搜索到160832篇“ 基因克隆与表达“的相关文章
- 大豆GmKCS1基因克隆与表达分析
- 2025年
- 超长链脂肪酸代谢合成过程中的关键限速酶KCS1对于植物抵御非生物胁迫具有重要作用,为了探究大豆KCS1基因的功能,本研究从栽培大豆中克隆出大豆KCS1基因并对该基因进行生物信息学分析以及对该基因的组织表达情况、盐胁迫下的表达变化情况进行探究。结果表明:GmKCS1基因启动子区域内与胁迫响应相关的顺式作用元件数量最多,为10个;大豆KCS1蛋白与野生大豆KCS1蛋白、拟南芥KCS1蛋白、谷子KCS1蛋白聚类为同一进化分支,大豆KCS1蛋白与野生大豆KCS1蛋白的进化关系最近;GmKCS1基因在大豆根、茎、子叶和叶组织中均可表达,但在叶组织中的表达水平最高;盐胁迫可诱导GmKCS1基因表达,GmKCS1基因相对表达水平在盐胁迫8 h和12 h时显著上升,并且在盐胁迫8 h达到峰值。本研究表明,GmKCS1基因在大豆响应盐胁迫过程中可发挥重要生物学功能,并为后续在大豆耐盐分子育种过程中应用大豆KCS基因提供参考依据。
- 孙冰姿袁野周诗宇周筱钰厉书媛李赵博
- 关键词：大豆盐胁迫基因克隆生物信息学
- 水母雪兔子SmGPAT13基因克隆与表达分析
- 2025年
- 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosph ate acyltransferase,GPAT)在植物角质层形成方面具有重要作用。为探究高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)角质层的形成机制,以水母雪兔子为材料,采用RT-PCR技术克隆了与角质层形成相关的GPAT基因,并对其进行生物信息学分析和不同组织(根、茎、叶和花)qRT-PCR的表达量验证。结果表明:克隆得到的SmGPAT13基因含有GPAT家族特征性酰基转移酶结构域(PlsC),cDNA全长序列为1497 bp,可编码498个氨基酸;该蛋白相对分子质量为55.68 kDa,等电点为8.96,蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;系统发育树分析表明,SmGPAT13蛋白与菊科小蓬草(Erigeron canadensis)蛋白的亲缘关系最近,且归属于GPAT6亚家族;启动子区顺式作用元件预测发现,SmGPAT13基因的启动子区含有逆境胁迫、生长发育、激素和光响应相关的顺式作用元件;qRT-PCR结果表明,SmGPAT13基因在不同组织中均有表达,且在花中相对表达量最高。本研究可为进一步探究水母雪兔子SmGPAT13基因功能提供理论依据。
- 胡国瑾段瑞君
- 关键词：基因克隆
- 胡桃楸花芽性别分化激素调控相关SAUR基因克隆与表达分析
- 2025年
- 为探讨胡桃楸花芽发育过程中性别分化激素调控的分子机理,本研究从胡桃楸转录组测序数据库中筛选出与激素调控相关SAUR基因的差异片段,通过PCR扩增技术获得SAUR基因CDS全长序列,并对JmSAUR基因进行生物信息学分析和表达分析。克隆获得JmSAUR基因的CDS序列全长为492 bp,编码164个氨基酸,将该基因编码的氨基酸序列进行BLAST序列比对和聚类分析,结果表明与核桃(Juglans regia)、薄皮山核桃(Carya illinoinensis)、杨梅(Morella rubra)亲缘关系最近,同源性可以达到84.16%以上。荧光定量表达分析得出胡桃楸激素调控相关基因JmSAUR在胡桃楸雌雄花芽中表达量较高,而在叶片和果实中表达较低。本研究从胡桃楸中成功克隆获得了花芽性别分化激素调控相关JmSAUR基因,推测该基因参与了胡桃楸花芽性别分化过程。该研究结果可以解决因交配类型雌雄花发育不一致带来的雌花数量减少,果实产量低,从而抑制胡桃楸人工林资源发展的这一重要瓶颈问题,在林业生产上具有重要的理论和指导意义。
- 蔡佳友秦柏婷刘春苹陆秀君张丽杰
- 关键词：胡桃楸基因克隆性别分化
- 龙牙百合LbAGPS1基因克隆与表达分析
- 2025年
