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大白菜蜡质缺失突变体YW71的遗传及序列变异分析
2024年
以大白菜蜡质突变体YW71为对象,研究其亮绿无蜡粉性状的遗传规律和调控基因。通过遗传分析,表明YW71中的亮绿无蜡粉性状由隐性单基因控制。通过等位基因互补实验证明YW71的亮绿性状是BrWAX2等位突变引起的。序列分析表明,在YW71中BrWAX2基因在第3个外显子末端发生了39 bp的缺失,进而引起转录水平的可变剪切和翻译水平的提前终止。表达模式分析表明,BrWAX2基因在YW71茎和叶中表达量显著下降。此外,研究针对39 bp的变异开发并验证了共显性标记BrWAX2-In Del1。研究结果丰富了白菜类蔬菜蜡质突变遗传资源,将为亮绿无蜡粉品种的分子育种提供理论指导和技术支持。
杨双娟唐昊赵艳艳魏小春王志勇苏贺楠张文静李林王坐京原玉香张晓伟
关键词:大白菜序列变异分析
水稻孤雌生殖诱导基因BBM1序列变异分析
2024年
[目的]在水稻卵细胞中异位表达BBM1能够诱导孤雌生殖,挖掘BBM1优异等位变异和功能类似基因对水稻杂种优势固定具有重要意义。[方法]利用383份水稻核心种质的三代测序数据,对BBM1基因进行结构变异分析序列多态性分析、单倍型分析,并根据序列相似度以及表达模式相似度筛选BBM1功能类似基因。[结果]BBM1基因在3份种质中存在两个拷贝,在2份野生稻中存在微型颠倒重复转座元件(MITEs)插入变异;具有非常明显的籼粳分化,94.80%的粳稻和3.80%的籼稻中BBM1因单碱基变异造成翻译提前终止,缺少26个氨基酸残基;BBM1编码区序列十分保守,绝大多数材料中具有相同的单倍型;筛选到BBM1序列和表达模式相似基因LOC_Os06g44750,其可能具有BBM1诱导孤雌生殖的功能。[结论]明确了水稻中BBM1基因变异情况,挖掘出重要单倍型和功能类似候选基因,为进一步提高水稻孤雌生殖频率奠定基础。
汪晴王艳茹张秀丽吕启明
关键词:水稻孤雌生殖
通过ProteoMiner改进序列变异分析
本发明提供了鉴定含有高丰度蛋白的样品中的宿主细胞蛋白(HCP)杂质的方法和系统。可以使用已附接到固体支持物的相互作用肽配体来富集所述HCP杂质。可以从所述固体支持物中洗脱出所述HCP杂质。可以使所分离的HCP杂质经受有限...
张思思赵博肖辉李宁
李资源遗传多样性及R2R3-MYB基因序列变异分析
李是蔷薇科李属的温带落叶果树,果味酸甜、色泽丰富,具有较高的经济价值和药用价值。中国栽培李资源丰富,但利用率不高,育种亲本多为地方优良品种,存在一定的局限性。因此,对中国栽培李资源进行遗传多样性评价,对杂交育种亲本选择和...
付韵
关键词:SSR分子标记基因序列变异
大黄鱼野生和养殖群体的COI序列变异分析
2023年
为阐明大黄鱼Larimichthys crocea野生和养殖群体的遗传变异特性,本研究采用COI基因序列对徐闻东岸野生群体(XWD)、硇洲岛野生群体(NZD)、闽粤东野生群体(MYD)、象山养殖群体(XSYZ)和宁德养殖群体(NDYZ)等5个大黄鱼群体的遗传多样性水平、单倍型分布、遗传分化、历史动态等进行比较分析。结果显示,3个野生群体的遗传多样性水平(h=0.757 6-0.877 5、π=0.002 6-0.003 1)明显高于2个养殖群体(h=0.194 7-0.495 2、π=0.000 8-0.001 0),二者的单倍型分布频率差异明显;XSYZ与NDYZ、MYD群体间存在显著的遗传分化(F_(st)=0.128 5、0.086 0,P<0.05),NDYZ与3个野生群体间具有遗传同质性(F_(st)=-0.010 6-0.000 2,P>0.05)。历史动态分析支持野生大黄鱼经历了晚更新世的群体数量扩张,但不支持养殖大黄鱼发生群体扩张。研究表明群体间遗传多样性的差异反映了不同进化力量在大黄鱼野生和养殖群体遗传中的作用机制。养殖实践和人工选育对东海区大黄鱼群体间的遗传分化起到了重要作用,而群体扩张、养殖逃逸、人工放流以及物种的扩散能力等因素可能促使粤西海域和东海区大黄鱼群体间具有遗传同质性。本研究揭示了粤西海域和东海区大黄鱼群体种质资源状况以及野生群体与养殖群体间的遗传特性差异,可为大黄鱼种质资源保护和利用提供科学依据。
雷凤玲陈敏芳蒙扬鑫牛素芳吴仁协潘滢
关键词:大黄鱼COI基因遗传分化种质资源
肋骨分叉-基底细胞痣-颌骨囊肿综合征两家系基因序列变异分析被引量:1
2023年
两家系肋骨分叉-基底细胞痣-颌骨囊肿综合征先证者均为男性,因X线摄片见颌骨多发低密度影就诊,临床及影像学检查见胸廓畸形、小脑幕及大脑镰钙化、眶距增宽等表现。两例先证者分别检出PTCH1基因位点的c.C2541C>A(p.Y847X)和c.C1501C>T(p.Q501X)杂合突变,对比先证者及其家系相关成员基因序列,结果两例先证者的母亲外周血中均检出PTCH1基因位点的杂合突变,明确该突变均来源于母亲。其中一例先证者临床表现为智力低下,还检出FANCD2基因位点的c.C2141T(p.P714L)和c.G3343A(p.V1115I)杂合突变;另一例先证者智力正常,未发现FANCD2基因突变。两例先证者均行颌骨囊肿开窗减压联合刮治术,随访原病灶处骨质生长状况良好,至今均未见复发。
