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我国结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c~Rv3304的多态性及生理意义研究: 2024年; 目的分析我国141株结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c~Rv3304基因间隔区的多态性,探讨Rv3303c~Rv3304基因间隔区的生理意义。方法通过聚合酶链式反应(PCR)及测序技术分析141株结核分枝杆菌现代北京基因型菌株中Rv3303c~Rv3304基因间隔区序列,构建Rv3303c~Rv3304基因间隔区的重组质粒,将重组质粒及空载质粒电转入耻垢分枝杆菌mc2155中,β-半乳糖苷酶(报告基因lacZ表达产物)活性试验检测报告基因lacZ的表达水平;使用SPSS 25.0软件进行单因素方差分析。结果141株现代北京基因型菌株中Rv3303c~Rv3304基因间隔区存在376 bp、260 bp和144 bp 3种不同长度序列,分别含有4、2和0个拷贝重复序列,以2个拷贝重复序列为主,占比约95.74%;基于这3种不同拷贝重复序列,构建重组质粒pSD5B-334、pSD5B-332、pSD5B-330,并将重组质粒及空载质粒转入耻垢分枝杆菌中;β-半乳糖苷酶活性检测结果显示,与菌株MSMEG-pSD5B相比,重组菌株MSMEG-334、MSMEG-332、MSMEG-330的β-半乳糖苷酶活性均上升,菌株间的β半乳糖苷酶活性的差异有统计学意义(P<0.001)。结论我国结核分枝杆菌现代北京基因型菌株Rv3303c~Rv3304基因间隔区具有多态性,通过模式菌株验证发现其能显著影响报告基因lacZ的转录。; 南晓甜李马超刘海灿王蔚赵秀芹万康林赵丽丽; 关键词：结核分枝杆菌 Β-半乳糖苷酶活性

北京市复治结核病患者非北京基因型菌株谱系及耐药分析被引量：4: 2022年; 目的了解北京市复治结核病患者非北京基因型菌株谱系及耐药情况,为复治非北京基因型结核病患者有效防治提供科学依据。方法采用RD105基因缺失法对复治患者所分离的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)进行检测,筛查出非北京基因型菌株,使用可变数目串联重复序列基因分型实验分析非北京基因型菌株的遗传特征,再使用比例法药敏实验及全基因组测序分析其耐药情况。结果 134例复治结核病患者所分离的MTB中,北京基因型为125例(93.3%),非北京基因型为9例(6.7%)。9例非北京基因型MTB呈现9种不同的基因型,均不成簇,为独特型。9例非北京基因型MTB均为谱系4,其中,亚谱系L4.4有4株,亚谱系L4.5有5株。耐药预测结果显示,9例非北京基因型中,6例为全敏感菌株(66.7%),1例单耐异烟肼,耐药突变位点为ahpC_c.-48G>A,1例同时耐异烟肼与乙硫异烟胺,耐药突变位点为fabG1_c.-15C>T,1例单耐氟喹诺酮,耐药突变位点为gyrA_p.Asp94Asn与gyrA_p.Ala90Val。全基因组测序预测耐药结果与比例法药敏结果完全一致。结论复治结核病患者非北京基因型菌株主要为谱系4,呈明显的多态性。耐药突变位点均为常见突变位点。; 张洁杨新宇潘丽萍丁北川田丽丽代小伟李传友张宗德; 关键词：结核分枝杆菌全基因组测序耐药

宜昌地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的鉴定及VNTR分型被引量：3: 2022年; 目的研究宜昌地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的多态性和流行特征,揭示该地区结核病的分子流行病学特征,为结核病防治提供科学依据。方法选择2018年1月—2019年12月具有完整病例信息的结核分枝杆菌298株,进行人型结核分枝杆菌的鉴定,用扩增RD105缺失片段的多重PCR(DTM-PCR)鉴定北京基因型菌株;应用优化的9位点数目可变串联重复序列技术(VNTR)分析北京基因型菌株的多态性。结果298株结核分枝杆菌中,260株为人型结核分枝杆菌,DTM-PCR鉴定发现北京基因型菌株140株(53.85%),非北京基因型菌株120株(46.15%)。北京基因型菌株耐药率(32.14%)高于非北京基因型菌株耐药率(10.83%),差异有统计学意义(P<0.05)。VNTR-9位点对北京基因型菌株的分辨率为0.9985,成簇率为12.15%。结论北京基因型菌株在宜昌地区呈较高流行趋势,且北京基因型菌株耐药率更高。VNTR-9位点基因分型方法用于该地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的鉴别,能准确反映宜昌地区结核分枝杆菌的分子流行病学特征。; 李丹李丹徐新娟杜德兵吴文艳王德成庄倩王德成金柱; 关键词：结核分枝杆菌北京基因型分子流行病学