- 【目的】克隆龙牙百合腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基编码基因(LbAGPS1),并分析其表达模式,为通过调节该基因表达进而促进百合鳞茎淀粉合成积累及膨大发育提供理论依据。【方法】利用同源克隆技术从龙牙百合组培苗幼嫩叶片中克隆到LbAGPS1基因,对其进行生物信息学分析及亚细胞定位;采用荧光定量PCR技术对LbAGPS1基因在龙牙百合叶片、鳞片、鳞茎盘等组织部位的表达差异进行分析。【结果】LbAGPS1基因包含1个完整的长度为1569 bp的开放阅读框(ORF),编码1个由522个氨基酸组成的亲水性蛋白,二级结构由α-螺旋(23.56%)、β-折叠(20.12%)、无规则卷曲(50.38%)、β-转角(5.94%)组成;LbAGPS1蛋白具有葡萄糖-1-磷酸腺苷酸转移酶特征结构,属于cl33437家族蛋白,具有PLN02241、GlgC保守结构域及9个低聚物界面特征与10个配体结合位点。系统发育分析结果表明,LbAGPS1蛋白与亚洲百合AGPase蛋白小亚基具有较近的亲缘关系。亚细胞定位结果显示,LbAGPS1蛋白在烟草叶片中的表达主要定位于叶绿体;实时荧光定量PCR结果显示,LbAGPS1基因主要在龙牙百合的鳞茎中表达,其相对表达量显著高于叶片与鳞茎盘的相对表达量,鳞茎中又以内部鳞片相对表达量最高,其次为中部、外部鳞片。【结论】LbAGPS1基因编码蛋白含有cl33437家族PLN02241、GlgC保守结构域及特征位点,主要在鳞茎的鳞片发育过程中表达,具有明显的组织表达特异性。
- 张进忠张进忠李朝生韦莉萍陈翠云孙嘉曼
- 关键词：龙牙百合淀粉腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因表达
- 半夏PtNAC48基因克隆与表达分析
- 2025年
- 根据半夏三代转录组数据,利用PCR技术克隆PtNAC48基因,并对其进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技术检测该基因在半夏根、块茎、叶柄、叶片4个组织部位和15%PEG 4000模拟干旱胁迫处理下不同时间段的基因表达变化,以探究干旱胁迫下PtNAC48的功能与作用,为后续研究该基因响应半夏干旱胁迫的分子机制奠定基础。结果表明,成功克隆PtNAC48基因,基因编码区全长1086 bp,编码361个氨基酸,含有NAC转录因子典型NAM保守结构域;亚细胞定位预测其定位在细胞核中,PtNAC48是亲水性蛋白,无信号肽与跨膜结构,存在糖基化和磷酸化位点。序列比对和进化分析表明,PtNAC48和其他物种已报道的NAC蛋白有相似的保守序列,与玉米ZmNAC071亲缘关系最近。qRT-PCR技术检测结果显示,PtNAC48基因在半夏的叶柄中表达量最高,在根中最低,模拟干旱处理下该基因表达量随处理时间逐渐升高,胁迫24 h时表达量最高,随后呈下降趋势;转录激活试验证明PtNAC48蛋白不具有转录自激活活性。PtNAC48基因受干旱胁迫诱导表达,推测该基因在响应半夏干旱胁迫中发挥着重要作用。
- 苏传栋纪明芳王振朱艳芳薛涛薛涛薛建平
- 关键词：半夏NAC转录因子基因克隆生物信息学干旱胁迫转录激活
- 香榧花粉TgPUX10基因克隆与表达
- 2025年
- 以香榧(Torreya grandis‘Merrillii’)花粉RNA反转录的cDNA为模板,利用RT-PCR技术分离出一条类似拟南芥PUX10-like cDNA序列,命名为TgPUX10,并对该基因进行鉴定、克隆、表达分析。结果表明:TgPUX10基因的完整开放阅读框(ORF)为1437 bp,编码477个氨基酸残基。TgPUX10蛋白的氨基酸序列包含UBA、HP、UAS、UBX功能结构域。通过构建瞬时表达载体,并利用拟南芥悬浮细胞转化体系,发现TgPUX10蛋白定位于油体细胞器。在花粉萌发的0、2、4 d时,油体相关基因TgOLE及TgCLO的表达量呈下降趋势,TgPUX10的表达量显著上升,证明TgPUX10影响香榧花粉萌发,且参与油体的降解过程。TgPUX10在各品种香榧中表达较为保守。与其他品种相比,细榧(Torreya grandis‘xifei’)的花粉活性较高,萌发率达到35.5%。
- 汤天羽汪承巧刘佳乐曹岳英伦张瑞吴家胜
- 关键词：香榧生物信息学分析亚细胞定位
- 紫薇LiUFGT1基因克隆与表达分析
- 2025年
