪切编码RNA,提示甘草酸可通过调节多基因可变剪切改善酒精性肝损伤病变。; 从美丽古丽拉莱·多力坤周蓓王忠吕晓敏; 关键词：基因芯片酒精性肝损伤甘草酸

应用基因芯片技术研究冠心病秽浊痰阻证差异表达基因及其通路被引量：2: 2021年; 目的探索冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)秽浊痰阻证患者差异表达基因及相关信号通路,从分子水平阐明CHD秽浊痰阻证的生物学特点。方法纳入2015年2月—2016年3月就诊于新疆医科大学附属中医医院明确诊断为CHD的患者24例,其中秽浊痰阻证组12例、非秽浊痰阻证组12例,另纳入经冠脉造影术排除CHD的12例受试者为对照组。采集外周血并提取总的RNA,通过Human GenomeU133Plus2.0芯片检测获取基因,使用R语言limma软件包筛选差异表达基因,利用STRING构建差异基因编码蛋白互作网络(PPIs),应用Cytoscape插件识别差异表达基因的核心模块,应用Clusterprofiler软件包对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果与对照组比较,CHD患者共筛选出184个差异表达基因,其中165个差异基因表达上调,19个差异基因表达下调。CHD秽浊痰阻证组与非秽浊痰阻证组差异表达基因42个,其中34个差异基因表达上调,8个差异基因表达显著下调,GO和KEGG富集分析中,7个模块显著富集了固有免疫调节、固有免疫正向调节、固有免疫的激活和Fc受体信号通路,模块基因参与了MAPK、NF-κB、PI3K/Akt等信号通路、Ⅰ型糖尿病相关通路、C-型凝集素受体信号通路、剪切应力与动脉粥样硬化相关通路等与CHD有密切关联的信号通路。结论 CHD秽浊痰阻证与冠心病非秽浊痰阻证患者存在显著的差异表达基因,这些差异表达基因显著富集在与冠心病相关的多条功能通路中。; 翟雪芹何义高玉陈战西王晶朱小莉周云王晓峰; 关键词：冠心病秽浊痰阻证差异表达基因

应用基因芯片技术诊断淋巴结核及其耐药性分析被引量：2: 2020年; 目的分析淋巴结核诊断及耐药性分析中基因芯片技术的临床应用价值。方法收集江西省赣州市第五人民医院2016年8月至2019年10月收治的疑似淋巴结核患者80例,分别给予患者基因芯片及培养法进行菌种鉴定,并对已确定为结核分枝杆菌(MTB)复合群样本进行上述两种方法的利福平、异烟肼耐药性检测,统计患者临床症状。将传统罗氏固体培养法检测结果作为参考标准,统计基因芯片技术用于非结核分枝杆菌(NTM)鉴定的诊断符合率,并以药敏实验结果为参考标准,统计基因芯片技术用于利福平、异烟肼耐药性检测的符合率、敏感度、特异度。结果80例疑似淋巴结核患者的主要临床表现包括肿块、畏寒、消瘦、咯痰、憋气,占比分别为78.75%(63/80)、32.50%(26/80)、31.25%(25/80)、33.75%(27/80)、30.00%(24/80);基因芯片技术对淋巴结核患者NTM鉴定的诊断符合率达100%。利福平耐药性检测中基因芯片技术的敏感度、特异度、符合率占比分别为98.57%(69/70)、100.00%(17/17)、98.11%(52/53),传统罗氏固体培养法的敏感度、特异度、符合率占比分别100.00%(70/70)、100.00%(18/18)、100.00%(52/52),差异未见显著性(P>0.05)。异烟肼耐药性检测中基因芯片技术的敏感度、特异度、符合率占比分别为98.57%(69/70)、100.00%(23/23)、97.87%(46/47),传统罗氏固体培养法的敏感度、特异度、符合率占比分别100.00%(70/70)、100.00%(24/24)、100.00%(46/46),差异未见显著性(P>0.05)。结论临床淋巴结核患者诊断工作中基因芯片技术具有较高应用价值,其诊断效能及MTB耐药性检测效能与传统培养法基本相同,可积极推广使用。; 曾忠周静陶俊赖海斌; 关键词：淋巴结核结核分枝杆菌基因芯片技术耐药性检测

应用基因芯片技术检测食源性腹泻致病大肠杆菌被引量：12: 2020年; 目的基因芯片技术在食源性致病大肠杆菌检测中的建立与应用。方法对菌株进行预处理,通过溴化十六烷基三甲铵(cetyltrime thylammonium ammonium bromide,CTAB)方法提取细菌中的基因组DNA并去除其中的杂质,利用提取的基因组设计引物序列和探针序列,设计完成后对致病大肠杆菌致病大肠杆就基因芯片进行杂交与洗涤,使用扫描仪对处理过的基因芯片进行扫描实现食源性致病大肠杆菌的检测。结果在病原菌按不同程度稀释的情况下,与传统的病原分离鉴定检测方法相比,将基因芯片技术应用在食源性致病大肠杆菌致检测中,能够明显的检测出荧光标记的病原菌。结论该方法的灵敏度更高,可以解决传统的致病大肠杆菌检测方法灵敏度较低,病原处于较低的感染状态时难以检出的问题。; 刘莹; 关键词：基因芯片食源性病原菌大肠杆菌病菌检测

