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搜索到177篇“ 大规模测序“的相关文章

基于平行大规模测序的阿尔茨海默病分子亚型鉴定: 背景:随着老年人口的增长,阿尔茨海默病(AD)的发病率逐年增加,但目前尚无有效的治疗方法。此外,长期的非编码RNAs和转录因子被证明在AD的发病过程中起着调节作用,这意味着不同机制诱导的不同AD分子亚型的存在。因此,我们...; 陈烈春邹春梁路聪邹东华; 关键词：阿尔茨海默病分子亚型分类器

面向大规模测序数据集的序列比对算法研究: 随着下一代基因测序技术的发展，测序成本以超过摩尔定律的速度急剧下降，与此同时测序速度也大幅提升。这一系列进步导致了测序数据爆炸性的增长，从而使得测序数据的分析成为相关研究中的一个主要瓶颈。在大多数测序数据分析中，第一步均...; 程昊宇; 关键词：GPU加速

超高精度大规模测序mapping算法FANSe在非模式生物中的应用被引量：2: 2017年; 大规模测序技术以其高通量、低成本的优势在生物学中得到广泛的应用.但对于基因组尚未被准确测定的非模式生物,传统算法受制于较低的精度、稳健性和容错性,难以有效应对.FANSe系列算法作为目前精度最高、容错性最好的大规模测序快速比对算法,解决了非模式生物二代测序应用所面临的参考库不准确问题,可为非模式生物的基因组、转录组、蛋白质组研究提供准确的结果.本文总结了目前基于FANSe的多种分析方案在非模式动物、植物、微生物以及复杂的共生体系中的应用,为非模式生物的研究提供参考.; 曹欣张弓

用大规模测序技术对tRNA组进行高分辨率定量测定: tRNA是能携带氨基酸的小分子非编码RNA,不仅在蛋白质翻译过程中起着重要作用,在生物进化研究、疾病研究以及蛋白质的工业化生产中也有着很重要的理论意义和应用价值。tRNA组指的是t RNA的全体,因为tRNA分子种类众多...; 顾炜; 关键词：氧化应激; 文献传递

鲤均一化全长cDNA文库构建、大规模测序及信息学分析: 鲤鱼/(Cyprinus carpio/)，原产于欧亚大陆，是世界上重要的水产养殖鱼类。为进一步分析研究鲤鱼转录组数据及其功能基因，我们构建了鲤均一化全长cDNA文库。本研究以1龄雌性鲤鱼的八种组织为材料，包括血液、鳃、...; 徐茹; 关键词：测序 RAB; 文献传递

花生种子全长cDNA文库的大规模测序和生物信息学分析: 花生是世界上五大油料作物之一，也是我国单产、总产和出口创汇额最高的油料作物和经济作物。它是一种地上开花，地下结果，其收获产品主要是地下荚果的作物。荚果的生长发育状况直接关系到花生的产量和品质的形成，这与荚果本身的基因的表...; 罗帮明; 关键词：油料作物经济作物基因序列; 文献传递

猪脂肪组织表达序列标签 (ESTs)大规模测序及分析被引量：4: 2004年; 利用大规模DNA序列测定的方法 ,对猪脂肪组织进行了表达序列标签 (ExpressedSequenceTag ,EST)序列测定 ,获得高质量EST共 7790个 ,并对此进行了初步分析。使用STACK_PACK软件进行聚类分析 ,得到 4 35 4个基因聚类 ,包括 36 0 9个单拷贝基因和 74 5个多拷贝基因 ;将候选基因序列用BlastN与nr库进行比较 (e =1e 10 ) ,从 4 35 4个候选基因中得到 2 712个已知基因 ,其中单基因为 1987个 ,多拷贝基因为 72 5 (36 94克隆 )个 ;未知功能基因和新EST有 2 10 9个克隆。根据BlastN结果 ,利用基因组文库添加序号 (GenBankAccessionNo .)为索引 ,构建了猪脂肪组织已知功能基因表达谱。从基因表达谱可以看出 ,在猪脂肪组织中参与代谢的基因所占比例最高 ,在某些方面也显示了脂肪组织旺盛的代谢活性。同时发现在猪脂肪组织中主组织相容性抗原 (MajorHistocompatibilityComplex ,MHC)或与MHC相关的基因表达丰度很高。其中单拷贝基因 181个 ,多拷贝基因 4 4个 ,共计 2 5 7个克隆 ,占细胞机体防御 (cellandorganismdefense)总数的 4 4 9%。占总已知基因数的 5 4 %。提取出全部与MHC相关的EST序列 (2 5 7个克隆 ) ,发现所有EST的部分序列 (长约 2 0 0个碱基 ) ,几乎分布在每一个已知猪BAC的所有编码序列上。据此推测 ,; 邓亚军童维陈雁炯胡松年李生斌; 关键词：表达序列标签测序 MHC基因

猪脂肪EST大规模测序及分析: 该文利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了EST序列测定和初步的分析.猪脂肪大规模EST序列共测定了10860个单向单次测定反应,所处理的总克隆数达到了8,730,421个碱基,成功反应数为9297（85.6...; 邓亚军; 关键词：表达序列标签测序相容性抗原免疫反应; 文献传递

基因组生物信息学在大规模测序中的应用被引量：3: 2000年; 大规模自动测序技术的迅猛发展使人类基因组计划 (Human Genome Project,HGP)取得了巨大进展 ,近来兴起的基因组信息学在 HGP的研究方面显示出巨大潜能。文章着重介绍了生物信息学的成就及在测序成就中的作用 ,目的在于阐明基因组生物信息学与大规模测序技术结合将是 HGP的发展趋势。; 张小慧李桂源; 关键词：人类基因组计划大规模测序

含OXTR BAC克隆DNA的大规模测序及基因鉴定: 该论文属于1﹪人类基因组计划的一部分.该文从用STS引物在D.E.Jong BAC文库中筛选出来的BAC克隆开始,首先,用碱裂解法提取BAC克隆DNA,然后用STS引物进行PCR反应验证该BAC NDA的正确性,用超声破...; 宋利萍; 关键词：人类基因组计划基因鉴定; 文献传递

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