初治和复治肺结核病例中北京基因型结核分枝杆菌与抗结核药物耐药性的关联研究: 2021年; 目的探讨北京地区初治和复治肺结核病病例中北京基因型结核分枝杆菌(M.tb)流行与抗结核药物耐药性出现的相关性。方法收集北京各区县菌阳M.tb必临床分离株1140例,采用比例法进行药物敏感性检测;应用间隔区寡核苷酸分型方法鉴定北京基因型和非北京基因型:分析基因型流行和耐药性产生间的相关性。结果在初治病例中,北京基因型M.tb中异烟肼(INH)、阿米卡星(AK)、卷曲霉素(CPM)和对氨基水杨酸(PAS)的耐药率均低于非北京基因型(χ^(2)值分别为2.670、15.282、16.219、22.676,Z5值均<0.05)。在复治病例中,北京基因型M.tb必中AK、PAS的耐药率均低于非北京基因型(χ^(2)值分别为15.167、4.574,P值均<0.05);北京基因型M.tb你中耐多药结核病菌株的比例低于非北京基因型(χ^(2)值为7.046,P<0.05)。结论在初治和复治病例中北京基因型M.tb必的流行和抗结核药物耐药性的出现有不同的相关性,在初治病例中和INH、AK、CPM和PAS耐药性的出现有关联,而在复治病例中只在AK和PAS耐药性的产生上有关联,同时在复治病例中北京基因型菌株中出现耐多药结核病的概率更低。; 于丹付雷姚丛邢青易俊莉李传友刘毅; 关键词：北京基因型初治抗结核药物

北京基因型耐多药结核分枝杆菌二线抗结核药物耐药基因突变特征分析被引量：4: 2021年; 目的了解耐多药结核分枝杆菌(MDR-TB)北京基因型菌株对二线抗结核药物的耐药情况及耐药基因突变特征。方法对中国科学院大学宁波华美医院2017—2019年临床分离的MDR-TB采用RD105缺失基因检测法鉴定基因型。采用药敏试验比例法检测MDR-TB对卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素、氧氟沙星和左氧氟沙星等二线抗结核药物的耐药性。以结核分枝杆菌标准株H37RV为参比序列,PCR法检测rrs、tlyA、eis、gidB、gyrA和gyrB耐药基因突变,通过比较不同基因型的耐药率和基因突变率,分析北京基因型二线抗结核药物耐药特征。结果133株MDR-TB经鉴定,北京基因型106株,非北京基因型27株。北京基因型MDR-TB卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素、氧氟沙星和左氧氟沙星耐药率分别为9.43%、7.55%、3.77%、32.08%和32.08%,准广泛耐药率为30.19%,广泛耐药率为7.55%,与非北京基因型比较差异均无统计学意义(P>0.05)。北京基因型MDR-TB rrs、tlyA、eis、gidB、gyrA和gyrB突变率分别为7.55%、7.55%、1.89%、2.83%、36.79%和2.83%,与非北京基因型比较差异均无统计学意义(P>0.05)。rrs突变类型有2种,tlyA 1种,eis 2种,gidB 2种,gyrA 5种,gyrB 3种,均以点突变为主。结论北京基因型菌株为MDR-TB的优势菌株,对氟喹诺酮类药物耐药率较高,以gyrA基因突变为主。; 叶静芬方晴胡耀仁许小敏车洋; 关键词：结核分枝杆菌北京基因型耐药

