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外周血DNA中辅助检测肺结节良恶性的甲基化生物标记物组合及其应用
本发明提供了外周血DNA中辅助检测肺结节良恶性的甲基化生物标记物的组合及其应用,所述甲基化生物标志物组合包括以下标记物:chr11:133938689‑133939345,chr19:10691814‑10692015,...
杨昊陶锦胜陈志伟范建兵
前列腺癌患者外周血DNA腺嘌呤N6甲基化修饰的研究
2023年
目的本研究分析前列腺癌(PCa)患者外周血DNA腺嘌呤N6甲基化(6mA)修饰的水平,从而探讨6m A修饰与PCa的关系,为PCa寻找新的诊断和预后标志物。方法分别检测PCa组与对照组的外周血6mA,筛选差异基因6mA热点,通过生物信息学分析方法,在全基因组范围对疾病相关位点进行筛选与鉴定。结果与正常组比较,PCa组中6mA表达上调基因有2558个,表达下调基因有1106个,主要分布在内含子上。功能富集与信号通路富集分析结果显示,钙离子信号通路和T细胞受体信号通路富集倍数最高,此通路中PLCG1、ITPR1、PPP3C和CAMK2等上调基因与上游T细胞受体调控基因共同作用调控钙离子信号转导。结论钙离子信号通路和T细胞受体信号通路6m A修饰异常可能与PCa的发生、发展相关。
李凤艳朱鹏吴俊霖刘弘潘卫兵
关键词:前列腺癌
脑卒中患者TOAST、OCSP分型与外周血DNA甲基转移酶及MeCp2蛋白水平的关系被引量:2
2023年
目的研究脑卒中患者治疗急性卒中实验(TOAST)、牛津郡社区卒中项目(OCSP)分型与外周血DNA甲基转移酶(Dnmt)1、Dnmt3a、Dnmt3b及甲基CpG结合蛋白(MeCp2)水平的关系。方法选取2017年2月至2020年5月该院收治的116例急性缺性脑卒中患者作为观察组,另选取同期50例健康志愿者作为对照组,采集所有研究对象外周静脉检测Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平,分析脑卒中患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平与TOAST、OCSP分型及脑梗死面积的关系。结果观察组患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。不同TOAST分型患者外周血Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05);而外周血Dnmt1水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中大动脉粥样硬化型(LAA)组与不明原因型(SUE)组外周血Dnmt1水平均明显高于心源性栓塞型组、小动脉闭塞型组和其他明确病因型组,差异均有统计学意义(P<0.05);而LAA组与SUE组外周血Dnmt1水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。不同OCSP分型患者外周血Dnmt3b水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);而外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05);其中完全前循环梗死(TACI)组外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平与后循环梗死(POCI)组比较,差异均无统计学意义(P>0.05);TACI组和POCI组外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平均明显高于部分前循环梗死组和腔隙性梗死组,差异均有统计学意义(P<0.05)。不同梗死面积患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论缺性脑卒中患者发病24 h内外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平均异常升高,其表达水平与患者TOAST分型有关,而与患者脑梗死面积无关。
张鹏
基于外周血DNA甲基化的多囊卵巢综合征及抗缪勒管激素预测模型的构建方法及评估系统
本发明属于生物医学技术领域,具体涉及基于外周血DNA甲基化的多囊卵巢综合征及抗缪勒管激素预测模型的构建方法及评估系统。具体的,本发明一种基于外周血DNA甲基化的多囊卵巢综合征预测模型及清抗缪勒管激素水平预测模型的构建方...