彭笑陈默王栋韩瑞高廷益刘亮刘畅张凯
关键词:家系
湖南省部分地区养猪场PEDV的检测及S1基因序列变异分析
2022年
为了解2020—2021年湖南省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,试验从10个暴发仔猪腹泻的猪场采集40份样品进行PEDV核酸检测,统计阳性率,并对部分阳性样品的S1基因进行扩增、测序,并进行序列同源性分析和遗传进化分析。结果表明:场阳性率为60.0%,40份组织样品中有21份为PEDV阳性,阳性率为52.5%;6个阳性猪场随机挑选的6份样品PEDV毒株S1基因扩增得到大小均为1 700 bp左右的目的条带,其核苷酸和对应推导的氨基酸序列相似性分别为97.2%~99.8%和95.4%~99.5%,与国内外流行的PEDV变异株(G2型)对应核苷酸序列相似性分别为96.8%~99.2%和95.0%~98.7%;与PEDV疫苗株(CV777株,G1型)对应核苷酸序列相似性分别为91.2%~92.3%和88.9%~90.8%。进一步遗传进化分析结果发现,获得的6个PEDV毒株均属于G2亚群,与我国流行的PEDV变异株所属分支相隔很近。说明PEDV是导致湖南省部分地区仔猪腹泻的常见病原,且均为PEDV变异株。
彭娜娜王文范方程宁慧敏邓瑞德董伟
关键词:猪流行性腹泻病毒S1基因系统进化分析
湖南娄底市犬弓首蛔虫流行状况及线粒体cox 1和nad 4序列变异分析被引量:2
2022年
为了解湖南省娄底市犬弓首蛔虫流行状况及虫株遗传变异情况,本试验于2021年3—9月对该地区368份犬粪便和104份环境(土壤和水源)样品的犬弓首蛔虫污染情况进行调查;对9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列进行扩增、测序与分析。结果显示:被调查的犬粪便和环境样品的犬弓首蛔虫虫卵检出率分别为13.59%(50/368)和18.27%(19/104);其中宠物犬(11.74%)较流浪犬(17.36%)来源粪便样品检出率低,公园来源土壤样品(9.09%)较小区来源样品(3.92%)检出率高;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列长度分别为424 bp和1197 bp,核苷酸序列同源性为99.4%~100.0%和98.7%~100.0%,与其他具有代表性蛔虫分离株对应序列同源性均低于90%;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列核苷酸多样性分别为0.007±0.002和0.006±0.003。结果表明湖南娄底市犬弓首蛔虫分离株遗传变异较低,但虫卵流行状况严重,且存在于公共环境中,对人类健康造成潜在威胁。
王先坤李静
黄籽甘蓝型油菜高亚麻酸性状相关基因序列变异分析
油菜(Oilseed rape)作为世界上广泛种植的油料作物之一,对人类的价值在于油菜籽含有丰富的多不饱和脂肪酸,亚麻酸正是其中一种重要的不饱和脂肪酸。我国种植的主栽类型-甘蓝型油菜(Brassica napus L.)...
张笑晗
关键词:甘蓝型油菜黄籽亚麻酸类黄酮
阿尔茨海默病患者PICALM基因序列变异分析及其rs3851179位点对Aβ吞噬功能研究
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)又称老年痴呆症,是一种缓慢起病,以进行性认知功能减退为主要表现的中枢神经系统退行性疾病,AD病因目前普遍认为是遗传、环境、老化等多种因素共同参与。近年来随着基因...
柴贤良
关键词:阿尔茨海默症小胶质细胞诱导多功能干细胞

相关作者

周开亚
作品数:275被引量:3,538H指数:38
供职机构:南京师范大学生命科学学院
研究主题:中华绒螯蟹 江豚 中药材 系统发生关系 RAPD
许明辉
作品数:96被引量:645H指数:18
供职机构:云南省农业科学院
研究主题:水稻 稻瘟病 抗稻瘟病基因 烟草 杂种优势
孙一丁
作品数:69被引量:175H指数:7
供职机构:云南省农业科学院
研究主题:水稻 稻瘟病 抗稻瘟病基因 野生稻 萝卜
马继琼
作品数:59被引量:183H指数:8
供职机构:云南省农业科学院
研究主题:魔芋 水稻 抗稻瘟病基因 稻瘟病 序列变异分析
李柱刚
作品数:207被引量:419H指数:11
供职机构:黑龙江省农业科学院
研究主题:南瓜 复合微生物 亚麻 大白菜 水稻