初治和复治肺结核病例中北京基因型结核分枝杆菌与抗结核药物耐药性的关联研究被引量：11: 2020年; 目的探讨北京地区初治和复治肺结核病病例中北京基因型结核分枝杆菌(M tb)流行与抗结核药物耐药性出现的相关性。方法收集北京各区县菌阳M tb临床分离株1140例,采用比例法进行药物敏感性检测;应用间隔区寡核苷酸分型方法鉴定北京基因型和非北京基因型;分析基因型流行和耐药性产生间的相关性。结果在初治病例中,北京基因型M tb中异烟肼(INH)、阿米卡星(AK)、卷曲霉素(CPM)和对氨基水杨酸(PAS)的耐药率均低于非北京基因型(χ^2值分别为2670、15282、16219、22676,P值均<005)。在复治病例中,北京基因型M tb中AK、PAS的耐药率均低于非北京基因型(χ^2值分别为15167、4574,P值均<005);北京基因型M tb中耐多药结核病菌株的比例低于非北京基因型(χ^2值为7046,P<005)。结论在初治和复治病例中北京基因型M tb的流行和抗结核药物耐药性的出现有不同的相关性,在初治病例中和INH、AK、CPM和PAS耐药性的出现有关联,而在复治病例中只在AK和PAS耐药性的产生上有关联,同时在复治病例中北京基因型菌株中出现耐多药结核病的概率更低。; 于丹付雷姚丛邢青易俊莉李传友刘毅; 关键词：北京基因型初治抗结核药物

北京基因型结核分枝杆菌的流行及与二线抗结核药物耐药性的相关性: 2020年; 目的探讨北京市北京基因型MTB的流行风险因素及其与二线抗结核药物耐药性的相关性。方法收集北京各区县MTB菌阳临床株1140例,采用比例法进行药敏试验;采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法鉴定北京基因型与非北京基因型MTB;使用SPSS 22.0统计学软件,采用χ^(2)检验或Fisher精确概率检验方法对实验数据进行统计学分析。结果在1140株MTB临床分离株中,北京基因型941株(82.5%),非北京基因型199株;北京基因型菌株来源的患者中男性663例(70.5%),非北京基因型菌株来源的患者中男性124例(62.3%).两者比较差异有统计学意义[P-0.021.OR(95%CI):1.442(1.048-1.985)];北京基因型菌株来源的患者中流动人口441例(46.%),非北京基因型菌株来源的患者中流动人口78例(39.2%),两者比较差异有统计学意义[P-0.048,OR(95%CI):1.368(1.001~1.869)];北京基因型菌株来源的患者中年龄>65岁的患者129例(13.7%),非北京基因型菌株来源的患者中40例(20.1%),二者比较差异有统计学意义[P=0.021,OR(95%CI):0.631(0.426~0.936)];北京基因型菌株中对左氧氟沙星(Levofloxacin,Lfx).阿米卡星(Amikacin,Am).卷曲霉素(Capreomyein,Cm).对氨基水杨酸(Praminsalicylic,PAS)的耐药率分别为5.5%(52/941).1.3%(12/941).3.2%(30/941)和3.0%(28/941),非北京基因型菌株对以上4种药物的耐药率分别为10.6%(21/199).8.5%(17/199)、12.6%(25/199)和11.6%6(23/199),二者对4种药物的耐药率比较差异均有统计学意义(均P<0.05);北京基因型菌株中耐多药(MDR)菌株58株(6.2%),非北京基因型菌株中MDR菌株19株(9.5%),两者比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论北京基因型MTB在北京广泛流行且在男性人群和流动人口中的比例较高;与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株对Lfx.Am.Cm及PAS的耐药率低,但MDR-TB患者的比例无显著差异。; 梁晨张旭霞邢青易俊莉张雨晴李传友刘毅唐神结; 关键词：抗结核药物耐药