陈子江赵涵赵世刚高雪莹王玉藤
溶栓运重建再灌注治疗急性心肌梗死患者外周血DNA损伤和氧化应激的影响
2023年
目的探讨溶栓运重建再灌注治疗急性心肌梗死(AMI)患者对其外周血脱氧核糖核酸(DNA)损伤和氧化应激的影响。方法选取2017年10月至2020年10月本院收治的98例急性AMI患者,采用随机数字表法分为观察组(n=49)和对照组(n=49)。观察组采用溶栓运重建再灌注治疗,对照组采用心脏支架介入治疗。观察并比较两组治疗前后心肌坏死标志物、炎症因子水平、心功能指标和外周血淋巴细胞染色体微核,统计两组主要终点事件发生情况。结果观察组清肌酸激酶同工酶(CK-MB)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、白介素-8(IL-8)、C-反应蛋白(CRP)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平均显著低于对照组(P<0.05);观察组左室射分数(LVEF)高于对照组,左心室收缩末期内径(LVESD)、左室舒张末期内径(LVEDD)低于对照组(P<0.05);治疗后2 h、24 h,观察组染色体微核率与对照组无显著差异(P>0.05);观察组超氧化物歧化酶(SOD)和氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)水平高于对照组,丙二醛(MDA)水平低于对照组(P<0.05);观察组心源性死亡率及再次心肌梗死率等终点事件发生率明显低于对照组(P<0.05)。结论溶栓运重建再灌注治疗AMI疗效显著,可改善患者心功能,减轻炎症反应,调节氧化应激水平,同时不加重外周血DNA损伤,远期效果良好。
任芳芳柳莹杨淼
关键词:氧化应激
老年甲状腺结节合并糖尿病患者外周血DNA甲基化/羟甲基化的表达及其临床意义
2023年
目的 探讨老年甲状腺结节合并糖尿病患者外周血DNA甲基化/羟甲基化的检测及其临床意义。方法 选择2021年1月至2022年12月兰州市第一人民医院收治的136例老年甲状腺结节合并糖尿病患者为研究组,另选同期体检正常的135例老年人为对照组。采集所有入组对象一般资料,测定空腹糖(FPG)、餐后2 h糖(2hPBG)、糖化红蛋白(HbA1c)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、游离四碘甲状腺原氨酸(FT4)、促甲状腺激素(TSH)、甲状腺球蛋白抗体(TGAb)和甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)水平。采用酶联免疫吸附法检测外周血全基因组5-甲基胞嘧啶(5-mC)、5羟甲基胞嘧啶(5-hmC)、细胞间黏附分子-1(ICAM-1)和甲基双加氧酶(TET2)水平。采用SPSS 21.0统计软件进行数据分析。根据数据类型,分别采用t检验、Mann-Whitney U检验或χ2检验进行组间比较。采用Spearman相关性分析探讨外周血5-mC、5-hmC与甲状腺结节合并糖尿病的相关性。结果 研究组患者FPG、2hPBG、HbA1c、TSH、TgAb和TPOAb水平均高于对照组,FT3低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。研究组外周血5-mC、5-hmC水平均高于对照组[6.64%(3.53%,8.53%)和4.28%(1.70%,7.20%);50.41%(35.00%,63.27%)和36.51%(17.81%,50.06%)];外周血TET2、ICAM-1水平均高于对照组[9.37(5.70,13.56)和4.56(1.52,6.99)pg/ml;4.98(2.35,7.01)和0.97(0.15,1.60)ng/ml],差异均有统计学意义(P<0.001)。Spearman相关性分析结果显示,5-mC与TgAb、TPOAb和HbA1c呈正相关(r=0.413,0.348,0.405;P<0.05);5-hmC与TgAb、TPOAb、FBG和2hPG呈正相关(r=0.375,0.406,0.376,0.311;P<0.05);5-mC与5-hmC呈正相关(r=0.256;P<0.05)。结论 老年甲状腺结节合并糖尿病患者外周血全基因组DNA甲基化与羟甲基化水平显著正常人群,外周血5-mC、5-hmC水平与老年甲状腺结节、糖尿病发病显著相关。
马晓权方兴中成建荣
关键词:老年人甲状腺结节糖尿病DNA甲基化羟甲基化
一种用于外周血DNA甲基化检测的运输保存装置
本实用新型属于试剂保存装置领域,尤其涉及一种用于外周血DNA甲基化检测的运输保存装置,包括箱体,所述箱体顶面长边铰接有箱盖,所述箱盖与所述箱体内设置有缓冲保温体,所述缓冲保温体内放置有若干试剂瓶,所述箱体内侧底部设置有维...
