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结核分枝杆菌北京家族与结核病近期复发的关系研究
背景与目的:  中国是全球30个结核病高负担国家之一,2017年中国新发结核病患者数88.9万人,因结核死亡人数约是3.7万,新发患者数位居全球第二位仅次于印度.Van Soolingen等人于1995年首次发现并定义结...
李国莉
关键词:结核病结核分枝杆菌基因分型
文献传递
青海省北京家族结核分枝杆菌的磷脂酶C基因多态性研究
2018年
目的研究青海高原地区结核分枝杆菌的磷脂酶C基因的多态性并探讨其与北京家族结核菌株的关系。方法收集2012-2016年青海地区结核分枝杆菌临床分离株共250株,采用多位点数目可变串联重复序列(multiple-locus variable-number tandem repeat analysis,MLVA)分型技术进行基因分型,通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)分析结核分枝杆菌磷脂酶C基因(phospholipase C,plc)的多态性。结果 250株临床分离结核杆菌中,北京家族菌株184株占73. 60%,非北京家族菌株66株占26. 40%。该地区结核杆菌的plc基因呈多态性,250株结核杆菌中分别有13. 20%,15. 20%和16. 40%的菌株含突变的plc A,plc B和plc C基因,突变率较低,而plc D基因突变率高达97. 20%。北京株与非北京株的plc A,plc B和plc C基因突变率差异均有统计学意义(均有P <0. 05),而plc D基因突变率未发现差异(2=0. 322,P=0. 571)。结论结核分枝杆菌plc基因突变可能会减弱菌株毒力,而北京株中该基因突变较少,可能因此导致该家族菌株在本地区的广泛流行。
张媛媛王兆芬李斌蒋明霞马斌忠申秀丽陈虹汝李会茹汪海静王毕力格
关键词:结核分枝杆菌基因分型磷脂酶C
北京家族结核分枝杆菌鉴定方法的研究进展被引量:4
2016年
结核病仍是严重威胁人类健康的全球公共卫生问题之一。北京家族结核分枝杆菌是我国大部分地区流行的主要菌株。作者论述了插入序列IS6110-限制性片段长度多态性(IS6110-RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)、长序列多态性(LSP)以及单核苷酸多态性(SNP)等多种北京家族结核分枝杆菌分型技术,并讨论了各技术的优缺点,以便对北京家族结核分枝杆菌的鉴定提供可靠依据。
郭立娟黄海荣高飞王桂荣
关键词:基因型
相同多态性位点对结核分枝杆菌北京家族菌株多位点可变数目串联重复序列基因型构成的影响
2015年
目的探讨多态性相同的位点对北京家族结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列(MIRU-VNTR)基因分型的影响,为合理选择分型位点提供科学依据。方法分别选取9个及12个位点,构成4组MIRU—VNTR位点组合,其中,9位点组成的两个组合中,分别有两个不同位点(MIRU40/MIRUl6)多态性一致,其余为相同位点;12位点的两个组合则分别包括另外两个多态性相同的位点(MIRu39/MIRu31)。进行聚类分析,比较含有相同多态性的不同位点组合的分辨能力、成簇能力以及基因型特点。结果9位点两个组合都将菌株分为三群,其中,Ⅲ群菌株仅有1株相同,分别占组合1、2的2.0%和1.6%。12位点组合也将菌株分为三群,第Ⅱ群菌株组成差异非常明显,完全没有相同的菌株。结论多态性相同的位点对北京家族菌株MIRU—VNTR基因分型影响较大。在选择MIRU—VNTR分型位点时,应不仅仅检验位点的分辨能力和对成簇的影响,还应考虑有相同/相近多态性的位点对基因型构成的影响。
董彩博潘新灵孙高翔崔佳奕凌虹李迪
关键词:结核分枝杆菌多态性
福建省结核分枝杆菌北京家族基因型研究被引量:3
2014年
目的了解福建省结核分枝杆菌北京家族基因型的流行分布特点以及与耐药性等的相关性。方法对来源于2008年-2011年间福建省30个耐药监测点的312株结核分枝杆菌临床分离株,应用RD105缺失基因检测法进行北京家族基因型鉴定。使用卡方检验分析相关性。结果在312株结核分枝杆菌中,北京家族基因型占59.3%(185/312)。感染北京家族基因型菌株与患者年龄、性别、地区和治疗史无关(P分别为0.11、0.38、0.99、0.05)。北京家族基因型菌株在耐异烟肼、利福平、乙胺丁醇和耐多药(MDR)的比例显著高于非北京家族基因型(P分别为0.02、0.00、0.02、0.00)。结论北京家族基因型是福建省主要流行结核分枝杆菌基因型,初步分析显示北京家族基因型菌株与患者年龄、性别、地区和治疗史无关,而与耐异烟肼、利福平、乙胺丁醇和MDR有关。
梁庆福陈求扬林淑芳逄宇林建赵永
关键词:结核分枝杆菌基因分型
内蒙古自治区结核分枝杆菌Spoligotyping分型及北京家族分析被引量:9
2013年
目的了解内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株的基因型构成,及该地区北京家族菌株的分布特征。方法从内蒙古自治区结核病防治研究所收集2011年全年临床分离的372株结核分枝杆菌菌株及其372例来源患者的背景资料,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法和BioNumerics 5.0软件进行基因分型分析,将372株临床菌株Spoligotyping分型结果与SpolDB 4.0数据库进行比对。另外,采用NTF及LSP对北京家族菌株进行分析。来源患者中汉族和蒙古族分别为282例及84例,其他为回族4例,维吾尔族和满族各1例,例数过少,因此仅分析主要民族与北京家族的易感性。以SPSS 13.0软件进行统计学分析,χ2检验分析不同民族与北京家族易感性。结果372株临床菌株共分为48种基因型,其中24种基因型为新的型别。85.48%(318/372)为北京家族,同时存在T家族(仅次于北京家族的主要流行基因型)占4.84%(18/372)、H家族(Haarlem)0.81%(3/372)、MANU家族(2004年最先于印度Delhi发现)0.27%(1/372)和LAM家族(Latin American and Mediter-ranean,拉丁美洲和地中海家族)0.27%(1/372)。汉族北京家族菌株占87.94%(248/282),非北京家族菌株占12.06%(34/282),蒙古族北京家族菌株79.76%(67/84),非北京家族菌株20.24%(17/84),差异无统计学意义(χ2=3.612,P=0.057)。结论内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,且北京基因型为该地区主要流行株,而北京家族菌株与民族易感性间无关联。
余琴苏云开吕冰马岩连璐璐杨晓敏董海燕刘耀赵秀芹吴移谋万康林
关键词:细菌分型技术分子分型汉族
结核分枝杆菌北京家族菌株的起源、进化及其与现代人类迁移的联系
我国是全球22个结核高负担国家之一,结核病人数位居世界第二。我国的结核疫情主要由结核分枝杆菌北京家族菌株(简称北京菌株)所致。该菌株在东亚各国高度流行,并在全球广泛传播。在表型上,北京菌株通常被认为具有更强的致病性和耐药...