- 以紫薇(Lagerstroemia indica)品种‘建民红’的半同胞家系后代中的红、粉、白3种不同花色子代作为试材,克隆获取LiUFGT1基因的全长,对其进行生物信息学和表达分析,探究UFGT基因在紫薇不同花色中的作用,以期为进一步研究紫薇花色调控机制及其分子育种提供参考依据。结果表明:紫薇LiUFGT1基因的CDS区为1203 bp,共编码400个氨基酸,具有UDPGT保守结构域;其蛋白分子质量约为44.05 kD,等电点(pI)为5.51,属于不稳定的亲水性蛋白。系统进化树分析显示LiUFGT1与石榴PgUFGT基因亲缘关系最近,氨基酸相似性达93%。花青苷含量检测表明红花子代(R)在盛花期和末花期的花青苷含量较高,粉花子代(P)在花苞期、盛花期、末花期等3个花发育过程中花青苷含量逐渐上升;而白花子代(W)的花青苷含量低,总体呈现下降趋势。qRT-PCR分析显示LiUFGT1在R、P、W的不同花发育时期的表达趋势与花青苷含量变化一致,表明LiUFGT1基因的表达与花青苷呈正相关。
- 高子龙王金凤陈卓梅李纪元刘伟鑫李永华
- 关键词：紫薇花色花青苷含量
- 山葡萄VaLSD1基因克隆与表达分析
- 2025年
- 为了揭示山葡萄VaLSD1基因参与调控抗寒胁迫的作用,从优质山葡萄品种双优中克隆获得了VaLSD1基因的全长序列,通过序列分析、蛋白互作网络分析、表达模式分析和亚细胞定位分析,发现VaLSD1基因编码序列长780 bp,编码259个氨基酸;VaLSD1含有3个保守的zf-LSD1结构域,VaLSD1蛋白N端存在跨膜结构;VaLSD1蛋白与多个液泡蛋白分拣因子互作;在低温胁迫下,VaLSD1基因上调表达;此外,VaLSD1蛋白定位于细胞核。研究结果可为深入解析山葡萄VaLSD1基因的分子功能提供基础,为阐明山葡萄VaLSD1基因参与抗寒应答的分子机制提供数据线索。
- 袁峰袁峰
- 关键词：山葡萄亚细胞定位低温胁迫
- 百合GARP家族鉴定和鳞片发育的基因克隆与表达
- 2025年
- GARP是植物特异性转录因子家族,在植物生长发育和非生物胁迫响应中发挥关键作用。为全面了解百合GARP转录因子提供基础资料,为探索百合鳞片的生长发育机制奠定一定基础,基于二代、三代百合转录组数据,对其GARP家族成员进行鉴定和表达分析。结果表明,在转录组数据中共鉴定出34个GARP蛋白,均为亲水性蛋白,68%为酸性蛋白,94%为不稳定蛋白。系统进化树将百合GARPs分为5个亚家族:ARR-B、GLK、NIGT1/HRS1/HHO、PHR1/PHL1和KAN,进化分析发现,百合GARPs可能参与生长发育、生物钟调节、开花转化、激素运输、非生物胁迫等过程。对鳞片发育具有重要作用的ARR-B亚家族成员进行qRT-PCR分析,结果发现,LhGARP33、LhGARP30和LhGARP3可能对鳞茎发育起重要作用。LhGARP3和LhGARP30被成功克隆,氨基酸序列具有典型的ARR-Bs磷酸受体结构域(REC)及金属和磷酸化结合位点。空间表达分析了ARR-B I亚组在花、叶和鳞片中的表达模式,结果表明,LhGARP5在叶中的表达量最高,而LhGARP31在花中的表达量最高,LhGARP33、LhGARP30和LhGARP3的表达特征基本一致,均在鳞片中高表达,其可能作为关键基因在鳞片发育过程中发挥主要作用。
- 刘佳鑫武琼韩美玲李超杜方
- 关键词：百合基因克隆
- 辣椒CcBBX20基因克隆和表达分析
- 2024年
- 锌指蛋白在植物生长发育和对非生物胁迫因子的响应中发挥着重要的调节作用。BBX蛋白属于锌指蛋白,CcBBX20基因是锌指蛋白家族的重要成员。为探讨CcBBX20在辣椒生长发育和响应非生物胁迫中的生物学功能,本研究利用基因克隆获得基因的编码序列;应用生物信息学分析方法预测该基因编码蛋白质的结构和功能;根据PepperHub数据库相关数据分析该基因在10种非生物胁迫处理下辣椒幼苗根和叶的表达量模式。结果表明:辣椒CcBBX20所编码的蛋白有209个氨基酸残基,相对分子质量为23.12 kD,分子式为C984H1551N285O329S15,理论等电点为5.78,是不稳定的亲水性蛋白;有2个典型的Bbox-SF结构域,没有信号肽和跨膜结构域,主要定位在细胞核中;其二级结构主要由无规则卷曲组成(占58.85%),α螺旋占比22.01%,β-转角占比3.83%。辣椒CcBBX20和马铃薯、番茄、茄子BBX20的亲缘关系最近。基因表达分析表明CcBBX20在辣椒幼苗根和叶受到不同胁迫后表达差异显著,在脱落酸、赤霉素、生长素、水杨酸、茉莉酸甲酯以及高温处理下表现为促进作用,其中高温42℃,处理1.5 h后表达量最高;在过氧化氢、甘露醇和盐处理下表现为抑制作用。因此辣椒CcBBX20基因作为BBX基因家族成员,在响应高温胁迫中发挥作用,可能会提高幼苗对高温的耐受力,可为辣椒耐高温育种目标提供候选基因。
- 邓巧灵华玮王华素张明先张芮豪吕俊恒邓明华
- 关键词：辣椒基因克隆生物信息分析高温胁迫
