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基于山药转录组测序的EST-SSR信息分析及分子标记开发被引量：1: 2025年; 山药(Dioscorea opposita Thunb.)为药食同源作物,为解析其遗传背景,本研究基于山药珠芽转录组数据挖掘SSR位点。结果表明,在46701条unigenes中检测到24467个SSR,平均每2.29 kb发现1个SSR位点,发生频率33.78%,出现频率53.40%。重复基元类型中单核苷酸占比52.64%,A/T基元最多,其次,二、三核苷酸重复类型分别占23.66%和20.42%,六核苷酸重复类型最为丰富,有112种;SSR基元重复次数多为5~10次,除单碱基类型外,6次重复位点最多;SSR基序长度主要为10~15 bp,占总数的59.64%。随机合成50对不同重复基元类型EST-SSR引物,对29份不同山药种质资源模板进行PCR扩增及电泳分析,47对引物为有效引物,82%的引物呈现多态性;聚类分析表明,29份资源可大致分为3大类群,分为北方山药、南方参薯及混杂类群。以上结果显示,山药转录组SSR位点数量较多、发生频率较高,并且类型丰富,可为山药种质资源鉴定、遗传多样性分析及分子标记辅助育种等提供基础。; 李锦超董俊美贾凯旋孟义江杨太新侯孟泽葛淑俊; 关键词：山药转录组 SSR分子标记

抗赤霉病小麦中科1878中易位重组片段的克隆及分子标记开发与育种应用: 本发明涉及抗赤霉病小麦中科1878中易位重组片段的克隆及分子标记开发与育种应用。具体来说，本发明涉及抗赤霉病小麦中科1878的特异性分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明还涉及所述分子标记...; 刘阳张晶周晨易从杨石庆华韩方普

大豆脂氧合酶基因功能分子标记开发及其应用: 本发明公开了大豆脂氧合酶基因功能分子标记开发及其应用。本发明涉及分子生物技术领域，具体涉及大豆脂氧合酶基因功能分子标记开发及其应用。本发明通过检测待测大豆基因组中SNP的多态性或基因型，根据基因型鉴定或辅助鉴定大豆腥味性...; 黄珊珊王超郭春兰李莹侯文秀胡喜平杨楠李昆邹冰雪化金阁郭梅孙树民许晶王茂青刘萍萍陈宵宇何琳刘业丽郑宝香郑姣龙冯丽娟卢美丽焦毓哲

狼尾草属叶绿体基因组特征与分子标记开发: 2025年; 【目的】利用4种已发布的狼尾草属Pennisetum植物叶绿体基因序列,分析其叶绿体基因组特征并开发相应的分子标记,为狼尾草属植物的进化及系统发育关系提供新的观点。【方法】基于美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库已发布的4种狼尾草属叶绿体完整基因组序列,利用生物信息学手段分析其重复序列、密码子偏好性、多态性、共线性并开发简单重复序列(SSR)分子标记。【结果】4种狼尾草属植物的叶绿体基因组长度及GC含量都较为接近且密码子偏倚程度不高;边界扩张分析显示各区域间收缩不显著;共线性分析表明4种狼尾草植物的种间共线性较强;基于叶绿体基因组序列的系统发育分析表明白草P.flaccidum和御谷P.glaucum、象草P.purpureum和狼尾草P.alopecuroides的亲缘关系最近。5对SSR分子标记在狼尾草属植物中有较高的实用性,引物SSR2是御谷和狼尾草的特异性引物,引物SSR5是御谷的特异性引物。SSR1、SSR3和SSR4在4种狼尾草属植物中显示出较高的保守性,SSR1的种间保守性最高。【结论】4种狼尾草叶绿体基因组较为保守,且白草与御谷、象草与狼尾草的亲缘关系最为接近,同时引物SSR2是御谷和狼尾草的特异性引物,引物SSR5是御谷的特异性引物。; 江转转陈红鲍红艳代雨童; 关键词：狼尾草属叶绿体基因组分子标记

玉米氮吸收性状相关NPF家族基因挖掘及InDel分子标记开发: 2025年; 玉米作为中国的第一大粮食作物,在保障中国粮食安全方面的作用重大。在玉米生长发育过程中氮肥是重要的肥力因素,然而近些年氮肥的大量投入也造成了一系列环境问题。对于这些问题,利用分子标记辅助育种,充分发挥氮素的利用效率是一种环保高效的解决方法。本研究对硝态氮吸收转运相关的NPF家族进行分析,通过全基因组关联分析挖掘出与玉米氮吸收性状紧密关联的15个候选基因,根据已报道的功能位点设计插入缺失(InDel)分子标记,以期设计出与玉米硝酸盐含量积累性状显著关联的功能标记。共设计了69对InDel分子标记,经过亲本多态性检验,发现特异性良好的有32对标记。在609份玉米自交系组成的自然群体中对这些InDel分子标记进行功能验证,结果表明,在玉米ZmNPF6.2、ZmNPF6.4、ZmNPF6.8、ZmNPF8.12、ZmNPF8.14基因附近的7对InDel分子标记与氮素吸收性状紧密关联。本研究开发的氮高效吸收相关InDel分子标记可为分子标记辅助育种提供理论基础,为培育氮高效利用的玉米新品种指引了方向。; 罗春梅赵晨旭余海兵赵涵周玲; 关键词：玉米

