搜索到17469篇“ 分子流行病学分析“的相关文章
- 湖州市某三甲医院住院患者艰难梭菌毒素基因检测及其分子流行病学分析
- 2025年
- 目的研究地市级医院住院患者艰难梭菌感染的发生情况,并分析艰难梭菌的分子流行病学特征。方法收集湖州市第一人民医院2023年11月—2023年12月住院腹泻患者粪便标本,培养分离艰难梭菌后,采用核酸扩增技术检测毒素基因,菌株经全基因测序后(Whole Genome Sequencing,WGS)进行分子流行病学分析。结果从500份住院患者腹泻样本中分离得到49株艰难梭菌,其中产毒型艰难梭菌40株,艰难梭菌感染(Clostridium difficile infections,CDI)阳性率为8.00%;PCR检测的毒素基因主要为tcdA(+)/tcdB(+),双毒素基因阴性(A+B+CDT-),占97.50%(39/40),1株携带双毒素基因(A+B+CDT+);CDI阳性率最高的科室是消化内科,其次为ICU;MLST分型中,共有13种ST型别,其中ST2型为优势型别,占30.00%;结合WGS数据分析,未发现艰难梭菌菌株在研究期间发生流行和传播。结论本院CDI在住院腹泻患者中的发生率较低,未发生院内感染传播和暴发流行现象,但不排除存在未知感染源可能性,应重点关注重点科室,如ICU患者发生CDI情况。
- 郑莉莉强鑫华嵇龙飞
- 关键词：住院患者艰难梭菌毒素基因分子分型
- 一起CV-A5引起的疱疹性咽峡炎疫情分子流行病学分析
- 2025年
- 目的对2022年5月广州市某幼儿园一起疱疹性咽峡炎(HA)疫情进行病原学鉴定及病原基因特征分析。方法采用统一调查表对某幼儿园于2022年5月23-31日诊断为疱疹性咽峡炎及同一幼儿园有发热,伴咽痛、口腔疱疹等症状之一患儿进行个案调查。采集本次疫情7名患者大便样本,使用荧光RT-PCR和半巢式PCR法鉴定病原。对病毒VP1区全长进行测序,氨基酸位点变异及系统进化分析。结果7份样本经检测为肠道病毒阳性,均为柯萨奇病毒A5(CV-A5)。共获得4条CV-A5 VP1全长序列,核苷酸和氨基酸相似性均为100.0%;与CV-A5原型株核苷酸和氨基酸相似性分别为79.3%和94.6%;与C1亚型毒株核苷酸和氨基酸相似性分别为89.7%~96.9%和95.6%~99.3%。系统进化分析显示,此次疫情CV-A5均属于我国广泛流行的C1亚型。与CV-A5原型株相比,在VP1区存在16个氨基酸位点变异;与CV-A5 C1亚型毒株相比,存在2个氨基酸位点变异。结论CV-A5是引起此次HA疫情的病原,属于中国大陆主要流行的C1亚型株。与C1亚型流行株相比,本次疫情在VP1区出现新的氨基酸变异,对于是否会引起病毒免疫逃逸及毒力改变还需进一步研究。
- 曾庆张晓杨结仪刘静雯耿进妹李魁彪狄飚谢华萍
- 关键词：疱疹性咽峡炎VP1基因系统进化分析
- 外周血口形红细胞增多伴巨大血小板患者分子流行病学分析
- 2025年
- 目的分析外周血口形红细胞增多伴巨大血小板患者的分子流行病学特征。方法收集2022—2023年上海交通大学医学院附属瑞金医院30例口形红细胞增多伴巨大血小板患者外周血样本,进行全血细胞计数和全外显子基因测序。收集患者临床资料、基本病史和测序结果,综合分析每位患者的基因突变情况,并判断表型形成的原因。结果30例患者中,有26例患者伴血小板减少,22例患者伴不同程度贫血。基因测序结果显示,有8例患者携带植物固醇血症相关基因(ABCG 5、ABCG 8)突变,其中3例ABCG 5纯合突变、1例ABCG 8纯合突变、2例ABCG 8复合杂合突变、2例单纯ABCG 5杂合突变;有5例患者携带遗传性口形红细胞增多症(HST)相关基因(PIEZO 1、ABCB 6)杂合突变;有2例患者携带家族性高胆固醇血症(FH)相关基因(LDLR、LDLRAP 1)突变,其中1例LDLR杂合突变、1例LDLRAP 1纯合突变;有1例患者携带脂质代谢异常相关基因(ABCA 1)杂合突变;有2例患者携带遗传性球形红细胞增多症相关基因(SPTA 1、SPTB)杂合突变,其中1例为SPTA 1和SPTB双重突变;有3例患者携带血小板功能相关基因(RASGRP 2、TUBB 1、MYH 9)复合杂合突变,其中2例RASGRP 2和TUBB 1复合杂合突变;有9例患者基因突变结果与表型不符合。结论遗传性基因突变、继发性因素均可导致口形红细胞增多伴巨大血小板,当患者出现类似细胞形态学改变时,可能指向多种不同疾病方向,应及时进行基因筛查,综合分析可能的病因。