北京基因型结核分枝杆菌的流行及与二线抗结核药物耐药性的相关性被引量：9: 2020年; 目的探讨北京市北京基因型MTB的流行风险因素及其与二线抗结核药物耐药性的相关性。方法收集北京各区县MTB菌阳临床株1140例,采用比例法进行药敏试验;采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法鉴定北京基因型与非北京基因型MTB;使用SPSS 22.0统计学软件,采用χ2检验或Fisher精确概率检验方法对实验数据进行统计学分析。结果在1140株MTB临床分离株中,北京基因型941株(82.5%),非北京基因型199株;北京基因型菌株来源的患者中男性663例(70.5%),非北京基因型菌株来源的患者中男性124例(62.3%),两者比较差异有统计学意义[P=0.021,OR(95%CI):1.442(1.048~1.985)];北京基因型菌株来源的患者中流动人口441例(46.9%),非北京基因型菌株来源的患者中流动人口78例(39.2%),两者比较差异有统计学意义[P=0.048,OR(95%CI):1.368(1.001~1.869)];北京基因型菌株来源的患者中年龄≥65岁的患者129例(13.7%),非北京基因型菌株来源的患者中40例(20.1%),二者比较差异有统计学意义[P=0.021,OR(95%CI):0.631(0.426~0.936)];北京基因型菌株中对左氧氟沙星(Levofloxacin,Lfx)、阿米卡星(Amikacin,Am)、卷曲霉素(Capreomycin,Cm)、对氨基水杨酸(Para-aminosalicylic,PAS)的耐药率分别为5.5%(52/941)、1.3%(12/941)、3.2%(30/941)和3.0%(28/941),非北京基因型菌株对以上4种药物的耐药率分别为10.6%(21/199)、8.5%(17/199)、12.6%(25/199)和11.6%(23/199),二者对4种药物的耐药率比较差异均有统计学意义(均P<0.05);北京基因型菌株中耐多药(MDR)菌株58株(6.2%),非北京基因型菌株中MDR菌株19株(9.5%),两者比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论北京基因型MTB在北京广泛流行且在男性人群和流动人口中的比例较高;与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株对Lfx、Am、Cm及PAS的耐药率低,但MDR-TB患者的比例无显著差异。; 梁晨张旭霞邢青易俊莉张雨晴李传友刘毅唐神结; 关键词：抗结核药物耐药

福建省耐多药结核病分枝杆菌非北京基因型耐药性及相关基因突变分析被引量：4: 2020年; 目的了解福建省耐多药结核分枝杆菌非北京基因型的多态性及分布,探讨非北京基因型对11种其他抗结核药物的耐药性,分析其与耐药相关基因突变的关系。方法收集两次耐药监测点来源结核杆菌菌株进行一线抗结核药物的耐药性检测,选取耐多药菌株进行其他抗结核药物的耐药性测定,应用间隔区寡核苷酸分型技术进行基因分型,采用PCR扩增耐药相关基因rpoB、KatG、inhA基因并进行测序分析。结果 119株MDR菌株经Spoligotyping基因分型,其中非北京基因型39株,占32.77%,以H家族(14株,占11.76%)和T家族(含T1、T2、T3和T5,14株占11.76%)为主要流行型。非北京基因型与北京基因感染者性别、年龄组、职业、文化、登记分类及地区分布差异均无统计学意义(均P>0.05)。非北京基因型菌株对11种抗结核药物的耐药率与北京基因型的耐药率差异均无统计学意义(P均>0.05)。测序分析非北京基因型菌株rpoB、KatG、inhA基因突变率分别为96.64%、77.31%和12.61%。非北京基因型菌株在rpoB基因531位密码子、516位密码子和在katG基因315位密码子的突变率均低于北京基因型菌株(P<0.05);非北京基因型耐药相关基因的其他位点突变率与北京基因型的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论福建省非北京基因型的主要流行家族是H家族和T家族,非北京基因型与耐药性无关,其rpoB基因531位密码子、516位密码子和katG基因315位密码子的突变率均低于北京基因型菌株。; 魏淑贞赵永林建周银发林勇明林淑芳; 关键词：耐多药结核分枝杆菌

北京和非北京基因型结核分枝杆菌生长曲线及mazEF系统的研究: 2019年; 目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF3, 6,9和mazE3, 6,9基因mRNA表达水平;利用Western Blot技术检测MazF9蛋白表达水平。结果在标准和低氧条件下培养的第4、6、8、10 d,营养饥饿条件下培养的第2、4、6、8 d,北京基因型菌株的OD值(细菌数量)均高于非北京基因型菌株,差异有统计学意义(P<0.05);在上述3种培养条件下,北京和非北京基因型mazEF3,6,9缺失突变株和过表达株菌数均低于其亲本株。在mRNA、蛋白水平上,与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株mazEF3高表达9.55倍、mazF3高表达4.86倍、mazF6高表达2.64倍、mazF9高表达5.27倍和mazE9低表达0.16倍;mazF9蛋白高表达1.62倍,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达存在差异,mazEF系统与北京基因型菌株流行相关。; 谢婉莹赵继利杨赛丽刘微袁俐

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