夏宇曾敏王海月刘雪梅贾斌孙峰
艾灸治疗慢性萎缩性胃炎的临床观察及对其外周血DNA甲基化的影响被引量:13
2022年
目的:观察隔药饼灸及隔姜灸治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的临床疗效,探讨艾灸对CAG相关癌前病变外周血DNA甲基化谱的影响。方法:选取2018年5月至2020年10月上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院针灸科收治的CAG患者70例作为研究对象,随机分为隔药饼灸组和隔姜灸组,每组35例,2组患者均选取中脘、气海、双侧足三里、双侧内关穴进行治疗。比较2组治疗前后中医症状评分、光镜下胃黏膜组织病理学变化,评价2组的临床疗效,并选取每组治疗前后患者全样本各2例,采用全基因组甲基化测序,结合生物信息学分析,观察外周血DNA甲基化位点和甲基化状态的变化。结果:1)治疗后,2组中医症状总积分均较治疗前显著降低(均P<0.01),隔药饼灸组胃脘疼痛、食欲减退症状积分低于隔姜灸组(均P<0.01),隔姜灸组烧心、反胃症状积分低于隔药饼灸组(均P<0.01);隔药饼灸组临床总有效率为87.88%,隔姜灸组为78.79%,差异无统计学意义(P>0.05)。治疗后2组胃黏膜的萎缩、肠化病变程度及隔药饼灸组的炎症程度有明显改善(P<0.05)。隔药饼灸组胃镜病理总体有效率82.14%,隔姜灸组总体有效率69.57%,差异无统计学意义(P>0.05)。2)CG序列环境下,治疗前后隔药饼灸组共有176个差异甲基化基因,隔姜灸组有652个差异甲基化基因。隔药饼灸组治疗前后差异甲基化区域(DMR)锚定启动子区域相关基因涉及的KEGG通路包括cAMP、AMPK和核因子κB信号通路、泛素介导的蛋白水解等,隔姜灸组涉及的KEGG通路包括mTOR和HIF-1信号通路、代谢通路、细胞凋亡等。结论:隔药饼灸和隔姜灸可改善慢性萎缩性胃炎患者临床症状,减轻胃黏膜萎缩、肠化生等病理状态;隔药饼灸在改善患者胃脘疼痛、食欲减退症状更具优势,而隔姜灸在改善患者烧心、反胃症状更优。艾灸能影响CAG患者外周血全基因组DMR的DNA甲基化水平,这可能是艾�
顾沐恩黄艳刘雅楠刘慧荣黄儒德吴璐一彭广彬李国娜李璟吴焕淦
关键词:艾灸慢性萎缩性胃炎DNA甲基化
成年结节性硬化症相关的肾管平滑肌脂肪瘤患者外周血DNA测序的价值被引量:1
2022年
目的:评估成年结节性硬化症相关的肾管平滑肌脂肪瘤患者外周血DNA测序的价值。方法:分析2015年09月至2019年09月因双肾多发管平滑肌脂肪瘤就诊于我院的所有患者的病史、家族史及辅助检查,提取符合结节性硬化症诊断标准的患者外周血DNA,通过二代测序检测TSC1与TSC2基因。结果:纳入研究的患者共47例,检测出TSC1/2基因突变的22例(46.8%)。检测出有突变的患者中最大肾管平滑肌脂肪瘤直径超过8 cm的比例明显高于未超过的,差异有统计学意义(P<0.05)。检测出的TSC1/2基因突变位点26个,主要为错义突变,其中13个未见报道。结论:对成年结节性症相关的肾管平滑肌脂肪瘤患者的外周血DNA进行基因测序,可能有很大比例无法检测出TSC1/2基因突变,肾管平滑肌脂肪瘤肿瘤直径超过8 cm的患者外周血DNA更易检出突变。成年结节性症相关的肾管平滑肌脂肪瘤患者中可能有较大比例是体细胞突变的嵌合体,基因测序不能仅提取外周血DNA样本。
倪建鑫严奉奇郝春林郭博昕武国军
关键词:结节性硬化症肾血管平滑肌脂肪瘤
糖与老年人群甲状腺结节及外周血DNA甲基化/羟甲基化相关性的研究
背景:糖尿病和甲状腺结节是老年人群常见疾病。已有不少临床研究表明,糖尿病患者甲状腺结节的患病率明显增加。但其中机制仍不明确。有研究表明,高糖可能通过改变 DNA 5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC...
王晓玮
关键词:老年高血糖中医证型甲状腺结节

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邓立春
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姜藻
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顾晓怡
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