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中国近海口虾蛄种群的谱系地理学研究及胸孔类的分子系统发生: 口足类(Stomatopoda)是重要的海洋底栖动物类群,大多数生活在地球的热带、亚热带、温带的近海海域,中国近海海域是口足类非常重要的地理分布区域。其中,口虾蛄(Oratosquilla oratoria)是广泛分布在...; 张代臻; 关键词：口虾蛄更新世喜马拉雅运动分歧时间

基于16S rRNA基因的7种乳酸杆菌的分子系统发生被引量：8: 2010年; 对7种乳酸菌的16SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定,进行序列比对后,以清酒乳杆菌为外组群,运用MEGA2.0和Tree-Przz5.0遗传分析软件以邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建系统发生树。结果表明:4种乳酸菌(类干酪乳杆菌、干酪乳杆菌、鼠李糖乳杆菌、戊糖乳杆菌)为一支系,另外3种(类植物乳杆菌、弯曲乳杆菌、草乳杆菌)构成另一支系,这两个支系又互为姊妹群。结果还显示,乳酸菌高级分类单元(超科及以上分类阶元)的系统发生与现行形态分类体系间存在明显的分歧。; 肖作为张红刚杨岩涛鲁曼霞杨崧; 关键词：分子系统发生 RRNA基因乳酸菌 PCR

从细胞色素b基因全序列探讨大额牛的分子系统发生被引量：25: 2008年; 大额牛是一种半野生半家养的珍稀牛种,有关其起源和系统地位一直存在争议。通过PCR扩增、测序等步骤共获得了11头大额牛细胞色素b(Cytb)基因全序列(1140bp)。应用分析软件,对大额牛11条Cytb序列进行了分析,并结合GenBank中牛属动物6个近缘种的同源序列,以亚洲水牛(Bubalus bubalis)为外群,分别采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建了牛属动物分子系统发育树。序列分析结果表明,11条大额牛Cytb序列1140位点中,共发现95个变异位点(占分析位点总数的8.33%),定义了6种单倍型,表明大额牛群体的Cytb基因遗传多态性比较丰富。构建的NJ和MP分子系统树均显示,大额牛研究群体明显分为3支,第1支与普通牛(Bos taurus)相聚,第2支与瘤牛(Bos indicus)相聚,第3支与印度野牛(Bos gaurus)相聚。系统发育分析表明,大额牛很可能是印度野牛的家养型或驯化种,我国大额牛群体可能曾受到其他牛种血缘的入侵。; 李世平常洪马国龙陈宏宇冀德君耿荣庆; 关键词：大额牛细胞色素B基因分子系统发生

基于线粒体COⅠ和Cyt b基因的粉蝶亚科及黄粉蝶亚科(粉蝶科)部分类群的分子系统发生被引量：21: 2007年; 测定了粉蝶科的粉蝶亚科和黄粉蝶亚科14属共24种线粒体COⅠ和Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载了2种粉蝶的同源序列,以眼蝶科的2个物种为外类群,运用NJ法、贝叶斯法分别重建了分子系统树,探讨了它们的系统发生关系。基因序列分析结果表明,经比对和处理后的序列总长度为1111bp,其中变异位点478个,简约位点382个,碱基T、C、A、G平均含量为39.9%、16.9%、30.9%、12.3%,A+T含量和C+G含量分别为70.8%和29.2%。分子系统树显示:黄粉蝶亚科不是单系群,但其中迁粉蝶属和豆粉蝶属在不同的分析方法中均聚合在一起。粉蝶亚科形成一个独立的支系,其中,襟粉蝶族为并系群;粉蝶族的粉蝶属、飞龙粉蝶属和云粉蝶属具有较近的亲缘关系。; 许丽郝家胜朱国萍殷先兵潘鸿春黄敦元张小平; 关键词：CYT 分子系统发生

几种鳄分子系统发生的探讨被引量：12: 2001年; 百年来关于扬子鳄的分类学位置存在着很多争议 ,本文测得扬子鳄、暹罗鳄和湾鳄的mtDNAND4和Cytb基因 ,并从GenBank中获得密西西比鳄和海龟的ND4基因和Cytb基因相应片段。用ClustalX1.8进行对位排列 ,以海龟为外群构建分子进化系统树。结果显示 :在鳄类动物中 ,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近 ,两者ND4基因序列碱基差异为 2 0 .6 8% ,而Cytb基因序列碱基差异为 14.43 % ;但扬子鳄与密西西比与鳄的分类问题仍将有待进一步探讨。; 朱伟铨王义权吴孝兵周开亚; 关键词：CYTB基因序列分子系统发生

两栖爬行动物的分子系统发生被引量：29: 2001年; 介绍了两栖爬行动物分子系统发生研究中选用的分子信息的种类及已发表的蛙类、蟾蜍类、龟类、蜥蜴类和蛇类等的分子系统学研究。这些研究中使用的DNA信息主要为mtDNA序列 ,也使用了一些核DNA序列。其研究的内容涉及目间、科间等高级阶元的系统发生关系 ,以及属间、种间以及亚种或种群间的系统发生关系。; 周开亚; 关键词：线粒体DNA 核DNA 分子系统发生两栖类爬行类

分类学中的方法论小叙: 2025年; 我从事分类学研究60年,从《中国植物志》到世界专著性研究,受到国内外的肯定。在这一过程中体会到,完善而合理的研究方法至关重要。分类学是一门综合性很强的学科,涉及到生物学几乎所有学科,其中形态学、孢粉学、细胞学、遗传学、分子生物学和统计学是必须掌握的学科。针对中国的植物分类学研究历史和现状,我以世界芍药属(科)(Paeonia,Paeoniaceae)和桔梗科党参属(Codonopsis,Campanulaceae)以及近缘类群的研究为例,应用了上述各个学科,重点强调野外考察和统计分析是不可或缺的研究方法。只有通过野外考察才能获取必要的实验材料,才能分清居群多态性和种间差异;唯有统计分析才能区分是种内的变异还是遗传隔离。分子系统学的兴起已使分类学进入一个崭新的时代,分类学工作者必须认识它,学习它。我的团队在上述两项研究中应用了它,获得超预期的成果。我的感想是:高水平的研究必须有完善的科学方法。; 洪德元; 关键词：野外考察分子系统发生芍药属桔梗科

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