搜索到497篇“ 原子动力学“的相关文章
基于机器学习原子势函数的原子动力学蒙特卡洛程序TensorKMC的优化
2024年
核反应堆压力容器是核电站中最重要的部件之一,在使用过程中通常会受到辐照损伤,这极大影响了其使用寿命,给核电站的安全带来隐患。原子动力学蒙特卡洛方法(AKMC)是研究材料辐照损伤的有效理论方法,可以与计算机数值模拟进行结合来研究压力容器的微结构演变。辐照损伤的材料存在缺陷,原子间相互作用建模时需要考虑非球对称相互作用,但TensorKMC在计算时并没有考虑到原子的角向作用。文中针对该问题,提出了一种包含角向相互作用、可以与TensorKMC的三重编码完美结合的指纹建模方法,并可利用多重度对角向指纹的计算过程进行化简。文中在TensorKMC程序中实现了该方法,测试结果显示角向指纹对势函数的精度有显著影响,最大角动量越高,势函数越精准,程序的模拟耗时也会显著增加。同时,也针对TensorKMC的原子势函数的激活函数开展了测试,结果表明梯度光滑的Softplus和SquarePlus相比初版TensorKMC所用的ReLU在拟合高维势能面时有明显的优势,在最大角动量较低时ReLU有性能优势,但随着最大角动量的增大,不同激活函数对总体模拟时间几乎无特别影响。因此,在实际研究中推荐使用梯度光滑的激活函数。
刘人僪陈欣商红慧张云泉
原子动力学蒙特卡洛模拟的原子指纹计算方法及装置
本发明公开了一种原子动力学蒙特卡洛模拟的原子指纹计算方法及装置,该方法应用于异构多核处理器,可以将原子指纹运算分配至多个从核执行,以及采用预先确定原子指纹表的方式快速获取指纹函数的结果,结合空位系统的相对坐标、近邻关系及...
宋海峰商红慧陈欣林蓉芬王丽芳高兴誉
两种微生物源谷氨酰胺转氨酶与底物特异性识别的全原子动力学模拟研究
2023年
微生物源谷氨酰胺转氨酶(Transglutaminase,TGase)能够催化蛋白间氨酰基转移促进蛋白交联,已经广泛应用于食品、轻工等多种领域.然而目前微生物源TGase与底物间基于长程作用力的分子特异性识别机制仍不清楚,理性改造困难.本研究以源自高茂源链霉菌(MTG)和源自枯草芽孢杆菌(BTG)的两种TGase为研究对象,使用分子对接技术构建酶与底物的结合复合体并使用分子动力学模拟解析两种TGase与底物识别的分子机制.结果显示两种TGase在底物识别过程高度类似,均由催化腔外周loop区域氨基酸残基通过范德华及静电作用固定底物整体,而后由位于催化腔底部催化三联体内Asp(MTG)或Glu(BTG)通过羧基侧链稳定反应发生局部空间构象并拉近底物Gln内γ-酰胺基与核心催化残基Cys间距,以便后续反应过程中TGase-底物中间体的生成.上述结果阐明了TGase与底物活性基团的分子识别模式,提出了两种TGase内作用于底物识别的氨基酸残基,为以后TGase的理性改造研究提供了理论基础.