一种用于松树母本鉴定的分子标记开发及其应用: 本发明公开了一种用于松树母本鉴定的分子标记开发及其应用。解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定松树母本。具体公开了检测SNP40、SNP81、SNP318、SNP443、SNP521和/或SNP590的物质在鉴定待测松树母本...; 李伟夏琪靖刘红梅

钝叶草种质资源分子标记开发及遗传多样性研究: 2025年; 为了研究不同地理来源钝叶草种质资源间的遗传差异,本研究以13份来自不同国家的钝叶草种质资源为研究对象,利用SRAP标记对其进行遗传多样性分析。结果表明:从100对引物组合中筛选出了21对有多态性条带、且扩增条带清晰稳定的引物。利用这些引物对钝叶草种质进行扩增,共扩增获得161条条带,且均是多态性条带,多态性百分率为100.00%,平均一对引物能检测到7条条带,扩增范围为4~10条。遗传相似性系数为0.4805~0.9286,平均值为0.6452。利用UPMAG法在遗传相似性系数为0.6930时将13份钝叶草种质分为4个类群。主成分分析可将其分为5个类群。本研究结果表明13份钝叶草种质资源的遗传多样性处于上等水平,SRAP标记能有效地评价钝叶草种质的遗传差异,为钝叶草种质的开发利用提供依据。; 黄春琼张瑜王文强董荣书杨虎彪刘国道; 关键词：钝叶草 SRAP 分子标记

基于重测序紫花苜蓿高蛋白、高产关联InDel分子标记开发: 2025年; 随着高通量测序技术的迅猛发展,测序成本大幅降低,测序速度和数据质量均得到了显著提升,极大地推动了紫花苜蓿基因组的深入研究,进而也为紫花苜蓿不同性状关联的分子标记开发提供了重要基础信息。插入/缺失(insertion/deletion,InDel)多态性标记因其分布广泛、密度高、遗传稳定以及重复性强等优点而受到关注,然而目前其在紫花苜蓿中的研究及应用仍十分有限。本研究基于国内外80份紫花苜蓿材料的基因组重测序数据,通过与紫花苜蓿“中苜1号”参考基因组序列比对挖掘InDel变异位点,开发与高蛋白和高产性状相关的InDel标记。结果表明,在全基因组范围内设计的40个标记中,经聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证后,成功开发出29个多态性标记,多态性比率达到72.5%。其中,已开发的InDel_25和InDel_39标记可分别用于高产和优质紫花苜蓿材料的鉴定。本研究开发的InDel标记可结合传统育种方法,有望加速高产、优质紫花苜蓿新品种的培育。; 冯雅琪陈嘉慧张静妮隋超陈基伟刘志鹏周强刘文献; 关键词：紫花苜蓿

油菜含油量关键转录因子的eQTL与其紧密连锁的分子标记开发与应用: 本发明涉及一种油菜含油量关键转录因子的eQTL与其紧密连锁的分子标记开发与应用。提供了一种甘蓝型油菜高含油量的C03染色体QTL位点qlec1.C03.1的应用，所述甘蓝型油菜高含油量的主效QTL位点位于C03染色体的第...; 郭亮韩勖赵虎谭增栋

基于转录组技术的铁皮石斛CDDP分子标记开发及抗寒性遗传多样性分析: 2025年; 目的基于转录组技术开发CDDP分子标记,解析铁皮石斛抗寒性遗传多样性,可为后续抗寒种质资源的筛选提供参考。方法设置铁皮石斛低温(0℃)试验,以常温处理组为对照进行转录组学分析,获取铁皮石斛抗寒性相关功能基因并开发的CDDP分子标记,对来自浙江、云南的栽培种铁皮石斛进行抗寒种质资源鉴定,使用NTSYS、Popgen32、Structure等软件进行遗传分析。结果铁皮石斛低温胁迫试验转录组测序得到46.85 Gb数据,共有1815个差异表达基因参与铁皮石斛低温胁迫响应,其中1281个基因上调表达,534个基因下调表达。根据抗寒性相关差异表达基因设计了251对CDDP引物,共筛选出29对多态性引物,扩增得到185条清晰的条带,平均每条引物扩增6.38条带。多态性条带共178条,条带的多态率(PPL)为96.22%。遗传分析结果表明,供试铁皮石斛具有丰富的遗传变异。群体结构分析表明,该研究中铁皮石斛种质资源可分成6个亚群。结论贵州栽培种铁皮石斛抗寒性遗传变异丰富,CDDP分子标记可以有效应用于铁皮石斛遗传多样性分析中。; 任得强王小仲胡晓陈宏宇陈春伶; 关键词：铁皮石斛

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