- 周嘉宽郭平蔡祺杨铭康黄之玺薛伊伦华任翔林瀚李佳明王剑飚
- 关键词：巨大血小板遗传性疾病
- 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌临床分布及耐药性分子流行病学分析
- 2025年
- 目的分析联勤保障部队第九〇〇医院2017—2023年耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)检出特点、耐药性及耐药基因携带情况,为临床防治MRSA提供实验依据。方法回顾性分析2017—2023年检出的金黄色葡萄球菌(SA)的临床分布和耐药情况,通过聚合酶链式反应(PCR)检测324株MRSA分离株5种耐药基因携带情况。结果2017—2023年共检出SA 3086株,其中1054株为MRSA(34.15%)。MRSA主要由神经外科(18.22%)、骨科(14.23%)及普通外科(11.57%)送检,检出占比最高的标本类型是分泌物(39.09%)和痰液(20.97%)。MRSA对红霉素、克林霉素、四环素、环丙沙星、庆大霉素、莫西沙星、复方新诺明、利福平存在不同程度的耐药性,其中对红霉素和克林霉素的耐药率较高(>70%),未检出对万古霉素和利奈唑胺耐药的MRSA菌株。耐药基因mecA、tetM、aac、ermA、ermC的检出率分别为100.00%、20.37%、99.69%、70.99%、99.38%。结论MRSA检出率较高,对常用抗生素有不同程度的耐药并携带多种耐药基因,临床应结合药敏试验和基因检测结果合理使用抗生素,以减少多重耐药菌的出现。
- 黄程鑫邓梦秋陈莉程少杰段梦晨张胜行赖晓凤
- 关键词：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性耐药基因
- 感染性腹泻病原监测及其分子流行病学分析
- 目的 观察及分析衢州地区感染性腹泻分子流行病学特征及病原监测的结果,分析其病毒性特征,为临床制定针对性的预防和控制策略提供科学依据。方法 第一部分研究:收集2023年1月至2023年12月在浙江省衢州市医院门诊及住院26...
- 王胜
- 关键词：感染性腹泻诺如病毒流行病学病原监测
- 副猪嗜血杆菌的多重耐药性及氨基糖苷类耐药基因分子流行病学分析
- 2024年
- 为了解规模化猪场副猪嗜血杆菌(HPS)的耐药基因流行情况,对来自国内52株HPS分离株开展了耐药基因检测、药敏试验、氨基糖苷类耐药基因Aph(3')-Ia和StrB氨基酸序列的比对及分析。结果表明:HPS分离株含有多重耐药基因(β-内酰胺类,氨基糖苷类,磺胺类药和Ⅰ类整合子),其中bla-_(TEM)、Aph(3')-Ia、3'CS和Int1基因检出率为100%;HPS分离菌株对硫酸链霉素的耐药率高达75%。HPS分离菌株Aph(3')-Ia编码的部分氨基酸与除了已知HPS之外的6种细菌的氨基酸序列相同;HPS分离株JX-6 StrB基因编码的氨基酸序列与其他细菌差别较大,该菌株第18号位点StrB基因的ATP结合位点也发生了突变。本研究表明规模化养猪场HPS氨基糖苷类耐药基因Aph(3')-Ia和StrB携带率高,细菌耐药性的差异和耐药基因的改变可能是由一些特定的位点突变所导致。本研究为规模化养殖场HPS耐药基因变化规律研究和相关疾病的防控奠定了基础。
- 吴瑗董婉玉王馨雨刘雅琦周莹珊杜静于浩然仲伟宋厚辉张聚民王晓杜
- 关键词：副猪嗜血杆菌耐药基因分子流行病学
- 猪塞内卡病毒的分离鉴定与分子流行病学分析
- A型塞内卡病毒（Senecavirus,SVA）是小RNA病毒科塞内卡病毒属的唯一成员,主要引起猪的水疱性病变。SVA于2014年首次发现并被报道,并在短时间内传播到世界多个养猪业发达的国家。我国首次于2015年在广东省...
