搜索到103篇“ 启动子识别“的相关文章
- 一种基于深度学习的大肠杆菌启动子识别及强弱分类方法
- 本发明公开了一种基于深度学习的大肠杆菌启动子识别及强弱分类方法，属于生物信息技术领域。所述方法包括：对基因序列进行数字化处理、对训练样本进行扩充、构建深度学习网络模型用于特征学习。本发明采用的残差网络结合自注意力机制，具...
- 周景文王兴隆徐康杰赵欣怡陈坚曾伟主
- 基于深度学习的lncRNA及其启动子识别研究
- 长链非编码RNA(lncRNA)在多种生物过程中都发挥着重要作用,同时与多种人类疾病和癌症的发生相关。准确识别lncRNA及其启动子有助于lncRNA功能的研究。目前,通过实验技术识别lncRNA及其启动子的流程复杂且费...
- 张天阳
- 关键词：长链非编码RNA启动子卷积神经网络转录因子
- 基于融合深度学习的大肠杆菌启动子识别与分类研究
- 启动子是基因表达调控的重要元件，深入研究启动子的序列结构特征和功能，是理解基因转录调控机制和表达模式的关键。在后基因组学时代，数据的可用性使得建立用于检测启动子的计算模型成为可能。到目前为止，启动子的识别主要是通过生物实...
- 胡仔豪
- 关键词：大肠杆菌卷积神经网络Σ因子
- 转录前起始复合物的组装和启动子识别机制
- 2023年
- 基因转录作为中心法则的关键环节,将遗传信息由DNA传递至RNA,从而指导蛋白质的合成,是生物体最重要的生命活动之一。转录起始过程发生在几万种不同基因的高度多样化的启动子区,启动子区转录前起始复合物(PIC)的装配是转录起始的关键步骤,受到极其复杂的调控,是基因表达调控的核心。数十年来,大量基于TBP-TATA框体系开展的PIC结构和功能研究逐步揭示了基于TBP的PIC在TATA框启动子上的组装机制。近年来,研究显示,人类超过85%基因启动子不含有TATA框,并且几乎所有的基因转录过程都需要TFIID参与,且功能并不能够被TBP所替代。近期,基于TFIID的不同组装阶段的PIC结构和包含+1核小体的复合物结构的研究突破,首次系统地展示了PIC识别不同类型启动子及其在染色质上组装的分子过程,为后续研究基因表达调控提供了理论基础。
- 陈曦子徐彦辉
- 关键词：转录起始转录调控
- 基于深度学习框架的启动子识别及分类研究
- 启动子是位于转录起始位点附近并且具有调控作用的一段DNA序列，负责启动基因组中特定基因的转录，决定了基因的起始转录和表达强度。启动子的准确识别对于更好地理解转录调控具有重要意义。使用机器学习等基于计算的方法识别启动子比传...
- 孙昂
- 关键词：启动子识别
- 一种人类基因启动子识别方法和系统
- 本申请公开了一种人类基因启动子识别方法和系统。该方法在获取人类基因训练样本后，基于启动子与三个非启动子之间的对称散度，从所有N联体集合中确定最具有分辨率的N联体集合。进而，利用具有分辨率的N联体集合完成对分类器的训练，并...
- 徐文轩张莉李凡长王邦军张召
- 基于支持向量机的启动子识别算法研究
- 随着基因组测序工作的不断展开，相关数据的积累速度正在以指数级的速度飞速增长。关于基因表达的研究，一直都是遗传学研究的核心内容，而启动子又在基因表达过程中扮演着重要的角色。由此可见，启动子的研究在遗传学中非常重要。正如其名...
- 胡震
- 关键词：支持向量机启动子识别大数据
- 基于Weka平台的分类算法在启动子识别中的应用被引量：2
- 2018年
- 在"后基因组"时代,对于DNA功能元件的注释,尤其是启动子这类关键的调控元件的鉴定是进一步理解人类基因组繁杂调控网络的重要研究内容。本文基于高通量测序数据对细胞系H1-hesc中的基因启动子进行识别分类,利用数据挖掘软件Weka基于启动子组蛋白修饰特征建立分类模型,比较各分类算法性能优劣,以期应用最佳分类器在其它细胞系中识别分类启动子。
- 蒋璐凯
- 关键词：启动子高通量测序WEKA
- 一种人类基因启动子识别方法及系统
- 本申请公开了一种启动子识别方法，通过对多个样本基因序列进行胞嘧啶、鸟嘌呤CG偏好特征的统计，将多个样本基因序列分为两类，针对每一类样本基因序列分别执行以下步骤：分别提取其中每一个样本基因序列的刚性特征、CpG岛特征和四联...
- 张莉徐文轩罗璇王邦军杨季文李凡长
- 启动子识别方法及系统
- 本发明公开了一种启动子识别方法及系统：获取测试数据<Image file="DDA0000623834430000011.GIF" he="55" imgContent="drawing" imgFormat="GIF"...
- 张莉徐文轩鲁亚平王邦军张召杨季文李凡长
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- 王立宏
- 作品数：56被引量：154H指数：7
- 供职机构：烟台大学计算机与控制工程学院
- 研究主题：半监督聚类 潜在语义索引 数据挖掘 决策表 启动子
- 杜耀华
- 作品数：43被引量：105H指数：6
- 供职机构：军事医学科学院卫生装备研究所
- 研究主题：启动子识别 二次判别分析 大肠杆菌 剪接位点识别 启动子
- 王正志
- 作品数：243被引量：797H指数：14
- 供职机构：国防科学技术大学机电工程与自动化学院
- 研究主题：合成孔径雷达 神经网络 SAR SAR图像 H
- 秦洋
- 作品数：8被引量：5H指数：1
- 供职机构：烟台大学计算机学院
- 研究主题：潜在语义索引 启动子 DNA序列 启动子识别 语义差异
- 武栓虎
- 作品数：32被引量：35H指数：3
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