吴楠张永峰季宝成
关键词:分子对接分子动力学模拟
Fe-Cr-W合金内富Cr团簇形核析出动力学原子动力学蒙特卡罗模拟
2023年
低活化铁素体马氏体钢被认为是第四代堆及聚变反应堆候选结构材料之一。低活化铁素体马氏体钢以Fe-Cr为基体,W是其中重要的溶质元素。低温辐照脆化行为是限制低活化铁素体马氏体钢服役的重要问题之一。服役过程中析出的团簇因阻碍位错运动而引起材料硬化脆化。深入理解服役过程中团簇析出行为有助于认识低活化铁素体马氏体钢的低温辐照脆化问题。基于优化后的自主开发程序MIET_AKMC,利用原子动力学蒙特卡罗(atomic kinetic Monte Carlo, AKMC)方法研究了Fe-Cr(8%,10%,16%,20%)-W(1%,2%)合金在热老化条件下富Cr团簇形核析出动力学行为。结果表明,热老化后Cr原子析出形成富Cr的团簇,W仍保持固溶状态。Cr团簇析出分为形核、长大、粗化3个阶段。在团簇开始粗化时,团簇平均半径约(0.57±0.03) nm,且该值不受温度和Cr含量的影响。W会延迟团簇析出动力学过程,尤其是当Cr含量为10%时,延迟效果最明显,这是因为Cr含量为10%时,体系SRO参数绝对值达最大;W延迟效果得益于W与空位间较强的结合能(0.14 eV,空位与Cr结合能为0.06 eV)。从模拟结果可知,除已知的固溶强化外,W元素加入会通过延迟富Cr团簇析出从而有益于Fe-Cr钢性能,因为富Cr团簇会引起Fe-Cr合金硬化、脆化。
贾丽霞王东杰王瑾曹金利豆艳坤吴石贺新福杨文
关键词:析出动力学
石墨炔锚定金属原子动力学过程的第一性原理研究
石墨炔作为一类新的碳同素异形体材料,引起研究者们的广泛关注。与石墨烯材料相同,石墨炔也是二维范德瓦尔斯层状材料,因此很容易剥离形成二维材料。石墨炔因为晶体结构中存在有序的三角大孔,且具有本征半导体电子性质,所以在纳米材料...
刘雪晴
关键词:密度泛函理论
基于神经网络势的原子动力学蒙特卡洛程序开发与优化
核反应堆压力容器是核电站中最重要的部件之一,其服役寿命对整个核电站的安全运转起着决定性的作用。核反应堆压力容器作为经典的Fe-Cu二元合金,在使用过程中会受到辐照损伤,这使得溶质原子析出形成沉淀从而加快了合金的老化过程。...
刘人僪
超高斯光场调控超冷原子动力学的研究
超冷原子由于其高度纯净和优越的可控性,在精密测量和量子模拟领域发挥了重要作用。通过光场对超冷原子动力学进行调控是常用的一种量子模拟方法,比如利用光晶格势等操控超冷原子来研究物理问题。近年来,平顶光束的出现为超高斯势垒和势...
宋家莹
关键词:量子隧穿隧穿时间
原子动力学蒙特卡洛模拟的原子指纹计算方法及装置
本发明公开了一种原子动力学蒙特卡洛模拟的原子指纹计算方法及装置,该方法应用于异构多核处理器,可以将原子指纹运算分配至多个从核执行,以及采用预先确定原子指纹表的方式快速获取指纹函数的结果,结合空位系统的相对坐标、近邻关系及...
宋海峰商红慧陈欣林蓉芬王丽芳高兴誉
飞秒强激光驱动原子动力学过程中的电子关联效应研究
光与物质相互作用不仅是人们探究物理规律的基本方法,也是探索微观原子分子结构的重要手段。随着超快激光技术的发展,光与物质的相互作用研究进入到了一个全新的领域。在飞秒强激光场中,原子分子会展现出一系列有趣的超快非线性物理现象...
施孟文
关键词:电子关联效应维格纳分布高次谐波产生
原子动力学多极极化率的计算
随着激光制冷和俘获技术的快速发展,原子光钟的精度得到了巨大的提高。目前最好的Sr原子晶格钟的精度已经达到了 10-18量级。在确定基本物理常数、检验洛伦兹不变性和寻找新物理等领域中,相关实验对原子光钟的精度提出了更高的需...
周密

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贺新福
作品数:117被引量:96H指数:5
供职机构:中国原子能科学研究院
研究主题:分子动力学 辐照损伤 位错环 团簇 原子尺度
王东杰
作品数:34被引量:25H指数:3
供职机构:中国原子能科学研究院
研究主题:分子动力学 位错环 团簇 CR 反应堆
贾丽霞
作品数:45被引量:29H指数:3
供职机构:中国原子能科学研究院
研究主题:分子动力学 原子尺度 团簇 位错环 反应堆
张云泉
作品数:177被引量:413H指数:11
供职机构:中国科学院计算技术研究所
研究主题:高性能计算机 排行榜 OPENCL TOP100 GPU
杨文
作品数:278被引量:195H指数:8
供职机构:中国原子能科学研究院
研究主题:反应堆 辐照 放射性 反应堆压力容器 A508-3钢