罗涛
关键词:起源进化耐药
文献传递
结核分枝杆菌北京家族菌株与耐药相关性研究的Meta分析被引量:7
2012年
目的探讨结核分枝杆菌北京家族(即北京基因型)与耐药的相关性。方法检索Medline、荷兰《医学文摘》(Embase)、SCI、EBSCO、中国期刊全文数据库(CNKI)、维普、万方数据库,检索范围包括1990--2010年的所有文献,检索到有关研究北京基因型与耐药的文献525篇,按照纳入、排除标准筛选有关研究的文献,采用RevMan5.0软件对其进行综合定量分析。结果总共纳入文献38篇,关于异烟肼耐药22篇,利福平耐药24篇,链霉素耐药19篇,乙胺丁醇耐药18篇,多重耐药(MDR)26篇。Meta亚组分析结果表明,在中国,北京基因型与利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,合并OR(95%CI)值分别为1.62(1.13~2.31)、1.67(1.16~2.40)、1.79(1.20~2.68);在俄罗斯,北京基因型与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,合并OR(95%CI)值分别为4.82(3.19—7.29)、4.84(3.84—6.10)、3.32(2.51—4.40)、5.42(3.36~8.74);在越南,北京基因型与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,合并OR(95%CI)值分别为2.12(1.55~2.91)、4.71(3.01~7,36)、3.78(1.63—8.77)、4.21(1.58—11.18);在其他国家,北京基因型与异烟肼耐药、利福平耐药、链霉素耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,合并OR(95%CI)值分别为1.69(1.19—2.42)、2.48(1.92~3.19)、3.04(2.13~4.33)和2.36(1.52—3.68)。结论结核分枝杆菌北京基因型与3种一线类抗结核药(异烟肼、利福平、乙胺丁醇)的耐药呈正相关,并且与MDR存在强关联,联系强度在不同国家存在一定差异。
刘彬彬卢亮萍吕冰万康林颜艳
关键词:基因型META分析
北京地区结核分枝杆菌的基因分型及北京家族进化的初步研究
目的:对北京地区结核分枝杆菌进行基因分型以及进行北京家族进化的探讨,了解北京地区结核分枝杆菌的菌株基因型特征、主要流行型及北京家族进化的特征,为追索传染源、寻找传播途径和加强结核病的预防与控制提供基础科学依据。   方...
刘彬彬
关键词:结核分枝杆菌基因分型
日本结核分枝杆菌北京家族株的系统发生学与基因学特征被引量:2
2011年
为评价目前在日本流行的结核分枝杆菌的基因结构特征,对从全日本结核病患者中分离到的237株北京家族株进行了系统发生学的研究。与之前来自于其他国家的报道不同,古老亚型菌株是日本的主要流行株。成簇分析建立在JATA-VNTR(日本防痨协会随机重复序列的可变数目)的基础上,这种方法可以描述日本结核分枝杆菌菌株的独特的VNTR方法,结果揭示了现代亚型菌株间没有地域来源的区别,具有高度的相似性。JATA-VNTR方法可能对在经常分离出古老亚型菌株的菌群中进行系统发生学研究是有价值的。
S.MaedaT.WadaT.IwamotoY.MuraseS.MitaraiI.SugawaraS.Kato姜广路刘宇红
关键词:结核分支杆菌VNTR系统发生学

相关作者

万康林
作品数:480被引量:1,736H指数:19
供职机构:中国疾病预防控制中心
研究主题:结核分枝杆菌 莱姆病 莱姆病螺旋体 基因分型 分枝杆菌
赵秀芹
作品数:122被引量:565H指数:14
供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
研究主题:结核分枝杆菌 基因分型 临床分离株 分枝杆菌 菌种鉴定
吕冰
作品数:104被引量:557H指数:14
供职机构:北京市疾病预防控制中心
研究主题:结核分枝杆菌 基因分型 临床分离株 间隔区寡核苷酸分型 SPOLIGOTYPING
刘志广
作品数:76被引量:397H指数:11
供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
研究主题:结核分枝杆菌 基因分型 间隔区寡核苷酸分型 临床分离株 SPOLIGOTYPING
董海燕
作品数:32被引量:175H指数:10
供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
研究主题:结核分枝杆菌 基因分型 间隔区寡核苷酸分型 临床分离株 SPOLIGOTYPING