应用基因芯片技术研究非小细胞肺癌circRNAs表达谱特征: 本文从以下几个方面进行论述：　　第一章应用微阵列芯片技术筛选非小细胞肺癌的circRNAs表达谱　　目的：应用circRNAs微阵列芯片技术检测非小细胞肺癌组织和邻近正常上皮组织差异表达的circRNAs，初步建立非小...; 姚立帅; 关键词：非小细胞肺癌基因表达谱基因芯片

应用基因芯片技术研究喉鳞状细胞癌中circRNA的表达: 目的:　　越来越多的证据表明环状RNA(circular RNA，circRNA)在调节基因表达中发挥着重要作用，并且circRNA的异常表达已被证实与多种恶性肿瘤的发病存在相关性。然而circRNA在喉鳞状细胞癌中的作...; 夏鑫; 关键词：喉鳞状细胞癌基因芯片生物信息学

应用基因芯片技术研究硫酸氨基葡萄糖对骨性关节炎相关炎性基因表达谱的影响被引量：8: 2019年; 目的利用基因表达谱芯片技术对硫酸氨基葡萄糖作用于骨性关节炎关节软骨胶原酶和磷脂酶A2基因表达谱的改变进行研究,为硫酸氨基葡萄糖的作用机制提供基因学证据,并验证基因芯片技术检测胶原酶和磷脂酶A2基因表达差异的可靠性。方法收集9例软骨样本,其中正常膝关节软骨样本3例,6例来源于髋关节骨性关节炎关节置换软骨样本,体外分离培养组织样本。将每株细胞分为正常对照组、炎症对照组(炎症介质刺激)、药物干预组(硫酸氨基葡萄糖+炎症介质)。行基因芯片杂交,并进行芯片扫描和数据分析,分别对比正常对照组与炎症对照组、炎症对照组与药物干预组,筛查出细胞样本中与前列腺素E2代谢相关表达有差异的基因,并对胶原酶和磷脂酶A2基因筛查结果进行验证。结果细胞株样本的炎症对照组与药物干预对照组筛选出共同的差异表达基因143条,其中与前列腺素E2及磷脂酶A2、胶原酶代谢有关的差异表达基因PTGS1基因上调,CXCL13、TNFSF17、PTGS2、PTGES表达下调。通过酶联免疫吸附剂测定及反转录聚合酶链反应验证炎症介质能激活前列腺素E2的表达,进而促进软骨分解代谢中胶原酶和磷脂酶A2的异常表达趋势;而硫酸氨基葡萄糖能够抑制胶原酶和磷脂酶A2的表达,抑制前列腺素E2表达。结论炎症介质能激活前列腺素E2的表达,促进关节软骨炎症的发生及关节软骨细胞的分解代谢;硫酸氨基葡萄糖抑制磷脂酶A2和胶原酶活性,减少前列腺素E2生成的同时,能够调节前列腺素E2基因的表达,从而起到对抗炎症保护关节软骨作用。; 桑平李高峰李雪鹏张季铠; 关键词：胶原酶磷脂酶A2 前列腺素E2 硫酸氨基葡萄糖

应用基因芯片技术筛选结直肠癌中差异DNA甲基化位点: 2018年; 背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确。筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点。目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选结直肠癌组织与癌旁正常黏膜组织间差异甲基化位点,构建特异性结直肠癌差异甲基化基因谱。方法:应用甲基化450K芯片技术对6例结直肠癌及其癌旁组织进行甲基化分析,共分析位点431 467个,按P值筛选出异常甲基化位点,按甲基化β值差值区分高甲基化位点和低甲基化位点;对筛选出的差异甲基化位点进一步行GO分析和KEGG分析,了解差异甲基化位点的功能。结果:共检出结直肠癌和癌旁正常组织显著差异的甲基化位点3 649个,其中高甲基化位点1 259个,主要分布于基因启动子区和基因体,筛选出特异的SLC15A3等高甲基化基因;低甲基化位点共2 390个,主要分布于基因间区和基因体,筛选出特异的ACOT2、TTLL8、UHRF1等低甲基化基因。GO分析和KEGG分析发现,这些基因功能与DNA结合、转录因子活性、信号转导通路等有关。结论:结直肠癌和癌旁正常组织存在大量差异甲基化位点,提示DNA异常甲基化与结直肠癌的发生、发展密切相关。基因芯片技术可用于结直肠癌差异甲基化位点的初筛,但构建结直肠癌差异甲基化谱作为临床分子标记物仍需行进一步验证。; 余捷王梓桦杨世英薛寒冰; 关键词：DNA甲基化结直肠肿瘤芯片分析技术

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