- 纪颖
- 关键词：全基因组测序遗传进化分析
- 安徽省六安市立克次体病血清学诊断和分子流行病学分析
- 2024年
- 目的 2017年5月-2021年11月安徽省六安市霍山县医院收治的发热伴皮疹病例数量增加,通过流行病学和临床特征分析,查明其病因,为发热伴皮疹预防控制提供科学依据。方法 对发热伴皮疹患者进行流行病学调查,详细询问其病史情况,调取其临床病历。采集患者入院时的急性期和恢复期血清,使用间接免疫荧光法检测血清中无形体、伯氏疏螺旋体、东方体、埃立克体、立氏立克次体和斑疹伤寒立克次体的IgG抗体滴度,通过恢复期血清IgG抗体滴度4倍增长,判定为感染该病原体;急性期血清经立克次体序列测定,所得序列与GenBank公布序列比对分析,根据同源性确定引起该起疫情的病原体。结果 病例急性期血清无形体、伯氏疏螺旋体和斑疹伤寒立克次体IgG抗体均为阴性;急性期血清中立氏立克次体IgG阳性率为51.52%(68/132),恢复期阳性率为89.19%(33/37),患者恢复期血清中IgG抗体滴度与急性期相比,增长均>4倍。立克次体ompA序列进化树分析表明该立克次体与我国云南省发现的Candidatus Rickettsia jingxinensis最为接近。结论 六安市发热伴皮疹病例经血清学诊断为斑点热立克次体感染。
- 汤复根吕勇陈智超杨卫杨慧常宏伟
- 关键词：立克次体病间接免疫荧光法
- 中国不同地区猪轮状病毒的分离鉴定及分子流行病学分析被引量：8
- 2024年
- 为鉴定国内不同地区猪轮状病毒(Porcine rotavirus,PRo V)并分析其分子流行病学特征,本研究将从我国不同地区收集病料中检测到的16份PRoV阳性仔猪粪便样品和小肠内容物处理后接种MA-104细胞,传代后进行荧光定量PCR (qPCR)和间接免疫荧光试验(IFA)鉴定,并经电镜观察。结果显示,其中7份样品F1~F3代病毒液qPCR Ct值均随着传代次数的升高而逐渐降低,IFA鉴定结果显示均能在细胞中观察到特异性荧光,电镜观察到直径约70 nm无囊膜的病毒粒子,表明本实验分离到7株PRoV。利用RT-PCR扩增7株分离株和其余9份PRoV的阳性样品的VP7基因并测序分析基因型,基于VP7基因进行同源性和遗传进化分析。结果显示,16份阳性样品包含3种G型,即G9(7/16)、G4 (6/16)和G3 (3/16),同时G9型FJ-2021分离株和G4型JS01-2021分离株与近两年流行株亲缘关系较近。统计16份样品中G型PRoV的地域分布,结果显示华东地区有G9、G4和G3型的流行,四川有G3和G9型流行,广东有G9型的流行,分别与华东地区、四川地区和广西地区报道的流行G型一致;除此之外,G9型在云南、辽宁、湖南均有流行,G4基因型在广西、广东、陕西、黑龙江、河南均有流行。本研究首次收集了来自我国12个省市的PRoV阳性临床样品并进行PRoV的分离鉴定,丰富了PRoV在国内的流行资料,对不同地区针对性的防控PRoV的感染提供了流行病学数据,同时为进一步研究不同G型PRoV的致病机制和疫苗研发奠定了基础。
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- 关键词：猪轮状病毒
- 青海省碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌的分子流行病学分析
- 2024年
- 目的通过研究2022年7月至2023年5月青海省5家医院分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(CRE)的分布、基因型及耐药性,为临床CRE感染的治疗、院内感染防控,以及抗菌药物制订和评价提供数据支持。方法采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪进行细菌鉴定,采用VITEKⅡcompact进行细菌药敏试验,采用碳青霉烯酶抑制剂增强试验进行产酶表型鉴定,采用聚合酶链反应检测碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaNDM、blaIMP、blaVIM和blaOXA-48)。对分离出的优势菌株进行多位点序列分型(MLST)和同源性分析。结果共分离出59株CRE,其中50株分离自临床标本,9株分离自患者所处的环境;59株CRE中阴沟肠杆菌23株,肺炎克雷伯菌22株,大肠埃希菌7株,产酸克雷伯菌5株,弗氏柠檬酸杆菌和布氏柠檬酸杆菌各1株。CRE主要分离于重症监护病房、烧伤科、肝胆科。标本来源主要为伤口分泌物、痰液、血液。59株CRE对酶抑制剂复合制剂、头孢菌素类、氨曲南及碳青霉烯类等抗菌药物均具有较高的耐药率(87.5%~100.0%),对阿米卡星和替加环素的耐药率相对较低,分别为30.4%和15.5%。最常见的碳青霉烯酶基因型是blaNDM(59.32%,35/59),其次是blaKPC(32.20%,19/59),肺炎克雷伯菌中blaKPC-2检出率最高(72.73%,16/22),阴沟肠杆菌中blaNDM-1检出率最高(69.57%,16/23)。MLST结果显示,肺炎克雷伯菌ST分型主要为ST11型(68.18%,15/22),阴沟肠杆菌ST分型主要为ST97型(26.09%,6/23),9株从患者所处环境中分离出的CRE与临床菌株的ST型一致。结论青海省5家医院分离的CRE耐药率普遍较高,主要以阴沟肠杆菌和肺炎克雷伯菌为主,碳青霉烯酶基因以blaNDM和blaKPC为主,耐药问题严重,临床应加强CRE的筛查及控制,预防其在院内传播。
- 何轶群扎拉加李娟董娟卢天龙黄文辉
- 关键词：碳青霉烯酶
